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'Spodoptera frugiperda' 7108 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 2 1 sample 1 26 'synthetic construct' ? 32630 ? 3 1 sample 1 26 'synthetic construct' ? 32630 ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight AGS non-polymer . 'PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER' ;ATP-GAMMA-S; ADENOSINE 5'-(3-THIOTRIPHOSPHATE); ADENOSINE 5'-(GAMMA-THIOTRIPHOSPHATE); ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE MONOTHIOPHOSPHATE ; 'C10 H16 N5 O12 P3 S' 523.247 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 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'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 MET 1 1 ? ? ? A . n A 1 2 ALA 2 2 ? ? ? A . n A 1 3 HIS 3 3 ? ? ? A . n A 1 4 TYR 4 4 ? ? ? 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K N N 9 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ORC1_HUMAN Q13415 ? 1 ;MAHYPTRLKTRKTYSWVGRPLLDRKLHYQTYREMCVKTEGCSTEIHIQIGQFVLIEGDDDENPYVAKLLELFEDDSDPPP KKRARVQWFVRFCEVPACKRHLLGRKPGAQEIFWYDYPACDSNINAETIIGLVRVIPLAPKDVVPTNLKNEKTLFVKLSW NEKKFRPLSSELFAELNKPQESAAKCQKPVRAKSKSAESPSWTPAEHVAKRIESRHSASKSRQTPTHPLTPRARKRLELG NLGNPQMSQQTSCASLDSPGRIKRKVAFSEITSPSKRSQPDKLQTLSPALKAPEKTRETGLSYTEDDKKASPEHRIILRT RIAASKTIDIREERTLTPISGGQRSSVVPSVILKPENIKKRDAKEAKAQNEATSTPHRIRRKSSVLTMNRIRQQLRFLGN SKSDQEEKEILPAAEISDSSSDEEEASTPPLPRRAPRTVSRNLRSSLKSSLHTLTKVPKKSLKPRTPRCAAPQIRSRSLA AQEPASVLEEARLRLHVSAVPESLPCREQEFQDIYNFVESKLLDHTGGCMYISGVPGTGKTATVHEVIRCLQQAAQANDV PPFQYIEVNGMKLTEPHQVYVQILQKLTGQKATANHAAELLAKQFCTRGSPQETTVLLVDELDLLWTHKQDIMYNLFDWP THKEARLVVLAIANTMDLPERIMMNRVSSRLGLTRMCFQPYTYSQLQQILRSRLKHLKAFEDDAIQLVARKVAALSGDAR RCLDICRRATEICEFSQQKPDSPGLVTIAHSMEAVDEMFSSSYITAIKNSSVLEQSFLRAILAEFRRSGLEEATFQQIYS QHVALCRMEGLPYPTMSETMAVCSHLGSCRLLLVEPSRNDLLLRVRLNVSQDDVLYALKDE ; 1 2 PDB 8S0C 8S0C ? 2 ? 1 3 PDB 8S0C 8S0C ? 3 ? 1 4 UNP ORC2_HUMAN Q13416 ? 4 ;MSKPELKEDKMLEVHFVGDDDVLNHILDREGGAKLKKERAQLLVNPKKIIKKPEYDLEEDDQEVLKDQNYVEIMGRDVQE SLKNGSATGGGNKVYSFQNRKHSEKMAKLASELAKTPQKSVSFSLKNDPEITINVPQSSKGHSASDKVQPKNNDKSEFLS TAPRSLRKRLIVPRSHSDSESEYSASNSEDDEGVAQEHEEDTNAVIFSQKIQAQNRVVSAPVGKETPSKRMKRDKTSDLV EEYFEAHSSSKVLTSDRTLQKLKRAKLDQQTLRNLLSKVSPSFSAELKQLNQQYEKLFHKWMLQLHLGFNIVLYGLGSKR DLLERFRTTMLQDSIHVVINGFFPGISVKSVLNSITEEVLDHMGTFRSILDQLDWIVNKFKEDSSLELFLLIHNLDSQML RGEKSQQIIGQLSSLHNIYLIASIDHLNAPLMWDHAKQSLFNWLWYETTTYSPYTEETSYENSLLVKQSGSLPLSSLTHV LRSLTPNARGIFRLLIKYQLDNQDNPSYIGLSFQDFYQQCREAFLVNSDLTLRAQLTEFRDHKLIRTKKGTDGVEYLLIP VDNGTLTDFLEKEEEEA ; 1 5 UNP ORC3_HUMAN Q9UBD5 Q9UBD5-2 5 ;MATSSMSKGCFVFKPNSKKRKISLPIEDYFNKGKNEPEDSKLRFETYQLIWQQMKSENERLQEELNKNLFDNLIEFLQKS HSGFQKNSRDLGGQIKLREIPTAALVLGVNVTDHDLTFGSLTEALQNNVTPYVVSLQAKDCPDMKHFLQKLISQLMDCCV DIKSKEEESVHVTQRKTHYSMDSLSSWYMTVTQKTDPKMLSKKRTTSSQWQSPPVVVILKDMESFATKVLQDFIIISSQH LHEFPLILIFGIATSPIIIHRLLPHAVSSLLCIELFQSLSCKEHLTTVLDKLLLTTQFPFKINEKVLQVLTNIFLYHDFS VQNFIKGLQLSLLEHFYSQPLSVLCCNLPEAKRRINFLSNNQCENIRRLPSFRRYVEKQASEKQVALLTNERYLKEETQL LLENLHVYHMNYFLVLRCLHKFTSSLPKYPLGRQIRELYCTCLEKNIWDSEEYASVLQLLRMLAKDELMTILEKCFKVFK SYCENHLGSTAKRIEEFLAQFQSLDAETKEEEDASGSQPKGLQKTDLYHLQKSLLEMKELRRSKKQTKFEVLRENVVNFI DCLVREYLLPPETQPLHEVVYFSAAHALREHLNAAPRIALHTALNNPYYYLKNEALKSEEGCIPNIAPDICIAYKLHLEC SRLINLVDWSEAFATVVTAAEKMDANSATSEEMNEIIHARFIRAVSELELLGFIKPTKQKTDHVARLTWGGC ; 1 6 UNP ORC4_HUMAN O43929 ? 6 ;MSSRKSKSNSLIHTECLSQVQRILRERFCRQSPHSNLFGVQVQYKHLSELLKRTALHGESNSVLIIGPRGSGKTMLINHA LKELMEIEEVSENVLQVHLNGLLQINDKIALKEITRQLNLENVVGDKVFGSFAENLSFLLEALKKGDRTSSCPVIFILDE FDLFAHHKNQTLLYNLFDISQSAQTPIAVIGLTCRLDILELLEKRVKSRFSHRQIHLMNSFGFPQYVKIFKEQLSLPAEF PDKVFAEKWNENVQYLSEDRSVQEVLQKHFNISKNLRSLHMLLMLALNRVTASHPFMTAVDLMEASQLCSMDSKANIVHG LSVLEICLIIAMKHLNDIYEEEPFNFQMVYNEFQKFVQRKAHSVYNFEKPVVMKAFEHLQQLELIKPMERTSGNSQREYQ LMKLLLDNTQIMNALQKYPNCPTDVRQWATSSLSWL ; 1 7 UNP ORC5_HUMAN O43913 ? 7 ;MPHLENVVLCRESQVSILQSLFGERHHFSFPSIFIYGHTASGKTYVTQTLLKTLELPHVFVNCVECFTLRLLLEQILNKL NHLSSSEDGCSTEITCETFNDFVRLFKQVTTAENLKDQTVYIVLDKAEYLRDMEANLLPGFLRLQELADRNVTVLFLSEI VWEKFRPNTGCFEPFVLYFPDYSIGNLQKILSHDHPPEYSADFYAAYINILLGVFYTVCRDLKELRHLAVLNFPKYCEPV VKGEASERDTRKLWRNIEPHLKKAMQTVYLREISSSQWEKLQKDDTDPGQLKGLSAHTHVELPYYSKFILIAAYLASYNP ARTDKRFFLKHHGKIKKTNFLKKHEKTSNHLLGPKPFPLDRLLAILYSIVDSRVAPTANIFSQITSLVTLQLLTLVGHDD QLDGPKYKCTVSLDFIRAIARTVNFDIIKYLYDFL ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8S0C A 1 ? 861 ? 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ASN B 428 TRP B 433 5 ? 6 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP D 434 ? PHE D 441 ? ASP B 434 PHE B 441 1 ? 8 HELX_P HELX_P17 AB8 ILE E 26 ? ASN E 31 ? ILE C 26 ASN C 31 1 ? 6 HELX_P HELX_P18 AB9 GLU E 36 ? GLN E 85 ? GLU C 36 GLN C 85 1 ? 50 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP E 113 ? ASN E 127 ? ASP C 113 ASN C 127 1 ? 15 HELX_P HELX_P20 AC2 GLN E 137 ? CYS E 141 ? GLN C 137 CYS C 141 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP E 143 ? CYS E 159 ? ASP C 143 CYS C 159 1 ? 17 HELX_P HELX_P22 AC4 SER E 180 ? GLN E 193 ? SER C 180 GLN C 193 1 ? 14 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP E 221 ? PHE E 225 ? ASP C 221 PHE C 225 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 ALA E 226 ? GLN E 239 ? ALA C 226 GLN C 239 1 ? 14 HELX_P HELX_P25 AC7 ILE E 257 ? LEU E 263 ? ILE C 257 LEU C 263 1 ? 7 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO E 264 ? SER E 269 ? PRO C 264 SER C 269 1 ? 6 HELX_P HELX_P27 AC9 LYS E 282 ? LYS E 291 ? LYS C 282 LYS C 291 1 ? 10 HELX_P HELX_P28 AD1 ASN E 303 ? ASP E 318 ? ASN C 303 ASP C 318 1 ? 16 HELX_P HELX_P29 AD2 VAL E 321 ? GLN E 339 ? 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AA6 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? parallel AA5 3 4 ? parallel AA5 4 5 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 832 ? LEU A 833 ? LEU A 832 LEU A 833 AA1 2 ARG A 846 ? LEU A 847 ? ARG A 846 LEU A 847 AA2 1 HIS D 336 ? ILE D 339 ? HIS B 336 ILE B 339 AA2 2 LEU D 388 ? ILE D 392 ? LEU B 388 ILE B 392 AA2 3 ILE D 418 ? ILE D 424 ? ILE B 418 ILE B 424 AA2 4 ASN D 310 ? TYR D 314 ? ASN B 310 TYR B 314 AA2 5 TRP D 443 ? GLU D 447 ? TRP B 443 GLU B 447 AA3 1 VAL E 133 ? LEU E 136 ? VAL C 133 LEU C 136 AA3 2 VAL E 216 ? LEU E 219 ? VAL C 216 LEU C 219 AA3 3 ILE E 247 ? GLY E 251 ? ILE C 247 GLY C 251 AA3 4 ILE E 100 ? LEU E 105 ? ILE C 100 LEU C 105 AA3 5 LEU E 271 ? LEU E 275 ? LEU C 271 LEU C 275 AA4 1 LEU F 95 ? ASN F 100 ? LEU D 95 ASN D 100 AA4 2 VAL F 154 ? ASP F 159 ? VAL D 154 ASP D 159 AA4 3 ILE F 187 ? THR F 193 ? ILE D 187 THR D 193 AA4 4 ASN F 61 ? ILE F 66 ? ASN D 61 ILE D 66 AA4 5 GLN F 214 ? HIS F 216 ? GLN D 214 HIS D 216 AA5 1 HIS G 58 ? ASN G 62 ? HIS E 58 ASN E 62 AA5 2 VAL G 120 ? ASP G 125 ? VAL E 120 ASP E 125 AA5 3 VAL G 152 ? PHE G 156 ? VAL E 152 PHE E 156 AA5 4 SER G 32 ? TYR G 36 ? SER E 32 TYR E 36 AA5 5 PHE G 175 ? TYR G 178 ? PHE E 175 TYR E 178 AA6 1 LEU G 393 ? LEU G 395 ? LEU E 393 LEU E 395 AA6 2 TYR G 407 ? CYS G 409 ? TYR E 407 CYS E 409 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N LEU A 833 ? N LEU A 833 O ARG A 846 ? O ARG A 846 AA2 1 2 N VAL D 337 ? N VAL B 337 O LEU D 391 ? O LEU B 391 AA2 2 3 N LEU D 390 ? N LEU B 390 O TYR D 419 ? O TYR B 419 AA2 3 4 O ILE D 424 ? O ILE B 424 N LEU D 313 ? N LEU B 313 AA2 4 5 N VAL D 312 ? N VAL B 312 O LEU D 444 ? O LEU B 444 AA3 1 2 N LEU E 136 ? N LEU C 136 O ILE E 218 ? O ILE C 218 AA3 2 3 N LEU E 219 ? N LEU C 219 O ILE E 249 ? O ILE C 249 AA3 3 4 O LEU E 248 ? O LEU C 248 N PRO E 101 ? N PRO C 101 AA3 4 5 N ALA E 104 ? N ALA C 104 O GLU E 274 ? O GLU C 274 AA4 1 2 N VAL F 97 ? N VAL D 97 O ILE F 157 ? O ILE D 157 AA4 2 3 N PHE F 156 ? N PHE D 156 O ALA F 188 ? O ALA D 188 AA4 3 4 O GLY F 191 ? O GLY D 191 N ILE F 65 ? N ILE D 65 AA4 4 5 N ILE F 66 ? N ILE D 66 O ILE F 215 ? O ILE D 215 AA5 1 2 N VAL G 59 ? N VAL E 59 O TYR G 121 ? O TYR E 121 AA5 2 3 N ILE G 122 ? N ILE E 122 O THR G 153 ? O THR E 153 AA5 3 4 O PHE G 156 ? O PHE E 156 N ILE G 35 ? N ILE E 35 AA5 4 5 N SER G 32 ? N SER E 32 O PHE G 175 ? O PHE E 175 AA6 1 2 N THR G 394 ? N THR E 394 O LYS G 408 ? O LYS E 408 # _pdbx_entry_details.entry_id 8S0C _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ASP B 333 ? ? -96.03 58.41 2 1 TYR B 454 ? ? -90.74 52.35 3 1 VAL C 129 ? ? -96.86 -62.99 4 1 LEU C 341 ? ? -65.59 1.35 5 1 ARG D 289 ? ? -97.46 33.26 6 1 PHE D 344 ? ? -160.69 -169.26 7 1 ALA E 127 ? ? -68.60 0.69 8 1 MET E 133 ? ? -95.08 -61.39 9 1 ARG E 143 ? ? -99.08 34.39 10 1 ASN E 151 ? ? 60.09 65.21 11 1 THR E 267 ? ? -93.90 -60.75 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 8S0C _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 7JPS _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.details 'The PDB model was fit into the map and chains A to E were used as a starting model.' _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name PDB _em_3d_fitting_list.type 'experimental model' _em_3d_fitting_list.accession_code 7JPS _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 # _em_3d_reconstruction.entry_id 8S0C _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details 'Local refinement in cryoSPARC' _em_3d_reconstruction.resolution 4 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 182341 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details _em_entity_assembly.entity_id_list 1 0 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX 'H. sapiens ORC1-5 bound to double stranded DNA as part of the MCM-ORC complex' ? ? ? '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7' 2 1 RECOMBINANT COMPLEX 'Double stranded DNA' ? ? ? '2, 3' 3 1 RECOMBINANT COMPLEX 'H. sapiens ORC1-5' ? ? ? '1, 4, 5, 6, 7' # _em_imaging.entry_id 8S0C _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 130000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'UltrAuFoil R1.2/1.3' _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 8S0C _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 90 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 295 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 8S0C _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? A MET 1 2 1 Y 1 A ALA 2 ? A ALA 2 3 1 Y 1 A HIS 3 ? A HIS 3 4 1 Y 1 A TYR 4 ? A TYR 4 5 1 Y 1 A PRO 5 ? A PRO 5 6 1 Y 1 A THR 6 ? A THR 6 7 1 Y 1 A ARG 7 ? A ARG 7 8 1 Y 1 A LEU 8 ? A LEU 8 9 1 Y 1 A LYS 9 ? A LYS 9 10 1 Y 1 A THR 10 ? A THR 10 11 1 Y 1 A ARG 11 ? A ARG 11 12 1 Y 1 A LYS 12 ? A LYS 12 13 1 Y 1 A THR 13 ? A THR 13 14 1 Y 1 A TYR 14 ? A TYR 14 15 1 Y 1 A SER 15 ? A SER 15 16 1 Y 1 A TRP 16 ? A TRP 16 17 1 Y 1 A VAL 17 ? A VAL 17 18 1 Y 1 A GLY 18 ? A GLY 18 19 1 Y 1 A ARG 19 ? A ARG 19 20 1 Y 1 A PRO 20 ? A PRO 20 21 1 Y 1 A LEU 21 ? A LEU 21 22 1 Y 1 A LEU 22 ? A LEU 22 23 1 Y 1 A ASP 23 ? A ASP 23 24 1 Y 1 A ARG 24 ? A ARG 24 25 1 Y 1 A LYS 25 ? A LYS 25 26 1 Y 1 A LEU 26 ? A LEU 26 27 1 Y 1 A HIS 27 ? A HIS 27 28 1 Y 1 A TYR 28 ? A TYR 28 29 1 Y 1 A GLN 29 ? A GLN 29 30 1 Y 1 A THR 30 ? A THR 30 31 1 Y 1 A TYR 31 ? A TYR 31 32 1 Y 1 A ARG 32 ? A ARG 32 33 1 Y 1 A GLU 33 ? A GLU 33 34 1 Y 1 A MET 34 ? A MET 34 35 1 Y 1 A CYS 35 ? A CYS 35 36 1 Y 1 A VAL 36 ? A VAL 36 37 1 Y 1 A LYS 37 ? A LYS 37 38 1 Y 1 A THR 38 ? A THR 38 39 1 Y 1 A GLU 39 ? A GLU 39 40 1 Y 1 A GLY 40 ? A GLY 40 41 1 Y 1 A CYS 41 ? A CYS 41 42 1 Y 1 A SER 42 ? A SER 42 43 1 Y 1 A THR 43 ? A THR 43 44 1 Y 1 A GLU 44 ? A GLU 44 45 1 Y 1 A ILE 45 ? A ILE 45 46 1 Y 1 A HIS 46 ? A HIS 46 47 1 Y 1 A ILE 47 ? A ILE 47 48 1 Y 1 A GLN 48 ? A GLN 48 49 1 Y 1 A ILE 49 ? A ILE 49 50 1 Y 1 A GLY 50 ? A GLY 50 51 1 Y 1 A GLN 51 ? A GLN 51 52 1 Y 1 A PHE 52 ? A PHE 52 53 1 Y 1 A VAL 53 ? A VAL 53 54 1 Y 1 A LEU 54 ? A LEU 54 55 1 Y 1 A ILE 55 ? A ILE 55 56 1 Y 1 A GLU 56 ? A GLU 56 57 1 Y 1 A GLY 57 ? A GLY 57 58 1 Y 1 A ASP 58 ? A ASP 58 59 1 Y 1 A ASP 59 ? A ASP 59 60 1 Y 1 A ASP 60 ? A ASP 60 61 1 Y 1 A GLU 61 ? A GLU 61 62 1 Y 1 A ASN 62 ? A ASN 62 63 1 Y 1 A PRO 63 ? A PRO 63 64 1 Y 1 A TYR 64 ? A TYR 64 65 1 Y 1 A VAL 65 ? A VAL 65 66 1 Y 1 A ALA 66 ? A ALA 66 67 1 Y 1 A LYS 67 ? A LYS 67 68 1 Y 1 A LEU 68 ? A LEU 68 69 1 Y 1 A LEU 69 ? A LEU 69 70 1 Y 1 A GLU 70 ? A GLU 70 71 1 Y 1 A LEU 71 ? A LEU 71 72 1 Y 1 A PHE 72 ? A PHE 72 73 1 Y 1 A GLU 73 ? A GLU 73 74 1 Y 1 A ASP 74 ? A ASP 74 75 1 Y 1 A ASP 75 ? A ASP 75 76 1 Y 1 A SER 76 ? A SER 76 77 1 Y 1 A ASP 77 ? A ASP 77 78 1 Y 1 A PRO 78 ? A PRO 78 79 1 Y 1 A PRO 79 ? A PRO 79 80 1 Y 1 A PRO 80 ? A PRO 80 81 1 Y 1 A LYS 81 ? A LYS 81 82 1 Y 1 A LYS 82 ? A LYS 82 83 1 Y 1 A ARG 83 ? A ARG 83 84 1 Y 1 A ALA 84 ? A ALA 84 85 1 Y 1 A ARG 85 ? A ARG 85 86 1 Y 1 A VAL 86 ? A VAL 86 87 1 Y 1 A GLN 87 ? A GLN 87 88 1 Y 1 A TRP 88 ? A TRP 88 89 1 Y 1 A PHE 89 ? A PHE 89 90 1 Y 1 A VAL 90 ? A VAL 90 91 1 Y 1 A ARG 91 ? A ARG 91 92 1 Y 1 A PHE 92 ? A PHE 92 93 1 Y 1 A CYS 93 ? A CYS 93 94 1 Y 1 A GLU 94 ? A GLU 94 95 1 Y 1 A VAL 95 ? A VAL 95 96 1 Y 1 A PRO 96 ? A PRO 96 97 1 Y 1 A ALA 97 ? A ALA 97 98 1 Y 1 A CYS 98 ? A CYS 98 99 1 Y 1 A LYS 99 ? A LYS 99 100 1 Y 1 A ARG 100 ? A ARG 100 101 1 Y 1 A HIS 101 ? A HIS 101 102 1 Y 1 A LEU 102 ? A LEU 102 103 1 Y 1 A LEU 103 ? A LEU 103 104 1 Y 1 A GLY 104 ? 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N 23 AGS N9 C4 sing Y N 24 AGS C8 N7 doub Y N 25 AGS N7 C5 sing Y N 26 AGS C5 C6 sing Y N 27 AGS C5 C4 doub Y N 28 AGS C6 N6 sing N N 29 AGS C6 N1 doub Y N 30 AGS N1 C2 sing Y N 31 AGS C2 N3 doub Y N 32 AGS N3 C4 sing Y N 33 AGS O2G HOG2 sing N N 34 AGS O3G H21 sing N N 35 AGS O2B HOB2 sing N N 36 AGS O2A HOA2 sing N N 37 AGS "C5'" "H5'1" sing N N 38 AGS "C5'" "H5'2" sing N N 39 AGS "C4'" "H4'" sing N N 40 AGS "C3'" "H3'" sing N N 41 AGS "O3'" "HO3'" sing N N 42 AGS "C2'" "H2'" sing N N 43 AGS "O2'" "HO2'" sing N N 44 AGS "C1'" "H1'" sing N N 45 AGS C8 H8 sing N N 46 AGS N6 HN61 sing N N 47 AGS N6 HN62 sing N N 48 AGS C2 H2 sing N N 49 ALA N CA sing N N 50 ALA N H sing N N 51 ALA N H2 sing N N 52 ALA CA C sing N N 53 ALA CA CB sing N N 54 ALA CA HA sing N N 55 ALA C O doub N N 56 ALA C OXT sing N N 57 ALA CB HB1 sing N N 58 ALA CB HB2 sing N N 59 ALA CB HB3 sing N N 60 ALA OXT HXT sing N N 61 ARG N CA sing N N 62 ARG N H sing N N 63 ARG N H2 sing N N 64 ARG CA C sing N N 65 ARG CA CB sing N N 66 ARG CA HA sing N N 67 ARG C O doub N N 68 ARG C OXT sing N N 69 ARG CB CG sing N N 70 ARG CB HB2 sing N N 71 ARG CB HB3 sing N N 72 ARG CG CD sing N N 73 ARG CG HG2 sing N N 74 ARG CG HG3 sing N N 75 ARG CD NE sing N N 76 ARG CD HD2 sing N N 77 ARG CD HD3 sing N N 78 ARG NE CZ sing N N 79 ARG NE HE sing N N 80 ARG CZ NH1 sing N N 81 ARG CZ NH2 doub N N 82 ARG NH1 HH11 sing N N 83 ARG NH1 HH12 sing N N 84 ARG NH2 HH21 sing N N 85 ARG NH2 HH22 sing N N 86 ARG OXT HXT sing N N 87 ASN N CA sing N N 88 ASN N H sing N N 89 ASN N H2 sing N N 90 ASN CA C sing N N 91 ASN CA CB sing N N 92 ASN CA HA sing N N 93 ASN C O doub N N 94 ASN C OXT sing N N 95 ASN CB CG sing N N 96 ASN CB HB2 sing N N 97 ASN CB HB3 sing N N 98 ASN CG OD1 doub N N 99 ASN CG ND2 sing N N 100 ASN ND2 HD21 sing N N 101 ASN ND2 HD22 sing N N 102 ASN OXT HXT sing N N 103 ASP N CA sing N N 104 ASP N H sing N N 105 ASP N H2 sing N N 106 ASP CA C sing N N 107 ASP CA CB sing N N 108 ASP CA HA sing N N 109 ASP C O doub N N 110 ASP C OXT sing N N 111 ASP CB CG sing N N 112 ASP CB HB2 sing N N 113 ASP CB HB3 sing N N 114 ASP CG OD1 doub N N 115 ASP CG OD2 sing N N 116 ASP OD2 HD2 sing N N 117 ASP OXT HXT sing N N 118 CYS N CA sing N N 119 CYS N H sing N N 120 CYS N H2 sing N N 121 CYS CA C sing N N 122 CYS CA CB sing N N 123 CYS CA HA sing N N 124 CYS C O doub N N 125 CYS C OXT sing N N 126 CYS CB SG sing N N 127 CYS CB HB2 sing N N 128 CYS CB HB3 sing N N 129 CYS SG HG sing N N 130 CYS OXT HXT sing N N 131 DA OP3 P sing N N 132 DA OP3 HOP3 sing N N 133 DA P OP1 doub N N 134 DA P OP2 sing N N 135 DA P "O5'" sing N N 136 DA OP2 HOP2 sing N N 137 DA "O5'" "C5'" sing N N 138 DA "C5'" "C4'" sing N N 139 DA "C5'" "H5'" sing N N 140 DA "C5'" "H5''" sing N N 141 DA "C4'" "O4'" sing N N 142 DA "C4'" "C3'" sing N N 143 DA "C4'" "H4'" sing N N 144 DA "O4'" "C1'" sing N N 145 DA "C3'" "O3'" sing N N 146 DA "C3'" "C2'" sing N N 147 DA "C3'" "H3'" sing N N 148 DA "O3'" "HO3'" sing N N 149 DA "C2'" "C1'" sing N N 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Y N 230 DG C8 H8 sing N N 231 DG N7 C5 sing Y N 232 DG C5 C6 sing N N 233 DG C5 C4 doub Y N 234 DG C6 O6 doub N N 235 DG C6 N1 sing N N 236 DG N1 C2 sing N N 237 DG N1 H1 sing N N 238 DG C2 N2 sing N N 239 DG C2 N3 doub N N 240 DG N2 H21 sing N N 241 DG N2 H22 sing N N 242 DG N3 C4 sing N N 243 DT OP3 P sing N N 244 DT OP3 HOP3 sing N N 245 DT P OP1 doub N N 246 DT P OP2 sing N N 247 DT P "O5'" sing N N 248 DT OP2 HOP2 sing N N 249 DT "O5'" "C5'" sing N N 250 DT "C5'" "C4'" sing N N 251 DT "C5'" "H5'" sing N N 252 DT "C5'" "H5''" sing N N 253 DT "C4'" "O4'" sing N N 254 DT "C4'" "C3'" sing N N 255 DT "C4'" "H4'" sing N N 256 DT "O4'" "C1'" sing N N 257 DT "C3'" "O3'" sing N N 258 DT "C3'" "C2'" sing N N 259 DT "C3'" "H3'" sing N N 260 DT "O3'" "HO3'" sing N N 261 DT "C2'" "C1'" sing N N 262 DT "C2'" "H2'" sing N N 263 DT "C2'" "H2''" sing N N 264 DT "C1'" N1 sing N N 265 DT "C1'" "H1'" sing N N 266 DT N1 C2 sing N N 267 DT N1 C6 sing N N 268 DT C2 O2 doub N N 269 DT C2 N3 sing N N 270 DT N3 C4 sing N N 271 DT N3 H3 sing N N 272 DT C4 O4 doub N N 273 DT C4 C5 sing N N 274 DT C5 C7 sing N N 275 DT C5 C6 doub N N 276 DT C7 H71 sing N N 277 DT C7 H72 sing N N 278 DT C7 H73 sing N N 279 DT C6 H6 sing N N 280 GLN N CA sing N N 281 GLN N H sing N N 282 GLN N H2 sing N N 283 GLN CA C sing N N 284 GLN CA CB sing N N 285 GLN CA HA sing N N 286 GLN C O doub N N 287 GLN C OXT sing N N 288 GLN CB CG sing N N 289 GLN CB HB2 sing N N 290 GLN CB HB3 sing N N 291 GLN CG CD sing N N 292 GLN CG HG2 sing N N 293 GLN CG HG3 sing N N 294 GLN CD OE1 doub N N 295 GLN CD NE2 sing N N 296 GLN NE2 HE21 sing N N 297 GLN NE2 HE22 sing N N 298 GLN OXT HXT sing N N 299 GLU N CA sing N N 300 GLU N H sing N N 301 GLU N H2 sing N N 302 GLU CA C sing N N 303 GLU CA CB sing N N 304 GLU CA HA sing N N 305 GLU C O doub N N 306 GLU C OXT sing N N 307 GLU CB CG sing N N 308 GLU CB HB2 sing N N 309 GLU CB HB3 sing N N 310 GLU CG CD sing N N 311 GLU CG HG2 sing N N 312 GLU CG HG3 sing N N 313 GLU CD OE1 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'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? 22 1 1 1 ? ? # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ;The MCM recruitment reaction was reconstituted in vitro using purified H. sapiens proteins, a short DNA template and ATPgammaS. Four microlitres of the entire reaction was applied on a grid and incubated for 1 min at room temperature before blotting with filter paper for 5 s and plunge-freezing in liquid ethane. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 8S0C 'double helix' 8S0C 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 B DT 1 1_555 C DA 26 1_555 -0.108 -0.240 -0.733 -1.428 3.236 0.971 1 X_DT1:DA58_Y X 1 ? 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