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EMDB EMD-40889 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2023-11-01 2 'Structure model' 1 1 2024-01-31 3 'Structure model' 1 2 2024-02-07 4 'Structure model' 1 3 2024-05-01 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Data collection' 3 3 'Structure model' 'Database references' 4 3 'Structure model' 'Structure summary' 5 4 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 3 'Structure model' audit_author 4 3 'Structure model' citation 5 3 'Structure model' citation_author 6 3 'Structure model' em_author_list 7 4 'Structure model' citation 8 4 'Structure model' citation_author # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.country' 2 2 'Structure model' '_citation.journal_abbrev' 3 2 'Structure model' '_citation.journal_id_CSD' 4 2 'Structure model' '_citation.journal_id_ISSN' 5 2 'Structure model' '_citation.title' 6 2 'Structure model' '_citation.year' 7 3 'Structure model' '_audit_author.name' 8 3 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 9 3 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 10 3 'Structure model' '_citation.title' 11 3 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 12 3 'Structure model' '_citation_author.name' 13 3 'Structure model' '_em_author_list.author' 14 4 'Structure model' '_citation.journal_volume' 15 4 'Structure model' '_citation.page_first' 16 4 'Structure model' '_citation.page_last' 17 4 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' # loop_ _database_PDB_caveat.id _database_PDB_caveat.text 1 ;Residues DT J 91 and DT J 92 that are next to each other in the sample sequence are not properly linked: distance between O3' and P is 1.39 ; 2 ;Residues DT J 92 and DG J 93 that are next to each other in the sample sequence are not properly linked: distance between O3' and P is 1.39. ; # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8SYP _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-05-25 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Structure of CX3CR1 nucleosome' _pdbx_database_related.db_id EMD-40889 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 3 _pdbx_contact_author.email baiyaw@mail.nih.gov _pdbx_contact_author.name_first Yawen _pdbx_contact_author.name_last Bai _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0003-3239-1109 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Lian, T.' 1 ? 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_citation_author.identifier_ORCID primary 'Lian, T.' 1 ? primary 'Guan, R.' 2 ? primary 'Zhou, B.R.' 3 ? primary 'Bai, Y.' 4 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Histone H3.1' 15437.167 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Histone H4' 11394.426 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Histone H2A type 2-C' 14017.428 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Histone H2B type 2-E' 13951.239 2 ? ? ? ? 5 polymer syn 'DNA (162-MER)' 50043.855 1 ? ? ? ? 6 polymer syn 'DNA (162-MER)' 49965.957 1 ? ? ? ? 7 polymer man 'Single-chain variable fragment' 29030.146 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Histone H3/a,Histone H3/b,Histone H3/c,Histone H3/d,Histone H3/f,Histone H3/h,Histone H3/i,Histone H3/j,Histone H3/k,Histone H3/l' 3 'H2A-clustered histone 20,Histone H2A-GL101,Histone H2A/q' 4 'H2B-clustered histone 21,Histone 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;MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHKAKSK ; C,G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; D,H ? 5 polydeoxyribonucleotide no no ;(DT)(DA)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC) (DT)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA)(DT)(DC)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DG)(DT)(DT)(DG) (DC)(DT)(DG)(DA)(DG)(DA)(DG)(DT)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DC)(DA)(DT)(DT)(DG)(DC)(DT) (DG)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DA)(DT)(DG)(DG)(DA)(DT)(DA)(DC)(DT) (DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DC)(DA)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA) (DA)(DT)(DA)(DG)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DG)(DG)(DC)(DT) (DA)(DG)(DT)(DT)(DC)(DT)(DG)(DT)(DA)(DC)(DT)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC) (DA)(DG)(DG)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DT)(DG)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DC)(DC)(DT)(DA)(DT) (DT)(DT) ; ;TAGGTGCAGGGCCTCTCGGCTGCTGATCTTCAGCTGGTTGCTGAGAGTTGCAGCATTGCTGAGTCTTAGCAATGGATACT TCCCGATTCCCCTCACAAAAATAGGTCAGTCTGTCTGGCTAGTTCTGTACTTGCAGACACAGGGCATGTGGGGTTCCTAT TT ; I ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DA)(DA)(DT)(DA)(DG)(DG)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DC)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DC) (DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DA)(DG)(DT)(DA)(DC)(DA)(DG)(DA)(DA) (DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DC)(DT) (DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DG)(DG) (DG)(DA)(DA)(DG)(DT)(DA)(DT)(DC)(DC)(DA)(DT)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DA)(DG)(DA)(DC) (DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DA)(DA)(DT)(DG)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DA)(DC)(DT)(DC)(DT)(DC) (DA)(DG)(DC)(DA)(DA)(DC)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA)(DA)(DG)(DA)(DT)(DC)(DA)(DG) (DC)(DA)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC) (DT)(DA) ; ;AAATAGGAACCCCACATGCCCTGTGTCTGCAAGTACAGAACTAGCCAGACAGACTGACCTATTTTTGTGAGGGGAATCGG GAAGTATCCATTGCTAAGACTCAGCAATGCTGCAACTCTCAGCAACCAGCTGAAGATCAGCAGCCGAGAGGCCCTGCACC TA ; J ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MKSSHHHHHHENLYFQSNAMEVQLQQSGPELVEPGTSVKMPCKASGYTFTSYTIQWVKQTPRQGLEWIGYIYPYNAGTKY NEKFKGKATLTSDKSSSTVYMELSSLTSEDSAVYYCARKSSRLRSTLDYWGQGTSVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSMDIKM TQSPSSMHASLGERVTITCKASQDIRSYLSWYQQKPWKSPKTLIYYATSLADGVPSRFSGSGSGQDFSLTINNLESDDTA TYYCLQHGESPYTFGSGTKLEIKRA ; ;MKSSHHHHHHENLYFQSNAMEVQLQQSGPELVEPGTSVKMPCKASGYTFTSYTIQWVKQTPRQGLEWIGYIYPYNAGTKY NEKFKGKATLTSDKSSSTVYMELSSLTSEDSAVYYCARKSSRLRSTLDYWGQGTSVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSMDIKM TQSPSSMHASLGERVTITCKASQDIRSYLSWYQQKPWKSPKTLIYYATSLADGVPSRFSGSGSGQDFSLTINNLESDDTA TYYCLQHGESPYTFGSGTKLEIKRA ; M,N ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 ARG n 1 4 THR n 1 5 LYS n 1 6 GLN 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LEU n 2 51 ILE n 2 52 TYR n 2 53 GLU n 2 54 GLU n 2 55 THR n 2 56 ARG n 2 57 GLY n 2 58 VAL n 2 59 LEU n 2 60 LYS n 2 61 VAL n 2 62 PHE n 2 63 LEU n 2 64 GLU n 2 65 ASN n 2 66 VAL n 2 67 ILE n 2 68 ARG n 2 69 ASP n 2 70 ALA n 2 71 VAL n 2 72 THR n 2 73 TYR n 2 74 THR n 2 75 GLU n 2 76 HIS n 2 77 ALA n 2 78 LYS n 2 79 ARG n 2 80 LYS n 2 81 THR n 2 82 VAL n 2 83 THR n 2 84 ALA n 2 85 MET n 2 86 ASP n 2 87 VAL n 2 88 VAL n 2 89 TYR n 2 90 ALA n 2 91 LEU n 2 92 LYS n 2 93 ARG n 2 94 GLN n 2 95 GLY n 2 96 ARG n 2 97 THR n 2 98 LEU n 2 99 TYR n 2 100 GLY n 2 101 PHE n 2 102 GLY n 2 103 GLY n 3 1 MET n 3 2 SER n 3 3 GLY n 3 4 ARG n 3 5 GLY n 3 6 LYS n 3 7 GLN n 3 8 GLY n 3 9 GLY n 3 10 LYS n 3 11 ALA n 3 12 ARG n 3 13 ALA n 3 14 LYS n 3 15 ALA n 3 16 LYS n 3 17 SER n 3 18 ARG n 3 19 SER n 3 20 SER n 3 21 ARG n 3 22 ALA n 3 23 GLY n 3 24 LEU n 3 25 GLN n 3 26 PHE n 3 27 PRO n 3 28 VAL n 3 29 GLY n 3 30 ARG n 3 31 VAL n 3 32 HIS n 3 33 ARG n 3 34 LEU n 3 35 LEU n 3 36 ARG n 3 37 LYS n 3 38 GLY 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H ARG 32 NH2 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8SYP _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8SYP _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8SYP _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8SYP _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 16344 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.874 ? 23338 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 30.276 ? 4267 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.047 ? 2629 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 ? 1930 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8SYP _struct.title 'Genomic CX3CR1 nucleosome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8SYP _struct_keywords.text ;nucleosome, transcription factor, transcription, chromatin binding protein-DNA complex, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex, TRANSCRIPTION-DNA complex ; _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION/DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 7 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP H31_HUMAN P68431 ? 1 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 2 UNP H4_HUMAN P62805 ? 2 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 3 UNP H2A2C_HUMAN Q16777 ? 3 ;MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHKAKSK ; 1 4 UNP H2B2E_HUMAN Q16778 ? 4 ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; 1 5 GB DQ360291.1 86374231 ? 5 ;TAGGTGCAGGGCCTCTCGGCTGCTGATCTTCAGCTGGTTGCTGAGAGTTGCAGCATTGCTGAGTCTTAGCAATGGATACT TCCCGATTCCCCTCACAAAAATAGGTCAGTCTGTCTGGCTAGTTCTGTACTTGCAGACACAGGGCATGTGGGGTTCCTAT TT ; 4983 6 GB DQ360291.1 86374231 ? 6 ;AAATAGGAACCCCACATGCCCTGTGTCTGCAAGTACAGAACTAGCCAGACAGACTGACCTATTTTTGTGAGGGGAATCGG GAAGTATCCATTGCTAAGACTCAGCAATGCTGCAACTCTCAGCAACCAGCTGAAGATCAGCAGCCGAGAGGCCCTGCACC TA ; 5144 7 PDB 8SYP 8SYP ? 7 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8SYP A 1 ? 136 ? P68431 1 ? 136 ? 0 135 2 2 8SYP B 1 ? 103 ? P62805 1 ? 103 ? 0 102 3 3 8SYP C 1 ? 129 ? Q16777 1 ? 129 ? 0 128 4 4 8SYP D 1 ? 126 ? Q16778 1 ? 126 ? -3 122 5 1 8SYP E 1 ? 136 ? P68431 1 ? 136 ? 0 135 6 2 8SYP F 1 ? 103 ? P62805 1 ? 103 ? 0 102 7 3 8SYP G 1 ? 129 ? Q16777 1 ? 129 ? 0 128 8 4 8SYP H 1 ? 126 ? Q16778 1 ? 126 ? -3 122 9 5 8SYP I 1 ? 162 ? 86374231 4983 ? 5144 ? 1 162 10 6 8SYP J 1 ? 162 ? 86374231 5144 ? 4983 ? 1 162 11 7 8SYP M 1 ? 265 ? 8SYP 3 ? 267 ? 3 267 12 7 8SYP N 1 ? 265 ? 8SYP 3 ? 267 ? 3 267 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 45 ? GLN A 56 ? GLY A 44 GLN A 55 1 ? 12 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 64 ? ASP A 78 ? ARG A 63 ASP A 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 86 ? ALA A 115 ? GLN A 85 ALA A 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P4 AA4 MET A 121 ? ARG A 132 ? MET A 120 ARG A 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN B 26 ? ILE B 30 ? ASN B 25 ILE B 29 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 THR B 31 ? GLY B 42 ? THR B 30 GLY B 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU B 50 ? ALA B 77 ? LEU B 49 ALA B 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P8 AA8 THR B 83 ? ARG B 93 ? THR B 82 ARG B 92 1 ? 11 HELX_P HELX_P9 AA9 SER C 17 ? GLY C 23 ? SER C 16 GLY C 22 1 ? 7 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO C 27 ? GLY C 38 ? PRO C 26 GLY C 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA C 46 ? ASN C 74 ? ALA C 45 ASN C 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P12 AB3 ILE C 80 ? ASN C 90 ? ILE C 79 ASN C 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP C 91 ? LEU C 98 ? ASP C 90 LEU C 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P14 AB5 TYR D 38 ? HIS D 50 ? TYR D 34 HIS D 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P15 AB6 SER D 56 ? ASN D 85 ? SER D 52 ASN D 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P16 AB7 THR D 91 ? LEU D 103 ? THR D 87 LEU D 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY D 105 ? SER D 124 ? GLY D 101 SER D 120 1 ? 20 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY E 45 ? GLN E 56 ? GLY E 44 GLN E 55 1 ? 12 HELX_P HELX_P19 AC1 ARG E 64 ? ASP E 78 ? ARG E 63 ASP E 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P20 AC2 GLN E 86 ? ALA E 115 ? GLN E 85 ALA E 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P21 AC3 MET E 121 ? GLY E 133 ? MET E 120 GLY E 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 AC4 ASN F 26 ? ILE F 30 ? ASN F 25 ILE F 29 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 THR F 31 ? GLY F 42 ? THR F 30 GLY F 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 AC6 LEU F 50 ? ALA F 77 ? LEU F 49 ALA F 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P25 AC7 THR F 83 ? ARG F 93 ? THR F 82 ARG F 92 1 ? 11 HELX_P HELX_P26 AC8 SER G 17 ? GLY G 23 ? SER G 16 GLY G 22 1 ? 7 HELX_P HELX_P27 AC9 PRO G 27 ? GLY G 38 ? PRO G 26 GLY G 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA G 46 ? ASN G 74 ? ALA G 45 ASN G 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P29 AD2 ILE G 80 ? ASN G 90 ? ILE G 79 ASN G 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 AD3 ASP G 91 ? LEU G 98 ? 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THR N 109 SER N 113 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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I DA 137 N6 ? ? ? 1_555 J DT 26 O4 ? ? I DA 137 J DT 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog319 hydrog ? ? I DC 138 N3 ? ? ? 1_555 J DG 25 N1 ? ? I DC 138 J DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog320 hydrog ? ? I DC 138 N4 ? ? ? 1_555 J DG 25 O6 ? ? I DC 138 J DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog321 hydrog ? ? I DC 138 O2 ? ? ? 1_555 J DG 25 N2 ? ? I DC 138 J DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog322 hydrog ? ? I DA 139 N1 ? ? ? 1_555 J DT 24 N3 ? ? I DA 139 J DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog323 hydrog ? ? I DA 139 N6 ? ? ? 1_555 J DT 24 O4 ? ? I DA 139 J DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog324 hydrog ? ? I DC 140 N3 ? ? ? 1_555 J DG 23 N1 ? ? I DC 140 J DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog325 hydrog ? ? I DC 140 N4 ? ? ? 1_555 J DG 23 O6 ? ? I DC 140 J DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog326 hydrog ? ? I DC 140 O2 ? ? ? 1_555 J DG 23 N2 ? ? I DC 140 J DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog327 hydrog ? ? I DA 141 N1 ? ? ? 1_555 J DT 22 N3 ? ? I DA 141 J DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog328 hydrog ? ? I DA 141 N6 ? ? ? 1_555 J DT 22 O4 ? ? I DA 141 J DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog329 hydrog ? ? I DG 142 N1 ? ? ? 1_555 J DC 21 N3 ? ? I DG 142 J DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog330 hydrog ? ? I DG 142 N2 ? ? ? 1_555 J DC 21 O2 ? ? I DG 142 J DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog331 hydrog ? ? I DG 142 O6 ? ? ? 1_555 J DC 21 N4 ? ? I DG 142 J DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog332 hydrog ? ? I DG 143 N1 ? ? ? 1_555 J DC 20 N3 ? ? I DG 143 J DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog333 hydrog ? ? I DG 143 N2 ? ? ? 1_555 J DC 20 O2 ? ? I DG 143 J DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog334 hydrog ? ? I DG 143 O6 ? ? ? 1_555 J DC 20 N4 ? ? I DG 143 J DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog335 hydrog ? ? I DG 144 N1 ? ? ? 1_555 J DC 19 N3 ? ? 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