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;MANMEARNVMSGTWGELWLDGNKVAEVKKFQAKMEFTKEDIIIAGQMGTDTKYMGYKGKGSITLYHVSSRMHKLIGEKIK RGSEPRFVAISKLNDPDSYGAERIAVKNIAFDDLTLADWEVGVKGEIEAPFTFTEYDFLDII ; h,d,i,k,f,n,l,g,o,J,H,K,m,j,p,c,Y,e ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MAIGLPSINISFKELATTVKERSARGIIAMVLKDAKALGLNEIHEKEDIPVDLSAENKEYINLALMGNVNTPNKLLVYVI EGEADIQTALDFLETKEFNYLCMPKAVEADKTAIKNWIIKLRDIDKVKVKAVLGKVVGNHEGIINFTTEDVLVGEKKYSV DEFTSRVAGLIAGTPLSQSVTYTKLSDVVDIPKMTKVDAESRVNKGELILIKEAGAIRIARGVNSLTELTAEKGEMFQKI KIVDTLDIIHSDIRKVIIDDYIGKVTNSYDNKCLLIVAIKSYLEELEKSALIESDSTVEIDFEAQKSYLKSKGVDLSYMT LQEIKEANTGSKVFLKAKIKVLDAMEDIDLSIEI ; ;MAIGLPSINISFKELATTVKERSARGIIAMVLKDAKALGLNEIHEKEDIPVDLSAENKEYINLALMGNVNTPNKLLVYVI EGEADIQTALDFLETKEFNYLCMPKAVEADKTAIKNWIIKLRDIDKVKVKAVLGKVVGNHEGIINFTTEDVLVGEKKYSV DEFTSRVAGLIAGTPLSQSVTYTKLSDVVDIPKMTKVDAESRVNKGELILIKEAGAIRIARGVNSLTELTAEKGEMFQKI KIVDTLDIIHSDIRKVIIDDYIGKVTNSYDNKCLLIVAIKSYLEELEKSALIESDSTVEIDFEAQKSYLKSKGVDLSYMT LQEIKEANTGSKVFLKAKIKVLDAMEDIDLSIEI ; C,F,B,P,U,M,Q,V,N,D,E,A,R,W,O,S,T,L ? 3 'polypeptide(L)' no no 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_refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 77418 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.513 ? 104268 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.298 ? 10254 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.043 ? 12342 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 13056 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8V40 _struct.title 'CryoEM Structure of Diffocin - postcontracted - Collar - final state' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8V40 _struct_keywords.text 'Phage tail-like, bacteriocin, collar, post-contraction, VIRUS LIKE PARTICLE' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRUS LIKE PARTICLE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 2 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 2 ? L N N 2 ? M N N 3 ? N N N 2 ? O N N 1 ? P N N 1 ? Q N N 1 ? 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PA N N 2 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A031WFC4_CLODI A0A031WFC4 ? 1 ;MANMEARNVMSGTWGELWLDGNKVAEVKKFQAKMEFTKEDIIIAGQMGTDTKYMGYKGKGSITLYHVSSRMHKLIGEKIK RGSEPRFVAISKLNDPDSYGAERIAVKNIAFDDLTLADWEVGVKGEIEAPFTFTEYDFLDII ; 1 2 UNP A0A9Q7ZU73_CLODI A0A9Q7ZU73 ? 2 ;MAIGLPSINISFKELATTVKERSARGIIAMVLKDAKALGLNEIHEKEDIPVDLSAENKEYINLALMGNVNTPNKLLVYVI EGEADIQTALDFLETKEFNYLCMPKAVEADKTAIKNWIIKLRDIDKVKVKAVLGKVVGNHEGIINFTTEDVLVGEKKYSV DEFTSRVAGLIAGTPLSQSVTYTKLSDVVDIPKMTKVDAESRVNKGELILIKEAGAIRIARGVNSLTELTAEKGEMFQKI KIVDTLDIIHSDIRKVIIDDYIGKVTNSYDNKCLLIVAIKSYLEELEKSALIESDSTVEIDFEAQKSYLKSKGVDLSYMT LQEIKEANTGSKVFLKAKIKVLDAMEDIDLSIEI ; 1 3 UNP A0A1X9JZ99_CLODI A0A1X9JZ99 ? 3 ;MLKYKEILETIIEILKKNFTESIFIDDESVQGSEGSCFFVSILSVICTPVMLNTNNKDIVISIKYLPKPQSKSIRMYEIS DELNKLFNRNIKVTDRKLNITKLEQSIKKEESIYVLNFTFTLNYLDSVYEEDVVYENMKEINLNLGE ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8V40 h 1 ? 142 ? 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A0A9Q7ZU73 1 ? 354 ? 1 354 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 42-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 42 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 69 ? 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