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ALA n 2 31 PHE n 2 32 ASN n 2 33 ALA n 2 34 ALA n 2 35 ASP n 2 36 LYS n 2 37 VAL n 2 38 ASN n 2 39 PHE n 2 40 ALA n 2 41 THR n 2 42 TRP n 2 43 ASN n 2 44 GLN n 2 45 ALA n 2 46 ARG n 2 47 LEU n 2 48 GLU n 2 49 ARG n 2 50 ASP n 2 51 LEU n 2 52 SER n 2 53 ASN n 2 54 LYS n 2 55 LYS n 2 56 ILE n 2 57 TYR n 2 58 GLN n 2 59 GLU n 2 60 GLU n 2 61 GLU n 2 62 MET n 2 63 PRO n 2 64 GLU n 2 65 SER n 2 66 GLY n 2 67 ALA n 2 68 GLY n 2 69 SER n 2 70 GLU n 2 71 PHE n 2 72 ASN n 2 73 ARG n 2 74 LYS n 2 75 LEU n 2 76 ARG n 2 77 GLU n 2 78 GLU n 2 79 ALA n 2 80 ARG n 2 81 ARG n 2 82 LYS n 2 83 LYS n 2 84 TYR n 2 85 GLY n 2 86 ILE n 2 87 VAL n 2 88 LEU n 2 89 LYS n 2 90 GLU n 2 91 PHE n 2 92 ARG n 2 93 PRO n 2 94 GLU n 2 95 ASP n 2 96 GLN n 2 97 PRO n 2 98 TRP n 2 99 LEU n 2 100 LEU n 2 101 ARG n 2 102 VAL n 2 103 ASN n 2 104 GLY n 2 105 LYS n 2 106 SER n 2 107 GLY n 2 108 ARG n 2 109 LYS n 2 110 PHE n 2 111 LYS n 2 112 GLY n 2 113 ILE n 2 114 LYS n 2 115 LYS n 2 116 GLY n 2 117 GLY n 2 118 VAL n 2 119 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A0A4X1TRS6 1 ? 58 ? 1 58 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 18 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY B 5 ? 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'DG-C PAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 "O3'" ? 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HERE, ALPHA-AMANITIN IS REPRESENTED BY THE SEQUENCE (SEQRES) ; _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification ? # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 8WAY _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 8WAY _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 2.85 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 119942 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.9 # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details _em_entity_assembly.entity_id_list 1 0 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX 'Structure of transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS' ? ? ? 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18 2 1 NATURAL COMPLEX 'RNA POLYMERASE II' ? ? ? 7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18 3 1 RECOMBINANT COMPLEX TFIIF ? ? ? 2,3 4 1 SYNTHETIC COMPLEX DNA ? ? ? 4,5 5 1 SYNTHETIC COMPLEX RNA ? ? ? 6 6 1 NATURAL COMPLEX Alpha-amanitin ? ? ? 1 # _em_imaging.entry_id 8WAY _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 1500 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? # _em_vitrification.entry_id 8WAY _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 8WAY _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 S MET 1 ? 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"O3'" sing N N 15 A "C3'" "C2'" sing N N 16 A "C3'" "H3'" sing N N 17 A "O3'" "HO3'" sing N N 18 A "C2'" "O2'" sing N N 19 A "C2'" "C1'" sing N N 20 A "C2'" "H2'" sing N N 21 A "O2'" "HO2'" sing N N 22 A "C1'" N9 sing N N 23 A "C1'" "H1'" sing N N 24 A N9 C8 sing Y N 25 A N9 C4 sing Y N 26 A C8 N7 doub Y N 27 A C8 H8 sing N N 28 A N7 C5 sing Y N 29 A C5 C6 sing Y N 30 A C5 C4 doub Y N 31 A C6 N6 sing N N 32 A C6 N1 doub Y N 33 A N6 H61 sing N N 34 A N6 H62 sing N N 35 A N1 C2 sing Y N 36 A C2 N3 doub Y N 37 A C2 H2 sing N N 38 A N3 C4 sing Y N 39 ALA N CA sing N N 40 ALA N H sing N N 41 ALA N H2 sing N N 42 ALA CA C sing N N 43 ALA CA CB sing N N 44 ALA CA HA sing N N 45 ALA C O doub N N 46 ALA C OXT sing N N 47 ALA CB HB1 sing N N 48 ALA CB HB2 sing N N 49 ALA CB HB3 sing N N 50 ALA OXT HXT sing N N 51 ARG N CA sing N N 52 ARG N H sing N N 53 ARG N H2 sing N N 54 ARG CA C sing N N 55 ARG CA CB sing N N 56 ARG CA HA sing N N 57 ARG C O doub N N 58 ARG C OXT sing N N 59 ARG CB CG sing N N 60 ARG CB HB2 sing N N 61 ARG CB HB3 sing N N 62 ARG CG CD sing N N 63 ARG CG HG2 sing N N 64 ARG CG HG3 sing N N 65 ARG CD NE sing N N 66 ARG CD HD2 sing N N 67 ARG CD HD3 sing N N 68 ARG NE CZ sing N N 69 ARG NE HE sing N N 70 ARG CZ NH1 sing N N 71 ARG CZ NH2 doub N N 72 ARG NH1 HH11 sing N N 73 ARG NH1 HH12 sing N N 74 ARG NH2 HH21 sing N N 75 ARG NH2 HH22 sing N N 76 ARG OXT HXT sing N N 77 ASN N CA sing N N 78 ASN N H sing N N 79 ASN N H2 sing N N 80 ASN CA C sing N N 81 ASN CA CB sing N N 82 ASN CA HA sing N N 83 ASN C O doub N N 84 ASN C OXT sing N N 85 ASN CB CG sing N N 86 ASN CB HB2 sing N N 87 ASN CB HB3 sing N N 88 ASN CG OD1 doub N N 89 ASN CG ND2 sing N N 90 ASN ND2 HD21 sing N N 91 ASN ND2 HD22 sing N N 92 ASN OXT HXT sing N N 93 ASP N CA sing N N 94 ASP N H sing N N 95 ASP N H2 sing N N 96 ASP CA C sing N N 97 ASP CA CB sing N N 98 ASP CA HA sing N N 99 ASP C O doub N N 100 ASP C OXT sing N N 101 ASP CB CG sing N N 102 ASP CB HB2 sing N N 103 ASP CB HB3 sing N N 104 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N N 187 DA "C3'" "H3'" sing N N 188 DA "O3'" "HO3'" sing N N 189 DA "C2'" "C1'" sing N N 190 DA "C2'" "H2'" sing N N 191 DA "C2'" "H2''" sing N N 192 DA "C1'" N9 sing N N 193 DA "C1'" "H1'" sing N N 194 DA N9 C8 sing Y N 195 DA N9 C4 sing Y N 196 DA C8 N7 doub Y N 197 DA C8 H8 sing N N 198 DA N7 C5 sing Y N 199 DA C5 C6 sing Y N 200 DA C5 C4 doub Y N 201 DA C6 N6 sing N N 202 DA C6 N1 doub Y N 203 DA N6 H61 sing N N 204 DA N6 H62 sing N N 205 DA N1 C2 sing Y N 206 DA C2 N3 doub Y N 207 DA C2 H2 sing N N 208 DA N3 C4 sing Y N 209 DC OP3 P sing N N 210 DC OP3 HOP3 sing N N 211 DC P OP1 doub N N 212 DC P OP2 sing N N 213 DC P "O5'" sing N N 214 DC OP2 HOP2 sing N N 215 DC "O5'" "C5'" sing N N 216 DC "C5'" "C4'" sing N N 217 DC "C5'" "H5'" sing N N 218 DC "C5'" "H5''" sing N N 219 DC "C4'" "O4'" sing N N 220 DC "C4'" "C3'" sing N N 221 DC "C4'" "H4'" sing N N 222 DC "O4'" "C1'" sing N N 223 DC "C3'" "O3'" sing N N 224 DC "C3'" "C2'" sing N N 225 DC "C3'" "H3'" sing N N 226 DC "O3'" "HO3'" 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266 DG "C1'" "H1'" sing N N 267 DG N9 C8 sing Y N 268 DG N9 C4 sing Y N 269 DG C8 N7 doub Y N 270 DG C8 H8 sing N N 271 DG N7 C5 sing Y N 272 DG C5 C6 sing N N 273 DG C5 C4 doub Y N 274 DG C6 O6 doub N N 275 DG C6 N1 sing N N 276 DG N1 C2 sing N N 277 DG N1 H1 sing N N 278 DG C2 N2 sing N N 279 DG C2 N3 doub N N 280 DG N2 H21 sing N N 281 DG N2 H22 sing N N 282 DG N3 C4 sing N N 283 DT OP3 P sing N N 284 DT OP3 HOP3 sing N N 285 DT P OP1 doub N N 286 DT P OP2 sing N N 287 DT P "O5'" sing N N 288 DT OP2 HOP2 sing N N 289 DT "O5'" "C5'" sing N N 290 DT "C5'" "C4'" sing N N 291 DT "C5'" "H5'" sing N N 292 DT "C5'" "H5''" sing N N 293 DT "C4'" "O4'" sing N N 294 DT "C4'" "C3'" sing N N 295 DT "C4'" "H4'" sing N N 296 DT "O4'" "C1'" sing N N 297 DT "C3'" "O3'" sing N N 298 DT "C3'" "C2'" sing N N 299 DT "C3'" "H3'" sing N N 300 DT "O3'" "HO3'" sing N N 301 DT "C2'" "C1'" sing N N 302 DT "C2'" "H2'" sing N N 303 DT "C2'" "H2''" sing N N 304 DT "C1'" N1 sing N N 305 DT "C1'" "H1'" sing N N 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