HEADER IMMUNE SYSTEM 28-SEP-23 8WKW TITLE STRUCTURE OF MAVS-CARD FILAMENT COMPND MOL_ID: 1; COMPND 2 MOLECULE: MITOCHONDRIAL ANTIVIRAL-SIGNALING PROTEIN; COMPND 3 CHAIN: A, B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T, U, COMPND 4 V, W, X, Y, Z; COMPND 5 ENGINEERED: YES SOURCE MOL_ID: 1; SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS; SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: HUMAN; SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 9606; SOURCE 5 GENE: MAVS; SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI; SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562 KEYWDS FILAMENT, IMMUNE SYSTEM EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY AUTHOR M.SHI,P.GAO REVDAT 2 30-APR-25 8WKW 1 JRNL REVDAT 1 16-OCT-24 8WKW 0 JRNL AUTH M.SHI,T.JIANG,M.ZHANG,Q.LI,K.LIU,N.LIN,X.WANG,A.JIANG,Y.GAO, JRNL AUTH 2 Y.WANG,S.LIU,L.ZHANG,D.LI,P.GAO JRNL TITL NUCLEIC-ACID-INDUCED ZCCHC3 CONDENSATION PROMOTES BROAD JRNL TITL 2 INNATE IMMUNE RESPONSES. JRNL REF MOL.CELL V. 85 962 2025 JRNL REFN ISSN 1097-2765 JRNL PMID 39983719 JRNL DOI 10.1016/J.MOLCEL.2025.01.027 REMARK 2 REMARK 2 RESOLUTION. 3.21 ANGSTROMS. REMARK 3 REMARK 3 REFINEMENT. REMARK 3 SOFTWARE PACKAGES : PHENIX REMARK 3 RECONSTRUCTION SCHEMA : NULL REMARK 3 REMARK 3 EM MAP-MODEL FITTING AND REFINEMENT REMARK 3 PDB ENTRY : NULL REMARK 3 REFINEMENT SPACE : NULL REMARK 3 REFINEMENT PROTOCOL : NULL REMARK 3 REFINEMENT TARGET : NULL REMARK 3 OVERALL ANISOTROPIC B VALUE : NULL REMARK 3 REMARK 3 FITTING PROCEDURE : NULL REMARK 3 REMARK 3 EM IMAGE RECONSTRUCTION STATISTICS REMARK 3 NOMINAL PIXEL SIZE (ANGSTROMS) : NULL REMARK 3 ACTUAL PIXEL SIZE (ANGSTROMS) : NULL REMARK 3 EFFECTIVE RESOLUTION (ANGSTROMS) : 3.210 REMARK 3 NUMBER OF PARTICLES : 80454 REMARK 3 CTF CORRECTION METHOD : PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE REMARK 3 CORRECTION REMARK 3 REMARK 3 EM RECONSTRUCTION MAGNIFICATION CALIBRATION: NULL REMARK 3 REMARK 3 OTHER DETAILS: NULL REMARK 4 REMARK 4 8WKW COMPLIES WITH FORMAT V. 3.30, 13-JUL-11 REMARK 100 REMARK 100 THIS ENTRY HAS BEEN PROCESSED BY PDBJ ON 08-OCT-23. REMARK 100 THE DEPOSITION ID IS D_1300041464. REMARK 245 REMARK 245 EXPERIMENTAL DETAILS REMARK 245 RECONSTRUCTION METHOD : SINGLE PARTICLE REMARK 245 SPECIMEN TYPE : NULL REMARK 245 REMARK 245 ELECTRON MICROSCOPE SAMPLE REMARK 245 SAMPLE TYPE : FILAMENT REMARK 245 PARTICLE TYPE : POINT REMARK 245 NAME OF SAMPLE : MAVS-CARD REMARK 245 SAMPLE CONCENTRATION (MG ML-1) : NULL REMARK 245 SAMPLE SUPPORT DETAILS : NULL REMARK 245 SAMPLE VITRIFICATION DETAILS : NULL REMARK 245 SAMPLE BUFFER : NULL REMARK 245 PH : 7.50 REMARK 245 SAMPLE DETAILS : NULL REMARK 245 REMARK 245 DATA ACQUISITION REMARK 245 DATE OF EXPERIMENT : NULL REMARK 245 NUMBER OF MICROGRAPHS-IMAGES : NULL REMARK 245 TEMPERATURE (KELVIN) : NULL REMARK 245 MICROSCOPE MODEL : FEI TITAN KRIOS REMARK 245 DETECTOR TYPE : GATAN K2 SUMMIT (4K X 4K) REMARK 245 MINIMUM DEFOCUS (NM) : 1200.00 REMARK 245 MAXIMUM DEFOCUS (NM) : 1800.00 REMARK 245 MINIMUM TILT ANGLE (DEGREES) : NULL REMARK 245 MAXIMUM TILT ANGLE (DEGREES) : NULL REMARK 245 NOMINAL CS : NULL REMARK 245 IMAGING MODE : BRIGHT FIELD REMARK 245 ELECTRON DOSE (ELECTRONS NM**-2) : 6000.00 REMARK 245 ILLUMINATION MODE : FLOOD BEAM REMARK 245 NOMINAL MAGNIFICATION : NULL REMARK 245 CALIBRATED MAGNIFICATION : NULL REMARK 245 SOURCE : FIELD EMISSION GUN REMARK 245 ACCELERATION VOLTAGE (KV) : 300 REMARK 245 IMAGING DETAILS : NULL REMARK 247 REMARK 247 ELECTRON MICROSCOPY REMARK 247 THE COORDINATES IN THIS ENTRY WERE GENERATED FROM ELECTRON REMARK 247 MICROSCOPY DATA. PROTEIN DATA BANK CONVENTIONS REQUIRE REMARK 247 THAT CRYST1 AND SCALE RECORDS BE INCLUDED, BUT THE VALUES REMARK 247 ON THESE RECORDS ARE MEANINGLESS EXCEPT FOR THE CALCULATION REMARK 247 OF THE STRUCTURE FACTORS. REMARK 300 REMARK 300 BIOMOLECULE: 1 REMARK 300 SEE REMARK 350 FOR THE AUTHOR PROVIDED AND/OR PROGRAM REMARK 300 GENERATED ASSEMBLY INFORMATION FOR THE STRUCTURE IN REMARK 300 THIS ENTRY. THE REMARK MAY ALSO PROVIDE INFORMATION ON REMARK 300 BURIED SURFACE AREA. REMARK 350 REMARK 350 COORDINATES FOR A COMPLETE MULTIMER REPRESENTING THE KNOWN REMARK 350 BIOLOGICALLY SIGNIFICANT OLIGOMERIZATION STATE OF THE REMARK 350 MOLECULE CAN BE GENERATED BY APPLYING BIOMT TRANSFORMATIONS REMARK 350 GIVEN BELOW. BOTH NON-CRYSTALLOGRAPHIC AND REMARK 350 CRYSTALLOGRAPHIC OPERATIONS ARE GIVEN. REMARK 350 REMARK 350 BIOMOLECULE: 1 REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: 26-MERIC REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: A, B, C, D, E, F, G, H, I, J, REMARK 350 AND CHAINS: K, L, M, N, O, P, Q, R, S, REMARK 350 AND CHAINS: T, U, V, W, X, Y, Z REMARK 350 BIOMT1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 500 REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY REMARK 500 SUBTOPIC: TORSION ANGLES REMARK 500 REMARK 500 TORSION ANGLES OUTSIDE THE EXPECTED RAMACHANDRAN REGIONS: REMARK 500 (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; REMARK 500 SSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE). REMARK 500 REMARK 500 STANDARD TABLE: REMARK 500 FORMAT:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,4X,F7.2,3X,F7.2) REMARK 500 REMARK 500 EXPECTED VALUES: GJ KLEYWEGT AND TA JONES (1996). PHI/PSI- REMARK 500 CHOLOGY: RAMACHANDRAN REVISITED. STRUCTURE 4, 1395 - 1400 REMARK 500 REMARK 500 M RES CSSEQI PSI PHI REMARK 500 PRO A 2 47.84 -89.13 REMARK 500 PRO B 2 47.88 -89.22 REMARK 500 PRO C 2 47.82 -89.13 REMARK 500 PRO D 2 47.84 -89.20 REMARK 500 PRO E 2 47.77 -89.10 REMARK 500 PRO F 2 47.85 -89.12 REMARK 500 PRO G 2 47.82 -89.20 REMARK 500 PRO H 2 47.84 -89.21 REMARK 500 PRO I 2 47.81 -89.18 REMARK 500 PRO J 2 47.83 -89.14 REMARK 500 PRO K 2 47.84 -89.17 REMARK 500 PRO L 2 47.81 -89.14 REMARK 500 PRO M 2 47.86 -89.22 REMARK 500 PRO N 2 47.78 -89.17 REMARK 500 PRO O 2 47.83 -89.24 REMARK 500 PRO P 2 47.80 -89.21 REMARK 500 PRO Q 2 47.80 -89.16 REMARK 500 PRO R 2 47.81 -89.19 REMARK 500 PRO S 2 47.82 -89.16 REMARK 500 PRO T 2 47.77 -89.11 REMARK 500 PRO U 2 47.83 -89.17 REMARK 500 PRO V 2 47.85 -89.25 REMARK 500 PRO W 2 47.83 -89.14 REMARK 500 PRO X 2 47.85 -89.24 REMARK 500 PRO Y 2 47.83 -89.23 REMARK 500 PRO Z 2 47.75 -89.11 REMARK 500 REMARK 500 REMARK: NULL REMARK 900 REMARK 900 RELATED ENTRIES REMARK 900 RELATED ID: EMD-37609 RELATED DB: EMDB REMARK 900 STRUCTURE OF MAVS-CARD FILAMENT DBREF 8WKW A 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW B 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW C 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW D 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW E 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW F 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW G 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW H 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW I 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW J 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW K 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW L 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW M 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW N 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW O 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW P 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW Q 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW R 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW S 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW T 1 97 UNP Q7Z434 MAVS_HUMAN 1 97 DBREF 8WKW U 1 97 UNP Q7Z434 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ARG SEQRES 5 N 97 ASP THR LEU TRP HIS LEU PHE ASN THR LEU GLN ARG ARG SEQRES 6 N 97 PRO GLY TRP VAL GLU TYR PHE ILE ALA ALA LEU ARG GLY SEQRES 7 N 97 CYS GLU LEU VAL ASP LEU ALA ASP GLU VAL ALA SER VAL SEQRES 8 N 97 TYR GLN SER TYR GLN PRO SEQRES 1 O 97 MET PRO PHE ALA GLU ASP LYS THR TYR LYS TYR ILE CYS SEQRES 2 O 97 ARG ASN PHE SER ASN PHE CYS ASN VAL ASP VAL VAL GLU SEQRES 3 O 97 ILE LEU PRO TYR LEU PRO CYS LEU THR ALA ARG ASP GLN SEQRES 4 O 97 ASP ARG LEU ARG ALA THR CYS THR LEU SER GLY ASN ARG SEQRES 5 O 97 ASP THR LEU TRP HIS LEU PHE ASN THR LEU GLN ARG ARG SEQRES 6 O 97 PRO GLY TRP VAL GLU TYR PHE ILE ALA ALA LEU ARG GLY SEQRES 7 O 97 CYS GLU LEU VAL ASP LEU ALA ASP GLU VAL ALA SER VAL SEQRES 8 O 97 TYR GLN SER TYR GLN PRO SEQRES 1 P 97 MET PRO PHE ALA GLU ASP LYS THR TYR LYS TYR ILE CYS SEQRES 2 P 97 ARG ASN PHE SER ASN PHE CYS ASN VAL ASP VAL VAL GLU SEQRES 3 P 97 ILE LEU PRO TYR LEU PRO CYS LEU THR ALA ARG ASP GLN SEQRES 4 P 97 ASP ARG LEU ARG ALA THR CYS THR LEU SER GLY ASN 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