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A VAL 291 CG2 52 1 Y 1 A LEU 292 ? CG ? A LEU 292 CG 53 1 Y 1 A LEU 292 ? CD1 ? A LEU 292 CD1 54 1 Y 1 A LEU 292 ? CD2 ? A LEU 292 CD2 55 1 Y 1 A GLU 295 ? CG ? A GLU 295 CG 56 1 Y 1 A GLU 295 ? CD ? A GLU 295 CD 57 1 Y 1 A GLU 295 ? OE1 ? A GLU 295 OE1 58 1 Y 1 A GLU 295 ? OE2 ? A GLU 295 OE2 59 1 Y 1 A LYS 298 ? CG ? A LYS 298 CG 60 1 Y 1 A LYS 298 ? CD ? A LYS 298 CD 61 1 Y 1 A LYS 298 ? CE ? A LYS 298 CE 62 1 Y 1 A LYS 298 ? NZ ? A LYS 298 NZ 63 1 Y 1 A PHE 414 ? CG ? A PHE 414 CG 64 1 Y 1 A PHE 414 ? CD1 ? A PHE 414 CD1 65 1 Y 1 A PHE 414 ? CD2 ? A PHE 414 CD2 66 1 Y 1 A PHE 414 ? CE1 ? A PHE 414 CE1 67 1 Y 1 A PHE 414 ? CE2 ? A PHE 414 CE2 68 1 Y 1 A PHE 414 ? CZ ? A PHE 414 CZ 69 1 Y 1 A LYS 426 ? CG ? A LYS 426 CG 70 1 Y 1 A LYS 426 ? CD ? A LYS 426 CD 71 1 Y 1 A LYS 426 ? CE ? A LYS 426 CE 72 1 Y 1 A LYS 426 ? NZ ? A LYS 426 NZ 73 1 Y 1 A GLU 431 ? CG ? A GLU 431 CG 74 1 Y 1 A GLU 431 ? CD ? A GLU 431 CD 75 1 Y 1 A GLU 431 ? OE1 ? A GLU 431 OE1 76 1 Y 1 A GLU 431 ? OE2 ? A GLU 431 OE2 77 1 Y 1 A GLU 458 ? CG ? A GLU 458 CG 78 1 Y 1 A GLU 458 ? CD ? A GLU 458 CD 79 1 Y 1 A GLU 458 ? OE1 ? A GLU 458 OE1 80 1 Y 1 A GLU 458 ? OE2 ? A GLU 458 OE2 81 1 Y 1 A TYR 508 ? CG ? A TYR 508 CG 82 1 Y 1 A TYR 508 ? CD1 ? A TYR 508 CD1 83 1 Y 1 A TYR 508 ? CD2 ? A TYR 508 CD2 84 1 Y 1 A TYR 508 ? CE1 ? A TYR 508 CE1 85 1 Y 1 A TYR 508 ? CE2 ? A TYR 508 CE2 86 1 Y 1 A TYR 508 ? CZ ? A TYR 508 CZ 87 1 Y 1 A TYR 508 ? OH ? A TYR 508 OH 88 1 Y 1 A ARG 510 ? CG ? A ARG 510 CG 89 1 Y 1 A ARG 510 ? CD ? A ARG 510 CD 90 1 Y 1 A ARG 510 ? NE ? A ARG 510 NE 91 1 Y 1 A ARG 510 ? CZ ? A ARG 510 CZ 92 1 Y 1 A ARG 510 ? NH1 ? A ARG 510 NH1 93 1 Y 1 A ARG 510 ? NH2 ? A ARG 510 NH2 94 1 Y 1 A ASN 513 ? CG ? A ASN 513 CG 95 1 Y 1 A ASN 513 ? OD1 ? A ASN 513 OD1 96 1 Y 1 A ASN 513 ? ND2 ? A ASN 513 ND2 97 1 Y 1 C MET 423 ? CG ? B MET 423 CG 98 1 Y 1 C MET 423 ? SD ? B MET 423 SD 99 1 Y 1 C MET 423 ? CE ? B MET 423 CE 100 1 Y 1 C GLU 438 ? CG ? B GLU 438 CG 101 1 Y 1 C GLU 438 ? CD ? B GLU 438 CD 102 1 Y 1 C GLU 438 ? OE1 ? B GLU 438 OE1 103 1 Y 1 C GLU 438 ? OE2 ? B GLU 438 OE2 104 1 Y 1 C ARG 440 ? CG ? B ARG 440 CG 105 1 Y 1 C ARG 440 ? CD ? B ARG 440 CD 106 1 Y 1 C ARG 440 ? NE ? B ARG 440 NE 107 1 Y 1 C ARG 440 ? CZ ? B ARG 440 CZ 108 1 Y 1 C ARG 440 ? NH1 ? B ARG 440 NH1 109 1 Y 1 C ARG 440 ? NH2 ? B ARG 440 NH2 110 1 Y 1 C PHE 469 ? CG ? B PHE 469 CG 111 1 Y 1 C PHE 469 ? CD1 ? B PHE 469 CD1 112 1 Y 1 C PHE 469 ? CD2 ? B PHE 469 CD2 113 1 Y 1 C PHE 469 ? CE1 ? B PHE 469 CE1 114 1 Y 1 C PHE 469 ? CE2 ? B PHE 469 CE2 115 1 Y 1 C PHE 469 ? CZ ? B PHE 469 CZ 116 1 Y 1 C ARG 472 ? CG ? B ARG 472 CG 117 1 Y 1 C ARG 472 ? CD ? B ARG 472 CD 118 1 Y 1 C ARG 472 ? NE ? B ARG 472 NE 119 1 Y 1 C ARG 472 ? CZ ? B ARG 472 CZ 120 1 Y 1 C ARG 472 ? NH1 ? B ARG 472 NH1 121 1 Y 1 C ARG 472 ? NH2 ? B ARG 472 NH2 122 1 Y 1 C GLU 474 ? CG ? B GLU 474 CG 123 1 Y 1 C GLU 474 ? CD ? B GLU 474 CD 124 1 Y 1 C GLU 474 ? OE1 ? B GLU 474 OE1 125 1 Y 1 C GLU 474 ? OE2 ? B GLU 474 OE2 126 1 Y 1 C ILE 488 ? CG1 ? B ILE 488 CG1 127 1 Y 1 C ILE 488 ? CG2 ? B ILE 488 CG2 128 1 Y 1 C ILE 488 ? CD1 ? B ILE 488 CD1 129 1 Y 1 C ARG 489 ? CG ? B ARG 489 CG 130 1 Y 1 C ARG 489 ? CD ? B ARG 489 CD 131 1 Y 1 C ARG 489 ? NE ? B ARG 489 NE 132 1 Y 1 C ARG 489 ? CZ ? B ARG 489 CZ 133 1 Y 1 C ARG 489 ? NH1 ? B ARG 489 NH1 134 1 Y 1 C ARG 489 ? NH2 ? B ARG 489 NH2 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8WMA _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8WMA _struct.title 'Fzd4/DEP complex (local refined)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8WMA _struct_keywords.text 'GPCR complex, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP FZD4_HUMAN Q9ULV1 ? 1 ;MAWRGAGPSVPGAPGGVGLSLGLLLQLLLLLGPARGFGDEEERRCDPIRISMCQNLGYNVTKMPNLVGHELQTDAELQLT TFTPLIQYGCSSQLQFFLCSVYVPMCTEKINIPIGPCGGMCLSVKRRCEPVLKEFGFAWPESLNCSKFPPQNDHNHMCME GPGDEEVPLPHKTPIQPGEECHSVGTNSDQYIWVKRSLNCVLKCGYDAGLYSRSAKEFTDIWMAVWASLCFISTAFTVLT FLIDSSRFSYPERPIIFLSMCYNIYSIAYIVRLTVGRERISCDFEEAAEPVLIQEGLKNTGCAIIFLLMYFFGMASSIWW VILTLTWFLAAGLKWGHEAIEMHSSYFHIAAWAIPAVKTIVILIMRLVDADELTGLCYVGNQNLDALTGFVVAPLFTYLV IGTLFIAAGLVALFKIRSNLQKDGTKTDKLERLMVKIGVFSVLYTVPATCVIACYFYEISNWALFRYSADDSNMAVEMLK IFMSLLVGITSGMWIWSAKTLHTWQKCSNRLVNSGKVKREKRGNGWVKPGKGSETVV ; 1 2 UNP DVL2_HUMAN O14641 ? 2 ;MAGSSTGGGGVGETKVIYHLDEEETPYLVKIPVPAERITLGDFKSVLQRPAGAKYFFKSMDQDFGVVKEEISDDNARLPC FNGRVVSWLVSSDNPQPEMAPPVHEPRAELAPPAPPLPPLPPERTSGIGDSRPPSFHPNVSSSHENLEPETETESVVSLR RERPRRRDSSEHGAGGHRTGGPSRLERHLAGYESSSTLMTSELESTSLGDSDEEDTMSRFSSSTEQSSASRLLKRHRRRR KQRPPRLERTSSFSSVTDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQV NDMNFENMSNDDAVRVLRDIVHKPGPIVLTVAKCWDPSPQAYFTLPRNEPIQPIDPAAWVSHSAALTGTFPAYPGSSSMS TITSGSSLPDGCEGRGLSVHTDMASVTKAMAAPESGLEVRDRMWLKITIPNAFLGSDVVDWLYHHVEGFPERREARKYAS GLLKAGLIRHTVNKITFSEQCYYVFGDLSGGCESYLVNLSLNDNDGSSGASDQDTLAPLPGATPWPLLPTFSYQYPAPHP YSPQPPPYHELSSYTYGGGSASSQHSEGSRSSGSTRSDGGAGRTGRPEERAPESKSGSGSESEPSSRGGSLRRGGEASGT SDGGPPPSRGSTGGAPNLRAHPGLHPYGPPPGMALPYNPMMVVMMPPPPPPVPPAVQPPGAPPVRDLGSVPPELTASRQS FHMAMGNPSEFFVDVM ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8WMA A 1 ? 537 ? Q9ULV1 1 ? 537 ? 1 537 2 2 8WMA C 1 ? 736 ? O14641 1 ? 736 ? 1 736 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8WMA LEU A 309 ? UNP Q9ULV1 MET 309 conflict 309 1 1 8WMA ILE A 450 ? UNP Q9ULV1 CYS 450 conflict 450 2 1 8WMA PHE A 507 ? UNP Q9ULV1 CYS 507 conflict 507 3 1 8WMA TYR A 508 ? UNP Q9ULV1 SER 508 conflict 508 4 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 212 ? 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GLY C 455 HIS C 465 1 ? 11 HELX_P HELX_P16 AB7 GLU B 474 ? ALA B 485 ? GLU C 474 ALA C 485 1 ? 12 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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A CYS 302 A CYS 377 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id TYR _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 250 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id A _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id TYR _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 250 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id A _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 251 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 A _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 251 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 A _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 0.51 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? 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N VAL A 194 O ASN A 199 ? O ASN A 199 AA2 1 2 N ASP A 369 ? N ASP A 369 O TYR A 378 ? O TYR A 378 AA3 1 2 N TRP B 444 ? N TRP C 444 O ILE B 447 ? O ILE C 447 AA3 2 3 N PHE B 453 ? N PHE C 453 O TYR B 503 ? O TYR C 503 AA3 3 4 O VAL B 504 ? O VAL C 504 N ARG B 489 ? 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