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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP SPIKE_ADE1P P35774 ? 1 ;MTKRVRLSDSFNPVYPYEDESTSQHPFINPGFISPNGFTQSPNGVLTLKCLTPLTTTGGSLQLKVGGGLTVDDTNGFLKE NISATTPLVKTGHSIGLPLGAGLGTNENKLCIKLGQGLTFNSNNICIDDNINTLWTGVNPTEANCQIMNSSESNDCKLIL TLVKTGALVTAFVYVIGVSNNFNMLTTHRNINFTAELFFDSTGNLLTRLSSLKTPLNHKSGQNMATGAITNAKGFMPSTT AYPFNDNSREKENYIYGTCYYTASDRTAFPIDISVMLNRRAINDETSYCIRITWSWNTGDAPEVQTSATTLVTSPFTFYY IREDD ; 1 2 UNP MCP_HUMAN P15529 ? 2 ;MEPPGRRECPFPSWRFPGLLLAAMVLLLYSFSDACEEPPTFEAMELIGKPKPYYEIGERVDYKCKKGYFYIPPLATHTIC DRNHTWLPVSDDACYRETCPYIRDPLNGQAVPANGTYEFGYQMHFICNEGYYLIGEEILYCELKGSVAIWSGKPPICEKV LCTPPPKIKNGKHTFSEVEVFEYLDAVTYSCDPAPGPDPFSLIGESTIYCGDNSVWSRAAPECKVVKCRFPVVENGKQIS GFGKKFYYKATVMFECDKGFYLDGSDTIVCDSNSTWDPPVPKCLKVLPPSSTKPPALSHSVSTSSTTKSPASSASGPRPT YKPPVSNYPGYPKPEEGILDSLDVWVIAVIVIAIVVGVAVICVVPYRYLQRRKKKGTYLTDETHREVKFTSL ; 1 3 UNP DSG2_HUMAN Q14126 ? 3 ;MARSPGRAYALLLLLICFNVGSGLHLQVLSTRNENKLLPKHPHLVRQKRAWITAPVALREGEDLSKKNPIAKIHSDLAEE RGLKITYKYTGKGITEPPFGIFVFNKDTGELNVTSILDREETPFFLLTGYALDARGNNVEKPLELRIKVLDINDNEPVFT QDVFVGSVEELSAAHTLVMKINATDADEPNTLNSKISYRIVSLEPAYPPVFYLNKDTGEIYTTSVTLDREEHSSYTLTVE ARDGNGEVTDKPVKQAQVQIRILDVNDNIPVVENKVLEGMVEENQVNVEVTRIKVFDADEIGSDNWLANFTFASGNEGGY FHIETDAQTNEGIVTLIKEVDYEEMKNLDFSVIVANKAAFHKSIRSKYKPTPIPIKVKVKNVKEGIHFKSSVISIYVSES MDRSSKGQIIGNFQAFDEDTGLPAHARYVKLEDRDNWISVDSVTSEIKLAKLPDFESRYVQNGTYTVKIVAISEDYPRKT ITGTVLINVEDINDNCPTLIEPVQTICHDAEYVNVTAEDLDGHPNSGPFSFSVIDKPPGMAEKWKIARQESTSVLLQQSE KKLGRSEIQFLISDNQGFSCPEKQVLTLTVCECLHGSGCREAQHDSYVGLGPAAIALMILAFLLLLLVPLLLLMCHCGKG AKGFTPIPGTIEMLHPWNNEGAPPEDKVVPSFLPVDQGGSLVGRNGVGGMAKEATMKGSSSASIVKGQHEMSEMDGRWEE HRSLLSGRATQFTGATGAIMTTETTKTARATGASRDMAGAQAAAVALNEEFLRNYFTDKAASYTEEDENHTAKDCLLVYS QEETESLNASIGCCSFIEGELDDRFLDDLGLKFKTLAEVCLGQKIDINKEIEQRQKPATETSMNTASHSLCEQTMVNSEN TYSSGSSFPVPKSLQEANAEKVTQEIVTERSVSSRQAQKVATPLPDPMASRNVIATETSYVTGSTMPPTTVILGPSQPQS LIVTERVYAPASTLVDQPYANEGTVVVTERVIQPHGGGSNPLEGTQHLQDVPYVMVRERESFLAPSSGVQPTLAMPNIAV GQNVTVTERVLAPASTLQSSYQIPTENSMTARNTTVSGAGVPGPLPDFGLEESGHSNSTITTSSTRVTKHSTVQHSYS ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8QK3 B 1 ? 325 ? P35774 1 ? 325 ? 1 325 2 1 8QK3 A 1 ? 325 ? P35774 1 ? 325 ? 1 325 3 1 8QK3 C 1 ? 325 ? P35774 1 ? 325 ? 1 325 4 2 8QK3 E 1 ? 392 ? P15529 1 ? 392 ? -33 358 5 3 8QK3 D 1 ? 1118 ? Q14126 1 ? 1118 ? -48 1069 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8QK3 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8QK3 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 7701 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.541 ? 10499 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.645 ? 1035 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.044 ? 1201 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1361 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8QK3 _struct.title 'Human Adenovirus type 11 fiber knob in complex with its cell receptors, Desmoglein-2 and CD46' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8QK3 _struct_keywords.text 'adenovirus, cell entry, receptor binding, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 3 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 179 ? MET A 184 ? SER B 179 MET B 184 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 LEU A 185 ? HIS A 188 ? LEU B 185 HIS B 188 5 ? 4 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN A 231 ? MET A 236 ? ASN B 231 MET B 236 5 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG A 249 ? GLU A 252 ? ARG B 249 GLU B 252 5 ? 4 HELX_P HELX_P5 AA5 SER B 179 ? MET B 184 ? SER A 179 MET A 184 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 LEU B 185 ? HIS B 188 ? LEU A 185 HIS A 188 5 ? 4 HELX_P HELX_P7 AA7 ALA B 232 ? MET B 236 ? ALA A 232 MET A 236 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 AA8 ASP B 246 ? GLU B 252 ? ASP A 246 GLU A 252 5 ? 7 HELX_P HELX_P9 AA9 SER C 179 ? MET C 184 ? SER C 179 MET C 184 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 LEU C 185 ? HIS C 188 ? LEU C 185 HIS C 188 5 ? 4 HELX_P HELX_P11 AB2 ASN C 231 ? MET C 236 ? ASN C 231 MET C 236 5 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 ARG C 249 ? GLU C 252 ? ARG C 249 GLU C 252 5 ? 4 HELX_P HELX_P13 AB4 SER D 90 ? ASP D 92 ? SER E 56 ASP E 58 5 ? 3 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? D CYS 35 SG ? ? ? 1_555 D CYS 80 SG ? ? E CYS 1 E CYS 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf2 disulf ? ? D CYS 64 SG ? ? ? 1_555 D CYS 94 SG ? ? E CYS 30 E CYS 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf3 disulf ? ? D CYS 127 SG ? ? ? 1_555 D CYS 157 SG ? ? E CYS 93 E CYS 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PRO 72 D . ? PRO 38 E PRO 73 D ? PRO 39 E 1 0.35 2 GLU 204 E . ? GLU 155 D PRO 205 E ? PRO 156 D 1 7.55 3 TYR 207 E . ? TYR 158 D PRO 208 E ? PRO 159 D 1 -2.50 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 THR A 133 ? 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A GLY 104 105 1 Y 1 B THR 105 ? A THR 105 106 1 Y 1 B ASN 106 ? A ASN 106 107 1 Y 1 B GLU 107 ? A GLU 107 108 1 Y 1 B ASN 108 ? A ASN 108 109 1 Y 1 B LYS 109 ? A LYS 109 110 1 Y 1 B LEU 110 ? A LEU 110 111 1 Y 1 B CYS 111 ? A CYS 111 112 1 Y 1 B ILE 112 ? A ILE 112 113 1 Y 1 B LYS 113 ? A LYS 113 114 1 Y 1 B LEU 114 ? A LEU 114 115 1 Y 1 B GLY 115 ? A GLY 115 116 1 Y 1 B GLN 116 ? A GLN 116 117 1 Y 1 B GLY 117 ? A GLY 117 118 1 Y 1 B LEU 118 ? A LEU 118 119 1 Y 1 B THR 119 ? A THR 119 120 1 Y 1 B PHE 120 ? A PHE 120 121 1 Y 1 B ASN 121 ? A ASN 121 122 1 Y 1 B SER 122 ? A SER 122 123 1 Y 1 B ASN 123 ? A ASN 123 124 1 Y 1 B ASN 124 ? A ASN 124 125 1 Y 1 B ILE 125 ? A ILE 125 126 1 Y 1 B CYS 126 ? A CYS 126 127 1 Y 1 B ILE 127 ? A ILE 127 128 1 Y 1 B ASP 128 ? A ASP 128 129 1 Y 1 A MET 1 ? B MET 1 130 1 Y 1 A THR 2 ? B THR 2 131 1 Y 1 A LYS 3 ? B LYS 3 132 1 Y 1 A ARG 4 ? B ARG 4 133 1 Y 1 A VAL 5 ? B VAL 5 134 1 Y 1 A ARG 6 ? B ARG 6 135 1 Y 1 A LEU 7 ? B LEU 7 136 1 Y 1 A SER 8 ? 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