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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.484 ? 60359 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 22.222 ? 12744 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.035 ? 7487 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 4711 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8QBM _struct.title 'Retron-Eco1 filament with ADP-ribosylated Effector (full map with 2 segments)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8QBM _struct_keywords.text 'retron, N-glycosidase, DNA-RNA-Protein complex, IMMUNE SYSTEM' _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 4 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 2 ? K N N 3 ? L N N 2 ? M N N 1 ? N N N 2 ? O N N 3 ? P N N 4 ? Q N N 1 ? R N N 2 ? S N N 3 ? 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V U 50 O4 ? ? ? 1_555 V G 56 N1 ? ? b U 50 b G 56 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_27_PAIR ? ? ? hydrog854 hydrog ? ? V G 51 N1 ? ? ? 1_555 V C 55 N3 ? ? b G 51 b C 55 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog855 hydrog ? ? V G 51 N2 ? ? ? 1_555 V C 55 O2 ? ? b G 51 b C 55 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog856 hydrog ? ? V G 51 O6 ? ? ? 1_555 V C 55 N4 ? ? b G 51 b C 55 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog857 hydrog ? ? V C 73 N3 ? ? ? 1_555 CA DG 85 N1 ? ? b C 73 a DG 85 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog858 hydrog ? ? V C 73 N4 ? ? ? 1_555 CA DG 85 O6 ? ? b C 73 a DG 85 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog859 hydrog ? ? V C 73 O2 ? ? ? 1_555 CA DG 85 N2 ? ? b C 73 a DG 85 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog860 hydrog ? ? V U 74 O4 ? ? ? 1_555 CA DA 84 N6 ? ? b U 74 a DA 84 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-DA PAIR' ? ? ? hydrog861 hydrog ? ? V G 75 N1 ? ? ? 1_555 CA DC 83 N3 ? ? b G 75 a DC 83 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog862 hydrog ? ? V G 75 N2 ? ? ? 1_555 CA DC 83 O2 ? ? b G 75 a DC 83 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog863 hydrog ? ? V G 75 O6 ? ? ? 1_555 CA DC 83 N4 ? ? b G 75 a DC 83 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog864 hydrog ? ? V A 76 N1 ? ? ? 1_555 CA DT 82 N3 ? ? b A 76 a DT 82 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog865 hydrog ? ? V A 76 N6 ? ? ? 1_555 CA DT 82 O4 ? ? b A 76 a DT 82 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog866 hydrog ? ? V G 77 N1 ? ? ? 1_555 CA DC 81 N3 ? ? b G 77 a DC 81 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog867 hydrog ? ? V G 77 N2 ? ? ? 1_555 CA DC 81 O2 ? ? b G 77 a DC 81 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog868 hydrog ? ? V G 77 O6 ? ? ? 1_555 CA DC 81 N4 ? ? b G 77 a DC 81 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog869 hydrog ? ? V U 78 N3 ? ? ? 1_555 CA DA 80 N1 ? ? b U 78 a DA 80 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog870 hydrog ? ? V U 78 O4 ? ? ? 1_555 CA DA 80 N6 ? ? b U 78 a DA 80 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog871 hydrog ? ? 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'C-DG PAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 AR6 EA . ? 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AD2 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? parallel AA6 3 4 ? parallel AA6 4 5 ? parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? parallel AA9 3 4 ? parallel AA9 4 5 ? parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? parallel AC4 4 5 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TYR A 48 ? 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CYS P 233 SER P 235 AC3 1 LYS M 242 ? VAL M 243 ? LYS P 242 VAL P 243 AC3 2 LEU M 246 ? ILE M 248 ? LEU P 246 ILE P 248 AC3 3 VAL M 253 ? GLY M 254 ? VAL P 253 GLY P 254 AC4 1 VAL P 59 ? PHE P 62 ? VAL T 59 PHE T 62 AC4 2 ILE P 30 ? CYS P 35 ? ILE T 30 CYS T 35 AC4 3 VAL P 93 ? LEU P 96 ? VAL T 93 LEU T 96 AC4 4 LEU P 120 ? ASP P 125 ? LEU T 120 ASP T 125 AC4 5 VAL P 151 ? CYS P 154 ? VAL T 151 CYS T 154 AC5 1 ILE P 253 ? GLN P 255 ? ILE T 253 GLN T 255 AC5 2 TYR P 260 ? VAL P 262 ? TYR T 260 VAL T 262 AC6 1 TYR Q 48 ? GLU Q 54 ? TYR U 48 GLU U 54 AC6 2 MET Q 62 ? PRO Q 68 ? MET U 62 PRO U 68 AC7 1 ILE Q 191 ? TYR Q 195 ? ILE U 191 TYR U 195 AC7 2 ASP Q 198 ? ALA Q 203 ? ASP U 198 ALA U 203 AC7 3 PHE Q 114 ? ILE Q 118 ? PHE U 114 ILE U 118 AC7 4 CYS Q 233 ? SER Q 235 ? CYS U 233 SER U 235 AC8 1 LYS Q 242 ? VAL Q 243 ? LYS U 242 VAL U 243 AC8 2 LEU Q 246 ? ILE Q 248 ? LEU U 246 ILE U 248 AC8 3 VAL Q 253 ? GLY Q 254 ? VAL U 253 GLY U 254 AC9 1 TYR U 48 ? GLU U 54 ? TYR Z 48 GLU Z 54 AC9 2 MET U 62 ? PRO U 68 ? MET Z 62 PRO Z 68 AD1 1 ILE U 191 ? TYR U 195 ? ILE Z 191 TYR Z 195 AD1 2 ASP U 198 ? ALA U 203 ? ASP Z 198 ALA Z 203 AD1 3 PHE U 114 ? ILE U 118 ? PHE Z 114 ILE Z 118 AD1 4 CYS U 233 ? SER U 235 ? CYS Z 233 SER Z 235 AD2 1 LYS U 242 ? VAL U 243 ? LYS Z 242 VAL Z 243 AD2 2 LEU U 246 ? ILE U 248 ? LEU Z 246 ILE Z 248 AD2 3 VAL U 253 ? GLY U 254 ? 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