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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.520 ? 23192 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.210 ? 2439 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.043 ? 2643 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 2975 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8TGV _struct.title 'CryoEM structure of Fab HC84.26-HCV E2 complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8TGV _struct_keywords.text 'HCV, E2, Fab, antiviral, complex, ANTIVIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'ANTIVIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 2 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 5 ? N N N 5 ? O N N 5 ? 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D ASN 423 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? G ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? G ASN 423 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale6 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale7 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L BMA . C1 ? ? Z NAG 2 Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale8 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale9 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? covale10 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 THR 148 A . ? THR 510 A PRO 149 A ? PRO 511 A 1 25.62 2 PHE 172 B . ? PHE 151 E PRO 173 B ? PRO 152 E 1 -0.67 3 GLU 174 B . ? GLU 153 E PRO 175 B ? PRO 154 E 1 -6.62 4 TYR 160 C . ? TYR 139 F PRO 161 C ? PRO 140 F 1 0.61 5 THR 148 D . ? THR 510 D PRO 149 D ? PRO 511 D 1 22.41 6 PHE 172 E . ? PHE 151 B PRO 173 E ? PRO 152 B 1 -3.82 7 GLU 174 E . ? GLU 153 B PRO 175 E ? PRO 154 B 1 -1.54 8 THR 148 G . ? THR 510 G PRO 149 G ? PRO 511 G 1 20.62 9 PHE 172 H . ? PHE 151 I PRO 173 H ? PRO 152 I 1 -2.91 10 GLU 174 H . ? GLU 153 I PRO 175 H ? PRO 154 I 1 -0.02 11 PHE 172 J . ? PHE 151 K PRO 173 J ? PRO 152 K 1 -0.57 12 GLU 174 J . ? GLU 153 K PRO 175 J ? PRO 154 K 1 -3.44 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 3 ? AD6 ? 5 ? AD7 ? 4 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 3 ? AE1 ? 5 ? AE2 ? 4 ? AE3 ? 3 ? AE4 ? 4 ? AE5 ? 3 ? AE6 ? 3 ? AE7 ? 5 ? AE8 ? 4 ? AE9 ? 4 ? AF1 ? 3 ? AF2 ? 5 ? AF3 ? 4 ? AF4 ? 3 ? AF5 ? 4 ? AF6 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD6 4 5 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AE1 1 2 ? parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE1 4 5 ? anti-parallel AE2 1 2 ? parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE7 4 5 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF2 1 2 ? parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF2 4 5 ? anti-parallel AF3 1 2 ? parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 THR A 134 ? PRO A 136 ? THR A 496 PRO A 498 AA1 2 VAL A 174 ? ILE A 176 ? VAL A 536 ILE A 538 AA2 1 PRO A 151 ? VAL A 153 ? PRO A 513 VAL A 515 AA2 2 TYR A 145 ? PHE A 147 ? TYR A 507 PHE A 509 AA2 3 GLY A 189 ? ASN A 194 ? GLY A 551 ASN A 556 AA2 4 PHE A 198 ? GLY A 203 ? PHE A 560 GLY A 565 AA3 1 TRP A 240 ? THR A 242 ? TRP A 602 THR A 604 AA3 2 CYS A 245 ? VAL A 247 ? CYS A 607 VAL A 609 AA3 3 VAL A 274 ? CYS A 282 ? VAL A 636 CYS A 644 AA3 4 PHE A 265 ? VAL A 271 ? PHE A 627 VAL A 633 AA4 1 SER B 38 ? GLU B 44 ? SER E 17 GLU E 23 AA4 2 LEU B 99 ? THR B 105 ? LEU E 78 THR E 84 AA4 3 ILE B 91 ? ASP B 94 ? ILE E 70 ASP E 73 AA5 1 PHE B 76 ? TYR B 81 ? PHE E 55 TYR E 60 AA5 2 GLU B 67 ? ILE B 73 ? GLU E 46 ILE E 52 AA5 3 VAL B 54 ? GLN B 60 ? VAL E 33 GLN E 39 AA5 4 ARG B 119 ? GLY B 120 ? ARG E 98 GLY E 99 AA6 1 PHE B 76 ? TYR B 81 ? PHE E 55 TYR E 60 AA6 2 GLU B 67 ? ILE B 73 ? GLU E 46 ILE E 52 AA6 3 VAL B 54 ? GLN B 60 ? VAL E 33 GLN E 39 AA6 4 ALA B 113 ? TYR B 116 ? ALA E 92 TYR E 95 AA6 5 THR B 134 ? VAL B 136 ? THR E 113 VAL E 115 AA7 1 SER B 146 ? PRO B 149 ? SER E 125 PRO E 128 AA7 2 CYS B 166 ? TYR B 171 ? CYS E 145 TYR E 150 AA7 3 TYR B 202 ? SER B 206 ? TYR E 181 SER E 185 AA7 4 VAL B 195 ? LEU B 196 ? VAL E 174 LEU E 175 AA8 1 ALA B 162 ? ALA B 163 ? ALA E 141 ALA E 142 AA8 2 THR B 209 ? VAL B 210 ? THR E 188 VAL E 189 AA9 1 THR B 177 ? TRP B 180 ? THR E 156 TRP E 159 AA9 2 ILE B 221 ? HIS B 226 ? ILE E 200 HIS E 205 AA9 3 THR B 231 ? ARG B 236 ? THR E 210 ARG E 215 AB1 1 SER C 30 ? VAL C 33 ? SER F 9 VAL F 12 AB1 2 THR C 122 ? VAL C 126 ? THR F 101 VAL F 105 AB1 3 ASP C 105 ? ASP C 112 ? ASP F 84 ASP F 91 AB1 4 SER C 54 ? GLN C 58 ? SER F 33 GLN F 37 AB1 5 VAL C 65 ? TYR C 69 ? VAL F 44 TYR F 48 AB2 1 SER C 30 ? VAL C 33 ? SER F 9 VAL F 12 AB2 2 THR C 122 ? VAL C 126 ? THR F 101 VAL F 105 AB2 3 ASP C 105 ? ASP C 112 ? ASP F 84 ASP F 91 AB2 4 ALA C 115 ? PHE C 118 ? ALA F 94 PHE F 97 AB3 1 ALA C 39 ? SER C 44 ? ALA F 18 SER F 23 AB3 2 THR C 90 ? ILE C 95 ? THR F 69 ILE F 74 AB3 3 SER C 83 ? SER C 87 ? SER F 62 SER F 66 AB4 1 SER C 134 ? PHE C 138 ? SER F 113 PHE F 117 AB4 2 THR C 149 ? PHE C 159 ? THR F 128 PHE F 138 AB4 3 TYR C 193 ? SER C 202 ? TYR F 172 SER F 181 AB4 4 SER C 179 ? VAL C 183 ? SER F 158 VAL F 162 AB5 1 LYS C 165 ? VAL C 170 ? LYS F 144 VAL F 149 AB5 2 VAL C 211 ? THR C 217 ? VAL F 190 THR F 196 AB5 3 VAL C 225 ? THR C 226 ? VAL F 204 THR F 205 AB6 1 LYS C 165 ? VAL C 170 ? LYS F 144 VAL F 149 AB6 2 VAL C 211 ? THR C 217 ? VAL F 190 THR F 196 AB6 3 PHE C 229 ? ASN C 230 ? PHE F 208 ASN F 209 AB7 1 PRO D 151 ? VAL D 154 ? PRO D 513 VAL D 516 AB7 2 VAL D 144 ? PHE D 147 ? VAL D 506 PHE D 509 AB7 3 GLY D 189 ? MET D 193 ? GLY D 551 MET D 555 AB7 4 THR D 199 ? GLY D 203 ? THR D 561 GLY D 565 AB8 1 TRP D 240 ? THR D 242 ? TRP D 602 THR D 604 AB8 2 CYS D 245 ? VAL D 247 ? CYS D 607 VAL D 609 AB8 3 HIS D 276 ? CYS D 282 ? HIS D 638 CYS D 644 AB8 4 THR D 263 ? MET D 269 ? THR D 625 MET D 631 AB9 1 SER E 38 ? GLU E 44 ? SER B 17 GLU B 23 AB9 2 LEU E 99 ? THR E 105 ? LEU B 78 THR B 84 AB9 3 VAL E 89 ? ASP E 94 ? VAL B 68 ASP B 73 AC1 1 ALA E 79 ? TYR E 81 ? ALA B 58 TYR B 60 AC1 2 LEU E 66 ? PHE E 72 ? LEU B 45 PHE B 51 AC1 3 VAL E 54 ? GLN E 60 ? VAL B 33 GLN B 39 AC1 4 ALA E 113 ? GLY E 120 ? ALA B 92 GLY B 99 AC1 5 THR E 134 ? VAL E 136 ? THR B 113 VAL B 115 AC2 1 SER E 146 ? LEU E 150 ? SER B 125 LEU B 129 AC2 2 ALA E 162 ? TYR E 171 ? ALA B 141 TYR B 150 AC2 3 TYR E 202 ? VAL E 210 ? TYR B 181 VAL B 189 AC2 4 VAL E 189 ? THR E 191 ? VAL B 168 THR B 170 AC3 1 SER E 146 ? LEU E 150 ? SER B 125 LEU B 129 AC3 2 ALA E 162 ? TYR E 171 ? ALA B 141 TYR B 150 AC3 3 TYR E 202 ? VAL E 210 ? TYR B 181 VAL B 189 AC3 4 VAL E 195 ? LEU E 196 ? VAL B 174 LEU B 175 AC4 1 VAL E 176 ? SER E 179 ? VAL B 155 SER B 158 AC4 2 ILE E 221 ? HIS E 226 ? ILE B 200 HIS B 205 AC4 3 THR E 231 ? ARG E 236 ? THR B 210 ARG B 215 AC5 1 SER F 30 ? VAL F 33 ? 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