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A0A1P7WFX2 1 ? 776 ? 1 776 22 1 8VBX D 1 ? 776 ? A0A1P7WFX2 1 ? 776 ? 1 776 23 1 8VBX E 1 ? 776 ? A0A1P7WFX2 1 ? 776 ? 1 776 24 1 8VBX F 1 ? 776 ? A0A1P7WFX2 1 ? 776 ? 1 776 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 24-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 24 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'Structure solved in situ.' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLN A 103 ? VAL A 106 ? GLN A 103 VAL A 106 5 ? 4 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY A 335 ? GLY A 340 ? GLY A 335 GLY A 340 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 PRO A 601 ? ARG A 603 ? PRO A 601 ARG A 603 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 AA4 LEU A 604 ? GLY A 609 ? LEU A 604 GLY A 609 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 GLU B 24 ? ASP B 26 ? GLU R 24 ASP R 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P6 AA6 ILE B 81 ? GLY B 85 ? ILE R 81 GLY R 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 ASN B 89 ? GLU B 109 ? ASN R 89 GLU R 109 1 ? 21 HELX_P HELX_P8 AA8 VAL B 140 ? ASP B 146 ? VAL R 140 ASP R 146 1 ? 7 HELX_P HELX_P9 AA9 GLU C 24 ? ASP C 26 ? GLU Q 24 ASP Q 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P10 AB1 ILE C 81 ? GLY C 85 ? ILE Q 81 GLY Q 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 ASN C 89 ? GLU C 109 ? ASN Q 89 GLU Q 109 1 ? 21 HELX_P HELX_P12 AB3 VAL C 140 ? ASP C 146 ? VAL Q 140 ASP Q 146 1 ? 7 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU D 24 ? ASP D 26 ? GLU P 24 ASP P 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P14 AB5 ILE D 81 ? GLY D 85 ? ILE P 81 GLY P 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 ASN D 89 ? GLU D 109 ? ASN P 89 GLU P 109 1 ? 21 HELX_P HELX_P16 AB7 VAL D 140 ? ASP D 146 ? VAL P 140 ASP P 146 1 ? 7 HELX_P HELX_P17 AB8 GLU E 24 ? ASP E 26 ? GLU O 24 ASP O 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 AB9 ILE E 81 ? GLY E 85 ? ILE O 81 GLY O 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 AC1 ASN E 89 ? GLU E 109 ? ASN O 89 GLU O 109 1 ? 21 HELX_P HELX_P20 AC2 VAL E 140 ? ASP E 146 ? VAL O 140 ASP O 146 1 ? 7 HELX_P HELX_P21 AC3 GLU F 24 ? ASP F 26 ? GLU N 24 ASP N 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P22 AC4 ILE F 81 ? GLY F 85 ? ILE N 81 GLY N 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 ASN F 89 ? GLU F 109 ? ASN N 89 GLU N 109 1 ? 21 HELX_P HELX_P24 AC6 VAL F 140 ? ASP F 146 ? VAL N 140 ASP N 146 1 ? 7 HELX_P HELX_P25 AC7 GLU G 24 ? ASP G 26 ? GLU M 24 ASP M 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P26 AC8 ILE G 81 ? GLY G 85 ? ILE M 81 GLY M 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 ASN G 89 ? GLU G 109 ? ASN M 89 GLU M 109 1 ? 21 HELX_P HELX_P28 AD1 VAL G 140 ? ASP G 146 ? VAL M 140 ASP M 146 1 ? 7 HELX_P HELX_P29 AD2 GLU H 24 ? ILE H 28 ? GLU X 24 ILE X 28 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 ILE H 81 ? GLY H 85 ? ILE X 81 GLY X 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 ARG H 90 ? GLU H 109 ? ARG X 90 GLU X 109 1 ? 20 HELX_P HELX_P32 AD5 TYR H 144 ? ALA H 151 ? TYR X 144 ALA X 151 1 ? 8 HELX_P HELX_P33 AD6 GLU I 24 ? ILE I 28 ? GLU W 24 ILE W 28 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 ILE I 81 ? GLY I 85 ? ILE W 81 GLY W 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 ARG I 90 ? GLU I 109 ? ARG W 90 GLU W 109 1 ? 20 HELX_P HELX_P36 AD9 TYR I 144 ? ALA I 151 ? TYR W 144 ALA W 151 1 ? 8 HELX_P HELX_P37 AE1 GLU J 24 ? ILE J 28 ? GLU V 24 ILE V 28 5 ? 5 HELX_P HELX_P38 AE2 ILE J 81 ? GLY J 85 ? ILE V 81 GLY V 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P39 AE3 ARG J 90 ? GLU J 109 ? ARG V 90 GLU V 109 1 ? 20 HELX_P HELX_P40 AE4 TYR J 144 ? ALA J 151 ? TYR V 144 ALA V 151 1 ? 8 HELX_P HELX_P41 AE5 GLU K 24 ? ILE K 28 ? GLU U 24 ILE U 28 5 ? 5 HELX_P HELX_P42 AE6 ILE K 81 ? GLY K 85 ? ILE U 81 GLY U 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 AE7 ARG K 90 ? GLU K 109 ? ARG U 90 GLU U 109 1 ? 20 HELX_P HELX_P44 AE8 TYR K 144 ? ALA K 151 ? TYR U 144 ALA U 151 1 ? 8 HELX_P HELX_P45 AE9 GLU L 24 ? ILE L 28 ? GLU T 24 ILE T 28 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 AF1 ILE L 81 ? GLY L 85 ? ILE T 81 GLY T 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P47 AF2 ARG L 90 ? GLU L 109 ? ARG T 90 GLU T 109 1 ? 20 HELX_P HELX_P48 AF3 TYR L 144 ? ALA L 151 ? TYR T 144 ALA T 151 1 ? 8 HELX_P HELX_P49 AF4 GLU M 24 ? ILE M 28 ? GLU S 24 ILE S 28 5 ? 5 HELX_P HELX_P50 AF5 ILE M 81 ? GLY M 85 ? ILE S 81 GLY S 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 AF6 ARG M 90 ? GLU M 109 ? ARG S 90 GLU S 109 1 ? 20 HELX_P HELX_P52 AF7 TYR M 144 ? ALA M 151 ? TYR S 144 ALA S 151 1 ? 8 HELX_P HELX_P53 AF8 GLU N 24 ? ASP N 26 ? GLU L 24 ASP L 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P54 AF9 ARG N 90 ? GLU N 109 ? ARG L 90 GLU L 109 1 ? 20 HELX_P HELX_P55 AG1 THR N 141 ? GLN N 152 ? THR L 141 GLN L 152 1 ? 12 HELX_P HELX_P56 AG2 GLU O 24 ? ASP O 26 ? GLU K 24 ASP K 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P57 AG3 ARG O 90 ? GLU O 109 ? ARG K 90 GLU K 109 1 ? 20 HELX_P HELX_P58 AG4 THR O 141 ? GLN O 152 ? THR K 141 GLN K 152 1 ? 12 HELX_P HELX_P59 AG5 GLU P 24 ? ASP P 26 ? GLU J 24 ASP J 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P60 AG6 ARG P 90 ? GLU P 109 ? ARG J 90 GLU J 109 1 ? 20 HELX_P HELX_P61 AG7 THR P 141 ? GLN P 152 ? THR J 141 GLN J 152 1 ? 12 HELX_P HELX_P62 AG8 GLU Q 24 ? ASP Q 26 ? GLU I 24 ASP I 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P63 AG9 ARG Q 90 ? GLU Q 109 ? ARG I 90 GLU I 109 1 ? 20 HELX_P HELX_P64 AH1 THR Q 141 ? GLN Q 152 ? THR I 141 GLN I 152 1 ? 12 HELX_P HELX_P65 AH2 GLU R 24 ? ASP R 26 ? GLU H 24 ASP H 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P66 AH3 ARG R 90 ? GLU R 109 ? ARG H 90 GLU H 109 1 ? 20 HELX_P HELX_P67 AH4 THR R 141 ? GLN R 152 ? THR H 141 GLN H 152 1 ? 12 HELX_P HELX_P68 AH5 GLU S 24 ? ASP S 26 ? GLU G 24 ASP G 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P69 AH6 ARG S 90 ? GLU S 109 ? ARG G 90 GLU G 109 1 ? 20 HELX_P HELX_P70 AH7 THR S 141 ? GLN S 152 ? THR G 141 GLN G 152 1 ? 12 HELX_P HELX_P71 AH8 GLN T 103 ? VAL T 106 ? GLN B 103 VAL B 106 5 ? 4 HELX_P HELX_P72 AH9 GLY T 335 ? GLY T 340 ? GLY B 335 GLY B 340 1 ? 6 HELX_P HELX_P73 AI1 PRO T 601 ? ARG T 603 ? PRO B 601 ARG B 603 5 ? 3 HELX_P HELX_P74 AI2 LEU T 604 ? GLY T 609 ? LEU B 604 GLY B 609 1 ? 6 HELX_P HELX_P75 AI3 GLN U 103 ? VAL U 106 ? GLN C 103 VAL C 106 5 ? 4 HELX_P HELX_P76 AI4 GLY U 335 ? GLY U 340 ? GLY C 335 GLY C 340 1 ? 6 HELX_P HELX_P77 AI5 PRO U 601 ? ARG U 603 ? PRO C 601 ARG C 603 5 ? 3 HELX_P HELX_P78 AI6 LEU U 604 ? GLY U 609 ? LEU C 604 GLY C 609 1 ? 6 HELX_P HELX_P79 AI7 GLN V 103 ? VAL V 106 ? GLN D 103 VAL D 106 5 ? 4 HELX_P HELX_P80 AI8 GLY V 335 ? GLY V 340 ? GLY D 335 GLY D 340 1 ? 6 HELX_P HELX_P81 AI9 PRO V 601 ? ARG V 603 ? PRO D 601 ARG D 603 5 ? 3 HELX_P HELX_P82 AJ1 LEU V 604 ? GLY V 609 ? LEU D 604 GLY D 609 1 ? 6 HELX_P HELX_P83 AJ2 GLN W 103 ? VAL W 106 ? GLN E 103 VAL E 106 5 ? 4 HELX_P HELX_P84 AJ3 GLY W 335 ? GLY W 340 ? GLY E 335 GLY E 340 1 ? 6 HELX_P HELX_P85 AJ4 PRO W 601 ? ARG W 603 ? PRO E 601 ARG E 603 5 ? 3 HELX_P HELX_P86 AJ5 LEU W 604 ? GLY W 609 ? LEU E 604 GLY E 609 1 ? 6 HELX_P HELX_P87 AJ6 GLN X 103 ? VAL X 106 ? GLN F 103 VAL F 106 5 ? 4 HELX_P HELX_P88 AJ7 GLY X 335 ? GLY X 340 ? GLY F 335 GLY F 340 1 ? 6 HELX_P HELX_P89 AJ8 PRO X 601 ? ARG X 603 ? PRO F 601 ARG F 603 5 ? 3 HELX_P HELX_P90 AJ9 LEU X 604 ? GLY X 609 ? LEU F 604 GLY F 609 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 3 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 3 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 3 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 3 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 3 ? AD9 ? 3 ? AE1 ? 3 ? AE2 ? 3 ? AE3 ? 3 ? AE4 ? 3 ? AE5 ? 3 ? AE6 ? 3 ? AE7 ? 3 ? AE8 ? 3 ? 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AN9 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? 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CZ K PHE 118 ? ? 1.90 270 1 NH2 T ARG 70 ? ? CZ H PHE 118 ? ? 1.90 271 1 CG B PHE 3 ? ? NH1 C ARG 773 ? ? 1.90 272 1 CG E PHE 3 ? ? NH1 F ARG 773 ? ? 1.90 273 1 CG D PHE 3 ? ? NH1 E ARG 773 ? ? 1.92 274 1 CG A PHE 3 ? ? NH1 B ARG 773 ? ? 1.92 275 1 CG C PHE 3 ? ? NH1 D ARG 773 ? ? 1.92 276 1 NH1 A ARG 773 ? ? CG F PHE 3 ? ? 1.92 277 1 CB C PHE 3 ? ? CZ D ARG 773 ? ? 1.92 278 1 CZ A ARG 773 ? ? CB F PHE 3 ? ? 1.92 279 1 CB D PHE 3 ? ? CZ E ARG 773 ? ? 1.93 280 1 CB A PHE 3 ? ? CZ B ARG 773 ? ? 1.93 281 1 NH2 V ARG 70 ? ? CZ J PHE 118 ? ? 1.94 282 1 NH2 S ARG 70 ? ? CZ G PHE 118 ? ? 1.94 283 1 NH1 O ARG 90 ? ? CG D PRO 724 ? ? 1.95 284 1 CG A PRO 724 ? ? NH1 R ARG 90 ? ? 1.95 285 1 NH1 P ARG 90 ? ? CG C PRO 724 ? ? 1.96 286 1 NH1 M ARG 90 ? ? CG F PRO 724 ? ? 1.96 287 1 NH1 N ARG 90 ? ? CG E PRO 724 ? ? 1.96 288 1 NH1 Q ARG 90 ? ? CG B PRO 724 ? ? 1.96 289 1 NE T ARG 90 ? ? O E TYR 717 ? ? 2.03 290 1 NE W ARG 90 ? ? O B TYR 717 ? ? 2.03 291 1 O A TYR 717 ? ? NE X ARG 90 ? ? 2.03 292 1 NE U ARG 90 ? ? O D TYR 717 ? ? 2.03 293 1 NE V ARG 90 ? ? O C TYR 717 ? ? 2.04 294 1 NE S ARG 90 ? ? O F TYR 717 ? ? 2.04 295 1 O X PHE 125 ? ? O L LEU 130 ? ? 2.08 296 1 O T PHE 125 ? ? O H LEU 130 ? ? 2.08 297 1 O W PHE 125 ? ? O K LEU 130 ? ? 2.08 298 1 O U PHE 125 ? ? O I LEU 130 ? ? 2.09 299 1 O V PHE 125 ? ? O J LEU 130 ? ? 2.11 300 1 O S PHE 125 ? ? O G LEU 130 ? ? 2.11 301 1 OD1 P ASP 138 ? ? CG J LEU 130 ? ? 2.11 302 1 OD1 M ASP 138 ? ? CG G LEU 130 ? ? 2.11 303 1 CD S GLN 143 ? ? C G PRO 136 ? ? 2.12 304 1 CD V GLN 143 ? ? C J PRO 136 ? ? 2.12 305 1 CD W GLN 143 ? ? C K PRO 136 ? ? 2.12 306 1 CD T GLN 143 ? ? C H PRO 136 ? ? 2.12 307 1 OD1 R ASP 138 ? ? CG L LEU 130 ? ? 2.12 308 1 CD U GLN 143 ? ? C I PRO 136 ? ? 2.12 309 1 OD1 Q ASP 138 ? ? CG K LEU 130 ? ? 2.13 310 1 OD1 N ASP 138 ? ? CG H LEU 130 ? ? 2.13 311 1 CD X GLN 143 ? ? C L PRO 136 ? ? 2.13 312 1 OD1 O ASP 138 ? ? CG I LEU 130 ? ? 2.14 313 1 CZ S ARG 90 ? ? 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CB E PRO 724 ? ? 2.19 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 SER A 35 ? ? -96.22 32.76 2 1 VAL A 38 ? ? 67.80 -42.19 3 1 GLN A 71 ? ? 55.04 -123.31 4 1 PHE A 402 ? ? 56.35 -121.53 5 1 LYS A 404 ? ? 73.19 -7.46 6 1 THR A 484 ? ? -140.52 30.41 7 1 THR A 621 ? ? 57.00 -177.58 8 1 PRO A 663 ? ? -67.65 -179.21 9 1 ASP A 709 ? ? -170.20 146.77 10 1 VAL A 739 ? ? -121.06 -61.43 11 1 ASP A 745 ? ? -94.67 53.98 12 1 ARG X 32 ? ? 56.58 -139.36 13 1 ASN X 33 ? ? -99.49 -62.68 14 1 THR X 114 ? ? -140.76 15.87 15 1 GLN X 143 ? ? 72.45 -3.14 16 1 ARG W 32 ? ? 56.49 -139.35 17 1 ASN W 33 ? ? -99.47 -62.75 18 1 THR W 114 ? ? -140.67 15.83 19 1 GLN W 143 ? ? 72.46 -3.23 20 1 ARG V 32 ? ? 56.51 -139.38 21 1 ASN V 33 ? ? -99.44 -62.69 22 1 THR V 114 ? ? -140.70 15.74 23 1 GLN V 143 ? ? 72.52 -3.18 24 1 ARG U 32 ? ? 56.58 -139.36 25 1 ASN U 33 ? ? -99.46 -62.70 26 1 THR U 114 ? ? -140.76 15.87 27 1 GLN U 143 ? ? 72.45 -3.14 28 1 ARG T 32 ? ? 56.54 -139.36 29 1 ASN T 33 ? ? -99.47 -62.71 30 1 THR T 114 ? ? -140.75 15.84 31 1 GLN T 143 ? ? 72.46 -3.15 32 1 ARG S 32 ? ? 56.56 -139.38 33 1 ASN S 33 ? ? -99.44 -62.69 34 1 THR S 114 ? ? -140.72 15.78 35 1 GLN S 143 ? ? 72.52 -3.18 36 1 SER L 9 ? ? -114.19 50.43 37 1 ASN L 33 ? ? -130.34 -48.49 38 1 ASP L 50 ? ? 68.95 -0.20 39 1 ASN L 129 ? ? -100.55 65.60 40 1 SER K 9 ? ? -114.17 50.48 41 1 ASN K 33 ? ? -130.39 -48.42 42 1 ASP K 50 ? ? 68.97 -0.23 43 1 ASN K 129 ? ? -100.55 65.59 44 1 SER J 9 ? ? -114.30 50.51 45 1 ASN J 33 ? ? -130.32 -48.45 46 1 ASP J 50 ? ? 68.97 -0.16 47 1 THR J 51 ? ? -140.06 11.80 48 1 ASN J 129 ? ? -100.56 65.61 49 1 SER I 9 ? ? -114.19 50.47 50 1 ASN I 33 ? ? -130.38 -48.48 51 1 ASP I 50 ? ? 68.96 -0.10 52 1 THR I 51 ? ? -140.07 11.83 53 1 ASN I 129 ? ? -100.62 65.63 54 1 SER H 9 ? ? -114.25 50.44 55 1 ASN H 33 ? ? -130.35 -48.48 56 1 ASP H 50 ? ? 68.93 -0.21 57 1 ASN H 129 ? ? -100.55 65.63 58 1 SER G 9 ? ? -114.23 50.53 59 1 ASN G 33 ? ? -130.30 -48.54 60 1 ASP G 50 ? ? 68.97 -0.16 61 1 THR G 51 ? ? -140.06 11.80 62 1 ASN G 129 ? ? -100.60 65.59 63 1 SER B 35 ? ? -96.25 32.70 64 1 VAL B 38 ? ? 67.78 -42.14 65 1 GLN B 71 ? ? 55.11 -123.31 66 1 PHE B 402 ? ? 56.29 -121.47 67 1 LYS B 404 ? ? 73.18 -7.47 68 1 THR B 484 ? ? -140.50 30.40 69 1 THR B 621 ? ? 57.05 -177.63 70 1 PRO B 663 ? ? -67.61 -179.25 71 1 ASP B 709 ? ? -170.15 146.76 72 1 VAL B 739 ? ? -121.03 -61.42 73 1 ASP B 745 ? ? -94.65 53.97 74 1 SER C 35 ? ? -96.21 32.75 75 1 VAL C 38 ? ? 67.75 -42.13 76 1 GLN C 71 ? ? 55.11 -123.26 77 1 PHE C 402 ? ? 56.35 -121.55 78 1 LYS C 404 ? ? 73.13 -7.43 79 1 THR C 484 ? ? -140.53 30.41 80 1 THR C 621 ? ? 56.92 -177.61 81 1 PRO C 663 ? ? -67.60 -179.25 82 1 ASP C 709 ? ? -170.16 146.81 83 1 VAL C 739 ? ? -121.04 -61.48 84 1 ASP C 745 ? ? -94.71 53.98 85 1 SER D 35 ? ? -96.22 32.75 86 1 VAL D 38 ? ? 67.76 -42.12 87 1 GLN D 71 ? ? 55.05 -123.25 88 1 PHE D 402 ? ? 56.36 -121.54 89 1 LYS D 404 ? ? 73.17 -7.49 90 1 THR D 484 ? ? -140.57 30.37 91 1 THR D 621 ? ? 56.94 -177.57 92 1 PRO D 663 ? ? -67.65 -179.21 93 1 ASP D 709 ? ? -170.15 146.78 94 1 VAL D 739 ? ? -121.03 -61.50 95 1 ASP D 745 ? ? -94.67 53.90 96 1 SER E 35 ? ? -96.27 32.78 97 1 VAL E 38 ? ? 67.75 -42.09 98 1 GLN E 71 ? ? 55.06 -123.32 99 1 PHE E 402 ? ? 56.29 -121.47 100 1 LYS E 404 ? ? 73.18 -7.47 101 1 THR E 484 ? ? -140.50 30.40 102 1 ASP E 552 ? ? 70.01 35.70 103 1 THR E 621 ? ? 57.00 -177.60 104 1 PRO E 663 ? ? -67.68 -179.21 105 1 ASP E 709 ? ? -170.17 146.80 106 1 VAL E 739 ? ? -121.00 -61.45 107 1 ASP E 745 ? ? -94.65 53.93 108 1 SER F 35 ? ? -96.21 32.75 109 1 VAL F 38 ? ? 67.79 -42.14 110 1 GLN F 71 ? ? 55.06 -123.27 111 1 PHE F 402 ? ? 56.38 -121.54 112 1 LYS F 404 ? ? 73.14 -7.45 113 1 THR F 484 ? ? -140.53 30.41 114 1 THR F 621 ? ? 56.92 -177.61 115 1 PRO F 663 ? ? -67.68 -179.21 116 1 ASP F 709 ? ? -170.16 146.81 117 1 VAL F 739 ? ? -121.09 -61.43 118 1 ASP F 745 ? ? -94.67 53.91 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 8VBX _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ;Initial models were developed using AlphaFold-2, and were docked into EM maps. Models were then flexibly fit using chimeraX, followed by manual refinement using a combination of ISOLDE (ChimeraX) and coot. Automatic refinements were performed in PHENIX real space refine. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' # _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id . _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id . _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range . _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name AlphaFold _em_3d_fitting_list.type 'in silico model' _em_3d_fitting_list.accession_code ? _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 8VBX _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 3.23 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 17132 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details '10 mM Tris HCl pH 7.4, 10 mM MgSO4 and 0.01% w/v gelatin' _em_buffer.pH 7.4 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type VIRUS _em_entity_assembly.name 'Pectobacterium phage PhiM1' _em_entity_assembly.details ;Host Pectobacterium atrocepticum strain SCRI1043 bacteria were infected with WT Pectobacterium phage PhiM1. Sample was purified from overnight lysates. ; _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list 1,2 # _em_imaging.entry_id 8VBX _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode OTHER _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_min 800 _em_imaging.nominal_defocus_max 2400 _em_imaging.calibrated_defocus_min 800 _em_imaging.calibrated_defocus_max 2400 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 64000 _em_imaging.calibrated_magnification 36765 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.details ? # _em_virus_entity.id 1 _em_virus_entity.virus_host_category ? _em_virus_entity.virus_type VIRION _em_virus_entity.virus_isolate SPECIES _em_virus_entity.entity_assembly_id 1 _em_virus_entity.enveloped NO _em_virus_entity.empty NO _em_virus_entity.details ? # _em_vitrification.entry_id 8VBX _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 277.15 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 8VBX _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 8VBX _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C6 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? 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