data_8QYS # _entry.id 8QYS # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.395 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8QYS pdb_00008qys 10.2210/pdb8qys/pdb WWPDB D_1292134115 ? ? EMDB EMD-18761 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2024-02-21 2 'Structure model' 1 1 2024-03-06 3 'Structure model' 1 2 2024-04-17 4 'Structure model' 1 3 2024-08-28 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Database references' 3 4 'Structure model' 'Data collection' 4 4 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation_author 2 3 'Structure model' citation 3 3 'Structure model' citation_author 4 4 'Structure model' citation 5 4 'Structure model' citation_author 6 4 'Structure model' em_admin # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation_author.name' 2 4 'Structure model' '_citation.journal_volume' 3 4 'Structure model' '_citation.page_first' 4 4 'Structure model' '_citation.page_last' 5 4 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 6 4 'Structure model' '_em_admin.last_update' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8QYS _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-10-26 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Human preholo proteasome 20S core particle' _pdbx_database_related.db_id EMD-18761 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # loop_ _pdbx_contact_author.id _pdbx_contact_author.email _pdbx_contact_author.name_first _pdbx_contact_author.name_last _pdbx_contact_author.name_mi _pdbx_contact_author.role _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 3 schulman@biochem.mpg.de Brenda Schulman A. 'principal investigator/group leader' 0000-0002-3083-1126 4 jwhanna@bwh.harvard.edu John Hanna W. 'principal investigator/group leader' 0000-0003-2964-1058 5 wade_harper@hms.harvard.edu 'J. Wade' Harper ? 'principal investigator/group leader' 0000-0002-6944-7236 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Schulman, B.A.' 1 0000-0002-3083-1126 'Hanna, J.W.' 2 0000-0003-2964-1058 'Harper, J.W.' 3 0000-0002-6944-7236 'Adolf, F.' 4 0000-0002-9812-5711 'Du, J.' 5 0000-0003-1410-7020 'Rawson, S.D.' 6 0000-0002-2973-2630 'Walsh Jr, R.M.' 7 0000-0002-8939-8988 'Goodall, E.A.' 8 0000-0001-9876-5973 # loop_ _citation.abstract _citation.abstract_id_CAS _citation.book_id_ISBN _citation.book_publisher _citation.book_publisher_city _citation.book_title _citation.coordinate_linkage _citation.country _citation.database_id_Medline _citation.details _citation.id _citation.journal_abbrev _citation.journal_id_ASTM _citation.journal_id_CSD _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_full _citation.journal_issue _citation.journal_volume _citation.language _citation.page_first _citation.page_last _citation.title _citation.year _citation.database_id_CSD _citation.pdbx_database_id_DOI _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_patent _citation.unpublished_flag ? ? ? ? ? ? ? US ? ? primary Nat.Struct.Mol.Biol. ? ? 1545-9985 ? ? 31 ? 1176 1188 'Visualizing chaperone-mediated multistep assembly of the human 20S proteasome.' 2024 ? 10.1038/s41594-024-01268-9 38600324 ? ? ? ? ? ? ? ? ? US ? ? 1 Biorxiv ? ? 2692-8205 ? ? ? ? ? ? 'Visualizing chaperone-mediated multistep assembly of the human 20S proteasome.' 2024 ? 10.1101/2024.01.27.577538 38328185 ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Adolf, F.' 1 ? primary 'Du, J.' 2 ? primary 'Goodall, E.A.' 3 ? primary 'Walsh Jr., R.M.' 4 ? primary 'Rawson, S.' 5 ? primary 'von Gronau, S.' 6 ? primary 'Harper, J.W.' 7 ? primary 'Hanna, J.' 8 ? primary 'Schulman, B.A.' 9 ? 1 'Adolf, F.' 10 0000-0002-9812-5711 1 'Du, J.' 11 0000-0003-1410-7020 1 'Goodall, E.A.' 12 0000-0001-9876-5973 1 'Walsh Jr., R.M.' 13 0000-0002-8939-8988 1 'Rawson, S.' 14 0000-0002-2973-2630 1 'von Gronau, S.' 15 ? 1 'Harper, J.W.' 16 0000-0002-6944-7236 1 'Hanna, J.' 17 0000-0003-2964-1058 1 'Schulman, B.A.' 18 0000-0002-3083-1126 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-2' 25927.535 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-4' 27901.932 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-7' 26277.986 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-5' 26322.818 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-1' 27163.992 2 ? ? ? ? 6 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-3' 26870.670 2 ? ? ? ? 7 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-6' 27160.178 2 ? ? ? ? 8 polymer man 'Proteasome maturation protein' 15804.993 2 ? ? ? ? 9 polymer man 'Proteasome assembly chaperone 1' 32891.887 2 ? ? ? ? 10 polymer man 'Proteasome assembly chaperone 2' 29423.041 2 ? ? ? ? 11 polymer man 'Proteasome subunit beta type-7' 28292.514 2 3.4.25.1 ? ? ? 12 polymer man 'Proteasome subunit beta type-3' 22754.623 2 ? ? ? ? 13 polymer man 'Proteasome subunit beta type-2' 22462.838 2 ? ? ? ? 14 polymer man 'Proteasome subunit beta type-5' 22978.012 2 3.4.25.1 ? ? ? 15 polymer man 'Proteasome subunit beta type-1' 23421.793 2 ? ? ? ? 16 polymer man 'Proteasome subunit beta type-4' 23159.316 2 ? ? ? ? 17 polymer man 'Proteasome subunit beta type-6' 21158.898 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Macropain subunit C3,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C3,Proteasome component C3' 2 'Macropain subunit C9,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C9,Proteasome component C9,Proteasome subunit L' 3 'Proteasome subunit RC6-1,Proteasome subunit XAPC7' 4 'Macropain zeta chain,Multicatalytic endopeptidase complex zeta chain,Proteasome zeta chain' 5 ;30 kDa prosomal protein,PROS-30,Macropain subunit C2,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C2,Proteasome component C2,Proteasome nu chain ; 6 'Macropain subunit C8,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C8,Proteasome component C8' 7 '27 kDa prosomal protein,PROS-27,p27K,Macropain iota chain,Multicatalytic endopeptidase complex iota chain,Proteasome iota chain' 8 'Proteassemblin,Protein UMP1 homolog,hUMP1,Voltage-gated K channel beta subunit 4.1' 9 'PAC-1,Chromosome 21 leucine-rich protein,C21-LRP,Down syndrome critical region protein 2' 10 'PAC-2,Hepatocellular carcinoma-susceptibility protein 3,Tumor necrosis factor superfamily member 5-induced protein 1' 11 'Macropain chain Z,Multicatalytic endopeptidase complex chain Z,Proteasome subunit Z' 12 'Proteasome chain 13,Proteasome component C10-II,Proteasome theta chain' 13 'Macropain subunit C7-I,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C7-I,Proteasome component C7-I' 14 ;Macropain epsilon chain,Multicatalytic endopeptidase complex epsilon chain,Proteasome chain 6,Proteasome epsilon chain,Proteasome subunit MB1,Proteasome subunit X ; 15 'Macropain subunit C5,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C5,Proteasome component C5,Proteasome gamma chain' 16 ;26 kDa prosomal protein,HsBPROS26,PROS-26,Macropain beta chain,Multicatalytic endopeptidase complex beta chain,Proteasome beta chain,Proteasome chain 3,HsN3 ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMG PDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKA TAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; ;MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMG PDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKA TAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; A,R ? 2 'polypeptide(L)' no no ;RRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGITSD ANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWKAT CIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKHEE EEAKAERE ; ;RRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGITSD ANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWKAT CIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKHEE EEAKAERE ; B,S ? 3 'polypeptide(L)' no no ;YDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARI VINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIG RGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQSLKILNPEEIEKYVAEIEKEK ; ;YDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARI VINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIG RGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQSLKILNPEEIEKYVAEIEKEK ; C,T ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSG LIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSG TFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKD ; ;MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSG LIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSG TFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKD ; D,U ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTAD ARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMS IGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERP Q ; ;MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTAD ARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMS IGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERP Q ; E,V ? 6 'polypeptide(L)' no no ;GTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGLLAD ARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLKHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYGYWGC AIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDIVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTNGRHEIVPKDIREEAEKYAKESL K ; ;GTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGLLAD ARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLKHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYGYWGC AIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDIVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTNGRHEIVPKDIREEAEKYAKESL K ; F,W ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVM TGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYY CGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLV ALAE ; ;MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVM TGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYY CGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLV ALAE ; G,X ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MNARGLGSELKDSIPVTELSASGPFESHDLLRKGFSCVKNELLPSHPLELSEKNFQLNQDKMNFSTLRNIQGLFAPLKLQ MEFKAVQQVQRLPFLSSSNLSLDVLRGNDETIGFEDILNDPSQSEVMGEPHLMVEYKLGLL ; ;MNARGLGSELKDSIPVTELSASGPFESHDLLRKGFSCVKNELLPSHPLELSEKNFQLNQDKMNFSTLRNIQGLFAPLKLQ MEFKAVQQVQRLPFLSSSNLSLDVLRGNDETIGFEDILNDPSQSEVMGEPHLMVEYKLGLL ; H,Y ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MAATFFGEVVKAPCRAGTEDEEEEEEGRRETPEDREVRLQLARKREVRLLRRQTKTSLEVSLLEKYPCSKFIIAIGNNAV AFLSSFVMNSGVWEEVGCAKLWNEWCRTTDTTHLSSTEAFCVFYHLKSNPSVFLCQCSCYVAEDQQYQWLEKVFGSCPRK NMQITILTCRHVTDYKTSESTGSLPSPFLRALKTQNFKDSACCPLLEQPNIVHDLPAAVLSYCQVWKIPAILYLCYTDVM KLDLITVEAFKPILSTRSLKGLVKNIPQSTEILKKLMTTNEIQSNIYT ; ;MAATFFGEVVKAPCRAGTEDEEEEEEGRRETPEDREVRLQLARKREVRLLRRQTKTSLEVSLLEKYPCSKFIIAIGNNAV AFLSSFVMNSGVWEEVGCAKLWNEWCRTTDTTHLSSTEAFCVFYHLKSNPSVFLCQCSCYVAEDQQYQWLEKVFGSCPRK NMQITILTCRHVTDYKTSESTGSLPSPFLRALKTQNFKDSACCPLLEQPNIVHDLPAAVLSYCQVWKIPAILYLCYTDVM KLDLITVEAFKPILSTRSLKGLVKNIPQSTEILKKLMTTNEIQSNIYT ; I,Z ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MFVPCGESAPDLAGFTLLMPAVSVGNVGQLAMDLIISTLNMSKIGYFYTDCLVPMVGNNPYATTEGNSTELSINAEVYSL PSRKLVALQLRSIFIKYKSKPFCEKLLSWVKSSGCARVIVLSSSHSYQRNDLQLRSTPFRYLLTPSMQKSVQNKIKSLNW EEMEKSRCIPEIDDSEFCIRIPGGGITKTLYDESCSKEIQMAVLLKFVSEGDNIPDALGLVEYLNEWLQILKPLSDDPTV SASRWKIPSSWRLLFGSGLPPALF ; ;MFVPCGESAPDLAGFTLLMPAVSVGNVGQLAMDLIISTLNMSKIGYFYTDCLVPMVGNNPYATTEGNSTELSINAEVYSL PSRKLVALQLRSIFIKYKSKPFCEKLLSWVKSSGCARVIVLSSSHSYQRNDLQLRSTPFRYLLTPSMQKSVQNKIKSLNW EEMEKSRCIPEIDDSEFCIRIPGGGITKTLYDESCSKEIQMAVLLKFVSEGDNIPDALGLVEYLNEWLQILKPLSDDPTV SASRWKIPSSWRLLFGSGLPPALF ; J,a ? 11 'polypeptide(L)' no no ;AAVSVYAPPVGGFSFDNCRRNAVLEADFAKRGYKLPKVRKTGTTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFIS PNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGS TDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKNLVSEAIAAGIFNDLGSGSNIDLCVISKNKLDFLRPYTVPNKKGTR LGRYRCEKGTTAVLTEKITPLE ; ;AAVSVYAPPVGGFSFDNCRRNAVLEADFAKRGYKLPKVRKTGTTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFIS PNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGS TDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKNLVSEAIAAGIFNDLGSGSNIDLCVISKNKLDFLRPYTVPNKKGTR LGRYRCEKGTTAVLTEKITPLE ; K,b ? 12 'polypeptide(L)' no no ;IMSYNGGAVMAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGRQI KPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCAEQMYGMCESLWEPNMDPDH LFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD ; ;IMSYNGGAVMAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGRQI KPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCAEQMYGMCESLWEPNMDPDH LFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD ; L,c ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASNIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAA ANFTRRNLADCLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISRERAVELL RKCLEELQKRFILNLPTFSVRIIDKNGIHDLDNISFP ; ;MEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASNIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAA ANFTRRNLADCLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISRERAVELL RKCLEELQKRFILNLPTFSVRIIDKNGIHDLDNISFP ; M,d ? 14 'polypeptide(L)' no no ;PGIEMLHGTTTLAFKFRHGVIVAADSRATAGAYIASQTVKKVIEINPYLLGTMAGGAADCSFWERLLARQCRIYELRNKE RISVAAASKLLANMVYQYKGMGLSMGTMICGWDKRGPGLYYVDSEGNRISGATFSVGSGSVYAYGVMDRGYSYDLEVEQA YDLARRAIYQATYRDAYSGGAVNLYHVREDGWIRVSSDNVADLHEKYS ; ;PGIEMLHGTTTLAFKFRHGVIVAADSRATAGAYIASQTVKKVIEINPYLLGTMAGGAADCSFWERLLARQCRIYELRNKE RISVAAASKLLANMVYQYKGMGLSMGTMICGWDKRGPGLYYVDSEGNRISGATFSVGSGSVYAYGVMDRGYSYDLEVEQA YDLARRAIYQATYRDAYSGGAVNLYHVREDGWIRVSSDNVADLHEKYS ; N,e ? 15 'polypeptide(L)' no no ;FSPYVFNGGTILAIAGEDFAIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKIIEARLKMYKHSNNK AMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNV EHVPLSLDRAMRLVKDVFISAAERDVYTGDALRICIVTKEGIREETVSLRKD ; ;FSPYVFNGGTILAIAGEDFAIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKIIEARLKMYKHSNNK AMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNV EHVPLSLDRAMRLVKDVFISAAERDVYTGDALRICIVTKEGIREETVSLRKD ; O,f ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MVTGTSVLGVKFEGGVVIAADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLKQVLGQMVIDEELLGDGHSYS PRAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGYADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQPLLREVLEKQPVLSQTE ARDLVERCMRVLYYRDARSYNRFQTATVTEKGVEIEGPLSTETNWDIA ; ;MVTGTSVLGVKFEGGVVIAADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLKQVLGQMVIDEELLGDGHSYS PRAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGYADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQPLLREVLEKQPVLSQTE ARDLVERCMRVLYYRDARSYNRFQTATVTEKGVEIEGPLSTETNWDIA ; P,g ? 17 'polypeptide(L)' no no ;TTIMAVQFDGGVVLGADSRTTTGSYIANRVTDKLTPIHDRIFCCRSGSAADTQAVADAVTYQLGFHSIELNEPPLVHTAA SLFKEMCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQGYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLQFTANAL ALAMERDGSSGGVIRLAAIAESGVERQVLLGDQIPKF ; ;TTIMAVQFDGGVVLGADSRTTTGSYIANRVTDKLTPIHDRIFCCRSGSAADTQAVADAVTYQLGFHSIELNEPPLVHTAA SLFKEMCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQGYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLQFTANAL ALAMERDGSSGGVIRLAAIAESGVERQVLLGDQIPKF ; Q,h ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 GLU n 1 4 ARG n 1 5 GLY n 1 6 TYR n 1 7 SER n 1 8 PHE n 1 9 SER n 1 10 LEU n 1 11 THR n 1 12 THR n 1 13 PHE n 1 14 SER n 1 15 PRO n 1 16 SER n 1 17 GLY n 1 18 LYS n 1 19 LEU n 1 20 VAL n 1 21 GLN n 1 22 ILE n 1 23 GLU n 1 24 TYR n 1 25 ALA n 1 26 LEU n 1 27 ALA n 1 28 ALA n 1 29 VAL n 1 30 ALA n 1 31 GLY n 1 32 GLY n 1 33 ALA n 1 34 PRO n 1 35 SER n 1 36 VAL n 1 37 GLY n 1 38 ILE n 1 39 LYS n 1 40 ALA n 1 41 ALA n 1 42 ASN n 1 43 GLY n 1 44 VAL n 1 45 VAL n 1 46 LEU n 1 47 ALA n 1 48 THR n 1 49 GLU n 1 50 LYS n 1 51 LYS n 1 52 GLN n 1 53 LYS n 1 54 SER n 1 55 ILE n 1 56 LEU n 1 57 TYR n 1 58 ASP n 1 59 GLU n 1 60 ARG n 1 61 SER n 1 62 VAL n 1 63 HIS n 1 64 LYS n 1 65 VAL n 1 66 GLU n 1 67 PRO n 1 68 ILE n 1 69 THR n 1 70 LYS n 1 71 HIS n 1 72 ILE n 1 73 GLY n 1 74 LEU n 1 75 VAL n 1 76 TYR n 1 77 SER n 1 78 GLY n 1 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DA GLU 109 OE1 1346 1 Y 1 d GLU 109 ? OE2 ? DA GLU 109 OE2 1347 1 Y 1 e ARG 68 ? CG ? EA ARG 17 CG 1348 1 Y 1 e ARG 68 ? CD ? EA ARG 17 CD 1349 1 Y 1 e ARG 68 ? NE ? EA ARG 17 NE 1350 1 Y 1 e ARG 68 ? CZ ? EA ARG 17 CZ 1351 1 Y 1 e ARG 68 ? NH1 ? EA ARG 17 NH1 1352 1 Y 1 e ARG 68 ? NH2 ? EA ARG 17 NH2 1353 1 Y 1 h GLU 184 ? CG ? HA GLU 150 CG 1354 1 Y 1 h GLU 184 ? CD ? HA GLU 150 CD 1355 1 Y 1 h GLU 184 ? OE1 ? HA GLU 150 OE1 1356 1 Y 1 h GLU 184 ? OE2 ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.519 ? 79838 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 3.940 ? 8258 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.041 ? 9136 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 10240 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8QYS _struct.title 'Human preholo proteasome 20S core particle' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8QYS _struct_keywords.text 'Complex, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 1 ? S N N 2 ? T N N 3 ? U N N 4 ? V N N 5 ? W N N 6 ? X N N 7 ? Y N N 8 ? Z N N 9 ? AA N N 10 ? BA N N 11 ? CA N N 12 ? DA N N 13 ? EA N N 14 ? FA N N 15 ? GA N N 16 ? 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8 ;MNARGLGSELKDSIPVTELSASGPFESHDLLRKGFSCVKNELLPSHPLELSEKNFQLNQDKMNFSTLRNIQGLFAPLKLQ MEFKAVQQVQRLPFLSSSNLSLDVLRGNDETIGFEDILNDPSQSEVMGEPHLMVEYKLGLL ; 1 9 UNP PSMG1_HUMAN O95456 ? 9 ;MAATFFGEVVKAPCRAGTEDEEEEEEGRRETPEDREVRLQLARKREVRLLRRQTKTSLEVSLLEKYPCSKFIIAIGNNAV AFLSSFVMNSGVWEEVGCAKLWNEWCRTTDTTHLSSTEAFCVFYHLKSNPSVFLCQCSCYVAEDQQYQWLEKVFGSCPRK NMQITILTCRHVTDYKTSESTGSLPSPFLRALKTQNFKDSACCPLLEQPNIVHDLPAAVLSYCQVWKIPAILYLCYTDVM KLDLITVEAFKPILSTRSLKGLVKNIPQSTEILKKLMTTNEIQSNIYT ; 1 10 UNP PSMG2_HUMAN Q969U7 ? 10 ;MFVPCGESAPDLAGFTLLMPAVSVGNVGQLAMDLIISTLNMSKIGYFYTDCLVPMVGNNPYATTEGNSTELSINAEVYSL PSRKLVALQLRSIFIKYKSKPFCEKLLSWVKSSGCARVIVLSSSHSYQRNDLQLRSTPFRYLLTPSMQKSVQNKIKSLNW EEMEKSRCIPEIDDSEFCIRIPGGGITKTLYDESCSKEIQMAVLLKFVSEGDNIPDALGLVEYLNEWLQILKPLSDDPTV SASRWKIPSSWRLLFGSGLPPALF ; 1 11 UNP PSB7_HUMAN Q99436 ? 11 ;AAVSVYAPPVGGFSFDNCRRNAVLEADFAKRGYKLPKVRKTGTTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFIS PNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGS TDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKNLVSEAIAAGIFNDLGSGSNIDLCVISKNKLDFLRPYTVPNKKGTR LGRYRCEKGTTAVLTEKITPLE ; 2 12 UNP PSB3_HUMAN P49720 ? 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17 ;TTIMAVQFDGGVVLGADSRTTTGSYIANRVTDKLTPIHDRIFCCRSGSAADTQAVADAVTYQLGFHSIELNEPPLVHTAA SLFKEMCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQVYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLQFTANAL ALAMERDGSSGGVIRLAAIAESGVERQVLLGDQIPKF ; 35 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8QYS A 1 ? 234 ? 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