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EMDB EMD-17456 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details ;Single particle cryo-EM structure of the complex between Corynebacterium glutamicum homohexameric 2-oxoglutarate dehydrogenase OdhA and the FHA-protein inhibitor OdhI ; _pdbx_database_related.db_id EMD-17456 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8P5X _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-05-24 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Yang, L.' 1 0000-0003-3431-0288 'Mechaly, A.M.' 2 0000-0002-5305-7495 'Bellinzoni, M.' 3 0000-0002-8887-6917 # loop_ _citation.abstract _citation.abstract_id_CAS _citation.book_id_ISBN _citation.book_publisher _citation.book_publisher_city _citation.book_title _citation.coordinate_linkage _citation.country _citation.database_id_Medline _citation.details _citation.id _citation.journal_abbrev _citation.journal_id_ASTM _citation.journal_id_CSD _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_full _citation.journal_issue _citation.journal_volume _citation.language _citation.page_first _citation.page_last _citation.title _citation.year _citation.database_id_CSD _citation.pdbx_database_id_DOI _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_patent _citation.unpublished_flag ? ? ? ? ? ? ? UK ? ? primary 'Nat Commun' ? ? 2041-1723 ? ? 14 ? 4851 4851 'High resolution cryo-EM and crystallographic snapshots of the actinobacterial two-in-one 2-oxoglutarate dehydrogenase.' 2023 ? 10.1038/s41467-023-40253-6 37563123 ? ? ? ? ? ? ? ? ? US ? ? 1 Biorxiv ? ? 2692-8205 ? ? ? ? ? ? ;High resolution cryo-EM and crystallographic snapshots of the large actinobacterial 2-oxoglutarate dehydrogenase: an all-in-one fusion with unique properties ; 2023 ? 10.1101/2023.02.23.529587 ? ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Yang, L.' 1 ? primary 'Wagner, T.' 2 ? primary 'Mechaly, A.' 3 ? primary 'Boyko, A.' 4 ? primary 'Bruch, E.M.' 5 ? primary 'Megrian, D.' 6 ? primary 'Gubellini, F.' 7 ? primary 'Alzari, P.M.' 8 ? primary 'Bellinzoni, M.' 9 ? 1 'Yang, L.' 10 ? 1 'Wagner, T.' 11 ? 1 'Mechaly, A.' 12 ? 1 'Boyko, A.' 13 ? 1 'Bruch, E.M.' 14 ? 1 'Megrian, D.' 15 ? 1 'Gubellini, F.' 16 ? 1 'Alzari, P.M.' 17 ? 1 'Bellinzoni, M.' 18 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8P5X _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 1223 ? ? 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'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ODO12_CORGL Q8NRC3 ? 1 ;MSSASTFGQNAWLVDEMFQQFQKDPKSVDKEWRELFEAQGGPNTTPATTEAQPSAPKESAKPAPKAAPAAKAAPRVETKP ADKTAPKAKESSVPQQPKLPEPGQTPIRGIFKSIAKNMDISLEIPTATSVRDMPARLMFENRAMVNDQLKRTRGGKISFT HIIGYAMVKAVMAHPDMNNSYDVIDGKPTLIVPEHINLGLAIDLPQKDGSRALVVAAIKETEKMNFSEFLAAYEDIVARS RKGKLTMDDYQGVTVSLTNPGGIGTRHSVPRLTKGQGTIIGVGSMDYPAEFQGASEDRLAELGVGKLVTITSTYDHRVIQ GAVSGEFLRTMSRLLTDDSFWDEIFDAMNVPYTPMRWAQDVPNTGVDKNTRVMQLIEAYRSRGHLIADTNPLSWVQPGMP VPDHRDLDIETHNLTIWDLDRTFNVGGFGGKETMTLREVLSRLRAAYTLKVGSEYTHILDRDERTWLQDRLEAGMPKPTQ AEQKYILQKLNAAEAFENFLQTKYVGQKRFSLEGAEALIPLMDSAIDTAAGQGLDEVVIGMPHRGRLNVLFNIVGKPLAS IFNEFEGQMEQGQIGGSGDVKYHLGSEGQHLQMFGDGEIKVSLTANPSHLEAVNPVMEGIVRAKQDYLDKGVDGKTVVPL LLHGDAAFAGLGIVPETINLAKLRGYDVGGTIHIVVNNQIGFTTTPDSSRSMHYATDYAKAFGCPVFHVNGDDPEAVVWV GQLATEYRRRFGKDVFIDLVCYRLRGHNEADDPSMTQPKMYELITGRETVRAQYTEDLLGRGDLSNEDAEAVVRDFHDQM ESVFNEVKEGGKKQAEAQTGITGSQKLPHGLETNISREELLELGQAFANTPEGFNYHPRVAPVAKKRVSSVTEGGIDWAW GELLAFGSLANSGRLVRLAGEDSRRGTFTQRHAVAIDPATAEEFNPLHELAQSKGNNGKFLVYNSALTEYAGMGFEYGYS VGNEDSIVAWEAQFGDFANGAQTIIDEYVSSGEAKWGQTSKLILLLPHGYEGQGPDHSSARIERFLQLCAEGSMTVAQPS TPANHFHLLRRHALSDLKRPLVIFTPKSMLRNKAAASAPEDFTEVTKFQSVINDPNVADAAKVKKVMLVSGKLYYELAKR KEKDGRDDIAIVRIEMLHPIPFNRISEALAGYPNAEEVLFVQDEPANQGPWPFYQEHLPELIPNMPKMRRVSRRAQSSTA TGVAKVHQLEEKQLIDEAFEA ; 1 2 UNP ODHI_CORGL Q8NQJ3 ? 2 ;MSDNNGTPEPQVETTSVFRADLLKEMESSTGTAPASTGAENLPAGSALLVVKRGPNAGARFLLDQPTTTAGRHPESDIFL DDVTVSRRHAEFRINEGEFEVVDVGSLNGTYVNREPRNAQVMQTGDEIQIGKFRLVFLAGPAE ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8P5X A 3 ? 1223 ? 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_refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD WITH PHASES' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R 0.142 _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? 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_refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_lipid ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_carb ? _refine_hist.pdbx_pseudo_atom_details ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.009 0.013 56500 ? r_bond_refined_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.000 0.015 53239 ? r_bond_other_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.441 1.644 76597 ? r_angle_refined_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.122 1.581 122352 ? r_angle_other_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.113 5.000 7086 ? r_dihedral_angle_1_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 30.304 22.009 3101 ? r_dihedral_angle_2_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.946 15.000 9370 ? r_dihedral_angle_3_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 15.333 15.000 432 ? r_dihedral_angle_4_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.071 0.200 7290 ? r_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 0.020 65112 ? r_gen_planes_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.002 0.020 13096 ? r_gen_planes_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbd_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbd_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbtor_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbtor_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_xyhbond_nbd_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_xyhbond_nbd_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.446 4.217 28416 ? r_mcbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.446 4.217 28415 ? r_mcbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.097 6.394 35478 ? r_mcangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.097 6.394 35479 ? r_mcangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.172 4.910 28084 ? r_scbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.172 4.910 28085 ? r_scbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_scangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 9.722 7.132 41120 ? r_scangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.453 49.569 56577 ? r_long_range_B_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.453 49.571 56578 ? r_long_range_B_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_rigid_bond_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_free ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_bonded ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.01 ? 0.05 1 'interatomic distance' ? A 63044 ? ? 1 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.01 ? 0.05 2 'interatomic distance' ? B 63044 ? ? 1 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.01 ? 0.05 3 'interatomic distance' ? A 63052 ? ? 2 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.01 ? 0.05 4 'interatomic distance' ? C 63052 ? ? 2 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.01 ? 0.05 5 'interatomic distance' ? A 63012 ? ? 3 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.01 ? 0.05 6 'interatomic distance' ? D 63012 ? ? 3 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.01 ? 0.05 7 'interatomic distance' ? A 63092 ? ? 4 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.01 ? 0.05 8 'interatomic distance' ? E 63092 ? ? 4 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.01 ? 0.05 9 'interatomic distance' ? A 63032 ? ? 5 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.01 ? 0.05 10 'interatomic distance' ? F 63032 ? ? 5 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 11 'interatomic distance' ? B 63012 ? ? 6 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 12 'interatomic distance' ? C 63012 ? ? 6 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.01 ? 0.05 13 'interatomic distance' ? B 63056 ? ? 7 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.01 ? 0.05 14 'interatomic distance' ? D 63056 ? ? 7 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 15 'interatomic distance' ? B 63060 ? ? 8 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 16 'interatomic distance' ? E 63060 ? ? 8 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 17 'interatomic distance' ? B 63036 ? ? 9 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 18 'interatomic distance' ? F 63036 ? ? 9 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.01 ? 0.05 19 'interatomic distance' ? C 62994 ? ? 10 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.01 ? 0.05 20 'interatomic distance' ? D 62994 ? ? 10 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 21 'interatomic distance' ? C 63080 ? ? 11 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 22 'interatomic distance' ? E 63080 ? ? 11 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 23 'interatomic distance' ? C 63028 ? ? 12 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 24 'interatomic distance' ? F 63028 ? ? 12 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.01 ? 0.05 25 'interatomic distance' ? D 63044 ? ? 13 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.01 ? 0.05 26 'interatomic distance' ? E 63044 ? ? 13 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.01 ? 0.05 27 'interatomic distance' ? D 63014 ? ? 14 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.01 ? 0.05 28 'interatomic distance' ? F 63014 ? ? 14 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 29 'interatomic distance' ? E 63058 ? ? 15 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 30 'interatomic distance' ? F 63058 ? ? 15 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 31 'interatomic distance' ? G 5522 ? ? 16 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 32 'interatomic distance' ? H 5522 ? ? 16 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 33 'interatomic distance' ? G 5520 ? ? 17 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 34 'interatomic distance' ? I 5520 ? ? 17 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 35 'interatomic distance' ? G 5522 ? ? 18 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 36 'interatomic distance' ? J 5522 ? ? 18 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 37 'interatomic distance' ? G 5520 ? ? 19 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 38 'interatomic distance' ? K 5520 ? ? 19 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 39 'interatomic distance' ? G 5522 ? ? 20 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 40 'interatomic distance' ? L 5522 ? ? 20 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 41 'interatomic distance' ? H 5524 ? ? 21 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 42 'interatomic distance' ? I 5524 ? ? 21 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 43 'interatomic distance' ? H 5522 ? ? 22 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 44 'interatomic distance' ? J 5522 ? ? 22 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 45 'interatomic distance' ? H 5522 ? ? 23 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 46 'interatomic distance' ? K 5522 ? ? 23 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 47 'interatomic distance' ? H 5520 ? ? 24 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 48 'interatomic distance' ? L 5520 ? ? 24 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 49 'interatomic distance' ? I 5520 ? ? 25 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 50 'interatomic distance' ? J 5520 ? ? 25 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 51 'interatomic distance' ? I 5520 ? ? 26 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 52 'interatomic distance' ? K 5520 ? ? 26 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 53 'interatomic distance' ? I 5520 ? ? 27 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 54 'interatomic distance' ? L 5520 ? ? 27 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 55 'interatomic distance' ? J 5518 ? ? 28 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 56 'interatomic distance' ? K 5518 ? ? 28 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 57 'interatomic distance' ? J 5520 ? ? 29 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 58 'interatomic distance' ? L 5520 ? ? 29 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.00 ? 0.05 59 'interatomic distance' ? K 5520 ? ? 30 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.00 ? 0.05 60 'interatomic distance' ? L 5520 ? ? 30 # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_ls_shell.d_res_high 2.300 _refine_ls_shell.d_res_low 2.360 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 0 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 125688 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.469 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_R_complete ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.000 # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 A 1 2 B 1 1 A 2 2 C 2 1 A 3 2 D 3 1 A 4 2 E 4 1 A 5 2 F 5 1 B 6 2 C 6 1 B 7 2 D 7 1 B 8 2 E 8 1 B 9 2 F 9 1 C 10 2 D 10 1 C 11 2 E 11 1 C 12 2 F 12 1 D 13 2 E 13 1 D 14 2 F 14 1 E 15 2 F 15 1 G 16 2 H 16 1 G 17 2 I 17 1 G 18 2 J 18 1 G 19 2 K 19 1 G 20 2 L 20 1 H 21 2 I 21 1 H 22 2 J 22 1 H 23 2 K 23 1 H 24 2 L 24 1 I 25 2 J 25 1 I 26 2 K 26 1 I 27 2 L 27 1 J 28 2 K 28 1 J 29 2 L 29 1 K 30 2 L 30 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 0 A PRO 104 . A ALA 1223 . A PRO 102 A ALA 1221 0 ? 1 2 0 B PRO 104 . B ALA 1223 . B PRO 102 B ALA 1221 0 ? 2 1 0 A PRO 104 . A ALA 1223 . A PRO 102 A ALA 1221 0 ? 2 2 0 C PRO 104 . C ALA 1223 . C PRO 102 C ALA 1221 0 ? 3 1 0 A PRO 104 . A ALA 1223 . A PRO 102 A ALA 1221 0 ? 3 2 0 D PRO 104 . D ALA 1223 . D PRO 102 D ALA 1221 0 ? 4 1 0 A PRO 104 . A ALA 1223 . A PRO 102 A ALA 1221 0 ? 4 2 0 E PRO 104 . E ALA 1223 . E PRO 102 E ALA 1221 0 ? 5 1 0 A PRO 104 . A ALA 1223 . A PRO 102 A ALA 1221 0 ? 5 2 0 F PRO 104 . F ALA 1223 . F PRO 102 F ALA 1221 0 ? 6 1 0 B PRO 104 . B ALA 1223 . B PRO 102 B ALA 1221 0 ? 6 2 0 C PRO 104 . C ALA 1223 . C PRO 102 C ALA 1221 0 ? 7 1 0 B PRO 104 . B ALA 1223 . B PRO 102 B ALA 1221 0 ? 7 2 0 D PRO 104 . D ALA 1223 . D PRO 102 D ALA 1221 0 ? 8 1 0 B PRO 104 . B ALA 1223 . B PRO 102 B ALA 1221 0 ? 8 2 0 E PRO 104 . E ALA 1223 . E PRO 102 E ALA 1221 0 ? 9 1 0 B PRO 104 . B ALA 1223 . B PRO 102 B ALA 1221 0 ? 9 2 0 F PRO 104 . F ALA 1223 . F PRO 102 F ALA 1221 0 ? 10 1 0 C PRO 104 . C ALA 1223 . C PRO 102 C ALA 1221 0 ? 10 2 0 D PRO 104 . D ALA 1223 . D PRO 102 D ALA 1221 0 ? 11 1 0 C PRO 104 . C ALA 1223 . C PRO 102 C ALA 1221 0 ? 11 2 0 E PRO 104 . E ALA 1223 . E PRO 102 E ALA 1221 0 ? 12 1 0 C PRO 104 . C ALA 1223 . C PRO 102 C ALA 1221 0 ? 12 2 0 F PRO 104 . F ALA 1223 . F PRO 102 F ALA 1221 0 ? 13 1 0 D PRO 104 . D ALA 1223 . D PRO 102 D ALA 1221 0 ? 13 2 0 E PRO 104 . E ALA 1223 . E PRO 102 E ALA 1221 0 ? 14 1 0 D PRO 104 . D ALA 1223 . D PRO 102 D ALA 1221 0 ? 14 2 0 F PRO 104 . F ALA 1223 . F PRO 102 F ALA 1221 0 ? 15 1 0 E PRO 104 . E ALA 1223 . E PRO 102 E ALA 1221 0 ? 15 2 0 F PRO 104 . F ALA 1223 . F PRO 102 F ALA 1221 0 ? 16 1 0 G GLU 41 . G ALA 143 . G GLU 40 G ALA 142 0 ? 16 2 0 H GLU 41 . H ALA 143 . H GLU 40 H ALA 142 0 ? 17 1 0 G GLU 41 . G ALA 143 . G GLU 40 G ALA 142 0 ? 17 2 0 I GLU 41 . I ALA 143 . I GLU 40 I ALA 142 0 ? 18 1 0 G GLU 41 . G ALA 143 . G GLU 40 G ALA 142 0 ? 18 2 0 J GLU 41 . 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ALA F 850 ? ALA F 846 ALA F 848 5 ? 3 HELX_P HELX_P291 BG3 VAL F 862 ? GLY F 876 ? VAL F 860 GLY F 874 1 ? 15 HELX_P HELX_P292 BG4 ASP F 879 ? GLY F 895 ? ASP F 877 GLY F 893 1 ? 17 HELX_P HELX_P293 BG5 ASN F 927 ? GLN F 934 ? ASN F 925 GLN F 932 1 ? 8 HELX_P HELX_P294 BG6 GLU F 951 ? ASN F 965 ? GLU F 949 ASN F 963 1 ? 15 HELX_P HELX_P295 BG7 PHE F 976 ? GLY F 982 ? PHE F 974 GLY F 980 5 ? 7 HELX_P HELX_P296 BG8 ALA F 983 ? TYR F 990 ? ALA F 981 TYR F 988 1 ? 8 HELX_P HELX_P297 BG9 SER F 993 ? GLY F 999 ? SER F 991 GLY F 997 1 ? 7 HELX_P HELX_P298 BH1 ARG F 1023 ? LEU F 1030 ? ARG F 1021 LEU F 1028 1 ? 8 HELX_P HELX_P299 BH2 THR F 1043 ? SER F 1057 ? THR F 1041 SER F 1055 1 ? 15 HELX_P HELX_P300 BH3 SER F 1070 ? ASN F 1074 ? SER F 1068 ASN F 1072 5 ? 5 HELX_P HELX_P301 BH4 ALA F 1080 ? PHE F 1084 ? ALA F 1078 PHE F 1082 5 ? 5 HELX_P HELX_P302 BH5 ASP F 1101 ? VAL F 1105 ? ASP F 1099 VAL F 1103 5 ? 5 HELX_P HELX_P303 BH6 LYS F 1114 ? GLY F 1127 ? 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VAL F 1203 GLU F 1220 1 ? 18 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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C ILE 682 O ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? C ILE 680 C MG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? ? metalc11 metalc ? ? Q MG . MG ? ? ? 1_555 R TPP . O3B ? ? C MG 1301 C TPP 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.882 ? ? metalc12 metalc ? ? Q MG . MG ? ? ? 1_555 R TPP . O2A ? ? C MG 1301 C TPP 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? ? metalc13 metalc ? ? D ASN 680 OD1 ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? D ASN 678 D MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? ? metalc14 metalc ? ? D ILE 682 O ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? D ILE 680 D MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? ? metalc15 metalc ? ? S TPP . O1A ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? D TPP 1301 D MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? ? metalc16 metalc ? ? S TPP . O1B ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? D TPP 1301 D MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.855 ? ? metalc17 metalc ? ? E ASN 680 OD1 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? E ASN 678 E MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? ? metalc18 metalc ? ? E ILE 682 O ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? E ILE 680 E MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.487 ? ? metalc19 metalc ? ? U TPP . 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F TPP 1301 F MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.938 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 HIS 1140 A . ? HIS 1138 A PRO 1141 A ? PRO 1139 A 1 -5.91 2 HIS 1140 B . ? HIS 1138 B PRO 1141 B ? PRO 1139 B 1 -5.97 3 HIS 1140 C . ? HIS 1138 C PRO 1141 C ? 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parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB2 6 7 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? parallel AB4 5 6 ? parallel AB4 6 7 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? parallel AB6 4 5 ? parallel AB6 5 6 ? parallel AB6 6 7 ? parallel AB6 7 8 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? parallel AB7 3 4 ? parallel AB7 4 5 ? parallel AB7 5 6 ? parallel AB7 6 7 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? parallel AB9 4 5 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC1 5 6 ? anti-parallel AC1 6 7 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? parallel AC4 4 5 ? parallel AC4 5 6 ? parallel AC4 6 7 ? parallel AC4 7 8 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? parallel AC5 3 4 ? parallel AC5 4 5 ? parallel AC5 5 6 ? parallel AC5 6 7 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? parallel AC7 4 5 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? parallel AC9 5 6 ? parallel AC9 6 7 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? parallel AD2 3 4 ? parallel AD2 4 5 ? parallel AD2 5 6 ? parallel AD2 6 7 ? parallel AD2 7 8 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? parallel AD3 3 4 ? parallel AD3 4 5 ? parallel AD3 5 6 ? parallel AD3 6 7 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? parallel AD5 3 4 ? parallel AD5 4 5 ? parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? parallel AD7 3 4 ? parallel AD7 4 5 ? parallel AD7 5 6 ? parallel AD7 6 7 ? parallel AD7 7 8 ? anti-parallel AD8 1 2 ? parallel AD8 2 3 ? parallel AD8 3 4 ? 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