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AA BMA 3 AA BMA 3 ? ? ens_2 d_3 48 KB MAN . . KB MAN . . AA MAN 4 AA MAN 4 ? ? ens_2 d_3 49 KB MAN . . KB MAN . . AA MAN 5 AA MAN 5 ? ? ens_3 d_1 1 I GLN 1 . I SER 132 . D GLN 1 D SER 113 ? ? ens_3 d_2 1 G GLN 1 . G SER 132 . H GLN 1 H SER 113 ? ? ens_3 d_3 1 K GLN 1 . K SER 132 . J GLN 1 J SER 113 ? ? ens_4 d_1 1 J ALA 1 . J ARG 108 . E ALA 1 E ARG 108 ? ? ens_4 d_2 1 L ALA 1 . L ARG 108 . K ALA 1 K ARG 108 ? ? ens_4 d_3 1 H ALA 1 . H ARG 108 . L ALA 1 L ARG 108 ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details ens_1 ? ens_2 ? ens_3 ? ens_4 ? # loop_ _struct_ncs_ens_gen.ens_id _struct_ncs_ens_gen.dom_id_1 _struct_ncs_ens_gen.dom_id_2 _struct_ncs_ens_gen.oper_id ens_1 d_2 d_1 1 ens_1 d_3 d_1 2 ens_2 d_2 d_1 3 ens_2 d_3 d_1 4 ens_3 d_2 d_1 5 ens_3 d_3 d_1 6 ens_4 d_2 d_1 7 ens_4 d_3 d_1 8 # _struct.entry_id 8TOX _struct.title 'Cryo-EM structure of BG505 Env mutant A517E in complex with antibody ACS202 Fab' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8TOX _struct_keywords.text 'complex, viral antigen, antibody, VIRAL PROTEIN, VIRAL PROTEIN-ANTIVIRAL PROTEIN, IMMUNE SYSTEM complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/ANTIVIRAL PROTEIN,IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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UNP Q2N0S6 ARG 585 'engineered mutation' 588 31 3 8TOX VAL A 78 ? UNP Q2N0S6 ASP 586 'engineered mutation' 589 32 3 8TOX CYS A 94 ? UNP Q2N0S6 THR 602 'engineered mutation' 605 33 3 8TOX GLY A 125 ? UNP Q2N0S6 SER 633 'engineered mutation' 636 34 3 8TOX PHE A 140 ? UNP Q2N0S6 ASN 648 'engineered mutation' 651 35 3 8TOX ILE A 144 ? UNP Q2N0S6 LYS 652 'engineered mutation' 655 36 4 8TOX CYS C 171 ? UNP Q2N0S6 ILE 200 'engineered mutation' 201 37 4 8TOX ILE C 174 ? UNP Q2N0S6 ALA 203 'engineered mutation' 204 38 4 8TOX LYS C 210 ? UNP Q2N0S6 PRO 239 'engineered mutation' 240 39 4 8TOX ASN C 211 ? UNP Q2N0S6 SER 240 'engineered mutation' 241 40 4 8TOX ILE C 255 ? UNP Q2N0S6 LEU 284 'engineered mutation' 285 41 4 8TOX MET C 272 ? UNP Q2N0S6 ASN 301 'engineered mutation' 302 42 4 8TOX LEU C 288 ? UNP Q2N0S6 THR 317 'engineered mutation' 320 43 4 8TOX PRO C 298 ? UNP Q2N0S6 ALA 327 'engineered mutation' 329 44 4 8TOX PHE C 329 ? 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UNP Q2N0S6 ALA 498 'engineered mutation' 501 72 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC ; # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 18 ? 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N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? B ASN 637 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? G ASN 88 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? B ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? G ASN 133 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? B ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 MB NAG . C1 ? ? G ASN 137 G NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? G ASN 156 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? B ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? G ASN 160 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? B ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? G ASN 197 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? B ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? G ASN 234 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? B ASN 211 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? G ASN 241 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? B ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? G ASN 262 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? B ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? G ASN 276 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? B ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? G ASN 295 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? B ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? G ASN 301 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? B ASN 308 ND2 ? ? ? 1_555 NB NAG . C1 ? ? G ASN 339 G NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? B ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? G ASN 355 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? B ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 OB NAG . C1 ? ? G ASN 363 G NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? B ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? G ASN 386 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? B ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? G ASN 392 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? B ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? G ASN 448 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? C ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? A ASN 611 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? C ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 PB NAG . C1 ? ? A ASN 618 A NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? C ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? A ASN 637 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? D ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? C ASN 88 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? D ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? C ASN 133 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? D ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 QB NAG . C1 ? ? C ASN 137 C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? D ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? C ASN 156 t NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? D ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? C ASN 160 h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? D ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? C ASN 197 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? D ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? C ASN 234 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? D ASN 211 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? C ASN 241 k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? D ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? C ASN 262 l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? D ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? C ASN 276 m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? D ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? C ASN 295 n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? D ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? C ASN 301 o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? D ASN 308 ND2 ? ? ? 1_555 RB NAG . C1 ? ? C ASN 339 C NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? D ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? C ASN 355 p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? D ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 SB NAG . C1 ? ? C ASN 363 C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? D ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? C ASN 386 q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? D ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? C ASN 392 r NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? D ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? C ASN 448 s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? E ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? F ASN 611 u NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? E ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 TB NAG . C1 ? ? F ASN 618 F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? E ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? F ASN 637 v NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? F ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? I ASN 88 w NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? F ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? I ASN 133 x NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? F ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 UB NAG . C1 ? ? I ASN 137 I NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale49 covale one ? F ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? I ASN 156 AA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale50 covale one ? F ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? I ASN 160 y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale51 covale one ? F ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? I ASN 197 z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale52 covale one ? F ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? I ASN 234 0 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale53 covale one ? F ASN 211 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? I ASN 241 1 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale54 covale one ? F ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? I ASN 262 2 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale55 covale one ? F ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? I ASN 276 3 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale56 covale one ? F ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? I ASN 295 4 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale57 covale one ? F ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? I ASN 301 5 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale58 covale one ? F ASN 308 ND2 ? ? ? 1_555 VB NAG . C1 ? ? I ASN 339 I NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale59 covale one ? F ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? I ASN 355 6 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale60 covale one ? F ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 WB NAG . C1 ? ? I ASN 363 I NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale61 covale one ? F ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? I ASN 386 7 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale62 covale one ? F ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? I ASN 392 8 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale63 covale one ? F ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? I ASN 448 9 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale64 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale65 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale66 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? ? covale67 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O BMA . C1 ? ? O NAG 2 O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.279 ? ? covale68 covale both ? O BMA . O3 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale69 covale both ? O BMA . O6 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale70 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale71 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale72 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q BMA . C1 ? ? Q NAG 2 Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale73 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale74 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale75 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale76 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale77 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale78 covale both ? U BMA . O3 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale79 covale both ? U BMA . O6 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale80 covale both ? U MAN . O2 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U MAN 4 U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale81 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale82 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V BMA . C1 ? ? V NAG 2 V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale83 covale both ? V BMA . O3 ? ? ? 1_555 V MAN . C1 ? ? V BMA 3 V MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale84 covale both ? V BMA . O6 ? ? ? 1_555 V MAN . C1 ? ? V BMA 3 V MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale85 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale86 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale87 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale88 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.423 ? ? covale89 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale90 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA BMA . C1 ? ? a NAG 2 a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale91 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale92 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? ? covale93 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA BMA . C1 ? ? c NAG 2 c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale94 covale both ? CA BMA . O3 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? c BMA 3 c MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale95 covale both ? CA BMA . O6 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? c BMA 3 c MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale96 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale97 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale98 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale99 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA BMA . C1 ? ? f NAG 2 f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.278 ? ? covale100 covale both ? FA BMA . O3 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f BMA 3 f MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale101 covale both ? FA BMA . O6 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f BMA 3 f MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale102 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale103 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? h NAG 1 h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale104 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA BMA . C1 ? ? h NAG 2 h BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale105 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? i NAG 1 i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale106 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? j NAG 1 j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale107 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? k NAG 1 k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale108 covale both ? LA NAG . O4 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? l NAG 1 l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale109 covale both ? LA NAG . O4 ? ? ? 1_555 LA BMA . C1 ? ? l NAG 2 l BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale110 covale both ? LA BMA . O3 ? ? ? 1_555 LA MAN . C1 ? ? l BMA 3 l MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale111 covale both ? LA BMA . O6 ? ? ? 1_555 LA MAN . C1 ? ? l BMA 3 l MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale112 covale both ? LA MAN . O2 ? ? ? 1_555 LA MAN . C1 ? ? l MAN 4 l MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale113 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? m NAG 1 m NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale114 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA BMA . C1 ? ? m NAG 2 m BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale115 covale both ? MA BMA . O3 ? ? ? 1_555 MA MAN . C1 ? ? m BMA 3 m MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale116 covale both ? MA BMA . O6 ? ? ? 1_555 MA MAN . C1 ? ? m BMA 3 m MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale117 covale both ? NA NAG . O4 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? n NAG 1 n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale118 covale both ? OA NAG . O4 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? o NAG 1 o NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale119 covale both ? PA NAG . O4 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? p NAG 1 p NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale120 covale both ? QA NAG . O4 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? q NAG 1 q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale121 covale both ? RA NAG . O4 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? r NAG 1 r NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale122 covale both ? RA NAG . O4 ? ? ? 1_555 RA BMA . C1 ? ? r NAG 2 r BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale123 covale both ? SA NAG . O4 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? s NAG 1 s NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale124 covale both ? TA NAG . O4 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? t NAG 1 t NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? ? covale125 covale both ? TA NAG . O4 ? ? ? 1_555 TA BMA . C1 ? ? t NAG 2 t BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale126 covale both ? TA BMA . O3 ? ? ? 1_555 TA MAN . C1 ? ? t BMA 3 t MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale127 covale both ? TA BMA . O6 ? ? ? 1_555 TA MAN . C1 ? ? t BMA 3 t MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale128 covale both ? UA NAG . O4 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? u NAG 1 u NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale129 covale both ? VA NAG . O4 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? v NAG 1 v NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale130 covale both ? WA NAG . O4 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? w NAG 1 w NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale131 covale both ? WA NAG . O4 ? ? ? 1_555 WA BMA . C1 ? ? w NAG 2 w BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.279 ? ? covale132 covale both ? WA BMA . O3 ? ? ? 1_555 WA MAN . C1 ? ? w BMA 3 w MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale133 covale both ? WA BMA . O6 ? ? ? 1_555 WA MAN . C1 ? ? w BMA 3 w MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale134 covale both ? XA NAG . O4 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? x NAG 1 x NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale135 covale both ? YA NAG . O4 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? y NAG 1 y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale136 covale both ? YA NAG . O4 ? ? ? 1_555 YA BMA . C1 ? ? y NAG 2 y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale137 covale both ? ZA NAG . O4 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? z NAG 1 z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale138 covale both ? AB NAG . O4 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? 0 NAG 1 0 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale139 covale both ? BB NAG . O4 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? 1 NAG 1 1 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale140 covale both ? CB NAG . O4 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? 2 NAG 1 2 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale141 covale both ? CB NAG . O4 ? ? ? 1_555 CB BMA . C1 ? ? 2 NAG 2 2 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale142 covale both ? CB BMA . O3 ? ? ? 1_555 CB MAN . C1 ? ? 2 BMA 3 2 MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale143 covale both ? CB BMA . O6 ? ? ? 1_555 CB MAN . C1 ? ? 2 BMA 3 2 MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale144 covale both ? CB MAN . O2 ? ? ? 1_555 CB MAN . C1 ? ? 2 MAN 4 2 MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale145 covale both ? DB NAG . O4 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? 3 NAG 1 3 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale146 covale both ? DB NAG . O4 ? ? ? 1_555 DB BMA . C1 ? ? 3 NAG 2 3 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale147 covale both ? DB BMA . O3 ? ? ? 1_555 DB MAN . C1 ? ? 3 BMA 3 3 MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale148 covale both ? DB BMA . O6 ? ? ? 1_555 DB MAN . C1 ? ? 3 BMA 3 3 MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale149 covale both ? EB NAG . O4 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? 4 NAG 1 4 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale150 covale both ? FB NAG . O4 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? 5 NAG 1 5 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale151 covale both ? GB NAG . O4 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? 6 NAG 1 6 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale152 covale both ? HB NAG . O4 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? 7 NAG 1 7 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale153 covale both ? IB NAG . O4 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? 8 NAG 1 8 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale154 covale both ? IB NAG . O4 ? ? ? 1_555 IB BMA . C1 ? ? 8 NAG 2 8 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale155 covale both ? JB NAG . O4 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? 9 NAG 1 9 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale156 covale both ? KB NAG . O4 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? AA NAG 1 AA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? ? covale157 covale both ? KB NAG . O4 ? ? ? 1_555 KB BMA . C1 ? ? AA NAG 2 AA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale158 covale both ? KB BMA . O3 ? ? ? 1_555 KB MAN . C1 ? ? AA BMA 3 AA MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale159 covale both ? KB BMA . O6 ? ? ? 1_555 KB MAN . C1 ? ? AA BMA 3 AA MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 7 H . ? SER 7 L PRO 8 H ? PRO 8 L 1 -6.30 2 SER 7 J . ? SER 7 E PRO 8 J ? PRO 8 E 1 -6.28 3 SER 7 L . ? SER 7 K PRO 8 L ? PRO 8 K 1 -6.32 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 12 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 5 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 12 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 5 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 12 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 7 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 6 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 7 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 6 ? AD6 ? 4 ? AD7 ? 7 ? AD8 ? 4 ? 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'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? # _space_group.crystal_system triclinic _space_group.name_H-M_alt 'P 1' _space_group.IT_number 1 _space_group.name_Hall 'P 1' _space_group.id 1 # _atom_sites.entry_id 8TOX _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.Cartn_transform_axes ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C N O S # loop_