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_audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Zhou, B.R.' 1 0000-0002-5375-7977 'Bai, Y.' 2 0000-0003-3239-1109 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Mol.Cell _citation.journal_id_ASTM MOCEFL _citation.journal_id_CSD 2168 _citation.journal_id_ISSN 1097-2765 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 84 _citation.language ? _citation.page_first 3061 _citation.page_last 3079.e10 _citation.title 'Structural insights into the cooperative nucleosome recognition and chromatin opening by FOXA1 and GATA4.' _citation.year 2024 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.molcel.2024.07.016 _citation.pdbx_database_id_PubMed 39121853 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Zhou, B.R.' 1 ? primary 'Feng, H.' 2 ? primary 'Huang, F.' 3 ? primary 'Zhu, I.' 4 ? primary 'Portillo-Ledesma, S.' 5 ? primary 'Shi, D.' 6 ? primary 'Zaret, K.S.' 7 ? primary 'Schlick, T.' 8 ? primary 'Landsman, D.' 9 ? primary 'Wang, Q.' 10 ? primary 'Bai, Y.' 11 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Hepatocyte nuclear factor 3-alpha' 50022.562 2 ? ? ? ? 2 polymer syn 'DNA (171-MER)' 57399.637 1 ? ? ? ? 3 polymer syn 'DNA (171-MER)' 57427.770 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'Histone H2A type 1-B/E' 14165.551 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'Histone H3.1' 15437.167 2 ? ? ? ? 6 polymer man 'Histone H4' 11394.426 2 ? ? ? ? 7 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(DA)(DG)(DT)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DC)(DT)(DT)(DC)(DT)(DT)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA) (DT)(DG)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DG)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DT)(DG)(DG)(DC)(DC)(DA) (DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DA)(DA)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DC)(DC)(DG)(DG)(DA)(DA)(DT)(DG) (DA)(DT)(DG)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DA)(DA)(DC)(DA) (DT)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DT)(DA)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DA)(DA)(DG)(DT)(DA) (DC)(DA)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC) (DA)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DA)(DA)(DA)(DG)(DT)(DA)(DC)(DC)(DA)(DT)(DC) (DT)(DC)(DG)(DG)(DA)(DT) ; ;ATCTTTCCTATTGCTTTAAAGGCAGAGGACTGTATTGATCAGTCCAAACTTCTTTCTGCATGTACATGGAAAACTGGCCA AGGCAAACACGTCCGGAATGATGGTATTTAAGAACAAACATTCCCTGGTATCAGCAAGTACAGTGCCCTGCTGACAGAGC AGGAGACACAAAGTACCATCTCGGAT ; J ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; ;MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; G,C ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; A,E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; B,F ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; D,H ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 LEU n 1 3 GLY n 1 4 THR n 1 5 VAL n 1 6 LYS n 1 7 MET n 1 8 GLU n 1 9 GLY n 1 10 HIS n 1 11 GLU n 1 12 THR n 1 13 SER n 1 14 ASP n 1 15 TRP n 1 16 ASN n 1 17 SER n 1 18 TYR n 1 19 TYR n 1 20 ALA n 1 21 ASP n 1 22 THR n 1 23 GLN n 1 24 GLU n 1 25 ALA n 1 26 TYR n 1 27 SER n 1 28 SER n 1 29 VAL n 1 30 PRO n 1 31 VAL n 1 32 SER n 1 33 ASN n 1 34 MET n 1 35 ASN n 1 36 SER n 1 37 GLY n 1 38 LEU n 1 39 GLY n 1 40 SER n 1 41 MET n 1 42 ASN n 1 43 SER n 1 44 MET n 1 45 ASN n 1 46 THR n 1 47 TYR n 1 48 MET n 1 49 THR n 1 50 MET n 1 51 ASN n 1 52 THR n 1 53 MET n 1 54 THR n 1 55 THR n 1 56 SER n 1 57 GLY n 1 58 ASN n 1 59 MET n 1 60 THR n 1 61 PRO n 1 62 ALA n 1 63 SER n 1 64 PHE n 1 65 ASN n 1 66 MET n 1 67 SER n 1 68 TYR n 1 69 ALA n 1 70 ASN n 1 71 PRO n 1 72 GLY n 1 73 LEU n 1 74 GLY n 1 75 ALA n 1 76 GLY n 1 77 LEU n 1 78 SER n 1 79 PRO n 1 80 GLY n 1 81 ALA n 1 82 VAL n 1 83 ALA n 1 84 GLY n 1 85 MET n 1 86 PRO n 1 87 GLY n 1 88 GLY n 1 89 SER n 1 90 ALA n 1 91 GLY n 1 92 ALA n 1 93 MET n 1 94 ASN n 1 95 SER n 1 96 MET n 1 97 THR n 1 98 ALA n 1 99 ALA n 1 100 GLY n 1 101 VAL n 1 102 THR n 1 103 ALA n 1 104 MET n 1 105 GLY n 1 106 THR n 1 107 ALA n 1 108 LEU n 1 109 SER n 1 110 PRO n 1 111 SER n 1 112 GLY n 1 113 MET n 1 114 GLY n 1 115 ALA n 1 116 MET n 1 117 GLY n 1 118 ALA n 1 119 GLN n 1 120 GLN n 1 121 ALA n 1 122 ALA n 1 123 SER n 1 124 MET n 1 125 ASN n 1 126 GLY n 1 127 LEU n 1 128 GLY n 1 129 PRO n 1 130 TYR n 1 131 ALA n 1 132 ALA n 1 133 ALA n 1 134 MET n 1 135 ASN n 1 136 PRO n 1 137 CYS n 1 138 MET n 1 139 SER n 1 140 PRO n 1 141 MET n 1 142 ALA n 1 143 TYR n 1 144 ALA n 1 145 PRO n 1 146 SER n 1 147 ASN n 1 148 LEU n 1 149 GLY n 1 150 ARG n 1 151 SER n 1 152 ARG n 1 153 ALA n 1 154 GLY n 1 155 GLY n 1 156 GLY n 1 157 GLY n 1 158 ASP n 1 159 ALA n 1 160 LYS n 1 161 THR n 1 162 PHE n 1 163 LYS n 1 164 ARG n 1 165 SER n 1 166 TYR n 1 167 PRO n 1 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H . n # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8VFZ _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8VFZ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8VFZ _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8VFZ _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 15903 ? f_bond_d ? ? 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'expression tag' 478 12 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 174 ? 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