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'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.4357 ? 31710 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0357 ? 4081 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0030 ? 3983 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 3.1451 ? 3360 ? f_dihedral_angle_d ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details 1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_1 1.10673905569e-10 ? ? ? 'NCS constraints' E E ? ? ? ? 2 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_1 1.47933450446e-12 ? ? ? 'NCS constraints' E E ? ? ? ? 3 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ens_1 9.02370189403e-13 ? ? ? 'NCS constraints' E E ? ? ? ? 4 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ens_1 1.1255782897e-10 ? ? ? 'NCS constraints' E E ? ? ? ? 5 'ELECTRON MICROSCOPY' d_6 ens_1 1.23517076735e-12 ? ? ? 'NCS constraints' E E ? ? ? ? 6 'ELECTRON MICROSCOPY' d_7 ens_1 6.39858180566e-12 ? ? ? 'NCS constraints' E E ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] _struct_ncs_oper.details 1 given -0.900969040599 0.43388338051 -7.35520864547e-09 -0.43388338051 -0.900969040599 4.07578388406e-08 1.10573336217e-08 3.99128537485e-08 1.0 264.779617344 421.394133161 -9.11343900611e-06 ? 2 given -0.222520407717 -0.974928032292 8.34895510161e-08 0.974928032292 -0.222520407717 -1.41713833228e-07 1.5673891751e-07 4.986208374e-08 1.0 396.595451148 44.6854995502 -4.13094193163e-05 ? 3 given 0.623490046145 -0.781831287656 4.57291647079e-08 0.781831287656 0.623490046145 -1.55223162116e-07 9.28466456974e-08 1.32532588237e-07 1.0 209.05740014 -73.1523554572 -4.20135960724e-05 ? 4 given -0.90096863888 -0.433884214687 -2.10907451993e-08 0.433884214687 -0.90096863888 9.50128001412e-08 -6.02266541697e-08 7.64526118014e-08 1.0 421.394221329 264.779360951 -4.12549781004e-07 ? 5 given 0.623489640258 0.78183161134 -7.74217101655e-08 -0.78183161134 0.623489640258 -2.31674082617e-07 -1.32858487099e-07 2.04977130839e-07 1.0 -73.1523576695 209.057597835 -7.09724855597e-06 ? 6 given -0.222521273092 0.974927834776 -1.74741770288e-07 -0.974927834776 -0.222521273092 -3.00781669134e-08 -6.82078033298e-08 1.63667583758e-07 1.0 44.6856963614 396.595606424 -1.35968866175e-05 ? # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details ens_1 d_1 ;chain "E" ; ens_1 d_2 ;chain "B" ; ens_1 d_3 ;chain "C" ; ens_1 d_4 ;chain "F" ; ens_1 d_5 ;chain "D" ; ens_1 d_6 ;chain "A" ; ens_1 d_7 ;chain "G" ; # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details ens_1 d_1 1 E THR 166 . E THR 731 . E THR 166 E THR 731 ? ? ens_1 d_2 1 B THR 166 . B THR 731 . B THR 166 B THR 731 ? ? ens_1 d_3 1 C THR 166 . C THR 731 . C THR 166 C THR 731 ? ? ens_1 d_4 1 F THR 166 . F THR 731 . F THR 166 F THR 731 ? ? ens_1 d_5 1 D THR 166 . D THR 731 . D THR 166 D THR 731 ? ? ens_1 d_6 1 A THR 166 . A THR 731 . A THR 166 A THR 731 ? ? ens_1 d_7 1 G THR 166 . G THR 731 . G THR 166 G THR 731 ? ? # _struct_ncs_ens.id ens_1 _struct_ncs_ens.details ? # loop_ _struct_ncs_ens_gen.ens_id _struct_ncs_ens_gen.dom_id_1 _struct_ncs_ens_gen.dom_id_2 _struct_ncs_ens_gen.oper_id ens_1 d_2 d_1 1 ens_1 d_3 d_1 2 ens_1 d_4 d_1 3 ens_1 d_5 d_1 4 ens_1 d_6 d_1 5 ens_1 d_7 d_1 6 # _struct.entry_id 8TDJ _struct.title 'Cryo-EM structure of the wild-type AtMSL10 in GDN' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8TDJ _struct_keywords.text 'ion channels, mechanosensitive channels, heptamer, Arabidopsis thaliana, TRANSPORT PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'TRANSPORT PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 166 ? ILE A 188 ? THR A 166 ILE A 188 1 ? 23 HELX_P HELX_P2 AA2 VAL A 190 ? HIS A 193 ? VAL A 190 HIS A 193 5 ? 4 HELX_P HELX_P3 AA3 VAL A 201 ? ASN A 232 ? VAL A 201 ASN A 232 1 ? 32 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG A 236 ? ASN A 268 ? ARG A 236 ASN A 268 1 ? 33 HELX_P HELX_P5 AA5 SER A 274 ? LEU A 334 ? SER A 274 LEU A 334 1 ? 61 HELX_P HELX_P6 AA6 TRP A 388 ? 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