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I . n I 6 46 DA 46 46 ? ? ? I . n I 6 47 DA 47 47 ? ? ? I . n I 6 48 DT 48 48 ? ? ? I . n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code J 7 D3T 1 2001 2001 D3T D3T A . K 8 MG 1 2002 2002 MG MG A . # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 F ARG 202 ? CG ? F ARG 202 CG 2 1 Y 1 F ARG 202 ? CD ? F ARG 202 CD 3 1 Y 1 F ARG 202 ? NE ? F ARG 202 NE 4 1 Y 1 F ARG 202 ? CZ ? F ARG 202 CZ 5 1 Y 1 F ARG 202 ? NH1 ? F ARG 202 NH1 6 1 Y 1 F ARG 202 ? NH2 ? F ARG 202 NH2 7 1 Y 1 F LYS 203 ? CG ? F LYS 203 CG 8 1 Y 1 F LYS 203 ? CD ? F LYS 203 CD 9 1 Y 1 F LYS 203 ? CE ? F LYS 203 CE 10 1 Y 1 F LYS 203 ? NZ ? F LYS 203 NZ 11 1 Y 1 H DC 35 ? "O3'" ? H DC 35 "O3'" # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8WPF _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8WPF _struct.title 'Structure of monkeypox virus polymerase complex F8-A22-E4-H5 with exogenous DNA bearing one abasic site' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8WPF _struct_keywords.text 'Viral DNA replication, monkeypox virus, polymerase, H5, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 4 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 5 ? 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ARG A 497 THR A 513 1 ? 17 HELX_P HELX_P16 AB7 SER A 552 ? ASN A 562 ? SER A 552 ASN A 562 1 ? 11 HELX_P HELX_P17 AB8 ASN A 576 ? TYR A 591 ? ASN A 576 TYR A 591 1 ? 16 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY A 621 ? ALA A 644 ? GLY A 621 ALA A 644 1 ? 24 HELX_P HELX_P19 AC1 SER A 646 ? PHE A 673 ? SER A 646 PHE A 673 1 ? 28 HELX_P HELX_P20 AC2 SER A 680 ? ASN A 703 ? SER A 680 ASN A 703 1 ? 24 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP A 763 ? ARG A 781 ? ASP A 763 ARG A 781 1 ? 19 HELX_P HELX_P22 AC4 SER A 836 ? GLY A 857 ? SER A 836 GLY A 857 1 ? 22 HELX_P HELX_P23 AC5 ASN A 860 ? ARG A 883 ? ASN A 860 ARG A 883 1 ? 24 HELX_P HELX_P24 AC6 PRO A 886 ? PHE A 890 ? PRO A 886 PHE A 890 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 ASN A 905 ? ASN A 918 ? ASN A 905 ASN A 918 1 ? 14 HELX_P HELX_P26 AC8 ILE A 947 ? THR A 949 ? ILE A 947 THR A 949 5 ? 3 HELX_P HELX_P27 AC9 PHE A 967 ? LEU A 983 ? PHE A 967 LEU A 983 1 ? 17 HELX_P HELX_P28 AD1 ASN A 985 ? GLY A 998 ? ASN A 985 GLY A 998 1 ? 14 HELX_P HELX_P29 AD2 SER B 14 ? SER B 30 ? SER B 3 SER B 19 1 ? 17 HELX_P HELX_P30 AD3 LEU B 31 ? SER B 34 ? LEU B 20 SER B 23 5 ? 4 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP B 35 ? TYR B 53 ? ASP B 24 TYR B 42 1 ? 19 HELX_P HELX_P32 AD5 PRO B 118 ? ASP B 132 ? PRO B 107 ASP B 121 1 ? 15 HELX_P HELX_P33 AD6 SER B 158 ? TYR B 169 ? SER B 147 TYR B 158 1 ? 12 HELX_P HELX_P34 AD7 ASP B 188 ? PHE B 199 ? ASP B 177 PHE B 188 1 ? 12 HELX_P HELX_P35 AD8 ASP B 260 ? SER B 267 ? ASP B 249 SER B 256 1 ? 8 HELX_P HELX_P36 AD9 THR B 296 ? GLY B 309 ? THR B 285 GLY B 298 1 ? 14 HELX_P HELX_P37 AE1 GLY B 326 ? LEU B 334 ? GLY B 315 LEU B 323 1 ? 9 HELX_P HELX_P38 AE2 THR B 341 ? SER B 352 ? THR B 330 SER B 341 1 ? 12 HELX_P HELX_P39 AE3 SER B 352 ? GLN B 362 ? SER B 341 GLN B 351 1 ? 11 HELX_P HELX_P40 AE4 SER B 363 ? LEU B 372 ? SER B 352 LEU B 361 1 ? 10 HELX_P HELX_P41 AE5 PRO B 375 ? ASN B 384 ? PRO B 364 ASN B 373 1 ? 10 HELX_P HELX_P42 AE6 ASN B 404 ? ASN B 407 ? ASN B 393 ASN B 396 5 ? 4 HELX_P HELX_P43 AE7 ASN B 408 ? ASN B 417 ? ASN B 397 ASN B 406 1 ? 10 HELX_P HELX_P44 AE8 ASN B 417 ? PHE B 436 ? ASN B 406 PHE B 425 1 ? 20 HELX_P HELX_P45 AE9 TRP C 19 ? PRO C 21 ? TRP C 19 PRO C 21 5 ? 3 HELX_P HELX_P46 AF1 VAL C 22 ? LEU C 38 ? VAL C 22 LEU C 38 1 ? 17 HELX_P HELX_P47 AF2 ILE C 45 ? PHE C 49 ? ILE C 45 PHE C 49 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 AF3 LYS C 86 ? GLY C 101 ? LYS C 86 GLY C 101 1 ? 16 HELX_P HELX_P49 AF4 HIS C 133 ? VAL C 152 ? HIS C 133 VAL C 152 1 ? 20 HELX_P HELX_P50 AF5 ASN C 165 ? LEU C 170 ? ASN C 165 LEU C 170 1 ? 6 HELX_P HELX_P51 AF6 ALA C 184 ? ASP C 186 ? ALA C 184 ASP C 186 5 ? 3 HELX_P HELX_P52 AF7 HIS C 187 ? ASP C 192 ? HIS C 187 ASP C 192 1 ? 6 HELX_P HELX_P53 AF8 ARG C 193 ? ASP C 205 ? ARG C 193 ASP C 205 1 ? 13 HELX_P HELX_P54 AF9 ASN C 211 ? GLN C 214 ? ASN C 211 GLN C 214 5 ? 4 HELX_P HELX_P55 AG1 ASP D 141 ? GLY D 174 ? ASP D 141 GLY D 174 1 ? 34 HELX_P HELX_P56 AG2 PHE D 179 ? LYS D 199 ? PHE D 179 LYS D 199 1 ? 21 HELX_P HELX_P57 AG3 ASP E 141 ? SER E 164 ? ASP E 141 SER E 164 1 ? 24 HELX_P HELX_P58 AG4 GLU E 168 ? GLY E 196 ? GLU E 168 GLY E 196 1 ? 29 HELX_P HELX_P59 AG5 LEU F 142 ? GLY F 174 ? LEU F 142 GLY F 174 1 ? 33 HELX_P HELX_P60 AG6 PHE F 179 ? VAL F 200 ? PHE F 179 VAL F 200 1 ? 22 HELX_P HELX_P61 AG7 ASP G 141 ? SER G 164 ? ASP G 141 SER G 164 1 ? 24 HELX_P HELX_P62 AG8 GLU G 168 ? GLU G 195 ? GLU G 168 GLU G 195 1 ? 28 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale one ? 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N N 333 GLU HB3 H N N 334 GLU HG2 H N N 335 GLU HG3 H N N 336 GLU HE2 H N N 337 GLU HXT H N N 338 GLY N N N N 339 GLY CA C N N 340 GLY C C N N 341 GLY O O N N 342 GLY OXT O N N 343 GLY H H N N 344 GLY H2 H N N 345 GLY HA2 H N N 346 GLY HA3 H N N 347 GLY HXT H N N 348 HIS N N N N 349 HIS CA C N S 350 HIS C C N N 351 HIS O O N N 352 HIS CB C N N 353 HIS CG C Y N 354 HIS ND1 N Y N 355 HIS CD2 C Y N 356 HIS CE1 C Y N 357 HIS NE2 N Y N 358 HIS OXT O N N 359 HIS H H N N 360 HIS H2 H N N 361 HIS HA H N N 362 HIS HB2 H N N 363 HIS HB3 H N N 364 HIS HD1 H N N 365 HIS HD2 H N N 366 HIS HE1 H N N 367 HIS HE2 H N N 368 HIS HXT H N N 369 ILE N N N N 370 ILE CA C N S 371 ILE C C N N 372 ILE O O N N 373 ILE CB C N S 374 ILE CG1 C N N 375 ILE CG2 C N N 376 ILE CD1 C N N 377 ILE OXT O N N 378 ILE H H N N 379 ILE H2 H N N 380 ILE HA H N N 381 ILE HB H N N 382 ILE HG12 H N N 383 ILE HG13 H N N 384 ILE HG21 H N N 385 ILE HG22 H N N 386 ILE HG23 H N N 387 ILE HD11 H N N 388 ILE HD12 H N N 389 ILE HD13 H N 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