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'expression tag' 890 40 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 38 ? THR A 40 ? SER A 38 THR A 40 5 ? 3 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 41 ? ALA A 62 ? ARG A 41 ALA A 62 1 ? 22 HELX_P HELX_P3 AA3 THR A 66 ? PHE A 80 ? THR A 66 PHE A 80 1 ? 15 HELX_P HELX_P4 AA4 PHE A 80 ? LEU A 93 ? PHE A 80 LEU A 93 1 ? 14 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN A 94 ? VAL A 98 ? ASN A 94 VAL A 98 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 99 ? ALA A 125 ? ASP A 99 ALA A 125 1 ? 27 HELX_P HELX_P7 AA7 SER A 129 ? GLN A 143 ? SER A 129 GLN A 143 1 ? 15 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU A 149 ? GLN A 159 ? LEU A 149 GLN A 159 1 ? 11 HELX_P HELX_P9 AA9 TYR A 162 ? TYR A 165 ? TYR A 162 TYR A 165 5 ? 4 HELX_P HELX_P10 AB1 LEU A 166 ? THR A 196 ? LEU A 166 THR A 196 1 ? 31 HELX_P HELX_P11 AB2 ASN A 202 ? GLN A 216 ? ASN A 202 GLN A 216 1 ? 15 HELX_P HELX_P12 AB3 ASN A 217 ? ASP A 234 ? ASN A 217 ASP A 234 1 ? 18 HELX_P HELX_P13 AB4 PRO A 238 ? MET A 264 ? PRO A 238 MET A 264 1 ? 27 HELX_P HELX_P14 AB5 LYS A 272 ? LEU A 288 ? LYS A 272 LEU A 288 1 ? 17 HELX_P HELX_P15 AB6 LEU A 288 ? ASP A 302 ? LEU A 288 ASP A 302 1 ? 15 HELX_P HELX_P16 AB7 SER A 306 ? VAL A 322 ? SER A 306 VAL A 322 1 ? 17 HELX_P HELX_P17 AB8 ALA A 326 ? ASN A 337 ? ALA A 326 ASN A 337 1 ? 12 HELX_P HELX_P18 AB9 GLU A 339 ? PHE A 367 ? GLU A 339 PHE A 367 1 ? 29 HELX_P HELX_P19 AC1 PRO A 368 ? MET A 370 ? PRO A 368 MET A 370 5 ? 3 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP A 371 ? SER A 404 ? ASP A 371 SER A 404 1 ? 34 HELX_P HELX_P21 AC3 LYS A 405 ? GLN A 409 ? LYS A 405 GLN A 409 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 PRO A 411 ? ASN A 433 ? PRO A 411 ASN A 433 1 ? 23 HELX_P HELX_P23 AC5 PHE A 440 ? LYS A 472 ? PHE A 440 LYS A 472 1 ? 33 HELX_P HELX_P24 AC6 LEU A 655 ? LEU A 680 ? LEU A 655 LEU A 680 1 ? 26 HELX_P HELX_P25 AC7 GLY A 686 ? PHE A 711 ? GLY A 686 PHE A 711 1 ? 26 HELX_P HELX_P26 AC8 SER B 38 ? THR B 40 ? SER C 38 THR C 40 5 ? 3 HELX_P HELX_P27 AC9 ARG B 41 ? ALA B 62 ? ARG C 41 ALA C 62 1 ? 22 HELX_P HELX_P28 AD1 THR B 66 ? PHE B 80 ? THR C 66 PHE C 80 1 ? 15 HELX_P HELX_P29 AD2 PHE B 80 ? LEU B 93 ? PHE C 80 LEU C 93 1 ? 14 HELX_P HELX_P30 AD3 ASN B 94 ? VAL B 98 ? ASN C 94 VAL C 98 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP B 99 ? ALA B 125 ? ASP C 99 ALA C 125 1 ? 27 HELX_P HELX_P32 AD5 SER B 129 ? GLN B 143 ? SER C 129 GLN C 143 1 ? 15 HELX_P HELX_P33 AD6 LEU B 149 ? GLN B 159 ? LEU C 149 GLN C 159 1 ? 11 HELX_P HELX_P34 AD7 TYR B 162 ? TYR B 165 ? TYR C 162 TYR C 165 5 ? 4 HELX_P HELX_P35 AD8 LEU B 166 ? THR B 196 ? LEU C 166 THR C 196 1 ? 31 HELX_P HELX_P36 AD9 ASN B 202 ? GLN B 216 ? ASN C 202 GLN C 216 1 ? 15 HELX_P HELX_P37 AE1 ASN B 217 ? ASP B 234 ? ASN C 217 ASP C 234 1 ? 18 HELX_P HELX_P38 AE2 PRO B 238 ? MET B 264 ? PRO C 238 MET C 264 1 ? 27 HELX_P HELX_P39 AE3 LYS B 272 ? LEU B 288 ? LYS C 272 LEU C 288 1 ? 17 HELX_P HELX_P40 AE4 LEU B 288 ? ASP B 302 ? LEU C 288 ASP C 302 1 ? 15 HELX_P HELX_P41 AE5 SER B 306 ? VAL B 322 ? SER C 306 VAL C 322 1 ? 17 HELX_P HELX_P42 AE6 ALA B 326 ? ASN B 337 ? ALA C 326 ASN C 337 1 ? 12 HELX_P HELX_P43 AE7 GLU B 339 ? PHE B 367 ? GLU C 339 PHE C 367 1 ? 29 HELX_P HELX_P44 AE8 PRO B 368 ? MET B 370 ? PRO C 368 MET C 370 5 ? 3 HELX_P HELX_P45 AE9 ASP B 371 ? SER B 404 ? ASP C 371 SER C 404 1 ? 34 HELX_P HELX_P46 AF1 LYS B 405 ? GLN B 409 ? LYS C 405 GLN C 409 5 ? 5 HELX_P HELX_P47 AF2 PRO B 411 ? ASN B 433 ? PRO C 411 ASN C 433 1 ? 23 HELX_P HELX_P48 AF3 PHE B 440 ? LYS B 472 ? PHE C 440 LYS C 472 1 ? 33 HELX_P HELX_P49 AF4 LEU B 655 ? LEU B 680 ? LEU C 655 LEU C 680 1 ? 26 HELX_P HELX_P50 AF5 GLY B 686 ? PHE B 711 ? GLY C 686 PHE C 711 1 ? 26 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LEU 410 A . ? LEU 410 A PRO 411 A ? PRO 411 A 1 0.70 2 LEU 410 B . ? LEU 410 C PRO 411 B ? PRO 411 C 1 0.77 # _pdbx_entry_details.entry_id 8U5Q _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 PHE A 80 ? ? -132.63 -56.21 2 1 SER A 200 ? ? -145.43 29.30 3 1 ASP A 234 ? ? 52.29 -157.86 4 1 LEU A 288 ? ? -128.65 -56.65 5 1 LYS A 303 ? ? -88.70 42.04 6 1 LYS A 405 ? ? 56.80 19.37 7 1 ASN A 506 ? ? -154.93 66.84 8 1 PHE C 80 ? ? -131.87 -55.81 9 1 SER C 200 ? ? -145.60 29.42 10 1 ASP C 234 ? ? 52.84 -158.33 11 1 LEU C 288 ? ? -129.05 -56.89 12 1 LYS C 303 ? ? -88.87 41.61 13 1 LYS C 405 ? ? 56.49 19.70 14 1 ASN C 506 ? ? -155.10 66.84 15 1 LEU C 673 ? ? -43.60 -70.73 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 8U5Q _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' # _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id . _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id . _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range . _em_3d_fitting_list.details ;A monomeric assembly was predicted with AlphaFold and then rigid body fit into the map. Subsequent refinements were performed in ISOLDE. ; _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name AlphaFold _em_3d_fitting_list.type 'in silico model' _em_3d_fitting_list.accession_code Q7Z3F1 _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 # _em_3d_reconstruction.entry_id 8U5Q _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 2.4 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 189312 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages 1 _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.4 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'Monomer of LYCHOS (GPR155)' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list 1 # _em_imaging.entry_id 8U5Q _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_defocus_max 2000 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 105000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter 50 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN # _em_vitrification.entry_id 8U5Q _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 277.15 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 8U5Q _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 8U5Q _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C2 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? 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