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E . n # _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id 1 _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num 1 _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag Y _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag 1 _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id B _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id SER _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id 580 _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code ? _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id OG _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id ? _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id B _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id SER _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id 579 _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id OG # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8WKT _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8WKT _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8WKT _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8WKT _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 22459 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.568 ? 30292 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.030 ? 2906 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.041 ? 3232 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 3864 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8WKT _struct.title 'Cryo-EM structure of DSR2-DSAD1 complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8WKT _struct_keywords.text ;Anti-phage immune, NADase, Defense-associated sirtuin 2, DSR2, Phage tail tube protein, DSR Anti Defense 1, DSAD1, Bacteria-phage interaction, STRUCTURAL PROTEIN ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 1 ? E N N 1 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP D4G637_BACNB D4G637 ? 1 ;VKVDLESKRYGEKLKEVFLMLDNNVVECIKEITESSRNGKLVFFVGAGVSTLSDYPQWWRLVDKYHEELYGSPKKGNYSS DEYLRIPQIFYNVKGEMAFDGILKDFFQVDKPTNPIHDKILAMNPAHVITTNYDNLIDTACWKRGKYFSVISAEEDVANA TSSRYLLKVHGDFRKGFKGENVVLKEDDYLNYDQNYPLISNLMKTIIATHTIVFIGYGLGDYNINMLLNWVRKLQKDSFH KPFFIRTDPSPIENETLIYYENKGLRIIDAASLIDSNEYDYLERYSAVMDLLIESQENKFITKDDEVIDYIYGKISPLFA LQYIRKIDLKHVFEYDYHFEVNGTVVRHKNKGFGYMERFFELKESCDERSKLSKKQYERFNALFNFFEKNGVICMAKDAG TLNTSIEINSLAYHGKYDVMKKFIEEQSVSIEDDYKKAFFLACLGRWEESYDLYSNIILNSIDESNGCVYYLSQINRYRI YQSITQAVTQFNGLGLLTFGRHYKPFTDEFLARIEREMTNFNIDDLFNGMPFEFQKKYKILEFLSDNQFLYDDTVKLFEL TNKVRSEMSEGSYSFGMSSDIVVLLRLYDNLRFLYENCLWSVSFHEFHQYIRNSMSLLIEKAEYERTRDIDELGFSFFGK KSGFFMEYYDFVNISRHFKIDDIKNLERSCSIDKIRFGEQEKIEEYLVGIAEEITKQFSANGMNVVFYTQFISEAKAALY FAKYVKLSEEGLGKIVKALLFYFPERDLDIGKRYVWLERLTKCNELPKSIISIIDDFLVLQAEKHIDQNYSEVSSNGLYS RDYGALIKHFEKNFISKRLSEITLCLTQDKQKQIDFLFKLLPLLSTNAKSHLLSFKSVENINDLMNGIRIGLIDEFTPEH EELIIEYLETRKVNYIVEKEKGIQTFSSNDYMSTFGIWYFLEEINNSKMEEFIGMDDQYDFFVDPENFDYKKFIPSWLKN YNDKLLGKIAGNKHMKHHVIEVLKERVKNSNDKRYLEILMNYFI ; 2 2 UNP YOTI_BACSU Q796A8 ? 2 ;MIEIFKDTGATHDLVYHSKINTFVWDVEFDIVLSDSKELNKCYFVKCFNPYRINGKCDFAVSSIDIFSEGKRLLIENEFN FKITKAVHVATSKDVTEIVLHLSERISSPFPIVKEVVYLD ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8WKT A 1 ? 1004 ? 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MET A 20 ? LYS A 14 MET A 21 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 22 ? ASN A 38 ? ASP A 23 ASN A 39 1 ? 17 HELX_P HELX_P3 AA3 VAL A 49 ? SER A 53 ? VAL A 50 SER A 54 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 GLN A 57 ? GLY A 71 ? GLN A 58 GLY A 72 1 ? 15 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 81 ? GLY A 95 ? ASP A 82 GLY A 96 1 ? 15 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY A 95 ? PHE A 107 ? GLY A 96 PHE A 108 1 ? 13 HELX_P HELX_P7 AA7 ASN A 114 ? ALA A 122 ? ASN A 115 ALA A 123 1 ? 9 HELX_P HELX_P8 AA8 ASN A 135 ? GLY A 145 ? ASN A 136 GLY A 146 1 ? 11 HELX_P HELX_P9 AA9 ALA A 153 ? ASN A 159 ? ALA A 154 ASN A 160 1 ? 7 HELX_P HELX_P10 AB1 GLU A 186 ? ASN A 191 ? GLU A 187 ASN A 192 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 AB2 TYR A 196 ? HIS A 210 ? TYR A 197 HIS A 211 1 ? 15 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP A 221 ? ARG A 232 ? ASP A 222 ARG A 233 1 ? 12 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU A 255 ? GLY A 264 ? GLU A 256 GLY A 265 1 ? 10 HELX_P HELX_P14 AB5 ALA A 270 ? ILE A 274 ? ALA A 271 ILE A 275 1 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 ASP A 280 ? SER A 295 ? 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