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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.527 ? 39609 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.928 ? 3918 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.043 ? 4839 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 5019 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8R9W _struct.title 'PDCoV spike glycoprotein ectodomain in complex with the 22C10 antibody Fab fragment' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8R9W _struct_keywords.text 'Spike, coronavirus, antibody, complex, PDCoV, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 4 ? K N N 5 ? L N N 4 ? M N N 6 ? N N N 4 ? O N N 4 ? P N N 5 ? Q N N 4 ? R N N 6 ? S N N 4 ? 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A ASN 311 A NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 453 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? A ASN 472 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 475 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? A ASN 494 A NAG 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 507 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? A ASN 526 A NAG 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 633 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? A ASN 652 A NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 642 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? A ASN 661 A NAG 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 769 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 788 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 895 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 914 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? 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N-Glycosylation covale23 covale one ? H ASN 292 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? B ASN 311 B NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? H ASN 453 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? B ASN 472 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? H ASN 475 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? B ASN 494 B NAG 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? H ASN 507 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? B ASN 526 B NAG 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? H ASN 633 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? B ASN 652 B NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? H ASN 642 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? B ASN 661 B NAG 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? H ASN 769 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? B ASN 788 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? H ASN 895 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? B ASN 914 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? H ASN 926 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? B ASN 945 B NAG 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? H ASN 984 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? B ASN 1003 B NAG 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? I ASN 55 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? C ASN 74 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? I ASN 80 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? C ASN 99 C NAG 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? I ASN 143 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? C ASN 162 C NAG 1108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? I ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? C ASN 184 C NAG 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? I ASN 222 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? C ASN 241 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? I ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? C ASN 251 C NAG 1111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? I ASN 292 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? C ASN 311 C NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? I ASN 453 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 472 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? I ASN 475 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? C ASN 494 C NAG 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? I ASN 507 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? C ASN 526 C NAG 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? I ASN 633 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? C ASN 652 C NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? I ASN 642 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? C ASN 661 C NAG 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? I ASN 769 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? C ASN 788 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? I ASN 895 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? C ASN 914 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? I ASN 926 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? C ASN 945 C NAG 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? I ASN 984 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? C ASN 1003 C NAG 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale49 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale50 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale51 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K BMA . C1 ? ? J NAG 2 J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale52 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale53 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale54 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M BMA . C1 ? ? M NAG 2 M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale55 covale both ? M BMA . O3 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? M BMA 3 M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale56 covale both ? M BMA . O6 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? M BMA 3 M MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale57 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale58 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale59 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale60 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale61 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale62 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale63 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R BMA . C1 ? ? R NAG 2 R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale64 covale both ? R BMA . O3 ? ? ? 1_555 R MAN . C1 ? ? R BMA 3 R MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale65 covale both ? R BMA . O6 ? ? ? 1_555 R MAN . C1 ? ? R BMA 3 R MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale66 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale67 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale68 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale69 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale70 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale71 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale72 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W BMA . C1 ? ? W NAG 2 W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale73 covale both ? W BMA . O3 ? ? ? 1_555 W MAN . C1 ? ? W BMA 3 W MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale74 covale both ? W BMA . O6 ? ? ? 1_555 W MAN . C1 ? ? W BMA 3 W MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale75 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 6 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 6 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 5 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 6 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 4 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 5 ? AD9 ? 3 ? AE1 ? 6 ? AE2 ? 6 ? AE3 ? 5 ? AE4 ? 3 ? AE5 ? 3 ? AE6 ? 5 ? AE7 ? 5 ? 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parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC1 5 6 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 4 5 ? anti-parallel AC7 5 6 ? anti-parallel AC8 1 2 ? parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? 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parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? parallel AE6 3 4 ? parallel AE6 4 5 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE7 4 5 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AE9 4 5 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF5 1 2 ? parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 3 4 ? anti-parallel AF8 4 5 ? anti-parallel AF8 5 6 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AF9 4 5 ? anti-parallel AF9 5 6 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel AG1 4 5 ? anti-parallel AG2 1 2 ? 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