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EMDB EMD-38026 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2025-03-19 ? 2 'EM metadata' 1 0 2025-03-19 ? 3 'Half map' 1 0 2025-03-19 1 4 'Half map' 1 0 2025-03-19 2 5 Image 1 0 2025-03-19 ? 6 Mask 1 0 2025-03-19 1 7 'Primary map' 1 0 2025-03-19 ? 8 'Structure model' 1 1 2025-04-02 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 4 4 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 5 5 Image repository 'Initial release' ? ? 6 6 Mask repository 'Initial release' ? ? 7 7 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 8 'Structure model' 'Data collection' 2 8 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 8 'Structure model' citation 2 8 'Structure model' citation_author 3 8 'Structure model' em_admin # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 8 'Structure model' '_citation.journal_volume' 2 8 'Structure model' '_citation.page_first' 3 8 'Structure model' '_citation.page_last' 4 8 'Structure 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_pdbx_contact_author.email zhup@ibp.ac.cn _pdbx_contact_author.name_first zhu _pdbx_contact_author.name_last ping _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0003-2648-3170 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Wang, L.' 1 0009-0000-9559-0442 'Zhang, H.' 2 0000-0003-3788-4527 'Zhu, H.' 3 0000-0003-1522-0500 'Zhu, P.' 4 0000-0003-2648-3170 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Proc.Natl.Acad.Sci.USA _citation.journal_id_ASTM PNASA6 _citation.journal_id_CSD 0040 _citation.journal_id_ISSN 1091-6490 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 122 _citation.language ? _citation.page_first e2414490122 _citation.page_last e2414490122 _citation.title 'Cryo-EM structures reveal the acetylation process of piccolo NuA4.' _citation.year 2025 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1073/pnas.2414490122 _citation.pdbx_database_id_PubMed 40100634 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Wang, L.' 1 ? primary 'Zhang, H.' 2 ? primary 'Jia, Q.' 3 0009-0002-8834-2744 primary 'Li, W.' 4 0000-0002-7229-2466 primary 'Yang, C.' 5 0009-0001-6167-2164 primary 'Ma, L.' 6 ? primary 'Li, M.' 7 0000-0002-5328-5826 primary 'Lu, Y.' 8 0000-0002-8421-7228 primary 'Zhu, H.' 9 0000-0003-1522-0500 primary 'Zhu, P.' 10 0000-0003-2648-3170 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Chromatin modification-related protein EAF6' 59471.164 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'Chromatin modification-related protein' 13828.894 1 ? ? ? ? 3 polymer man 'Histone acetyltransferase' 55419.664 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'glutathione transferase,Enhancer of polycomb-like protein' 69285.969 1 ? ? ? ? 5 polymer man 'DNA (146-MER)' 45054.844 2 ? ? ? ? 6 polymer man 'Histone H3' 15391.007 2 ? ? ? ? 7 polymer man 'Histone H4' 11338.338 2 ? ? ? ? 8 polymer man 'Histone H2A' 14313.727 2 ? ? ? ? 9 polymer man 'Histone H2B' 14280.362 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MKIKTGARILALSALTTMMFSASALAKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATG DGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPA LDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAE AAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVN KDKPLGAVALKSYEEELVKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNSSSNNNN NNNNNNLGIEGRISEFENLYFQGHMTDELKSYEALKAELKKSLQDRREQEDTFDNLQQEIYDKETEYFSHNSNNNHSGHG GAHGSKSHYSGNIIKGFDTFSKSHHSHADSAFNNNDRIFSLSSATYVKQQHGQSQND ; ;MKIKTGARILALSALTTMMFSASALAKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATG DGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPA LDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAE AAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVN KDKPLGAVALKSYEEELVKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNSSSNNNN NNNNNNLGIEGRISEFENLYFQGHMTDELKSYEALKAELKKSLQDRREQEDTFDNLQQEIYDKETEYFSHNSNNNHSGHG GAHGSKSHYSGNIIKGFDTFSKSHHSHADSAFNNNDRIFSLSSATYVKQQHGQSQND ; L ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MDPSLVLEQTIQDVSNLPSEFRYLLEEIGSNDLKLIEEKKKYEQKESQIHKFIRQQGSIPKHPQEDGLDKEIKESLLKCQ SLQREKCVLANTALFLIARHLNKLEKNIALLEEDGVLAPV ; ;MDPSLVLEQTIQDVSNLPSEFRYLLEEIGSNDLKLIEEKKKYEQKESQIHKFIRQQGSIPKHPQEDGLDKEIKESLLKCQ SLQREKCVLANTALFLIARHLNKLEKNIALLEEDGVLAPV ; N ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MGSSHHHHHHSQDHENLYFQGAGSMSHDGKEEPGIAKKINSVDDIIIKCQCWVQKNDEERLAEILSINTRKAPPKFYVHY VNYNKRLDEWITTDRINLDKEVLYPKLKATDEDNKKQKKKKATNTSETPQDSLQDGVDGFSRENTDVMDLDNLNVQGIKD ENISHEDEIKKLRTSGSMTQNPHEVARVRNLNRIIMGKYEIEPWYFSPYPIELTDEDFIYIDDFTLQYFGSKKQYERYRK KCTLRHPPGNEIYRDDYVSFFEIDGRKQRTWCRNLCLLSKLFLDHKTLYYDVDPFLFYCMTRRDELGHHLVGYFSKEKES ADGYNVACILTLPQYQRMGYGKLLIEFSYELSKKENKVGSPEKPLSDLGLLSYRAYWSDTLITLLVEHQKEITIDEISSM TSMTTTDILHTAKTLNILRYYKGQHIIFLNEDILDRYNRLKAKKRRTIDPNRLIWKPPVFTASQLRFAW ; ;MGSSHHHHHHSQDHENLYFQGAGSMSHDGKEEPGIAKKINSVDDIIIKCQCWVQKNDEERLAEILSINTRKAPPKFYVHY VNYNKRLDEWITTDRINLDKEVLYPKLKATDEDNKKQKKKKATNTSETPQDSLQDGVDGFSRENTDVMDLDNLNVQGIKD ENISHEDEIKKLRTSGSMTQNPHEVARVRNLNRIIMGKYEIEPWYFSPYPIELTDEDFIYIDDFTLQYFGSKKQYERYRK KCTLRHPPGNEIYRDDYVSFFEIDGRKQRTWCRNLCLLSKLFLDHKTLYYDVDPFLFYCMTRRDELGHHLVGYFSKEKES ADGYNVACILTLPQYQRMGYGKLLIEFSYELSKKENKVGSPEKPLSDLGLLSYRAYWSDTLITLLVEHQKEITIDEISSM TSMTTTDILHTAKTLNILRYYKGQHIIFLNEDILDRYNRLKAKKRRTIDPNRLIWKPPVFTASQLRFAW ; K ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGLEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHN MLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALD VVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGDHPPKSDLVPRGSENLYFQGHMSSNSR FRHRKISVKQHLKIYLPNDLKHLDKDELQQREVVEIETGVEKNEEKEVHLHRILQMGSGHTKHKDYIPTPDASMTWNEYD KFYTGSFQETTSYIKFSATVEDCCGTNYNMDERDETFLNEQVNKGSSDILTEDEFEILCSSFEHAIHERQPFLSMDPESI LSFEELKPTLIKSDMADFNLRNQLNHEINSHKTHFITQFDPVSQMNTRPLIQLIEKFGSKIYDYWRERKIEVNGYEIFPQ 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(DA)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DA)(DA)(DT)(DT)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT) (DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG) (DC)(DA)(DG)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT) (DG)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DG)(DT)(DG)(DG)(DA)(DT) (DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DT) ; ;ATCAATATCCACCTGCAGATTCTACCAAAAGTGTATTTGGAAACTGCTCCATCAAAAGGCATGTTCAGCGGAATTCCGCT GAACATGCCTTTTGATGGAGCAGTTTCCAAATACACTTTTGGTAGAATCTGCAGGTGGATATTGAT ; I,J ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLASKAARKSAPSTGGVKKPHRYKPGTVALREIRRFQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAIGALQESVEAYLVSLFEDTNLAAIHAKRVTIQKKDIKLARRLRGERS ; ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLASKAARKSAPSTGGVKKPHRYKPGTVALREIRRFQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAIGALQESVEAYLVSLFEDTNLAAIHAKRVTIQKKDIKLARRLRGERS ; A,E ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKILRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEEVRAVLKSFLESVIRDSVTYTEHAKRK TVTSLDVVYALKRQGRTLYGFG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKILRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEEVRAVLKSFLESVIRDSVTYTEHAKRK TVTSLDVVYALKRQGRTLYGFG ; B,F ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MSGKAHGGKGKSGAKDSGSLRSQSSSARAGLQFPVGRIKRYLKRHATGRTRVGSKAAIYLTAVLEYLTAEVLELAGNAAK DLKVKRITPRHLQLAIRGDDELDSLIRATIASGGVLPHINKALLLKVEKKGSKK ; ;MSGKAHGGKGKSGAKDSGSLRSQSSSARAGLQFPVGRIKRYLKRHATGRTRVGSKAAIYLTAVLEYLTAEVLELAGNAAK DLKVKRITPRHLQLAIRGDDELDSLIRATIASGGVLPHINKALLLKVEKKGSKK ; C,G ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MSAKAEKKPASKAPAEKKPAAKKTSTSTDGKKRSKARKETYSSYIYKVLKQTHPDTGISQKSMSILNSFVNDIFERIATE ASKLAAYNKKSTISAREIQTAVRLILPGELAKHAVSEGTRAVTKYSSSTQA ; ;MSAKAEKKPASKAPAEKKPAAKKTSTSTDGKKRSKARKETYSSYIYKVLKQTHPDTGISQKSMSILNSFVNDIFERIATE ASKLAAYNKKSTISAREIQTAVRLILPGELAKHAVSEGTRAVTKYSSSTQA ; D,H ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 LYS n 1 3 ILE n 1 4 LYS n 1 5 THR n 1 6 GLY n 1 7 ALA n 1 8 ARG n 1 9 ILE n 1 10 LEU n 1 11 ALA n 1 12 LEU n 1 13 SER n 1 14 ALA n 1 15 LEU n 1 16 THR n 1 17 THR n 1 18 MET n 1 19 MET n 1 20 PHE n 1 21 SER n 1 22 ALA n 1 23 SER n 1 24 ALA n 1 25 LEU n 1 26 ALA n 1 27 LYS n 1 28 ILE n 1 29 GLU n 1 30 GLU n 1 31 GLY n 1 32 LYS n 1 33 LEU n 1 34 VAL n 1 35 ILE n 1 36 TRP n 1 37 ILE n 1 38 ASN n 1 39 GLY n 1 40 ASP n 1 41 LYS n 1 42 GLY n 1 43 TYR n 1 44 ASN n 1 45 GLY n 1 46 LEU n 1 47 ALA n 1 48 GLU n 1 49 VAL n 1 50 GLY n 1 51 LYS n 1 52 LYS n 1 53 PHE n 1 54 GLU n 1 55 LYS n 1 56 ASP n 1 57 THR n 1 58 GLY n 1 59 ILE n 1 60 LYS n 1 61 VAL n 1 62 THR n 1 63 VAL n 1 64 GLU n 1 65 HIS n 1 66 PRO n 1 67 ASP n 1 68 LYS n 1 69 LEU n 1 70 GLU n 1 71 GLU n 1 72 LYS n 1 73 PHE n 1 74 PRO n 1 75 GLN n 1 76 VAL n 1 77 ALA n 1 78 ALA n 1 79 THR n 1 80 GLY n 1 81 ASP n 1 82 GLY n 1 83 PRO n 1 84 ASP n 1 85 ILE n 1 86 ILE n 1 87 PHE n 1 88 TRP n 1 89 ALA n 1 90 HIS n 1 91 ASP n 1 92 ARG n 1 93 PHE n 1 94 GLY n 1 95 GLY n 1 96 TYR n 1 97 ALA n 1 98 GLN n 1 99 SER n 1 100 GLY n 1 101 LEU n 1 102 LEU n 1 103 ALA n 1 104 GLU n 1 105 ILE n 1 106 THR n 1 107 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