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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.566 ? 22003 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.985 ? 2230 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.045 ? 2542 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 2755 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8QE8 _struct.title 'Structure of the non-canonical CTLH E3 substrate receptor WDR26 bound to NMNAT1 substrate' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8QE8 _struct_keywords.text 'E3 ubiquitin ligase, CTLH, GID, NMNAT1, YPEL5, NAD, NADH, LIGASE' _struct_keywords.pdbx_keywords LIGASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 3 ? 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ALA 3 189 SER 3 200 1 ? 12 HELX_P HELX_P44 AE8 ASP E 201 ? HIS E 206 ? ASP 3 201 HIS 3 206 1 ? 6 HELX_P HELX_P45 AE9 SER E 222 ? GLY E 233 ? SER 3 222 GLY 3 233 1 ? 12 HELX_P HELX_P46 AF1 PRO E 241 ? ASN E 252 ? PRO 3 241 ASN 3 252 1 ? 12 HELX_P HELX_P47 AF2 SER E 255 ? ASP E 260 ? SER 3 255 ASP 3 260 1 ? 6 HELX_P HELX_P48 AF3 LEU E 267 ? ASN E 273 ? LEU 3 267 ASN 3 273 1 ? 7 HELX_P HELX_P49 AF4 THR F 21 ? THR F 38 ? THR 2 21 THR 2 38 1 ? 18 HELX_P HELX_P50 AF5 PRO F 62 ? LYS F 75 ? PRO 2 62 LYS 2 75 1 ? 14 HELX_P HELX_P51 AF6 GLU F 94 ? ALA F 108 ? GLU 2 94 ALA 2 108 1 ? 15 HELX_P HELX_P52 AF7 ALA F 157 ? PHE F 163 ? ALA 2 157 PHE 2 163 1 ? 7 HELX_P HELX_P53 AF8 LYS F 170 ? TYR F 181 ? LYS 2 170 TYR 2 181 1 ? 12 HELX_P HELX_P54 AF9 ALA F 189 ? SER F 200 ? ALA 2 189 SER 2 200 1 ? 12 HELX_P HELX_P55 AG1 SER F 200 ? HIS F 206 ? SER 2 200 HIS 2 206 1 ? 7 HELX_P HELX_P56 AG2 SER F 222 ? ARG F 232 ? SER 2 222 ARG 2 232 1 ? 11 HELX_P HELX_P57 AG3 PRO F 241 ? ASN F 252 ? PRO 2 241 ASN 2 252 1 ? 12 HELX_P HELX_P58 AG4 THR G 21 ? THR G 38 ? THR 1 21 THR 1 38 1 ? 18 HELX_P HELX_P59 AG5 GLY G 52 ? LYS G 56 ? GLY 1 52 LYS 1 56 5 ? 5 HELX_P HELX_P60 AG6 PRO G 62 ? THR G 74 ? PRO 1 62 THR 1 74 1 ? 13 HELX_P HELX_P61 AG7 GLU G 94 ? LEU G 106 ? GLU 1 94 LEU 1 106 1 ? 13 HELX_P HELX_P62 AG8 GLY G 156 ? PHE G 163 ? GLY 1 156 PHE 1 163 1 ? 8 HELX_P HELX_P63 AG9 LYS G 170 ? TYR G 181 ? LYS 1 170 TYR 1 181 1 ? 12 HELX_P HELX_P64 AH1 GLY G 190 ? SER G 200 ? GLY 1 190 SER 1 200 1 ? 11 HELX_P HELX_P65 AH2 SER G 200 ? HIS G 206 ? SER 1 200 HIS 1 206 1 ? 7 HELX_P HELX_P66 AH3 SER G 222 ? ARG G 232 ? SER 1 222 ARG 1 232 1 ? 11 HELX_P HELX_P67 AH4 PRO G 241 ? ASN G 252 ? PRO 1 241 ASN 1 252 1 ? 12 HELX_P HELX_P68 AH5 SER H 123 ? LEU H 135 ? SER B 123 LEU B 135 1 ? 13 HELX_P HELX_P69 AH6 VAL H 144 ? GLU H 150 ? VAL B 144 GLU B 150 1 ? 7 HELX_P HELX_P70 AH7 ARG H 284 ? CYS H 300 ? ARG B 284 CYS B 300 1 ? 17 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? D CYS 300 SG ? ? ? 1_555 J ZN . ZN ? ? A CYS 300 A ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? ? metalc2 metalc ? ? D HIS 303 ND1 ? ? ? 1_555 J ZN . ZN ? ? A HIS 303 A ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? metalc3 metalc ? ? D HIS 320 NE2 ? ? ? 1_555 J ZN . ZN ? ? A HIS 320 A ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? metalc4 metalc ? ? D CYS 322 SG ? ? ? 1_555 J ZN . ZN ? ? A CYS 322 A ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? ? metalc5 metalc ? ? H CYS 300 SG ? ? ? 1_555 L ZN . ZN ? ? B CYS 300 B ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? ? metalc6 metalc ? ? H HIS 303 ND1 ? ? ? 1_555 L ZN . ZN ? ? B HIS 303 B ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? metalc7 metalc ? ? H HIS 320 NE2 ? ? ? 1_555 L ZN . ZN ? ? B HIS 320 B ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? metalc8 metalc ? ? H CYS 322 SG ? ? ? 1_555 L ZN . ZN ? ? B CYS 322 B ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? D CYS 300 ? A CYS 300 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? A ZN 701 ? 1_555 ND1 ? D HIS 303 ? A HIS 303 ? 1_555 106.6 ? 2 SG ? D CYS 300 ? A CYS 300 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? A ZN 701 ? 1_555 NE2 ? D HIS 320 ? A HIS 320 ? 1_555 102.4 ? 3 ND1 ? D HIS 303 ? A HIS 303 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? A ZN 701 ? 1_555 NE2 ? D HIS 320 ? A HIS 320 ? 1_555 120.5 ? 4 SG ? D CYS 300 ? A CYS 300 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? A ZN 701 ? 1_555 SG ? D CYS 322 ? A CYS 322 ? 1_555 106.6 ? 5 ND1 ? D HIS 303 ? A HIS 303 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? A ZN 701 ? 1_555 SG ? D CYS 322 ? A CYS 322 ? 1_555 111.2 ? 6 NE2 ? D HIS 320 ? A HIS 320 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? A ZN 701 ? 1_555 SG ? D CYS 322 ? A CYS 322 ? 1_555 108.4 ? 7 SG ? H CYS 300 ? B CYS 300 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? B ZN 701 ? 1_555 ND1 ? H HIS 303 ? B HIS 303 ? 1_555 106.6 ? 8 SG ? H CYS 300 ? B CYS 300 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? B ZN 701 ? 1_555 NE2 ? H HIS 320 ? B HIS 320 ? 1_555 102.4 ? 9 ND1 ? H HIS 303 ? B HIS 303 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? B ZN 701 ? 1_555 NE2 ? H HIS 320 ? B HIS 320 ? 1_555 120.5 ? 10 SG ? H CYS 300 ? B CYS 300 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? B ZN 701 ? 1_555 SG ? H CYS 322 ? B CYS 322 ? 1_555 106.7 ? 11 ND1 ? H HIS 303 ? B HIS 303 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? B ZN 701 ? 1_555 SG ? H CYS 322 ? B CYS 322 ? 1_555 111.2 ? 12 NE2 ? H HIS 320 ? B HIS 320 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? B ZN 701 ? 1_555 SG ? H CYS 322 ? B CYS 322 ? 1_555 108.5 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASN 18 A . ? ASN 18 4 PRO 19 A ? PRO 19 4 1 -5.57 2 ASN 18 B . ? ASN 18 5 PRO 19 B ? PRO 19 5 1 -5.37 3 ASN 18 C . ? ASN 18 6 PRO 19 C ? PRO 19 6 1 -11.81 4 ASN 18 E . ? ASN 18 3 PRO 19 E ? PRO 19 3 1 -5.26 5 ASN 18 F . ? ASN 18 2 PRO 19 F ? PRO 19 2 1 -5.42 6 ASN 18 G . ? ASN 18 1 PRO 19 G ? PRO 19 1 1 -4.26 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 6 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 6 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA2 5 6 ? parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 5 6 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? parallel AB2 4 5 ? parallel AB2 5 6 ? parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? parallel AB3 4 5 ? parallel AB3 5 6 ? parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? parallel AB4 3 4 ? parallel AB4 4 5 ? parallel AB4 5 6 ? parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 80 ? 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