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_entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 840 human ? 'MCM8, C20orf154' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? 'cabbage looper' 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 1143 human ? 'MCM9, C6orf61, MCMDC1' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? 'cabbage looper' 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP MCM8_HUMAN Q9UJA3 ? 1 ;MNGEYRGRGFGRGRFQSWKRGRGGGNFSGKWREREHRPDLSKTTGKRTSEQTPQFLLSTKTPQSMQSTLDRFIPYKGWKL YFSEVYSDSSPLIEKIQAFEKFFTRHIDLYDKDEIERKGSILVDFKELTEGGEVTNLIPDIATELRDAPEKTLACMGLAI HQVLTKDLERHAAELQAQEGLSNDGETMVNVPHIHARVYNYEPLTQLKNVRANYYGKYIALRGTVVRVSNIKPLCTKMAF LCAACGEIQSFPLPDGKYSLPTKCPVPVCRGRSFTALRSSPLTVTMDWQSIKIQELMSDDQREAGRIPRTIECELVHDLV DSCVPGDTVTITGIVKVSNAEEGSRNKNDKCMFLLYIEANSISNSKGQKTKSSEDGCKHGMLMEFSLKDLYAIQEIQAEE NLFKLIVNSLCPVIFGHELVKAGLALALFGGSQKYADDKNRIPIRGDPHILVVGDPGLGKSQMLQAACNVAPRGVYVCGN TTTTSGLTVTLSKDSSSGDFALEAGALVLGDQGICGIDEFDKMGNQHQALLEAMEQQSISLAKAGVVCSLPARTSIIAAA NPVGGHYNKAKTVSENLKMGSALLSRFDLVFILLDTPNEHHDHLLSEHVIAIRAGKQRTISSATVARMNSQDSNTSVLEV VSEKPLSERLKVVPGETIDPIPHQLLRKYIGYARQYVYPRLSTEAARVLQDFYLELRKQSQRLNSSPITTRQLESLIRLT EARARLELREEATKEDAEDIVEIMKYSMLGTYSDEFGNLDFERSQHGSGMSNRSTAKRFISALNNVAERTYNNIFQFHQL RQIAKELNIQVADFENFIGSLNDQGYLLKKGPKVYQLQTM ; 1 2 UNP MCM9_HUMAN Q9NXL9 ? 2 ;MNSDQVTLVGQVFESYVSEYHKNDILLILKERDEDAHYPVVVNAMTLFETNMEIGEYFNMFPSEVLTIFDSALRRSALTI LQSLSQPEAVSMKQNLHARISGLPVCPELVREHIPKTKDVGHFLSVTGTVIRTSLVKVLEFERDYMCNKCKHVFVIKADF EQYYTFCRPSSCPSLESCDSSKFTCLSGLSSSPTRCRDYQEIKIQEQVQRLSVGSIPRSMKVILEDDLVDSCKSGDDLTI YGIVMQRWKPFQQDVRCEVEIVLKANYIQVNNEQSSGIIMDEEVQKEFEDFWEYYKSDPFAGRNVILASLCPQVFGMYLV KLAVAMVLAGGIQRTDATGTRVRGESHLLLVGDPGTGKSQFLKYAAKITPRSVLTTGIGSTSAGLTVTAVKDSGEWNLEA GALVLADAGLCCIDEFNSLKEHDRTSIHEAMEQQTISVAKAGLVCKLNTRTTILAATNPKGQYDPQESVSVNIALGSPLL SRFDLILVLLDTKNEDWDRIISSFILENKGYPSKSEKLWSMEKMKTYFCLIRNLQPTLSDVGNQVLLRYYQMQRQSDCRN AARTTIRLLESLIRLAEAHARLMFRDTVTLEDAITVVSVMESSMQGGALLGGVNALHTSFPENPGEQYQRQCELILEKLE LQSLLSEELRRLERLQNQSVHQSQPRVLEVETTPGSLRNGPGEESNFRTSSQQEINYSTHIFSPGGSPEGSPVLDPPPHL EPNRSTSRKHSAQHKNNRDDSLDWFDFMATHQSEPKNTVVVSPHPKTSGENMASKISNSTSQGKEKSEPGQRSKVDIGLL PSPGETGVPWRADNVESNKKKRLALDSEAAVSADKPDSVLTHHVPRNLQKLCKERAQKLCRNSTRVPAQCTVPSHPQSTP VHSPDRMLDSPKRKRPKSLAQVEEPAIENVKPPGSPVAKLAKFTFKQKSKLIHSFEDHSHVSPGATKIAVHSPKISQRRT RRDAALPVKRPGKLTSTPGNQISSQPQGETKEVSQQPPEKHGPREKVMCAPEKRIIQPELELGNETGCAHLTCEGDKKEE VSGSNKSGKVHACTLARLANFCFTPPSESKSKSPPPERKNRGERGPSSPPTTTAPMRVSKRKSFQLRGSTEKLIVSKESL FTLPELGDEAFDCDWDEEMRKKS ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8S92 A 1 ? 840 ? 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UNP Q9UJA3 GLU 519 'engineered mutation' 519 5 6 8S92 GLN F 415 ? UNP Q9NXL9 GLU 415 'engineered mutation' 415 6 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8S92 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8S92 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 12954 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.650 ? 17523 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.223 ? 1719 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.045 ? 2013 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 2235 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8S92 _struct.title 'Structure of N-terminal domains of Walker B mutated MCM8/9 heterohexamer complex with ADP' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8S92 _struct_keywords.text 'DNA Replication, DNA repair, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 TYR A 75 ? LYS A 79 ? TYR A 75 LYS A 79 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 PRO A 91 ? HIS A 106 ? PRO A 91 HIS A 106 1 ? 16 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP A 111 ? LYS A 118 ? ASP A 111 LYS A 118 1 ? 8 HELX_P HELX_P4 AA4 PHE A 125 ? GLU A 130 ? PHE A 125 GLU A 130 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY A 132 ? ILE A 138 ? GLY A 132 ILE A 138 1 ? 7 HELX_P HELX_P6 AA6 ILE A 141 ? ALA A 148 ? ILE A 141 ALA A 148 1 ? 8 HELX_P HELX_P7 AA7 GLU A 150 ? LEU A 175 ? GLU A 150 LEU A 175 1 ? 26 HELX_P HELX_P8 AA8 ASN B 2 ? HIS B 21 ? ASN D 2 HIS D 21 1 ? 20 HELX_P HELX_P9 AA9 HIS B 21 ? LYS B 30 ? HIS D 21 LYS D 30 1 ? 10 HELX_P HELX_P10 AB1 ALA B 44 ? ASN B 51 ? ALA D 44 ASN D 51 1 ? 8 HELX_P HELX_P11 AB2 GLU B 53 ? ASN B 59 ? GLU D 53 ASN D 59 1 ? 7 HELX_P HELX_P12 AB3 SER B 63 ? SER B 83 ? SER D 63 SER D 83 1 ? 21 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP B 159 ? TYR B 163 ? ASP D 159 TYR D 163 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 GLU B 225 ? VAL B 229 ? GLU D 225 VAL D 229 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 TYR C 75 ? LYS C 79 ? TYR B 75 LYS B 79 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 PRO C 91 ? HIS C 106 ? PRO B 91 HIS B 106 1 ? 16 HELX_P HELX_P17 AB8 ASP C 111 ? LYS C 118 ? ASP B 111 LYS B 118 1 ? 8 HELX_P HELX_P18 AB9 PHE C 125 ? GLU C 130 ? PHE B 125 GLU B 130 1 ? 6 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY C 132 ? ILE C 138 ? GLY B 132 ILE B 138 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 AC2 ILE C 141 ? ALA C 148 ? 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ILE C 141 ALA C 148 1 ? 8 HELX_P HELX_P35 AD8 GLU E 150 ? LEU E 175 ? GLU C 150 LEU C 175 1 ? 26 HELX_P HELX_P36 AD9 ASN F 2 ? HIS F 21 ? ASN F 2 HIS F 21 1 ? 20 HELX_P HELX_P37 AE1 HIS F 21 ? LYS F 30 ? HIS F 21 LYS F 30 1 ? 10 HELX_P HELX_P38 AE2 ALA F 44 ? ASN F 51 ? ALA F 44 ASN F 51 1 ? 8 HELX_P HELX_P39 AE3 GLU F 53 ? ASN F 59 ? GLU F 53 ASN F 59 1 ? 7 HELX_P HELX_P40 AE4 SER F 63 ? SER F 83 ? SER F 63 SER F 83 1 ? 21 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP F 159 ? TYR F 163 ? ASP F 159 TYR F 163 5 ? 5 HELX_P HELX_P42 AE6 GLU F 225 ? VAL F 229 ? GLU F 225 VAL F 229 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 6 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 6 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? 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O VAL A 123 N ARG A 197 ? N ARG A 197 AA2 1 2 N ILE A 219 ? N ILE A 219 O GLY A 333 ? O GLY A 333 AA2 2 3 N THR A 332 ? N THR A 332 O ASN A 360 ? O ASN A 360 AA2 3 4 O ILE A 357 ? O ILE A 357 N GLU A 312 ? N GLU A 312 AA2 4 5 O CYS A 313 ? O CYS A 313 N ILE A 291 ? N ILE A 291 AA2 5 6 O GLN A 294 ? O GLN A 294 N THR A 224 ? N THR A 224 AA3 1 2 N LEU A 234 ? N LEU A 234 O MET A 286 ? O MET A 286 AA4 1 2 N TYR B 38 ? N TYR D 38 O HIS B 97 ? O HIS D 97 AA5 1 2 N VAL B 42 ? N VAL D 42 O SER B 101 ? O SER D 101 AA6 1 2 O LEU B 238 ? O LEU D 238 N GLY B 128 ? N GLY D 128 AA6 2 3 N THR B 129 ? N THR D 129 O GLN B 205 ? O GLN D 205 AA6 3 4 N ILE B 202 ? N ILE D 202 O VAL B 222 ? O VAL D 222 AA6 4 5 N ILE B 223 ? N ILE D 223 O ALA B 265 ? O ALA D 265 AA6 5 6 O VAL B 262 ? O VAL D 262 N MET B 245 ? N MET D 245 AA7 1 2 O VAL C 123 ? O VAL B 123 N ARG C 197 ? N ARG B 197 AA8 1 2 N ILE C 219 ? N ILE B 219 O GLY C 333 ? O GLY B 333 AA8 2 3 N THR C 332 ? N THR B 332 O ASN C 360 ? 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