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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.566 ? 22003 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.985 ? 2230 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.045 ? 2542 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 2755 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8QE8 _struct.title 'Structure of the non-canonical CTLH E3 substrate receptor WDR26 bound to NMNAT1 substrate' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8QE8 _struct_keywords.text 'E3 ubiquitin ligase, CTLH, GID, NMNAT1, YPEL5, NAD, NADH, LIGASE' _struct_keywords.pdbx_keywords LIGASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 3 ? 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ALA 6 63 ALA 6 73 1 ? 11 HELX_P HELX_P45 51 TRP C 85 ? TRP C 85 ? TRP 6 85 TRP 6 85 1 ? 1 HELX_P HELX_P46 16 THR C 95 ? LEU C 106 ? THR 6 95 LEU 6 106 1 ? 12 HELX_P HELX_P47 53 ASP C 158 ? ALA C 164 ? ASP 6 158 ALA 6 164 1 ? 7 HELX_P HELX_P48 54 SER C 171 ? ASN C 180 ? SER 6 171 ASN 6 180 1 ? 10 HELX_P HELX_P49 55 ASN C 191 ? TYR C 198 ? ASN 6 191 TYR 6 198 1 ? 8 HELX_P HELX_P50 56 ASP C 201 ? HIS C 206 ? ASP 6 201 HIS 6 206 1 ? 6 HELX_P HELX_P51 57 SER C 223 ? ARG C 231 ? SER 6 223 ARG 6 231 1 ? 9 HELX_P HELX_P52 58 ASP C 242 ? HIS C 251 ? ASP 6 242 HIS 6 251 1 ? 10 HELX_P HELX_P53 61 GLN H 122 ? LEU H 135 ? GLN B 122 LEU B 135 1 ? 14 HELX_P HELX_P54 61 VAL H 144 ? GLU H 150 ? VAL B 144 GLU B 150 1 ? 7 HELX_P HELX_P55 63 GLN H 286 ? ARG H 299 ? GLN B 286 ARG B 299 1 ? 14 HELX_P HELX_P56 66 GLN D 286 ? ARG D 299 ? GLN A 286 ARG A 299 1 ? 14 HELX_P HELX_P57 61 VAL D 144 ? GLU D 150 ? VAL A 144 GLU A 150 1 ? 7 HELX_P HELX_P58 61 GLN D 122 ? LEU D 135 ? GLN A 122 LEU A 135 1 ? 14 HELX_P HELX_P59 67 ASN A 22 ? THR A 38 ? ASN 4 22 THR 4 38 1 ? 17 HELX_P HELX_P60 68 ALA A 63 ? ALA A 73 ? ALA 4 63 ALA 4 73 1 ? 11 HELX_P HELX_P61 69 TRP A 85 ? LEU A 88 ? TRP 4 85 LEU 4 88 1 ? 4 HELX_P HELX_P62 70 THR A 95 ? LEU A 106 ? THR 4 95 LEU 4 106 1 ? 12 HELX_P HELX_P63 71 ASP A 158 ? ALA A 164 ? ASP 4 158 ALA 4 164 1 ? 7 HELX_P HELX_P64 72 SER A 171 ? ASN A 180 ? SER 4 171 ASN 4 180 1 ? 10 HELX_P HELX_P65 73 ASN A 191 ? TYR A 198 ? ASN 4 191 TYR 4 198 1 ? 8 HELX_P HELX_P66 74 ASP A 201 ? HIS A 206 ? ASP 4 201 HIS 4 206 1 ? 6 HELX_P HELX_P67 75 SER A 223 ? ARG A 231 ? SER 4 223 ARG 4 231 1 ? 9 HELX_P HELX_P68 76 ASP A 242 ? LYS A 250 ? ASP 4 242 LYS 4 250 1 ? 9 HELX_P HELX_P69 77 SER A 256 ? ASP A 260 ? SER 4 256 ASP 4 260 1 ? 5 HELX_P HELX_P70 78 PRO A 269 ? ASN A 273 ? PRO 4 269 ASN 4 273 1 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? D CYS 300 SG ? ? ? 1_555 J ZN . ZN ? ? A CYS 300 A ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? ? metalc2 metalc ? ? D HIS 303 ND1 ? ? ? 1_555 J ZN . ZN ? ? A HIS 303 A ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? metalc3 metalc ? ? D HIS 320 NE2 ? ? ? 1_555 J ZN . ZN ? ? A HIS 320 A ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? metalc4 metalc ? ? D CYS 322 SG ? ? ? 1_555 J ZN . ZN ? ? A CYS 322 A ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? ? metalc5 metalc ? ? H CYS 300 SG ? ? ? 1_555 L ZN . ZN ? ? B CYS 300 B ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? ? metalc6 metalc ? ? H HIS 303 ND1 ? ? ? 1_555 L ZN . ZN ? ? B HIS 303 B ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? metalc7 metalc ? ? H HIS 320 NE2 ? ? ? 1_555 L ZN . ZN ? ? B HIS 320 B ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? metalc8 metalc ? ? H CYS 322 SG ? ? ? 1_555 L ZN . ZN ? ? B CYS 322 B ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? D CYS 300 ? A CYS 300 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? A ZN 701 ? 1_555 ND1 ? D HIS 303 ? A HIS 303 ? 1_555 106.6 ? 2 SG ? D CYS 300 ? A CYS 300 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? A ZN 701 ? 1_555 NE2 ? D HIS 320 ? A HIS 320 ? 1_555 102.4 ? 3 ND1 ? D HIS 303 ? A HIS 303 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? A ZN 701 ? 1_555 NE2 ? D HIS 320 ? A HIS 320 ? 1_555 120.5 ? 4 SG ? D CYS 300 ? A CYS 300 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? A ZN 701 ? 1_555 SG ? D CYS 322 ? A CYS 322 ? 1_555 106.6 ? 5 ND1 ? D HIS 303 ? A HIS 303 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? A ZN 701 ? 1_555 SG ? D CYS 322 ? A CYS 322 ? 1_555 111.2 ? 6 NE2 ? D HIS 320 ? A HIS 320 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? A ZN 701 ? 1_555 SG ? D CYS 322 ? A CYS 322 ? 1_555 108.4 ? 7 SG ? H CYS 300 ? B CYS 300 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? B ZN 701 ? 1_555 ND1 ? H HIS 303 ? B HIS 303 ? 1_555 106.6 ? 8 SG ? H CYS 300 ? B CYS 300 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? B ZN 701 ? 1_555 NE2 ? H HIS 320 ? B HIS 320 ? 1_555 102.4 ? 9 ND1 ? H HIS 303 ? B HIS 303 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? B ZN 701 ? 1_555 NE2 ? H HIS 320 ? B HIS 320 ? 1_555 120.5 ? 10 SG ? H CYS 300 ? B CYS 300 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? B ZN 701 ? 1_555 SG ? H CYS 322 ? B CYS 322 ? 1_555 106.7 ? 11 ND1 ? H HIS 303 ? B HIS 303 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? B ZN 701 ? 1_555 SG ? H CYS 322 ? B CYS 322 ? 1_555 111.2 ? 12 NE2 ? H HIS 320 ? B HIS 320 ? 1_555 ZN ? L ZN . ? B ZN 701 ? 1_555 SG ? H CYS 322 ? B CYS 322 ? 1_555 108.5 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASN 18 A . ? ASN 18 4 PRO 19 A ? PRO 19 4 1 -5.57 2 ASN 18 B . ? ASN 18 5 PRO 19 B ? PRO 19 5 1 -5.37 3 ASN 18 C . ? ASN 18 6 PRO 19 C ? PRO 19 6 1 -11.81 4 ASN 18 E . ? ASN 18 3 PRO 19 E ? PRO 19 3 1 -5.26 5 ASN 18 F . ? ASN 18 2 PRO 19 F ? PRO 19 2 1 -5.42 6 ASN 18 G . ? ASN 18 1 PRO 19 G ? PRO 19 1 1 -4.26 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 1 ? AB2 ? 1 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 6 ? AB9 ? 6 ? AC1 ? 6 ? AC2 ? 6 ? AC3 ? 6 ? AC4 ? 6 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? parallel AB8 3 4 ? parallel AB8 4 5 ? parallel AB8 5 6 ? parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? parallel AB9 4 5 ? parallel AB9 5 6 ? parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? parallel AC1 5 6 ? parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? parallel AC2 5 6 ? parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? parallel AC3 4 5 ? parallel AC3 5 6 ? parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? parallel AC4 4 5 ? parallel AC4 5 6 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TYR H 330 ? 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