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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.619 ? 8892 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.767 ? 979 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.045 ? 1008 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1148 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8VS6 _struct.title L-TGF-b3/avb8 _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8VS6 _struct_keywords.text 'TGFb, Complex, SIGNALING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'SIGNALING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 5 ? G N N 5 ? H N N 5 ? I N N 6 ? J N N 7 ? K N N 7 ? L N N 7 ? M N N 7 ? N N N 6 ? O N N 6 ? P N N 7 ? Q N N 8 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP TGFB3_HUMAN P10600 ? 1 ;LSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLTSPPEPTVMTHVPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAK EIHKFDMIQGLAEHNELAVCPKGITSKVFRFNVSSVEKNRTNLFRAEFRVLRVPNPSSKRNEQRIELFQILRPDEHIAKQ RYIGGKNLPTRGTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISIHCPCHTFQPNGDILENIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGD LGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRLDNPGQGGQRKKRALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWKWVHEPKGYYANF CSGPCPYLRSADTTHSTVLGLYNTLNPEASASPCCVPQDLEPLTILYYVGRTPKVEQLSNMVVKSCKCS ; 24 2 UNP ITAV_HUMAN P06756 ? 2 ;FNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFVPSASSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWSSTRRCQPIEFDATGNRDY AKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQEREPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSQDIDADGQGFCQGGFS IDFTKADRVLLGGPGSFYWQGQLISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFV SGVPRAARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQ RASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSM PPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLK ADGKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDESEFRDKLTPITIFME YRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKLEVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYE AELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSS NLFDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHVFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYELRNNGPSSFSKAMLHLQWP YKYNNNTLLYILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCL KIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPM PV ; 31 3 UNP ITB8_HUMAN P26012 ? 3 ;EDNRCASSNAASCARCLALGPECGWCVQEDFISGGSRSERCDIVSNLISKGCSVDSIEYPSVHVIIPTENEINTQVTPGE VSIQLRPGAEANFMLKVHPLKKYPVDLYYLVDVSASMHNNIEKLNSVGNDLSRKMAFFSRDFRLGFGSYVDKTVSPYISI HPERIHNQCSDYNLDCMPPHGYIHVLSLTENITEFEKAVHRQKISGNIDTPEGGFDAMLQAAVCESHIGWRKEAKRLLLV MTDQTSHLALDSKLAGIVVPNDGNCHLKNNVYVKSTTMEHPSLGQLSEKLIDNNINVIFAVQGKQFHWYKDLLPLLPGTI AGEIESKAANLNNLVVEAYQKLISEVKVQVENQVQGIYFNITAICPDGSRKPGMEGCRNVTSNDEVLFNVTVTMKKCDVT GGKNYAIIKPIGFNETAKIHIHRNCSCQCEDNRGPKGKCVDETFLDSKCFQCDENKCHFDEDQFSSESCKSHKDQPVCSG RGVCVCGKCSCHKIKLGKVYGKYCEKDDFSCPYHHGNLCAGHGECEAGRCQCFSGWEGDRCQCPSAAAQHCVNSKGQVCS GRGTCVCGRCECTDPRSIGRFCEHCPTCYTACKENWNCMQCLHPHNLSQAILDQCKTSCALMEQQHYVDQTSECFSSPSY LR ; 43 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8VS6 E 1 ? 389 ? P10600 24 ? 412 ? 4 392 2 2 8VS6 A 1 ? 962 ? P06756 31 ? 992 ? 1 1001 3 3 8VS6 B 1 ? 642 ? P26012 43 ? 684 ? 1 642 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 241 ? 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LEU B 248 GLY B 256 5 ? 9 HELX_P HELX_P16 AB7 TYR C 272 ? THR C 277 ? TYR B 272 THR B 277 5 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 SER C 282 ? ASN C 293 ? SER B 282 ASN B 293 1 ? 12 HELX_P HELX_P18 AB9 GLN C 305 ? ASP C 311 ? GLN B 305 ASP B 311 1 ? 7 HELX_P HELX_P19 AC1 LEU C 312 ? LEU C 316 ? LEU B 312 LEU B 316 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 AC2 ASN C 330 ? SER C 344 ? ASN B 330 SER B 344 1 ? 15 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? B CYS 59 SG ? ? ? 1_555 B CYS 67 SG ? ? A CYS 59 A CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 108 SG ? ? ? 1_555 B CYS 128 SG ? ? A CYS 108 A CYS 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 142 SG ? ? ? 1_555 B CYS 155 SG ? ? A CYS 142 A CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 169 SG ? ? ? 1_555 C CYS 176 SG ? ? B CYS 169 B CYS 176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 224 SG ? ? ? 1_555 C CYS 265 SG ? ? B CYS 224 B CYS 265 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 365 SG ? ? ? 1_555 C CYS 377 SG ? ? B CYS 365 B CYS 377 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf7 disulf ? ? C CYS 397 SG ? ? ? 1_555 C CYS 425 SG ? ? B CYS 397 B CYS 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? covale1 covale one ? B ASN 44 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? A ASN 44 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 260 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? A ASN 260 A NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 266 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? A ASN 266 C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? C ASN 191 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? B ASN 191 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? C ASN 360 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? B ASN 360 B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? C ASN 379 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? B ASN 379 B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? C ASN 389 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? B ASN 389 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? C ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? B ASN 414 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale9 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? C NAG 1 C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale10 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D BMA . C1 ? ? C NAG 2 C BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale11 covale both ? D BMA . O3 ? ? ? 1_555 D MAN . C1 ? ? C BMA 3 C MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale12 covale both ? D BMA . O6 ? ? ? 1_555 D MAN . C1 ? ? C BMA 3 C MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale13 covale both ? D MAN . O2 ? ? ? 1_555 D MAN . C1 ? ? C MAN 4 C MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale14 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale15 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale16 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale17 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? metalc1 metalc ? ? A ASP 240 OD1 ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? E ASP 243 B MG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.968 ? ? metalc2 metalc ? ? B ASP 230 OD1 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? A ASP 230 A CA 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? ? metalc3 metalc ? ? B ASN 232 OD1 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? A ASN 232 A CA 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.180 ? ? metalc4 metalc ? ? B ASP 234 OD1 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? A ASP 234 A CA 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? ? metalc5 metalc ? ? B ILE 236 O ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? A ILE 236 A CA 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? ? metalc6 metalc ? ? B ASP 238 OD1 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? A ASP 238 A CA 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? ? metalc7 metalc ? ? B ASP 284 OD1 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASP 284 A CA 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.360 ? ? metalc8 metalc ? ? B ASN 286 OD1 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASN 286 A CA 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? ? metalc9 metalc ? ? B ASP 288 OD1 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASP 288 A CA 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? ? metalc10 metalc ? ? B TYR 290 O ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A TYR 290 A CA 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.400 ? ? metalc11 metalc ? ? B ASP 292 OD1 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASP 292 A CA 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? ? metalc12 metalc ? ? B ASP 292 OD2 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASP 292 A CA 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? ? metalc13 metalc ? ? B ASP 349 OD1 ? ? ? 1_555 K CA . CA ? ? A ASP 349 A CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? ? metalc14 metalc ? ? B ASP 351 OD1 ? ? ? 1_555 K CA . CA ? ? A ASP 351 A CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? ? metalc15 metalc ? ? B ASP 353 OD1 ? ? ? 1_555 K CA . CA ? ? A ASP 353 A CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? ? metalc16 metalc ? ? B PHE 355 O ? ? ? 1_555 K CA . CA ? ? A PHE 355 A CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? ? metalc17 metalc ? ? B ASP 357 OD1 ? ? ? 1_555 K CA . CA ? ? A ASP 357 A CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? ? metalc18 metalc ? ? B ASP 357 OD2 ? ? ? 1_555 K CA . CA ? ? A ASP 357 A CA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.031 ? ? metalc19 metalc ? ? B ASP 413 OD1 ? ? ? 1_555 L CA . CA ? ? A ASP 413 A CA 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? ? metalc20 metalc ? ? B ASP 415 OD1 ? ? ? 1_555 L CA . CA ? ? A ASP 415 A CA 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.270 ? ? metalc21 metalc ? ? B ASN 417 OD1 ? ? ? 1_555 L CA . CA ? ? 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