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D N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP UVSSA_HUMAN Q2YD98 ? 1 ;MDQKLSKLVEELTTSGEPRLNPEKMKELKKICKSSEEQLSRAYRLLIAQLTQEHAEIRLSAFQIVEELFVRSHQFRMLVV SNFQEFLELTLGTDPAQPLPPPREAAQRLRQATTRAVEGWNEKFGEAYKKLALGYHFLRHNKKVDFQDTNARSLAERKRE EEKQKHLDKIYQERASQAEREMQEMSGEIESCLTEVESCFRLLVPFDFDPNPETESLGMASGMSDALRSSCAGQVGPCRS GTPDPRDGEQPCCSRDLPASAGHPRAGGGAQPSQTATGDPSDEDEDSDLEEFVRSHGLGSHKYTLDVELCSEGLKVQENE DNLALIHAARDTLKLIRNKFLPAVCSWIQRFTRVGTHGGCLKRAIDLKAELELVLRKYKELDIEPEGGERRRTEALGDAE EDEDDEDFVEVPEKEGYEPHIPDHLRPEYGLEAAPEKDTVVRCLRTRTRMDEEVSDPTSAAAQLRQLRDHLPPPSSASPS RALPEPQEAQKLAAERARAPVVPYGVDLHYWGQELPTAGKIVKSDSQHRFWKPSEVEEEVVNADISEMLRSRHITFAGKF EPVQHWCRAPRPDGRLCERQDRLKCPFHGKIVPRDDEGRPLDPEDRAREQRRQLQKQERPEWQDPELMRDVEAATGQDLG SSRYSGKGRGKKRRYPSLTNLKAQADTARARIGRKVFAKAAVRRVVAAMNRMDQKKHEKFSNQFNYALN ; 1 2 UNP ERCC8_HUMAN Q13216 ? 2 ;MLGFLSARQTGLEDPLRLRRAESTRRVLGLELNKDRDVERIHGGGINTLDIEPVEGRYMLSGGSDGVIVLYDLENSSRQS YYTCKAVCSIGRDHPDVHRYSVETVQWYPHDTGMFTSSSFDKTLKVWDTNTLQTADVFNFEETVYSHHMSPVSTKHCLVA VGTRGPKVQLCDLKSGSCSHILQGHRQEILAVSWSPRYDYILATASADSRVKLWDVRRASGCLITLDQHNGKKSQAVESA NTAHNGKVNGLCFTSDGLHLLTVGTDNRMRLWNSSNGENTLVNYGKVCNNSKKGLKFTVSCGCSSEFVFVPYGSTIAVYT VYSGEQITMLKGHYKTVDCCVFQSNFQELYSGSRDCNILAWVPSLYEPVPDDDETTTKSQLNPAFEDAWSSSDEEG ; 1 3 UNP DDB1_HUMAN Q16531 ? 3 ;MSYNYVVTAQKPTAVNGCVTGHFTSAEDLNLLIAKNTRLEIYVVTAEGLRPVKEVGMYGKIAVMELFRPKGESKDLLFIL TAKYNACILEYKQSGESIDIITRAHGNVQDRIGRPSETGIIGIIDPECRMIGLRLYDGLFKVIPLDRDNKELKAFNIRLE ELHVIDVKFLYGCQAPTICFVYQDPQGRHVKTYEVSLREKEFNKGPWKQENVEAEASMVIAVPEPFGGAIIIGQESITYH NGDKYLAIAPPIIKQSTIVCHNRVDPNGSRYLLGDMEGRLFMLLLEKEEQMDGTVTLKDLRVELLGETSIAECLTYLDNG VVFVGSRLGDSQLVKLNVDSNEQGSYVVAMETFTNLGPIVDMCVVDLERQGQGQLVTCSGAFKEGSLRIIRNGIGIHEHA SIDLPGIKGLWPLRSDPNRETDDTLVLSFVGQTRVLMLNGEEVEETELMGFVDDQQTFFCGNVAHQQLIQITSASVRLVS QEPKALVSEWKEPQAKNISVASCNSSQVVVAVGRALYYLQIHPQELRQISHTEMEHEVACLDITPLGDSNGLSPLCAIGL WTDISARILKLPSFELLHKEMLGGEIIPRSILMTTFESSHYLLCALGDGALFYFGLNIETGLLSDRKKVTLGTQPTVLRT FRSLSTTNVFACSDRPTVIYSSNHKLVFSNVNLKEVNYMCPLNSDGYPDSLALANNSTLTIGTIDEIQKLHIRTVPLYES PRKICYQEVSQCFGVLSSRIEVQDTSGGTTALRPSASTQALSSSVSSSKLFSSSTAPHETSFGEEVEVHNLLIIDQHTFE VLHAHQFLQNEYALSLVSCKLGKDPNTYFIVGTAMVYPEEAEPKQGRIVVFQYSDGKLQTVAEKEVKGAVYSMVEFNGKL LASINSTVRLYEWTTEKELRTECNHYNNIMALYLKTKGDFILVGDLMRSVLLLAYKPMEGNFEEIARDFNPNWMSAVEIL DDDNFLGAENAFNLFVCQKDSAATTDEERQHLQEVGLFHLGEFVNVFCHGSLVMQNLGETSTPTQGSVLFGTVNGMIGLV TSLSESWYNLLLDMQNRLNKVIKSVGKIEHSFWRSFHTERKTEPATGFIDGDLIESFLDISRPKMQEVVANLQYDDGSGM KREATADDLIKVVEELTRIH ; 1 4 UNP DDA1_HUMAN Q9BW61 ? 4 ;MADFLKGLPVYNKSNFSRFHADSVCKASNRRPSVYLPTREYPSEQIIVTEKTNILLRYLHQQWDKKNAAKKRDQEQVELE GESSAPPRKVARTDSPDMHEDT ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8QH5 D 21 ? 729 ? 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'expression tag' 152 102 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'electron microscopy' 'not applicable' 2 1 'gel filtration' ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 MET A 21 ? 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ASN C 53 GLN C 61 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PRO 121 A . ? PRO 101 D PRO 122 A ? PRO 102 D 1 1.82 2 GLU 244 C . ? GLU 224 B PRO 245 C ? PRO 225 B 1 -0.16 3 GLY 377 C . ? GLY 357 B PRO 378 C ? PRO 358 B 1 -1.90 4 LEU 591 C . ? LEU 571 B PRO 592 C ? PRO 572 B 1 5.48 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 9 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 5 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 2 ? 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LEU B 32 ? LEU A 30 LEU A 32 AA1 2 ILE B 358 ? PRO B 363 ? ILE A 358 PRO A 363 AA1 3 GLU B 348 ? SER B 353 ? GLU A 348 SER A 353 AA1 4 VAL B 337 ? GLN B 343 ? VAL A 337 GLN A 343 AA2 1 ARG B 36 ? VAL B 38 ? ARG A 36 VAL A 38 AA2 2 TYR B 82 ? CYS B 84 ? TYR A 82 CYS A 84 AA3 1 ILE B 46 ? ILE B 51 ? ILE A 46 ILE A 51 AA3 2 TYR B 58 ? GLY B 63 ? TYR A 58 GLY A 63 AA3 3 ILE B 68 ? ASP B 72 ? ILE A 68 ASP A 72 AA3 4 ALA B 86 ? ILE B 90 ? ALA A 86 ILE A 90 AA4 1 VAL B 102 ? TRP B 107 ? VAL A 102 TRP A 107 AA4 2 PHE B 115 ? SER B 119 ? PHE A 115 SER A 119 AA4 3 THR B 123 ? TRP B 127 ? THR A 123 TRP A 127 AA4 4 THR B 134 ? ASN B 139 ? THR A 134 ASN A 139 AA5 1 VAL B 144 ? MET B 149 ? VAL A 144 MET A 149 AA5 2 VAL B 159 ? THR B 163 ? VAL A 159 THR A 163 AA5 3 VAL B 168 ? ASP B 172 ? VAL A 168 ASP A 172 AA5 4 SER B 177 ? LEU B 182 ? SER A 177 LEU A 182 AA6 1 ILE B 189 ? TRP B 194 ? ILE A 189 TRP A 194 AA6 2 ILE B 201 ? SER B 206 ? ILE A 201 SER A 206 AA6 3 VAL B 211 ? ASP B 215 ? VAL A 211 ASP A 215 AA6 4 CYS B 222 ? THR B 225 ? CYS A 222 THR A 225 AA7 1 VAL B 248 ? PHE B 253 ? VAL A 248 PHE A 253 AA7 2 HIS B 259 ? GLY B 264 ? HIS A 259 GLY A 264 AA7 3 ARG B 268 ? ASN B 273 ? ARG A 268 ASN A 273 AA8 1 THR B 298 ? VAL B 299 ? THR A 298 VAL A 299 AA8 2 PHE B 307 ? TYR B 312 ? PHE A 307 TYR A 312 AA8 3 THR B 315 ? THR B 320 ? THR A 315 THR A 320 AA8 4 THR B 328 ? LEU B 330 ? THR A 328 LEU A 330 AA9 1 VAL C 1024 ? HIS C 1029 ? VAL B 1004 HIS B 1009 AA9 2 VAL C 1048 ? THR C 1052 ? VAL B 1028 THR B 1032 AA9 3 GLY C 1058 ? SER C 1062 ? GLY B 1038 SER B 1042 AA9 4 ASN C 24 ? THR C 28 ? ASN B 4 THR B 8 AA9 5 PHE C 1108 ? ASP C 1110 ? PHE B 1088 ASP B 1090 AB1 1 GLY C 37 ? GLY C 41 ? GLY B 17 GLY B 21 AB1 2 ASN C 50 ? LYS C 55 ? ASN B 30 LYS B 35 AB1 3 ARG C 58 ? VAL C 64 ? ARG B 38 VAL B 44 AB1 4 LEU C 69 ? GLY C 76 ? LEU B 49 GLY B 56 AB1 5 VAL D 34 ? TYR D 35 ? VAL C 34 TYR C 35 AB2 1 ILE C 81 ? PHE C 87 ? ILE B 61 PHE B 67 AB2 2 LEU C 96 ? THR C 101 ? 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LYS B 1121 ALA B 1124 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N GLU B 31 ? 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O LEU A 261 AA7 2 3 N GLY B 264 ? N GLY A 264 O ARG B 268 ? O ARG A 268 AA8 1 2 N THR B 298 ? N THR A 298 O PHE B 309 ? O PHE A 309 AA8 2 3 N VAL B 310 ? N VAL A 310 O ALA B 317 ? O ALA A 317 AA8 3 4 N VAL B 318 ? N VAL A 318 O THR B 328 ? O THR A 328 AA9 1 2 N ASN C 1025 ? N ASN B 1005 O GLY C 1051 ? O GLY B 1031 AA9 2 3 N PHE C 1050 ? N PHE B 1030 O GLY C 1058 ? O GLY B 1038 AA9 3 4 O LEU C 1059 ? O LEU B 1039 N VAL C 27 ? N VAL B 7 AA9 4 5 N VAL C 26 ? N VAL B 6 O ILE C 1109 ? O ILE B 1089 AB1 1 2 N GLY C 41 ? N GLY B 21 O ASN C 50 ? O ASN B 30 AB1 2 3 N LEU C 51 ? N LEU B 31 O TYR C 62 ? O TYR B 42 AB1 3 4 N LEU C 59 ? N LEU B 39 O VAL C 75 ? O VAL B 55 AB1 4 5 N GLU C 74 ? N GLU B 54 O TYR D 35 ? O TYR C 35 AB2 1 2 N GLU C 85 ? N GLU B 65 O PHE C 98 ? O PHE B 78 AB2 2 3 N ILE C 99 ? N ILE B 79 O CYS C 107 ? O CYS B 87 AB2 3 4 N ILE C 108 ? N ILE B 88 O ALA C 124 ? O ALA B 104 AB2 4 5 N ARG C 123 ? N ARG B 103 O GLN D 45 ? O GLN C 45 AB2 5 6 O ILE D 46 ? O ILE C 46 N LEU C 172 ? 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O ILE B 529 AC4 1 2 N ALA C 559 ? N ALA B 539 O GLY C 579 ? O GLY B 559 AC4 2 3 N ILE C 578 ? N ILE B 558 O ARG C 587 ? O ARG B 567 AC4 3 4 N ILE C 588 ? N ILE B 568 O HIS C 598 ? O HIS B 578 AC5 1 2 N LEU C 612 ? N LEU B 592 O LEU C 623 ? O LEU B 603 AC5 2 3 N CYS C 624 ? N CYS B 604 O PHE C 632 ? O PHE B 612 AC5 3 4 N GLY C 635 ? N GLY B 615 O SER C 644 ? O SER B 624 AC6 1 2 N ARG C 659 ? N ARG B 639 O PHE C 670 ? O PHE B 650 AC6 2 3 N VAL C 669 ? N VAL B 649 O ILE C 679 ? O ILE B 659 AC6 3 4 N VAL C 678 ? N VAL B 658 O SER C 689 ? O SER B 669 AC7 1 2 N ARG C 742 ? N ARG B 722 O LEU C 756 ? O LEU B 736 AC7 2 3 N VAL C 762 ? N VAL B 742 O THR C 770 ? O THR B 750 AC8 1 2 N ARG C 742 ? N ARG B 722 O LEU C 756 ? O LEU B 736 AC8 2 3 N VAL C 755 ? N VAL B 735 O LEU C 812 ? O LEU B 792 AC8 3 4 N LEU C 811 ? N LEU B 791 O HIS C 825 ? O HIS B 805 AC8 4 5 O GLN C 826 ? O GLN B 806 N SER C 784 ? N SER B 764 AC9 1 2 N VAL C 837 ? N VAL B 817 O ILE C 850 ? O ILE B 830 AC9 2 3 N PHE C 849 ? N PHE B 829 O PHE C 871 ? O PHE B 851 AC9 3 4 N SER C 874 ? N SER B 854 O LYS C 877 ? O LYS B 857 AD1 1 2 N SER C 892 ? N SER B 872 O SER C 903 ? O SER B 883 AD1 2 3 N ALA C 902 ? N ALA B 882 O ARG C 909 ? O ARG B 889 AD1 3 4 N LEU C 910 ? N LEU B 890 O GLU C 922 ? O GLU B 902 AD2 1 2 N TYR C 933 ? N TYR B 913 O GLY C 944 ? O GLY B 924 AD2 2 3 N VAL C 943 ? N VAL B 923 O LEU C 951 ? O LEU B 931 AD2 3 4 N LEU C 952 ? N LEU B 932 O ALA C 966 ? O ALA B 946 AD3 1 2 N ALA C 976 ? N ALA B 956 O ALA C 988 ? O ALA B 968 AD3 2 3 N GLY C 987 ? N GLY B 967 O PHE C 995 ? O PHE B 975 AD3 3 4 N LEU C 994 ? N LEU B 974 O PHE C 1018 ? O PHE B 998 AD4 1 2 N PHE C 1096 ? N PHE B 1076 O GLU C 1103 ? O GLU B 1083 AD5 1 2 N TYR C 1134 ? N TYR B 1114 O ARG C 1142 ? O ARG B 1122 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 H B ASP 744 ? ? O B GLY 748 ? ? 1.54 2 1 H A LYS 247 ? ? OG1 A THR 265 ? ? 1.58 3 1 H B ALA 869 ? ? 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We expect these are oxidized products or crosslinking side products. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol 'RIGID BODY FIT' # loop_ _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 1 7OO3 P 1-396 CSA P 1-396 PDB 'experimental model' 7OO3 1 2 1 7OO3 T 1-1140 'DDB1(BPA/BPC)' T 1-1140 PDB 'experimental model' 7OO3 1 3 1 6ZX9 A 393-709 'DDB1(BPB)' A 393-709 PDB 'experimental model' 6ZX9 2 4 1 6UD7 D 4-76 DDA1 D 4-76 PDB 'experimental model' 6UD7 3 5 1 . . . 'UVSSA(VHS)' A 1-150 AlphaFold 'in silico model' Q2YD98 4 # _em_3d_reconstruction.entry_id 8QH5 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details 'Combined from focused maps reconstructed with various particle numbers.' _em_3d_reconstruction.resolution 3.4 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 294142 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'Ternary complex of UVSSA(VHS)-CSA-DDB1-DDA1' _em_entity_assembly.details 'Ternary complex of ubiquitinated UVSSA-USP7-CSA-DDB1-DDA1. USP7 is invisible in the cryoEM map.' _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list 2,3,4,1 # _em_imaging.entry_id 8QH5 _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.details 'Collected on Krios 1 at Netherlands Center for Electron Nanoscopy (NeCEN)' _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_defocus_max 3000 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 81000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 100 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R1.2/1.3' _em_sample_support.details 'The grid was coated with graphene oxide.' _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 8QH5 _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 8QH5 _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 8QH5 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 D MET -19 ? 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