data_8QKX # _entry.id 8QKX # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.385 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8QKX pdb_00008qkx 10.2210/pdb8qkx/pdb WWPDB D_1292133417 ? ? BMRB 34863 ? ? # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2024-02-07 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr . _pdbx_database_status.entry_id 8QKX _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-09-18 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs . _pdbx_database_status.status_code_nmr_data REL _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name BMRB _pdbx_database_related.details 'Solution structure of a bimolecular quadruplex-duplex hybrid containing a V-shaped loop' _pdbx_database_related.db_id 34863 _pdbx_database_related.content_type unspecified # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email weisz@uni-greifswald.de _pdbx_contact_author.name_first Klaus _pdbx_contact_author.name_last Weisz _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-2736-6606 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Vianney, Y.M.' 1 0000-0002-4576-9935 'Weisz, K.' 2 0000-0002-2736-6606 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country DE _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Chemistryselect _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2365-6549 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structural Aspects of Split G-Quadruplexes in Quadruplex-Duplex Hybrid Systems' _citation.year 2024 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1002/slct.202304286 _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Agustin, D.F.' 1 ? primary 'Vianney, Y.M.' 2 ? primary 'Weisz, K.' 3 ? primary 'Wahjudi, M.' 4 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn ;DNA (5'-D(*CP*TP*CP*CP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*AP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*T)-3') ; 7498.800 1 ? ? ? ? 2 polymer syn ;DNA (5'-D(*TP*TP*GP*GP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*AP*GP*TP*T)-3') ; 4366.836 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DG)(DG)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DC)(DT) (DG)(DG)(DG)(DT) ; CTCCAGCTGGGTGAGGGGCTGGGT A ? 2 polydeoxyribonucleotide no no '(DT)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DT)' TTGGAGCTGGAGTT B ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DC n 1 2 DT n 1 3 DC n 1 4 DC n 1 5 DA n 1 6 DG n 1 7 DC n 1 8 DT n 1 9 DG n 1 10 DG n 1 11 DG n 1 12 DT n 1 13 DG n 1 14 DA n 1 15 DG n 1 16 DG n 1 17 DG n 1 18 DG n 1 19 DC n 1 20 DT n 1 21 DG n 1 22 DG n 1 23 DG n 1 24 DT n 2 1 DT n 2 2 DT n 2 3 DG n 2 4 DG n 2 5 DA n 2 6 DG n 2 7 DC n 2 8 DT n 2 9 DG n 2 10 DG n 2 11 DA n 2 12 DG n 2 13 DT n 2 14 DT n # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 1 1 sample 1 24 'synthetic construct' ? 32630 ? 2 1 sample 1 14 'synthetic construct' ? 32630 ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DC 1 1 1 DC DC A . n A 1 2 DT 2 2 2 DT DT A . n A 1 3 DC 3 3 3 DC DC A . n A 1 4 DC 4 4 4 DC DC A . n A 1 5 DA 5 5 5 DA DA A . n A 1 6 DG 6 6 6 DG DG A . n A 1 7 DC 7 7 7 DC DC A . n A 1 8 DT 8 8 8 DT DT A . n A 1 9 DG 9 9 9 DG DG A . n A 1 10 DG 10 10 10 DG DG A . n A 1 11 DG 11 11 11 DG DG A . n A 1 12 DT 12 12 12 DT DT A . n A 1 13 DG 13 13 13 DG DG A . n A 1 14 DA 14 14 14 DA DA A . n A 1 15 DG 15 15 15 DG DG A . n A 1 16 DG 16 16 16 DG DG A . n A 1 17 DG 17 17 17 DG DG A . n A 1 18 DG 18 18 18 DG DG A . n A 1 19 DC 19 19 19 DC DC A . n A 1 20 DT 20 20 20 DT DT A . n A 1 21 DG 21 21 21 DG DG A . n A 1 22 DG 22 22 22 DG DG A . n A 1 23 DG 23 23 23 DG DG A . n A 1 24 DT 24 24 24 DT DT A . n B 2 1 DT 1 25 25 DT DT B . n B 2 2 DT 2 26 26 DT DT B . n B 2 3 DG 3 27 27 DG DG B . n B 2 4 DG 4 28 28 DG DG B . n B 2 5 DA 5 29 29 DA DA B . n B 2 6 DG 6 30 30 DG DG B . n B 2 7 DC 7 31 31 DC DC B . n B 2 8 DT 8 32 32 DT DT B . n B 2 9 DG 9 33 33 DG DG B . n B 2 10 DG 10 34 34 DG DG B . n B 2 11 DA 11 35 35 DA DA B . n B 2 12 DG 12 36 36 DG DG B . n B 2 13 DT 13 37 37 DT DT B . n B 2 14 DT 14 38 38 DT DT B . n # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8QKX _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8QKX _struct.title 'Solution structure of a bimolecular quadruplex-duplex hybrid containing a V-shaped loop' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8QKX _struct_keywords.text 'G-Quadruplex, Quadruplex-Duplex Hybrid, V-shaped loop, DNA' _struct_keywords.pdbx_keywords DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 8QKX 8QKX ? 1 ? 1 2 PDB 8QKX 8QKX ? 2 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8QKX A 1 ? 24 ? 8QKX 1 ? 24 ? 1 24 2 2 8QKX B 1 ? 14 ? 8QKX 25 ? 38 ? 25 38 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'NMR Distance Restraints' 'not applicable' 2 1 'native gel electrophoresis' 'bimolecular but with a mobility rate similar to a three-layered G-quadruplex' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? A DC 1 N3 ? ? ? 1_555 B DG 12 N1 ? ? A DC 1 B DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DC 1 N4 ? ? ? 1_555 B DG 12 O6 ? ? A DC 1 B DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DC 1 O2 ? ? ? 1_555 B DG 12 N2 ? ? A DC 1 B DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DT 2 N3 ? ? ? 1_555 B DA 11 N1 ? ? A DT 2 B DA 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DT 2 O4 ? ? ? 1_555 B DA 11 N6 ? ? A DT 2 B DA 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DT 2 O2 ? ? ? 1_555 B DT 13 N3 ? ? A DT 2 B DT 37 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DT MISPAIR' ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DC 3 N3 ? ? ? 1_555 B DG 10 N1 ? ? A DC 3 B DG 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DC 3 N4 ? ? ? 1_555 B DG 10 O6 ? ? A DC 3 B DG 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DC 3 O2 ? ? ? 1_555 B DG 10 N2 ? ? A DC 3 B DG 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DC 4 N3 ? ? ? 1_555 B DG 9 N1 ? ? A DC 4 B DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DC 4 N4 ? ? ? 1_555 B DG 9 O6 ? ? A DC 4 B DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DC 4 O2 ? ? ? 1_555 B DG 9 N2 ? ? A DC 4 B DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DA 5 N1 ? ? ? 1_555 B DT 8 N3 ? ? A DA 5 B DT 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DA 5 N6 ? ? ? 1_555 B DT 8 O4 ? ? A DA 5 B DT 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DG 6 N1 ? ? ? 1_555 B DC 7 N3 ? ? A DG 6 B DC 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 6 N2 ? ? ? 1_555 B DC 7 O2 ? ? A DG 6 B DC 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DG 6 O6 ? ? ? 1_555 B DC 7 N4 ? ? A DG 6 B DC 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DC 7 N3 ? ? ? 1_555 B DG 6 N1 ? ? A DC 7 B DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DC 7 N4 ? ? ? 1_555 B DG 6 O6 ? ? A DC 7 B DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DC 7 O2 ? ? ? 1_555 B DG 6 N2 ? ? A DC 7 B DG 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DT 8 N3 ? ? ? 1_555 B DA 5 N1 ? ? A DT 8 B DA 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DT 8 O4 ? ? ? 1_555 B DA 5 N6 ? ? A DT 8 B DA 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DG 9 N1 ? ? ? 1_555 A DG 21 O6 ? ? A DG 9 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DG 9 N2 ? ? ? 1_555 A DG 21 N7 ? ? A DG 9 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DG 9 N7 ? ? ? 1_555 B DG 4 N2 ? ? A DG 9 B DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DG 9 O6 ? ? ? 1_555 B DG 4 N1 ? ? A DG 9 B DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DG 10 N7 ? ? ? 1_555 A DG 22 N2 ? ? A DG 10 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DG 10 O6 ? ? ? 1_555 A DG 22 N1 ? ? A DG 10 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A DG 10 N1 ? ? ? 1_555 B DG 3 O6 ? ? A DG 10 B DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A DG 10 N2 ? ? ? 1_555 B DG 3 N7 ? ? A DG 10 B DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A DG 11 N1 ? ? ? 1_555 A DG 15 O6 ? ? A DG 11 A DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A DG 11 N2 ? ? ? 1_555 A DG 15 N7 ? ? A DG 11 A DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? A DG 11 N7 ? ? ? 1_555 A DG 23 N2 ? ? A DG 11 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? A DG 11 O6 ? ? ? 1_555 A DG 23 N1 ? ? A DG 11 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? A DT 12 O2 ? ? ? 1_555 A DA 14 N6 ? ? A DT 12 A DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? A DT 12 O4 ? ? ? 1_555 A DG 23 N2 ? ? A DT 12 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DG MISPAIR' ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? A DT 12 N3 ? ? ? 1_555 A DT 24 O2 ? ? A DT 12 A DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DT MISPAIR' ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A DA 14 N1 ? ? ? 1_555 A DT 24 N3 ? ? A DA 14 A DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A DA 14 N6 ? ? ? 1_555 A DT 24 O2 ? ? A DA 14 A DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A DG 15 N1 ? ? ? 1_555 A DG 18 O6 ? ? A DG 15 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? A DG 15 N2 ? ? ? 1_555 A DG 18 N7 ? ? A DG 15 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A DG 16 N7 ? ? ? 1_555 A DG 21 N2 ? ? A DG 16 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? A DG 16 O6 ? ? ? 1_555 A DG 21 N1 ? ? A DG 16 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? A DG 16 N1 ? ? ? 1_555 B DG 4 O6 ? ? A DG 16 B DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? A DG 16 N2 ? ? ? 1_555 B DG 4 N7 ? ? A DG 16 B DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? A DG 17 N1 ? ? ? 1_555 A DG 22 O6 ? ? A DG 17 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? A DG 17 N2 ? ? ? 1_555 A DG 22 N7 ? ? A DG 17 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? A DG 17 N7 ? ? ? 1_555 B DG 3 N2 ? ? A DG 17 B DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? A DG 17 O6 ? ? ? 1_555 B DG 3 N1 ? ? A DG 17 B DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? A DG 18 N1 ? ? ? 1_555 A DG 23 O6 ? ? A DG 18 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? A DG 18 N2 ? ? ? 1_555 A DG 23 N7 ? ? A DG 18 A DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 122.62 118.90 3.72 0.60 N 2 1 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.31 121.90 -5.59 0.70 N 3 1 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.90 121.90 -5.00 0.70 N 4 1 "O4'" A DC 4 ? ? "C1'" A DC 4 ? ? N1 A DC 4 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 5 1 N1 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 122.51 118.90 3.61 0.60 N 6 1 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 116.69 121.90 -5.21 0.70 N 7 1 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 8 1 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 9 1 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.91 118.60 -4.69 0.60 N 10 1 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 11 1 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.61 118.90 3.71 0.60 N 12 1 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.45 121.90 -5.45 0.70 N 13 1 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.22 122.90 -3.68 0.60 N 14 1 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 114.08 108.30 5.78 0.30 N 15 1 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 16 1 "O4'" A DT 12 ? ? "C1'" A DT 12 ? ? N1 A DT 12 ? ? 110.98 108.30 2.68 0.30 N 17 1 C6 A DT 12 ? ? C5 A DT 12 ? ? C7 A DT 12 ? ? 118.41 122.90 -4.49 0.60 N 18 1 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 19 1 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.66 117.70 3.96 0.50 N 20 1 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 114.07 118.60 -4.53 0.60 N 21 1 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 111.61 108.30 3.31 0.30 N 22 1 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.06 108.30 4.76 0.30 N 23 1 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.31 108.30 3.01 0.30 N 24 1 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 25 1 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.27 121.90 -4.63 0.70 N 26 1 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.01 122.90 -3.89 0.60 N 27 1 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 114.78 108.30 6.48 0.30 N 28 1 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 110.24 108.30 1.94 0.30 N 29 1 "O4'" A DT 24 ? ? "C1'" A DT 24 ? ? N1 A DT 24 ? ? 112.23 108.30 3.93 0.30 N 30 1 "O4'" B DT 25 ? ? "C1'" B DT 25 ? ? N1 B DT 25 ? ? 112.76 108.30 4.46 0.30 N 31 1 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? "C2'" B DT 26 ? ? 99.35 105.90 -6.55 0.80 N 32 1 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? N1 B DT 26 ? ? 112.61 108.30 4.31 0.30 N 33 1 N3 B DT 26 ? ? C2 B DT 26 ? ? O2 B DT 26 ? ? 118.68 122.30 -3.62 0.60 N 34 1 "O4'" B DG 27 ? ? "C1'" B DG 27 ? ? N9 B DG 27 ? ? 112.40 108.30 4.10 0.30 N 35 1 "O4'" B DA 29 ? ? "C1'" B DA 29 ? ? N9 B DA 29 ? ? 112.02 108.30 3.72 0.30 N 36 1 C4 B DA 29 ? ? C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? 113.60 117.00 -3.40 0.50 N 37 1 C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N1 B DA 29 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 38 1 N1 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N6 B DA 29 ? ? 113.85 118.60 -4.75 0.60 N 39 1 N3 B DC 31 ? ? C2 B DC 31 ? ? O2 B DC 31 ? ? 116.57 121.90 -5.33 0.70 N 40 1 "O4'" B DG 33 ? ? "C1'" B DG 33 ? ? N9 B DG 33 ? ? 112.01 108.30 3.71 0.30 N 41 1 "O4'" B DA 35 ? ? "C1'" B DA 35 ? ? N9 B DA 35 ? ? 111.54 108.30 3.24 0.30 N 42 1 C4 B DA 35 ? ? C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? 113.63 117.00 -3.37 0.50 N 43 1 C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N1 B DA 35 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 44 1 N1 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N6 B DA 35 ? ? 113.86 118.60 -4.74 0.60 N 45 1 "O4'" B DT 37 ? ? "C1'" B DT 37 ? ? N1 B DT 37 ? ? 111.77 108.30 3.47 0.30 N 46 1 "O4'" B DT 38 ? ? "C1'" B DT 38 ? ? N1 B DT 38 ? ? 111.27 108.30 2.97 0.30 N 47 1 C6 B DT 38 ? ? C5 B DT 38 ? ? C7 B DT 38 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 48 2 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.63 121.90 -5.27 0.70 N 49 2 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.29 122.90 -3.61 0.60 N 50 2 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.75 121.90 -5.15 0.70 N 51 2 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 52 2 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 112.47 108.30 4.17 0.30 N 53 2 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.66 117.00 -3.34 0.50 N 54 2 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 55 2 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.69 118.60 -4.91 0.60 N 56 2 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.06 108.30 2.76 0.30 N 57 2 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.67 118.90 3.77 0.60 N 58 2 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.43 121.90 -5.47 0.70 N 59 2 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.14 122.90 -3.76 0.60 N 60 2 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 113.53 108.30 5.23 0.30 N 61 2 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.18 108.30 1.88 0.30 N 62 2 "O4'" A DT 12 ? ? "C1'" A DT 12 ? ? N1 A DT 12 ? ? 112.18 108.30 3.88 0.30 N 63 2 C6 A DT 12 ? ? C5 A DT 12 ? ? C7 A DT 12 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 64 2 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 111.43 108.30 3.13 0.30 N 65 2 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.58 117.00 -3.42 0.50 N 66 2 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.96 117.70 4.26 0.50 N 67 2 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 114.02 118.60 -4.58 0.60 N 68 2 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 69 2 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.19 108.30 4.89 0.30 N 70 2 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.76 108.30 2.46 0.30 N 71 2 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 110.37 108.30 2.07 0.30 N 72 2 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.28 121.90 -4.62 0.70 N 73 2 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.14 122.90 -3.76 0.60 N 74 2 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 112.61 108.30 4.31 0.30 N 75 2 "O4'" A DT 24 ? ? "C1'" A DT 24 ? ? N1 A DT 24 ? ? 112.24 108.30 3.94 0.30 N 76 2 "O4'" B DT 25 ? ? "C1'" B DT 25 ? ? N1 B DT 25 ? ? 113.13 108.30 4.83 0.30 N 77 2 N3 B DT 25 ? ? C2 B DT 25 ? ? O2 B DT 25 ? ? 118.49 122.30 -3.81 0.60 N 78 2 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? "C2'" B DT 26 ? ? 99.42 105.90 -6.48 0.80 N 79 2 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? N1 B DT 26 ? ? 113.56 108.30 5.26 0.30 N 80 2 C6 B DT 26 ? ? C5 B DT 26 ? ? C7 B DT 26 ? ? 118.90 122.90 -4.00 0.60 N 81 2 "O4'" B DG 27 ? ? "C1'" B DG 27 ? ? N9 B DG 27 ? ? 110.92 108.30 2.62 0.30 N 82 2 "O4'" B DA 29 ? ? "C1'" B DA 29 ? ? N9 B DA 29 ? ? 113.06 108.30 4.76 0.30 N 83 2 C4 B DA 29 ? ? C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 84 2 C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N1 B DA 29 ? ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 85 2 N1 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N6 B DA 29 ? ? 113.92 118.60 -4.68 0.60 N 86 2 "O4'" B DG 30 ? ? "C1'" B DG 30 ? ? N9 B DG 30 ? ? 110.99 108.30 2.69 0.30 N 87 2 N1 B DC 31 ? ? C2 B DC 31 ? ? O2 B DC 31 ? ? 122.60 118.90 3.70 0.60 N 88 2 N3 B DC 31 ? ? C2 B DC 31 ? ? O2 B DC 31 ? ? 116.49 121.90 -5.41 0.70 N 89 2 "O4'" B DG 33 ? ? "C1'" B DG 33 ? ? N9 B DG 33 ? ? 112.68 108.30 4.38 0.30 N 90 2 C4 B DA 35 ? ? C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 91 2 C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N1 B DA 35 ? ? 121.14 117.70 3.44 0.50 N 92 2 N1 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N6 B DA 35 ? ? 113.65 118.60 -4.95 0.60 N 93 2 "O4'" B DG 36 ? ? "C1'" B DG 36 ? ? N9 B DG 36 ? ? 111.42 108.30 3.12 0.30 N 94 2 "O4'" B DT 37 ? ? "C1'" B DT 37 ? ? N1 B DT 37 ? ? 112.08 108.30 3.78 0.30 N 95 2 "O4'" B DT 38 ? ? "C1'" B DT 38 ? ? N1 B DT 38 ? ? 110.12 108.30 1.82 0.30 N 96 2 C6 B DT 38 ? ? C5 B DT 38 ? ? C7 B DT 38 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 97 3 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.69 121.90 -5.21 0.70 N 98 3 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 99 3 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.59 121.90 -5.31 0.70 N 100 3 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 116.84 121.90 -5.06 0.70 N 101 3 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 112.53 108.30 4.23 0.30 N 102 3 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.57 117.00 -3.43 0.50 N 103 3 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 104 3 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.48 118.60 -5.12 0.60 N 105 3 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.81 108.30 2.51 0.30 N 106 3 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.52 118.90 3.62 0.60 N 107 3 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.53 121.90 -5.37 0.70 N 108 3 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.01 122.90 -3.89 0.60 N 109 3 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 113.60 108.30 5.30 0.30 N 110 3 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.50 108.30 2.20 0.30 N 111 3 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 110.37 108.30 2.07 0.30 N 112 3 "O4'" A DT 12 ? ? "C1'" A DT 12 ? ? N1 A DT 12 ? ? 111.83 108.30 3.53 0.30 N 113 3 N3 A DT 12 ? ? C2 A DT 12 ? ? O2 A DT 12 ? ? 118.66 122.30 -3.64 0.60 N 114 3 C6 A DT 12 ? ? C5 A DT 12 ? ? C7 A DT 12 ? ? 119.12 122.90 -3.78 0.60 N 115 3 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 111.23 108.30 2.93 0.30 N 116 3 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 114.43 118.60 -4.17 0.60 N 117 3 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 112.55 108.30 4.25 0.30 N 118 3 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.78 108.30 5.48 0.30 N 119 3 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.40 108.30 3.10 0.30 N 120 3 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 111.05 108.30 2.75 0.30 N 121 3 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.70 121.90 -4.20 0.70 N 122 3 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 111.30 108.30 3.00 0.30 N 123 3 N3 A DT 20 ? ? C2 A DT 20 ? ? O2 A DT 20 ? ? 118.32 122.30 -3.98 0.60 N 124 3 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 113.30 108.30 5.00 0.30 N 125 3 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 110.61 108.30 2.31 0.30 N 126 3 "O4'" A DT 24 ? ? "C1'" A DT 24 ? ? N1 A DT 24 ? ? 110.80 108.30 2.50 0.30 N 127 3 "O4'" B DT 25 ? ? "C1'" B DT 25 ? ? N1 B DT 25 ? ? 111.91 108.30 3.61 0.30 N 128 3 N3 B DT 25 ? ? C2 B DT 25 ? ? O2 B DT 25 ? ? 118.41 122.30 -3.89 0.60 N 129 3 C6 B DT 25 ? ? C5 B DT 25 ? ? C7 B DT 25 ? ? 119.06 122.90 -3.84 0.60 N 130 3 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? N1 B DT 26 ? ? 112.42 108.30 4.12 0.30 N 131 3 C6 B DT 26 ? ? C5 B DT 26 ? ? C7 B DT 26 ? ? 117.61 122.90 -5.29 0.60 N 132 3 "O4'" B DG 27 ? ? "C1'" B DG 27 ? ? N9 B DG 27 ? ? 112.71 108.30 4.41 0.30 N 133 3 "O4'" B DA 29 ? ? "C1'" B DA 29 ? ? N9 B DA 29 ? ? 112.89 108.30 4.59 0.30 N 134 3 C4 B DA 29 ? ? C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 135 3 C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N1 B DA 29 ? ? 121.08 117.70 3.38 0.50 N 136 3 N1 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N6 B DA 29 ? ? 113.86 118.60 -4.74 0.60 N 137 3 "O4'" B DG 30 ? ? "C1'" B DG 30 ? ? N9 B DG 30 ? ? 110.75 108.30 2.45 0.30 N 138 3 N3 B DC 31 ? ? C2 B DC 31 ? ? O2 B DC 31 ? ? 116.49 121.90 -5.41 0.70 N 139 3 "O4'" B DG 33 ? ? "C1'" B DG 33 ? ? N9 B DG 33 ? ? 112.81 108.30 4.51 0.30 N 140 3 "O4'" B DG 34 ? ? "C1'" B DG 34 ? ? N9 B DG 34 ? ? 110.42 108.30 2.12 0.30 N 141 3 C4 B DA 35 ? ? C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? 113.54 117.00 -3.46 0.50 N 142 3 C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N1 B DA 35 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 143 3 N1 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N6 B DA 35 ? ? 113.25 118.60 -5.35 0.60 N 144 3 "O4'" B DG 36 ? ? "C1'" B DG 36 ? ? N9 B DG 36 ? ? 110.78 108.30 2.48 0.30 N 145 3 "O4'" B DT 37 ? ? "C1'" B DT 37 ? ? N1 B DT 37 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 146 3 N3 B DT 37 ? ? C2 B DT 37 ? ? O2 B DT 37 ? ? 118.61 122.30 -3.69 0.60 N 147 3 C6 B DT 37 ? ? C5 B DT 37 ? ? C7 B DT 37 ? ? 119.16 122.90 -3.74 0.60 N 148 3 "O4'" B DT 38 ? ? "C1'" B DT 38 ? ? N1 B DT 38 ? ? 111.10 108.30 2.80 0.30 N 149 3 C6 B DT 38 ? ? C5 B DT 38 ? ? C7 B DT 38 ? ? 118.94 122.90 -3.96 0.60 N 150 4 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.65 121.90 -5.25 0.70 N 151 4 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 118.79 122.90 -4.11 0.60 N 152 4 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.57 121.90 -5.33 0.70 N 153 4 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 116.66 121.90 -5.24 0.70 N 154 4 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 112.48 108.30 4.18 0.30 N 155 4 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 156 4 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 157 4 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.68 118.60 -4.92 0.60 N 158 4 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.99 108.30 2.69 0.30 N 159 4 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.65 118.90 3.75 0.60 N 160 4 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.41 121.90 -5.49 0.70 N 161 4 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 162 4 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 113.85 108.30 5.55 0.30 N 163 4 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 164 4 "O4'" A DT 12 ? ? "C1'" A DT 12 ? ? N1 A DT 12 ? ? 110.87 108.30 2.57 0.30 N 165 4 C6 A DT 12 ? ? C5 A DT 12 ? ? C7 A DT 12 ? ? 119.14 122.90 -3.76 0.60 N 166 4 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 167 4 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.67 117.70 3.97 0.50 N 168 4 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 114.12 118.60 -4.48 0.60 N 169 4 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 170 4 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.40 108.30 5.10 0.30 N 171 4 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.36 108.30 3.06 0.30 N 172 4 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 110.81 108.30 2.51 0.30 N 173 4 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.20 121.90 -4.70 0.70 N 174 4 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 113.08 108.30 4.78 0.30 N 175 4 "C3'" A DG 21 ? ? "O3'" A DG 21 ? ? P A DG 22 ? ? 127.22 119.70 7.52 1.20 Y 176 4 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 110.22 108.30 1.92 0.30 N 177 4 "O4'" A DT 24 ? ? "C1'" A DT 24 ? ? N1 A DT 24 ? ? 111.99 108.30 3.69 0.30 N 178 4 "O4'" B DT 25 ? ? "C1'" B DT 25 ? ? "C2'" B DT 25 ? ? 100.36 105.90 -5.54 0.80 N 179 4 "O4'" B DT 25 ? ? "C1'" B DT 25 ? ? N1 B DT 25 ? ? 111.28 108.30 2.98 0.30 N 180 4 N3 B DT 25 ? ? C2 B DT 25 ? ? O2 B DT 25 ? ? 118.55 122.30 -3.75 0.60 N 181 4 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? N1 B DT 26 ? ? 110.76 108.30 2.46 0.30 N 182 4 C6 B DT 26 ? ? C5 B DT 26 ? ? C7 B DT 26 ? ? 118.97 122.90 -3.93 0.60 N 183 4 "C3'" B DT 26 ? ? "O3'" B DT 26 ? ? P B DG 27 ? ? 127.14 119.70 7.44 1.20 Y 184 4 "O4'" B DA 29 ? ? "C1'" B DA 29 ? ? N9 B DA 29 ? ? 111.32 108.30 3.02 0.30 N 185 4 C4 B DA 29 ? ? C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? 113.68 117.00 -3.32 0.50 N 186 4 C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N1 B DA 29 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 187 4 N1 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N6 B DA 29 ? ? 113.66 118.60 -4.94 0.60 N 188 4 "O4'" B DG 30 ? ? "C1'" B DG 30 ? ? N9 B DG 30 ? ? 111.76 108.30 3.46 0.30 N 189 4 N3 B DC 31 ? ? C2 B DC 31 ? ? O2 B DC 31 ? ? 116.62 121.90 -5.28 0.70 N 190 4 "O4'" B DG 33 ? ? "C1'" B DG 33 ? ? N9 B DG 33 ? ? 112.18 108.30 3.88 0.30 N 191 4 C4 B DA 35 ? ? C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 192 4 C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N1 B DA 35 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 193 4 N1 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N6 B DA 35 ? ? 113.32 118.60 -5.28 0.60 N 194 4 "O4'" B DG 36 ? ? "C1'" B DG 36 ? ? N9 B DG 36 ? ? 111.21 108.30 2.91 0.30 N 195 4 "O4'" B DT 37 ? ? "C1'" B DT 37 ? ? N1 B DT 37 ? ? 112.58 108.30 4.28 0.30 N 196 4 C6 B DT 37 ? ? C5 B DT 37 ? ? C7 B DT 37 ? ? 119.18 122.90 -3.72 0.60 N 197 4 "O4'" B DT 38 ? ? "C1'" B DT 38 ? ? N1 B DT 38 ? ? 111.05 108.30 2.75 0.30 N 198 5 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.68 121.90 -5.22 0.70 N 199 5 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.49 121.90 -5.41 0.70 N 200 5 "O4'" A DC 4 ? ? "C1'" A DC 4 ? ? N1 A DC 4 ? ? 111.34 108.30 3.04 0.30 N 201 5 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 116.59 121.90 -5.31 0.70 N 202 5 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 112.14 108.30 3.84 0.30 N 203 5 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 204 5 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.20 117.70 3.50 0.50 N 205 5 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.71 118.60 -4.89 0.60 N 206 5 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.49 108.30 2.19 0.30 N 207 5 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.66 118.90 3.76 0.60 N 208 5 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.41 121.90 -5.49 0.70 N 209 5 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 210 5 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 113.42 108.30 5.12 0.30 N 211 5 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 111.23 108.30 2.93 0.30 N 212 5 "O4'" A DT 12 ? ? "C1'" A DT 12 ? ? N1 A DT 12 ? ? 110.58 108.30 2.28 0.30 N 213 5 C6 A DT 12 ? ? C5 A DT 12 ? ? C7 A DT 12 ? ? 119.29 122.90 -3.61 0.60 N 214 5 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 215 5 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 216 5 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 113.97 118.60 -4.63 0.60 N 217 5 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 218 5 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 112.26 108.30 3.96 0.30 N 219 5 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.80 108.30 3.50 0.30 N 220 5 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.34 121.90 -4.56 0.70 N 221 5 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 112.68 108.30 4.38 0.30 N 222 5 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 223 5 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 112.95 108.30 4.65 0.30 N 224 5 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 225 5 "O4'" A DT 24 ? ? "C1'" A DT 24 ? ? N1 A DT 24 ? ? 112.23 108.30 3.93 0.30 N 226 5 N3 B DT 25 ? ? C2 B DT 25 ? ? O2 B DT 25 ? ? 118.69 122.30 -3.61 0.60 N 227 5 C6 B DT 25 ? ? C5 B DT 25 ? ? C7 B DT 25 ? ? 119.02 122.90 -3.88 0.60 N 228 5 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? "C2'" B DT 26 ? ? 100.73 105.90 -5.17 0.80 N 229 5 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? N1 B DT 26 ? ? 112.40 108.30 4.10 0.30 N 230 5 C6 B DT 26 ? ? C5 B DT 26 ? ? C7 B DT 26 ? ? 119.01 122.90 -3.89 0.60 N 231 5 "O4'" B DG 27 ? ? "C1'" B DG 27 ? ? N9 B DG 27 ? ? 111.95 108.30 3.65 0.30 N 232 5 "O4'" B DG 28 ? ? "C1'" B DG 28 ? ? N9 B DG 28 ? ? 110.19 108.30 1.89 0.30 N 233 5 "O4'" B DA 29 ? ? "C1'" B DA 29 ? ? N9 B DA 29 ? ? 112.32 108.30 4.02 0.30 N 234 5 C4 B DA 29 ? ? C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? 113.68 117.00 -3.32 0.50 N 235 5 C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N1 B DA 29 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 236 5 N1 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N6 B DA 29 ? ? 113.88 118.60 -4.72 0.60 N 237 5 "O4'" B DG 30 ? ? "C1'" B DG 30 ? ? N9 B DG 30 ? ? 110.33 108.30 2.03 0.30 N 238 5 N1 B DC 31 ? ? C2 B DC 31 ? ? O2 B DC 31 ? ? 122.51 118.90 3.61 0.60 N 239 5 N3 B DC 31 ? ? C2 B DC 31 ? ? O2 B DC 31 ? ? 116.57 121.90 -5.33 0.70 N 240 5 "O4'" B DG 33 ? ? "C1'" B DG 33 ? ? N9 B DG 33 ? ? 112.01 108.30 3.71 0.30 N 241 5 "O4'" B DG 34 ? ? "C1'" B DG 34 ? ? N9 B DG 34 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 242 5 C4 B DA 35 ? ? C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? 113.59 117.00 -3.41 0.50 N 243 5 C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N1 B DA 35 ? ? 121.09 117.70 3.39 0.50 N 244 5 N1 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N6 B DA 35 ? ? 113.28 118.60 -5.32 0.60 N 245 5 "O4'" B DG 36 ? ? "C1'" B DG 36 ? ? N9 B DG 36 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 246 5 "O4'" B DT 37 ? ? "C1'" B DT 37 ? ? N1 B DT 37 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 247 5 C6 B DT 37 ? ? C5 B DT 37 ? ? C7 B DT 37 ? ? 119.18 122.90 -3.72 0.60 N 248 5 C6 B DT 38 ? ? C5 B DT 38 ? ? C7 B DT 38 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 249 6 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.79 121.90 -5.11 0.70 N 250 6 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.06 122.90 -3.84 0.60 N 251 6 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.55 121.90 -5.35 0.70 N 252 6 "O4'" A DC 4 ? ? "C1'" A DC 4 ? ? N1 A DC 4 ? ? 110.19 108.30 1.89 0.30 N 253 6 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 116.63 121.90 -5.27 0.70 N 254 6 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 112.72 108.30 4.42 0.30 N 255 6 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.98 117.00 -3.02 0.50 N 256 6 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 257 6 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.96 118.60 -4.64 0.60 N 258 6 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.26 108.30 2.96 0.30 N 259 6 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.77 118.90 3.87 0.60 N 260 6 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.32 121.90 -5.58 0.70 N 261 6 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.22 122.90 -3.68 0.60 N 262 6 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 110.80 108.30 2.50 0.30 N 263 6 C6 A DT 12 ? ? C5 A DT 12 ? ? C7 A DT 12 ? ? 119.19 122.90 -3.71 0.60 N 264 6 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 114.49 108.30 6.19 0.30 N 265 6 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.34 117.70 3.64 0.50 N 266 6 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 114.66 118.60 -3.94 0.60 N 267 6 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 111.49 108.30 3.19 0.30 N 268 6 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.51 108.30 5.21 0.30 N 269 6 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.21 108.30 2.91 0.30 N 270 6 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 111.53 108.30 3.23 0.30 N 271 6 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.19 121.90 -4.71 0.70 N 272 6 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 273 6 N3 A DT 20 ? ? C2 A DT 20 ? ? O2 A DT 20 ? ? 118.38 122.30 -3.92 0.60 N 274 6 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 113.50 108.30 5.20 0.30 N 275 6 "C3'" A DG 21 ? ? "O3'" A DG 21 ? ? P A DG 22 ? ? 127.01 119.70 7.31 1.20 Y 276 6 "O4'" A DT 24 ? ? "C1'" A DT 24 ? ? N1 A DT 24 ? ? 112.83 108.30 4.53 0.30 N 277 6 "O4'" B DT 25 ? ? "C1'" B DT 25 ? ? N1 B DT 25 ? ? 113.01 108.30 4.71 0.30 N 278 6 C6 B DT 25 ? ? C5 B DT 25 ? ? C7 B DT 25 ? ? 119.02 122.90 -3.88 0.60 N 279 6 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? "C2'" B DT 26 ? ? 100.92 105.90 -4.98 0.80 N 280 6 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? N1 B DT 26 ? ? 112.90 108.30 4.60 0.30 N 281 6 C6 B DT 26 ? ? C5 B DT 26 ? ? C7 B DT 26 ? ? 118.45 122.90 -4.45 0.60 N 282 6 "O4'" B DG 27 ? ? "C1'" B DG 27 ? ? N9 B DG 27 ? ? 113.13 108.30 4.83 0.30 N 283 6 "O4'" B DA 29 ? ? "C1'" B DA 29 ? ? N9 B DA 29 ? ? 111.95 108.30 3.65 0.30 N 284 6 C4 B DA 29 ? ? C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? 113.91 117.00 -3.09 0.50 N 285 6 C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N1 B DA 29 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 286 6 N1 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N6 B DA 29 ? ? 113.89 118.60 -4.71 0.60 N 287 6 "O4'" B DG 30 ? ? "C1'" B DG 30 ? ? N9 B DG 30 ? ? 111.87 108.30 3.57 0.30 N 288 6 N3 B DC 31 ? ? C2 B DC 31 ? ? O2 B DC 31 ? ? 116.54 121.90 -5.36 0.70 N 289 6 "O4'" B DG 33 ? ? "C1'" B DG 33 ? ? N9 B DG 33 ? ? 112.11 108.30 3.81 0.30 N 290 6 "O4'" B DA 35 ? ? "C1'" B DA 35 ? ? N9 B DA 35 ? ? 111.28 108.30 2.98 0.30 N 291 6 C4 B DA 35 ? ? C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 292 6 C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N1 B DA 35 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 293 6 N1 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N6 B DA 35 ? ? 113.55 118.60 -5.05 0.60 N 294 6 "O4'" B DG 36 ? ? "C1'" B DG 36 ? ? N9 B DG 36 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 295 6 "O4'" B DT 37 ? ? "C1'" B DT 37 ? ? N1 B DT 37 ? ? 112.00 108.30 3.70 0.30 N 296 6 C6 B DT 37 ? ? C5 B DT 37 ? ? C7 B DT 37 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 297 6 "O4'" B DT 38 ? ? "C1'" B DT 38 ? ? N1 B DT 38 ? ? 112.74 108.30 4.44 0.30 N 298 7 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.43 121.90 -5.47 0.70 N 299 7 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.73 121.90 -5.17 0.70 N 300 7 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 116.59 121.90 -5.31 0.70 N 301 7 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 112.60 108.30 4.30 0.30 N 302 7 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 303 7 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 304 7 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.88 118.60 -4.72 0.60 N 305 7 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.45 108.30 3.15 0.30 N 306 7 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.59 121.90 -5.31 0.70 N 307 7 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 308 7 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 114.26 108.30 5.96 0.30 N 309 7 "O4'" A DT 12 ? ? "C1'" A DT 12 ? ? N1 A DT 12 ? ? 111.75 108.30 3.45 0.30 N 310 7 C6 A DT 12 ? ? C5 A DT 12 ? ? C7 A DT 12 ? ? 118.79 122.90 -4.11 0.60 N 311 7 "O4'" A DA 14 ? ? "C1'" A DA 14 ? ? N9 A DA 14 ? ? 111.95 108.30 3.65 0.30 N 312 7 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.43 117.00 -3.57 0.50 N 313 7 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.35 117.70 3.65 0.50 N 314 7 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 112.50 118.60 -6.10 0.60 N 315 7 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 316 7 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 112.85 108.30 4.55 0.30 N 317 7 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.51 108.30 3.21 0.30 N 318 7 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 111.49 108.30 3.19 0.30 N 319 7 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.12 121.90 -4.78 0.70 N 320 7 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 112.10 108.30 3.80 0.30 N 321 7 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 322 7 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 114.68 108.30 6.38 0.30 N 323 7 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 110.80 108.30 2.50 0.30 N 324 7 "O4'" A DT 24 ? ? "C1'" A DT 24 ? ? N1 A DT 24 ? ? 113.66 108.30 5.36 0.30 N 325 7 "O4'" B DT 25 ? ? "C1'" B DT 25 ? ? N1 B DT 25 ? ? 111.98 108.30 3.68 0.30 N 326 7 N3 B DT 25 ? ? C2 B DT 25 ? ? O2 B DT 25 ? ? 118.60 122.30 -3.70 0.60 N 327 7 C6 B DT 25 ? ? C5 B DT 25 ? ? C7 B DT 25 ? ? 118.66 122.90 -4.24 0.60 N 328 7 "C3'" B DT 26 ? ? "C2'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? 96.80 102.40 -5.60 0.80 N 329 7 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? N1 B DT 26 ? ? 114.37 108.30 6.07 0.30 N 330 7 N3 B DT 26 ? ? C2 B DT 26 ? ? O2 B DT 26 ? ? 118.23 122.30 -4.07 0.60 N 331 7 C6 B DT 26 ? ? C5 B DT 26 ? ? C7 B DT 26 ? ? 118.92 122.90 -3.98 0.60 N 332 7 "O4'" B DG 27 ? ? "C1'" B DG 27 ? ? N9 B DG 27 ? ? 113.75 108.30 5.45 0.30 N 333 7 "O4'" B DA 29 ? ? "C1'" B DA 29 ? ? N9 B DA 29 ? ? 112.18 108.30 3.88 0.30 N 334 7 C4 B DA 29 ? ? C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 335 7 C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N1 B DA 29 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 336 7 N1 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N6 B DA 29 ? ? 113.89 118.60 -4.71 0.60 N 337 7 "O4'" B DG 30 ? ? "C1'" B DG 30 ? ? N9 B DG 30 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 338 7 N3 B DC 31 ? ? C2 B DC 31 ? ? O2 B DC 31 ? ? 116.62 121.90 -5.28 0.70 N 339 7 "O4'" B DG 33 ? ? "C1'" B DG 33 ? ? N9 B DG 33 ? ? 112.03 108.30 3.73 0.30 N 340 7 "O4'" B DA 35 ? ? "C1'" B DA 35 ? ? N9 B DA 35 ? ? 111.94 108.30 3.64 0.30 N 341 7 C4 B DA 35 ? ? C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? 113.62 117.00 -3.38 0.50 N 342 7 C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N1 B DA 35 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 343 7 N1 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N6 B DA 35 ? ? 114.05 118.60 -4.55 0.60 N 344 7 "O4'" B DT 37 ? ? "C1'" B DT 37 ? ? N1 B DT 37 ? ? 113.43 108.30 5.13 0.30 N 345 7 C6 B DT 37 ? ? C5 B DT 37 ? ? C7 B DT 37 ? ? 118.87 122.90 -4.03 0.60 N 346 7 C6 B DT 38 ? ? C5 B DT 38 ? ? C7 B DT 38 ? ? 119.07 122.90 -3.83 0.60 N 347 8 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 111.78 108.30 3.48 0.30 N 348 8 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.56 121.90 -5.34 0.70 N 349 8 "O4'" A DT 2 ? ? "C1'" A DT 2 ? ? N1 A DT 2 ? ? 111.69 108.30 3.39 0.30 N 350 8 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.56 121.90 -5.34 0.70 N 351 8 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 116.88 121.90 -5.02 0.70 N 352 8 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 112.81 108.30 4.51 0.30 N 353 8 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.56 117.00 -3.44 0.50 N 354 8 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.26 117.70 3.56 0.50 N 355 8 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.69 118.60 -4.91 0.60 N 356 8 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 357 8 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.65 118.90 3.75 0.60 N 358 8 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.47 121.90 -5.43 0.70 N 359 8 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.19 122.90 -3.71 0.60 N 360 8 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 111.21 108.30 2.91 0.30 N 361 8 "O4'" A DT 12 ? ? "C1'" A DT 12 ? ? N1 A DT 12 ? ? 113.39 108.30 5.09 0.30 N 362 8 C6 A DT 12 ? ? C5 A DT 12 ? ? C7 A DT 12 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 363 8 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 111.24 108.30 2.94 0.30 N 364 8 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 365 8 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.52 117.70 3.82 0.50 N 366 8 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 113.47 118.60 -5.13 0.60 N 367 8 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 111.27 108.30 2.97 0.30 N 368 8 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.96 108.30 5.66 0.30 N 369 8 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.28 108.30 2.98 0.30 N 370 8 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 110.32 108.30 2.02 0.30 N 371 8 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.38 121.90 -4.52 0.70 N 372 8 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.22 122.90 -3.68 0.60 N 373 8 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 113.36 108.30 5.06 0.30 N 374 8 "O4'" A DT 24 ? ? "C1'" A DT 24 ? ? N1 A DT 24 ? ? 112.15 108.30 3.85 0.30 N 375 8 "O4'" B DT 25 ? ? "C1'" B DT 25 ? ? N1 B DT 25 ? ? 110.50 108.30 2.20 0.30 N 376 8 N3 B DT 25 ? ? C2 B DT 25 ? ? O2 B DT 25 ? ? 117.95 122.30 -4.35 0.60 N 377 8 C6 B DT 25 ? ? C5 B DT 25 ? ? C7 B DT 25 ? ? 119.15 122.90 -3.75 0.60 N 378 8 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? "C2'" B DT 26 ? ? 98.43 105.90 -7.47 0.80 N 379 8 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? N1 B DT 26 ? ? 116.75 108.30 8.45 0.30 N 380 8 N3 B DT 26 ? ? C2 B DT 26 ? ? O2 B DT 26 ? ? 117.86 122.30 -4.44 0.60 N 381 8 C6 B DT 26 ? ? C5 B DT 26 ? ? C7 B DT 26 ? ? 118.79 122.90 -4.11 0.60 N 382 8 "O4'" B DG 27 ? ? "C1'" B DG 27 ? ? N9 B DG 27 ? ? 112.10 108.30 3.80 0.30 N 383 8 "O4'" B DA 29 ? ? "C1'" B DA 29 ? ? N9 B DA 29 ? ? 111.65 108.30 3.35 0.30 N 384 8 C4 B DA 29 ? ? C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? 113.70 117.00 -3.30 0.50 N 385 8 C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N1 B DA 29 ? ? 121.15 117.70 3.45 0.50 N 386 8 N1 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N6 B DA 29 ? ? 113.58 118.60 -5.02 0.60 N 387 8 "O4'" B DG 30 ? ? "C1'" B DG 30 ? ? N9 B DG 30 ? ? 111.62 108.30 3.32 0.30 N 388 8 N3 B DC 31 ? ? C2 B DC 31 ? ? O2 B DC 31 ? ? 116.71 121.90 -5.19 0.70 N 389 8 "O4'" B DG 33 ? ? "C1'" B DG 33 ? ? N9 B DG 33 ? ? 112.35 108.30 4.05 0.30 N 390 8 C4 B DA 35 ? ? C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 391 8 C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N1 B DA 35 ? ? 121.36 117.70 3.66 0.50 N 392 8 N1 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N6 B DA 35 ? ? 113.75 118.60 -4.85 0.60 N 393 8 "O4'" B DT 37 ? ? "C1'" B DT 37 ? ? N1 B DT 37 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 394 8 C6 B DT 37 ? ? C5 B DT 37 ? ? C7 B DT 37 ? ? 119.11 122.90 -3.79 0.60 N 395 8 "O4'" B DT 38 ? ? "C1'" B DT 38 ? ? N1 B DT 38 ? ? 110.83 108.30 2.53 0.30 N 396 8 C6 B DT 38 ? ? C5 B DT 38 ? ? C7 B DT 38 ? ? 119.19 122.90 -3.71 0.60 N 397 9 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 398 9 C6 A DT 2 ? ? C5 A DT 2 ? ? C7 A DT 2 ? ? 119.10 122.90 -3.80 0.60 N 399 9 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.60 121.90 -5.30 0.70 N 400 9 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 116.55 121.90 -5.35 0.70 N 401 9 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 111.70 108.30 3.40 0.30 N 402 9 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 114.00 117.00 -3.00 0.50 N 403 9 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.36 117.70 3.66 0.50 N 404 9 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 114.06 118.60 -4.54 0.60 N 405 9 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.43 108.30 2.13 0.30 N 406 9 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.55 118.90 3.65 0.60 N 407 9 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.48 121.90 -5.42 0.70 N 408 9 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 409 9 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 113.52 108.30 5.22 0.30 N 410 9 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.31 108.30 2.01 0.30 N 411 9 "O4'" A DT 12 ? ? "C1'" A DT 12 ? ? N1 A DT 12 ? ? 113.21 108.30 4.91 0.30 N 412 9 C6 A DT 12 ? ? C5 A DT 12 ? ? C7 A DT 12 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 413 9 "O4'" A DG 13 ? ? "C1'" A DG 13 ? ? N9 A DG 13 ? ? 111.20 108.30 2.90 0.30 N 414 9 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 415 9 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.41 117.70 3.71 0.50 N 416 9 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 113.67 118.60 -4.93 0.60 N 417 9 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 111.24 108.30 2.94 0.30 N 418 9 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.29 108.30 4.99 0.30 N 419 9 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.18 108.30 2.88 0.30 N 420 9 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 110.89 108.30 2.59 0.30 N 421 9 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.33 121.90 -4.57 0.70 N 422 9 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 110.67 108.30 2.37 0.30 N 423 9 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 118.90 122.90 -4.00 0.60 N 424 9 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 115.17 108.30 6.87 0.30 N 425 9 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 426 9 "O4'" A DG 23 ? ? "C1'" A DG 23 ? ? N9 A DG 23 ? ? 110.23 108.30 1.93 0.30 N 427 9 "O4'" A DT 24 ? ? "C1'" A DT 24 ? ? N1 A DT 24 ? ? 112.14 108.30 3.84 0.30 N 428 9 "O4'" B DT 25 ? ? "C1'" B DT 25 ? ? "C2'" B DT 25 ? ? 100.45 105.90 -5.45 0.80 N 429 9 "O4'" B DT 25 ? ? "C1'" B DT 25 ? ? N1 B DT 25 ? ? 112.34 108.30 4.04 0.30 N 430 9 N3 B DT 25 ? ? C2 B DT 25 ? ? O2 B DT 25 ? ? 118.18 122.30 -4.12 0.60 N 431 9 C6 B DT 25 ? ? C5 B DT 25 ? ? C7 B DT 25 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 432 9 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? N1 B DT 26 ? ? 112.01 108.30 3.71 0.30 N 433 9 N3 B DT 26 ? ? C2 B DT 26 ? ? O2 B DT 26 ? ? 117.33 122.30 -4.97 0.60 N 434 9 C6 B DT 26 ? ? C5 B DT 26 ? ? C7 B DT 26 ? ? 118.30 122.90 -4.60 0.60 N 435 9 "C3'" B DT 26 ? ? "O3'" B DT 26 ? ? P B DG 27 ? ? 127.41 119.70 7.71 1.20 Y 436 9 "O4'" B DG 27 ? ? "C1'" B DG 27 ? ? N9 B DG 27 ? ? 112.91 108.30 4.61 0.30 N 437 9 "O4'" B DA 29 ? ? "C1'" B DA 29 ? ? N9 B DA 29 ? ? 112.92 108.30 4.62 0.30 N 438 9 C4 B DA 29 ? ? C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? 113.73 117.00 -3.27 0.50 N 439 9 C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N1 B DA 29 ? ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 440 9 N1 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N6 B DA 29 ? ? 113.71 118.60 -4.89 0.60 N 441 9 "O4'" B DG 30 ? ? "C1'" B DG 30 ? ? N9 B DG 30 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 442 9 N3 B DC 31 ? ? C2 B DC 31 ? ? O2 B DC 31 ? ? 116.67 121.90 -5.23 0.70 N 443 9 "O4'" B DG 33 ? ? "C1'" B DG 33 ? ? N9 B DG 33 ? ? 112.18 108.30 3.88 0.30 N 444 9 C4 B DA 35 ? ? C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? 113.66 117.00 -3.34 0.50 N 445 9 C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N1 B DA 35 ? ? 121.18 117.70 3.48 0.50 N 446 9 N1 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N6 B DA 35 ? ? 113.32 118.60 -5.28 0.60 N 447 9 "O4'" B DG 36 ? ? "C1'" B DG 36 ? ? N9 B DG 36 ? ? 110.88 108.30 2.58 0.30 N 448 9 "O4'" B DT 37 ? ? "C1'" B DT 37 ? ? N1 B DT 37 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 449 9 C6 B DT 37 ? ? C5 B DT 37 ? ? C7 B DT 37 ? ? 119.09 122.90 -3.81 0.60 N 450 9 "O4'" B DT 38 ? ? "C1'" B DT 38 ? ? N1 B DT 38 ? ? 110.78 108.30 2.48 0.30 N 451 9 C6 B DT 38 ? ? C5 B DT 38 ? ? C7 B DT 38 ? ? 119.19 122.90 -3.71 0.60 N 452 10 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.70 121.90 -5.20 0.70 N 453 10 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.62 121.90 -5.28 0.70 N 454 10 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 116.91 121.90 -4.99 0.70 N 455 10 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 111.87 108.30 3.57 0.30 N 456 10 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.62 117.00 -3.38 0.50 N 457 10 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.15 117.70 3.45 0.50 N 458 10 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.92 118.60 -4.68 0.60 N 459 10 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.92 108.30 2.62 0.30 N 460 10 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 461 10 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.29 122.90 -3.61 0.60 N 462 10 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 113.42 108.30 5.12 0.30 N 463 10 "O4'" A DT 12 ? ? "C1'" A DT 12 ? ? N1 A DT 12 ? ? 110.63 108.30 2.33 0.30 N 464 10 C6 A DT 12 ? ? C5 A DT 12 ? ? C7 A DT 12 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 465 10 C4 A DA 14 ? ? C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 466 10 C5 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N1 A DA 14 ? ? 121.65 117.70 3.95 0.50 N 467 10 N1 A DA 14 ? ? C6 A DA 14 ? ? N6 A DA 14 ? ? 114.33 118.60 -4.27 0.60 N 468 10 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 111.98 108.30 3.68 0.30 N 469 10 "O4'" A DG 16 ? ? "C4'" A DG 16 ? ? "C3'" A DG 16 ? ? 101.80 104.50 -2.70 0.40 N 470 10 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 110.63 108.30 2.33 0.30 N 471 10 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 112.74 108.30 4.44 0.30 N 472 10 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.30 108.30 3.00 0.30 N 473 10 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.29 121.90 -4.61 0.70 N 474 10 "O4'" A DT 20 ? ? "C1'" A DT 20 ? ? N1 A DT 20 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 475 10 N3 A DT 20 ? ? C2 A DT 20 ? ? O2 A DT 20 ? ? 118.69 122.30 -3.61 0.60 N 476 10 C6 A DT 20 ? ? C5 A DT 20 ? ? C7 A DT 20 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 477 10 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 113.45 108.30 5.15 0.30 N 478 10 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.29 108.30 1.99 0.30 N 479 10 "O4'" A DT 24 ? ? "C1'" A DT 24 ? ? N1 A DT 24 ? ? 111.32 108.30 3.02 0.30 N 480 10 "O4'" B DT 25 ? ? "C1'" B DT 25 ? ? "C2'" B DT 25 ? ? 101.04 105.90 -4.86 0.80 N 481 10 "O4'" B DT 25 ? ? "C1'" B DT 25 ? ? N1 B DT 25 ? ? 113.04 108.30 4.74 0.30 N 482 10 N3 B DT 25 ? ? C2 B DT 25 ? ? O2 B DT 25 ? ? 118.52 122.30 -3.78 0.60 N 483 10 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? "C2'" B DT 26 ? ? 99.62 105.90 -6.28 0.80 N 484 10 "O4'" B DT 26 ? ? "C1'" B DT 26 ? ? N1 B DT 26 ? ? 112.52 108.30 4.22 0.30 N 485 10 C6 B DT 26 ? ? C5 B DT 26 ? ? C7 B DT 26 ? ? 118.97 122.90 -3.93 0.60 N 486 10 "O4'" B DG 27 ? ? "C1'" B DG 27 ? ? N9 B DG 27 ? ? 112.26 108.30 3.96 0.30 N 487 10 "O4'" B DG 28 ? ? "C1'" B DG 28 ? ? N9 B DG 28 ? ? 110.12 108.30 1.82 0.30 N 488 10 "O4'" B DA 29 ? ? "C1'" B DA 29 ? ? N9 B DA 29 ? ? 112.95 108.30 4.65 0.30 N 489 10 C4 B DA 29 ? ? C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? 113.66 117.00 -3.34 0.50 N 490 10 C5 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N1 B DA 29 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 491 10 N1 B DA 29 ? ? C6 B DA 29 ? ? N6 B DA 29 ? ? 113.70 118.60 -4.90 0.60 N 492 10 "O4'" B DG 30 ? ? "C1'" B DG 30 ? ? N9 B DG 30 ? ? 110.59 108.30 2.29 0.30 N 493 10 N3 B DC 31 ? ? C2 B DC 31 ? ? O2 B DC 31 ? ? 116.61 121.90 -5.29 0.70 N 494 10 "O4'" B DG 33 ? ? "C1'" B DG 33 ? ? N9 B DG 33 ? ? 112.48 108.30 4.18 0.30 N 495 10 C4 B DA 35 ? ? C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 496 10 C5 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N1 B DA 35 ? ? 121.24 117.70 3.54 0.50 N 497 10 N1 B DA 35 ? ? C6 B DA 35 ? ? N6 B DA 35 ? ? 113.32 118.60 -5.28 0.60 N 498 10 "O4'" B DG 36 ? ? "C1'" B DG 36 ? ? N9 B DG 36 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 499 10 "O4'" B DT 37 ? ? "C1'" B DT 37 ? ? N1 B DT 37 ? ? 110.50 108.30 2.20 0.30 N 500 10 C6 B DT 37 ? ? C5 B DT 37 ? ? C7 B DT 37 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 501 10 "O4'" B DT 38 ? ? "C1'" B DT 38 ? ? N1 B DT 38 ? ? 111.22 108.30 2.92 0.30 N 502 10 C6 B DT 38 ? ? C5 B DT 38 ? ? C7 B DT 38 ? ? 119.06 122.90 -3.84 0.60 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DT A 2 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' 2 1 DT A 24 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 3 1 DG B 28 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 4 1 DT B 32 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 5 1 DG B 34 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 6 2 DT A 12 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 7 2 DG A 13 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 8 2 DG A 17 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 9 2 DG B 30 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' 10 2 DT B 32 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 11 3 DG A 6 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 12 3 DG B 28 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 13 3 DT B 32 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 14 4 DC A 3 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 15 4 DT B 25 ? ? 0.092 'SIDE CHAIN' 16 4 DC B 31 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 17 4 DT B 32 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 18 4 DG B 34 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' 19 5 DA A 14 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 20 5 DG A 18 ? ? 0.049 'SIDE CHAIN' 21 5 DG B 28 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 22 5 DT B 32 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' 23 6 DC A 1 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 24 6 DG A 6 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 25 6 DT A 24 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 26 6 DC B 31 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 27 6 DT B 32 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 28 6 DG B 34 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' 29 7 DT A 2 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 30 7 DT B 26 ? ? 0.162 'SIDE CHAIN' 31 7 DG B 28 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 32 7 DT B 32 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 33 8 DC A 3 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 34 8 DT A 12 ? ? 0.097 'SIDE CHAIN' 35 8 DT B 26 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 36 8 DC B 31 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 37 8 DT B 32 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 38 9 DT A 2 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 39 9 DT A 12 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 40 9 DG A 18 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 41 9 DT B 26 ? ? 0.106 'SIDE CHAIN' 42 9 DG B 28 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 43 9 DT B 32 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 8QKX _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the lowest energy' _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 8QKX _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system _pdbx_nmr_sample_details.label _pdbx_nmr_sample_details.type _pdbx_nmr_sample_details.details 1 ;0.42 mM DNA (5'-D(*CP*TP*CP*CP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*AP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*T)-3'), 0.42 mM DNA (5'-D(*TP*TP*GP*GP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*AP*GP*TP*T)-3'), 90% H2O/10% D2O ; '90% H2O/10% D2O' 'Sample 1' solution '120 mM K+, 298 K, 0.42 mM' 2 ;0.22 mM [U-13C; U-15N]-Gua DNA (5'-D(*CP*TP*CP*CP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*AP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*T)-3'), 0.22 mM DNA (5'-D(*TP*TP*GP*GP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*AP*GP*TP*T)-3'), 90% H2O/10% D2O ; '90% H2O/10% D2O' 'Sample 2_G1510%lab' solution '120 mM K+, 298 K, 0.22 mM' 3 ;0.22 mM DNA (5'-D(*CP*TP*CP*CP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*AP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*T)-3'), 0.22 mM [U-13C; U-15N]-Gua DNA (5'-D(*TP*TP*GP*GP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*AP*GP*TP*T)-3'), 90% H2O/10% D2O ; '90% H2O/10% D2O' 'Sample 3_G310%lab' solution '120 mM K+, 298 K, 0.22 mM' 4 ;0.22 mM DNA (5'-D(*CP*TP*CP*CP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*AP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*T)-3'), 0.22 mM [U-13C; U-15N]-Gua DNA (5'-D(*TP*TP*GP*GP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*AP*GP*TP*T)-3'), 90% H2O/10% D2O ; '90% H2O/10% D2O' 'Sample 4_G410%lab' solution '120 mM K+, 298 K, 0.22 mM' # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling 1 ;DNA (5'-D(*CP*TP*CP*CP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*AP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*T)-3') ; 0.42 ? mM 'natural abundance' 1 ;DNA (5'-D(*TP*TP*GP*GP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*AP*GP*TP*T)-3') ; 0.42 ? mM 'natural abundance' 2 ;DNA (5'-D(*CP*TP*CP*CP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*AP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*T)-3') ; 0.22 ? mM '[U-13C; U-15N]-Gua' 2 ;DNA (5'-D(*TP*TP*GP*GP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*AP*GP*TP*T)-3') ; 0.22 ? mM 'natural abundance' 3 ;DNA (5'-D(*CP*TP*CP*CP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*AP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*T)-3') ; 0.22 ? mM 'natural abundance' 3 ;DNA (5'-D(*TP*TP*GP*GP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*AP*GP*TP*T)-3') ; 0.22 ? mM '[U-13C; U-15N]-Gua' 4 ;DNA (5'-D(*CP*TP*CP*CP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*AP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*T)-3') ; 0.22 ? mM 'natural abundance' 4 ;DNA (5'-D(*TP*TP*GP*GP*AP*GP*CP*TP*GP*GP*AP*GP*TP*T)-3') ; 0.22 ? mM '[U-13C; U-15N]-Gua' # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 298 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units atm _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 120 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.details '120 mM K+, 298 K, 0.42 mM' _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units mM _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.spectrometer_id _pdbx_nmr_exptl.sample_state 1 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 1 isotropic 2 1 1 '2D 1H-13C HSQC aromatic' 1 isotropic 3 1 1 '2D DQF-COSY' 1 isotropic # _pdbx_nmr_refine.entry_id 8QKX _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 3 # loop_ _pdbx_nmr_software.ordinal _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.authors 1 'chemical shift assignment' 'CcpNmr Analysis' 2.4.2 CCPN 2 'structure calculation' Amber 18 'Case, Darden, Cheatham III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' 3 refinement Amber 18 'Case, Darden, Cheatham III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' 4 processing TopSpin 4.0.7 'Bruker Biospin' # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DA OP3 O N N 1 DA P P N N 2 DA OP1 O N N 3 DA OP2 O N N 4 DA "O5'" O N N 5 DA "C5'" C N N 6 DA "C4'" C N R 7 DA "O4'" O N N 8 DA "C3'" C N S 9 DA "O3'" O N N 10 DA "C2'" C N N 11 DA "C1'" C N R 12 DA N9 N Y N 13 DA C8 C Y N 14 DA N7 N Y N 15 DA C5 C Y N 16 DA C6 C Y N 17 DA N6 N N N 18 DA N1 N Y N 19 DA C2 C Y N 20 DA N3 N Y N 21 DA C4 C Y N 22 DA HOP3 H N N 23 DA HOP2 H N N 24 DA "H5'" H N N 25 DA "H5''" H N N 26 DA "H4'" H N N 27 DA "H3'" H N N 28 DA "HO3'" H N N 29 DA "H2'" H N N 30 DA "H2''" H N N 31 DA "H1'" H N N 32 DA H8 H N N 33 DA H61 H N N 34 DA H62 H N N 35 DA H2 H N N 36 DC OP3 O N N 37 DC P P N N 38 DC OP1 O N N 39 DC OP2 O N N 40 DC "O5'" O N N 41 DC "C5'" C N N 42 DC "C4'" C N R 43 DC "O4'" O N N 44 DC "C3'" C N S 45 DC "O3'" O N N 46 DC "C2'" C N N 47 DC "C1'" C N R 48 DC N1 N N N 49 DC C2 C N N 50 DC O2 O N N 51 DC N3 N N N 52 DC C4 C N N 53 DC N4 N N N 54 DC C5 C N N 55 DC C6 C N N 56 DC HOP3 H N N 57 DC HOP2 H N N 58 DC "H5'" H N N 59 DC "H5''" H N N 60 DC "H4'" H N N 61 DC "H3'" H N N 62 DC "HO3'" H N N 63 DC "H2'" H N N 64 DC "H2''" H N N 65 DC "H1'" H N N 66 DC H41 H N N 67 DC H42 H N N 68 DC H5 H N N 69 DC H6 H N N 70 DG OP3 O N N 71 DG P P N N 72 DG OP1 O N N 73 DG OP2 O N N 74 DG "O5'" O N N 75 DG "C5'" C N N 76 DG "C4'" C N R 77 DG "O4'" O N N 78 DG "C3'" C N S 79 DG "O3'" O N N 80 DG "C2'" C N N 81 DG "C1'" C N R 82 DG N9 N Y N 83 DG C8 C Y N 84 DG N7 N Y N 85 DG C5 C Y N 86 DG C6 C N N 87 DG O6 O N N 88 DG N1 N N N 89 DG C2 C N N 90 DG N2 N N N 91 DG N3 N N N 92 DG C4 C Y N 93 DG HOP3 H N N 94 DG HOP2 H N N 95 DG "H5'" H N N 96 DG "H5''" H N N 97 DG "H4'" H N N 98 DG "H3'" H N N 99 DG "HO3'" H N N 100 DG "H2'" H N N 101 DG "H2''" H N N 102 DG "H1'" H N N 103 DG H8 H N N 104 DG H1 H N N 105 DG H21 H N N 106 DG H22 H N N 107 DT OP3 O N N 108 DT P P N N 109 DT OP1 O N N 110 DT OP2 O N N 111 DT "O5'" O N N 112 DT "C5'" C N N 113 DT "C4'" C N R 114 DT "O4'" O N N 115 DT "C3'" C N S 116 DT "O3'" O N N 117 DT "C2'" C N N 118 DT "C1'" C N R 119 DT N1 N N N 120 DT C2 C N N 121 DT O2 O N N 122 DT N3 N N N 123 DT C4 C N N 124 DT O4 O N N 125 DT C5 C N N 126 DT C7 C N N 127 DT C6 C N N 128 DT HOP3 H N N 129 DT HOP2 H N N 130 DT "H5'" H N N 131 DT "H5''" H N N 132 DT "H4'" H N N 133 DT "H3'" H N N 134 DT "HO3'" H N N 135 DT "H2'" H N N 136 DT "H2''" H N N 137 DT "H1'" H N N 138 DT H3 H N N 139 DT H71 H N N 140 DT H72 H N N 141 DT H73 H N N 142 DT H6 H N N 143 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal DA OP3 P sing N N 1 DA OP3 HOP3 sing N N 2 DA P OP1 doub N N 3 DA P OP2 sing N N 4 DA P "O5'" sing N N 5 DA OP2 HOP2 sing N N 6 DA "O5'" "C5'" sing N N 7 DA "C5'" "C4'" sing N N 8 DA "C5'" "H5'" sing N N 9 DA "C5'" "H5''" sing N N 10 DA "C4'" "O4'" sing N N 11 DA "C4'" "C3'" sing N N 12 DA "C4'" "H4'" sing N N 13 DA "O4'" "C1'" sing N N 14 DA "C3'" "O3'" sing N N 15 DA "C3'" "C2'" sing N N 16 DA "C3'" "H3'" sing N N 17 DA "O3'" "HO3'" sing N N 18 DA "C2'" "C1'" sing N N 19 DA "C2'" "H2'" sing N N 20 DA "C2'" "H2''" sing N N 21 DA "C1'" N9 sing N N 22 DA "C1'" "H1'" sing N N 23 DA N9 C8 sing Y N 24 DA N9 C4 sing Y N 25 DA C8 N7 doub Y N 26 DA C8 H8 sing N N 27 DA N7 C5 sing Y N 28 DA C5 C6 sing Y N 29 DA C5 C4 doub Y N 30 DA C6 N6 sing N N 31 DA C6 N1 doub Y N 32 DA N6 H61 sing N N 33 DA N6 H62 sing N N 34 DA N1 C2 sing Y N 35 DA C2 N3 doub Y N 36 DA C2 H2 sing N N 37 DA N3 C4 sing Y N 38 DC OP3 P sing N N 39 DC OP3 HOP3 sing N N 40 DC P OP1 doub N N 41 DC P OP2 sing N N 42 DC P "O5'" sing N N 43 DC OP2 HOP2 sing N N 44 DC "O5'" "C5'" sing N N 45 DC "C5'" "C4'" sing N N 46 DC "C5'" "H5'" sing N N 47 DC "C5'" "H5''" sing N N 48 DC "C4'" "O4'" sing N N 49 DC "C4'" "C3'" sing N N 50 DC "C4'" "H4'" sing N N 51 DC "O4'" "C1'" sing N N 52 DC "C3'" "O3'" sing N N 53 DC "C3'" "C2'" sing N N 54 DC "C3'" "H3'" sing N N 55 DC "O3'" "HO3'" sing N N 56 DC "C2'" "C1'" sing N N 57 DC "C2'" "H2'" sing N N 58 DC "C2'" "H2''" sing N N 59 DC "C1'" N1 sing N N 60 DC "C1'" "H1'" sing N N 61 DC N1 C2 sing N N 62 DC N1 C6 sing N N 63 DC C2 O2 doub N N 64 DC C2 N3 sing N N 65 DC N3 C4 doub N N 66 DC C4 N4 sing N N 67 DC C4 C5 sing N N 68 DC N4 H41 sing N N 69 DC N4 H42 sing N N 70 DC C5 C6 doub N N 71 DC C5 H5 sing N N 72 DC C6 H6 sing N N 73 DG OP3 P sing N N 74 DG OP3 HOP3 sing N N 75 DG P OP1 doub N N 76 DG P OP2 sing N N 77 DG P "O5'" sing N N 78 DG OP2 HOP2 sing N N 79 DG "O5'" "C5'" sing N N 80 DG "C5'" "C4'" sing N N 81 DG "C5'" "H5'" sing N N 82 DG "C5'" "H5''" sing N N 83 DG "C4'" "O4'" sing N N 84 DG "C4'" "C3'" sing N N 85 DG "C4'" "H4'" sing N N 86 DG "O4'" "C1'" sing N N 87 DG "C3'" "O3'" sing N N 88 DG "C3'" "C2'" sing N N 89 DG "C3'" "H3'" sing N N 90 DG "O3'" "HO3'" sing N N 91 DG "C2'" "C1'" sing N N 92 DG "C2'" "H2'" sing N N 93 DG "C2'" "H2''" sing N N 94 DG "C1'" N9 sing N N 95 DG "C1'" "H1'" sing N N 96 DG N9 C8 sing Y N 97 DG N9 C4 sing Y N 98 DG C8 N7 doub Y N 99 DG C8 H8 sing N N 100 DG N7 C5 sing Y N 101 DG C5 C6 sing N N 102 DG C5 C4 doub Y N 103 DG C6 O6 doub N N 104 DG C6 N1 sing N N 105 DG N1 C2 sing N N 106 DG N1 H1 sing N N 107 DG C2 N2 sing N N 108 DG C2 N3 doub N N 109 DG N2 H21 sing N N 110 DG N2 H22 sing N N 111 DG N3 C4 sing N N 112 DT OP3 P sing N N 113 DT OP3 HOP3 sing N N 114 DT P OP1 doub N N 115 DT P OP2 sing N N 116 DT P "O5'" sing N N 117 DT OP2 HOP2 sing N N 118 DT "O5'" "C5'" sing N N 119 DT "C5'" "C4'" sing N N 120 DT "C5'" "H5'" sing N N 121 DT "C5'" "H5''" sing N N 122 DT "C4'" "O4'" sing N N 123 DT "C4'" "C3'" sing N N 124 DT "C4'" "H4'" sing N N 125 DT "O4'" "C1'" sing N N 126 DT "C3'" "O3'" sing N N 127 DT "C3'" "C2'" sing N N 128 DT "C3'" "H3'" sing N N 129 DT "O3'" "HO3'" sing N N 130 DT "C2'" "C1'" sing N N 131 DT "C2'" "H2'" sing N N 132 DT "C2'" "H2''" sing N N 133 DT "C1'" N1 sing N N 134 DT "C1'" "H1'" sing N N 135 DT N1 C2 sing N N 136 DT N1 C6 sing N N 137 DT C2 O2 doub N N 138 DT C2 N3 sing N N 139 DT N3 C4 sing N N 140 DT N3 H3 sing N N 141 DT C4 O4 doub N N 142 DT C4 C5 sing N N 143 DT C5 C7 sing N N 144 DT C5 C6 doub N N 145 DT C7 H71 sing N N 146 DT C7 H72 sing N N 147 DT C7 H73 sing N N 148 DT C6 H6 sing N N 149 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 8QKX 'double helix' 8QKX 'b-form double helix' 8QKX 'quadruple helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DC 1 1_555 B DG 12 1_555 0.325 -0.098 0.221 -2.906 -16.527 -1.231 1 A_DC1:DG36_B A 1 ? B 36 ? 19 1 1 A DT 2 1_555 B DA 11 1_555 -0.120 0.004 0.310 -18.332 -10.613 -0.121 2 A_DT2:DA35_B A 2 ? B 35 ? 20 1 1 A DC 3 1_555 B DG 10 1_555 0.574 -0.135 0.322 -12.140 -5.892 0.745 3 A_DC3:DG34_B A 3 ? B 34 ? 19 1 1 A DC 4 1_555 B DG 9 1_555 0.254 -0.108 0.014 -3.259 4.848 -1.239 4 A_DC4:DG33_B A 4 ? B 33 ? 19 1 1 A DA 5 1_555 B DT 8 1_555 0.120 -0.010 0.198 5.290 -11.260 -1.540 5 A_DA5:DT32_B A 5 ? B 32 ? 20 1 1 A DG 6 1_555 B DC 7 1_555 -0.279 -0.096 0.206 2.699 -13.342 -0.372 6 A_DG6:DC31_B A 6 ? B 31 ? 19 1 1 A DC 7 1_555 B DG 6 1_555 0.404 -0.111 0.189 -6.759 -9.966 -0.146 7 A_DC7:DG30_B A 7 ? B 30 ? 19 1 1 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 -0.041 -0.008 0.103 -15.813 -9.579 0.845 8 A_DT8:DA29_B A 8 ? B 29 ? 20 1 1 A DG 16 1_555 B DG 4 1_555 2.125 3.146 -0.255 -0.649 5.287 -88.562 9 A_DG16:DG28_B A 16 ? B 28 ? 6 3 1 A DA 14 1_555 A DT 24 1_555 -0.034 0.871 0.393 -8.276 15.553 162.437 10 A_DA14:DT24_A A 14 ? A 24 ? 21 2 1 A DG 15 1_555 A DG 18 1_555 2.143 3.179 0.134 -2.223 -6.089 -87.708 11 A_DG15:DG18_A A 15 ? A 18 ? 6 3 1 A DG 11 1_555 A DG 23 1_555 -2.006 -3.251 0.091 -5.092 9.980 88.996 12 A_DG11:DG23_A A 11 ? A 23 ? 6 3 1 A DG 10 1_555 A DG 22 1_555 -1.918 -3.227 0.122 -1.498 5.954 90.648 13 A_DG10:DG22_A A 10 ? A 22 ? 6 3 1 A DG 9 1_555 A DG 21 1_555 1.951 3.213 0.132 -1.550 4.494 -90.401 14 A_DG9:DG21_A A 9 ? A 21 ? 6 3 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DC 1 1_555 B DG 12 1_555 A DT 2 1_555 B DA 11 1_555 0.822 -0.122 3.565 4.406 2.179 39.160 -0.464 -0.645 3.622 3.235 -6.543 39.455 1 AA_DC1DT2:DA35DG36_BB A 1 ? B 36 ? A 2 ? B 35 ? 1 A DT 2 1_555 B DA 11 1_555 A DC 3 1_555 B DG 10 1_555 -0.081 0.062 3.237 -0.270 4.489 32.608 -0.650 0.098 3.217 7.947 0.478 32.908 2 AA_DT2DC3:DG34DA35_BB A 2 ? B 35 ? A 3 ? B 34 ? 1 A DC 3 1_555 B DG 10 1_555 A DC 4 1_555 B DG 9 1_555 0.914 0.608 3.192 4.081 1.617 35.121 0.763 -0.905 3.298 2.666 -6.731 35.386 3 AA_DC3DC4:DG33DG34_BB A 3 ? B 34 ? A 4 ? B 33 ? 1 A DC 4 1_555 B DG 9 1_555 A DA 5 1_555 B DT 8 1_555 -1.052 0.545 3.196 -2.684 -3.060 32.482 1.487 1.412 3.207 -5.444 4.774 32.730 4 AA_DC4DA5:DT32DG33_BB A 4 ? B 33 ? A 5 ? B 32 ? 1 A DA 5 1_555 B DT 8 1_555 A DG 6 1_555 B DC 7 1_555 -0.352 -0.105 3.325 -1.622 0.413 35.061 -0.237 0.336 3.336 0.686 2.691 35.100 5 AA_DA5DG6:DC31DT32_BB A 5 ? B 32 ? A 6 ? B 31 ? 1 A DG 6 1_555 B DC 7 1_555 A DC 7 1_555 B DG 6 1_555 0.112 -0.415 3.537 -0.172 -0.859 43.362 -0.471 -0.170 3.544 -1.163 0.233 43.370 6 AA_DG6DC7:DG30DC31_BB A 6 ? B 31 ? A 7 ? B 30 ? 1 A DC 7 1_555 B DG 6 1_555 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 1.182 -0.006 3.409 5.189 4.378 35.847 -0.657 -1.121 3.515 7.035 -8.338 36.464 7 AA_DC7DT8:DA29DG30_BB A 7 ? B 30 ? A 8 ? B 29 ? 1 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 A DG 16 1_555 B DG 4 1_555 3.294 -1.706 -1.919 -143.319 -92.235 5.405 -1.854 -0.102 -1.936 -48.584 75.492 170.444 8 AA_DT8DG16:DG28DA29_BB A 8 ? B 29 ? A 16 ? B 28 ? 1 A DA 14 1_555 A DT 24 1_555 A DG 15 1_555 A DG 18 1_555 -1.504 0.333 -2.831 0.422 7.020 107.942 0.283 0.924 -2.818 4.337 -0.261 108.098 9 AA_DA14DG15:DG18DT24_AA A 14 ? A 24 ? A 15 ? A 18 ? 1 A DG 15 1_555 A DG 18 1_555 A DG 11 1_555 A DG 23 1_555 -1.818 -3.293 -0.174 -9.796 5.938 178.448 -1.647 0.909 -0.174 2.969 4.899 178.456 10 AA_DG15DG11:DG23DG18_AA A 15 ? A 18 ? A 11 ? A 23 ? 1 A DG 11 1_555 A DG 23 1_555 A DG 10 1_555 A DG 22 1_555 0.605 0.327 -3.241 -3.156 -6.546 -22.169 -2.973 2.540 -2.912 16.464 -7.939 -23.316 11 AA_DG11DG10:DG22DG23_AA A 11 ? A 23 ? A 10 ? A 22 ? 1 A DG 10 1_555 A DG 22 1_555 A DG 9 1_555 A DG 21 1_555 -2.197 -3.346 -0.068 65.455 -164.592 156.314 -1.657 1.105 0.405 -82.324 -32.739 179.411 12 AA_DG10DG9:DG21DG22_AA A 10 ? A 22 ? A 9 ? A 21 ? # _pdbx_audit_support.funding_organization 'German Research Foundation (DFG)' _pdbx_audit_support.country Germany _pdbx_audit_support.grant_number 410497337 _pdbx_audit_support.ordinal 1 # _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.model 'AVANCE NEO' _pdbx_nmr_spectrometer.type ? _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Bruker _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 600 _pdbx_nmr_spectrometer.details ? # _atom_sites.entry_id 8QKX _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.Cartn_transform_axes ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_