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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.565 ? 27131 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 9.403 ? 2716 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.041 ? 3087 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 3399 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8XJ7 _struct.title 'The Cryo-EM structure of MPXV E5 in complex with DNA' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8XJ7 _struct_keywords.text 'primase, helicase, REPLICATION' _struct_keywords.pdbx_keywords REPLICATION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 3 ? K N N 4 ? L N N 3 ? M N N 4 ? N N N 3 ? O N N 3 ? 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Q5IXS3 1 ? 785 ? 1 785 7 2 8XJ7 X 1 ? 70 ? 8XJ7 -19 ? 50 ? -19 50 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 7 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASN A 324 ? 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C ANP 801 C MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.780 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG ? A SER 510 ? A SER 510 ? 1_555 MG ? I MG . ? A MG 802 ? 1_555 O1G ? H ANP . ? A ANP 801 ? 1_555 159.3 ? 2 OG ? A SER 510 ? A SER 510 ? 1_555 MG ? I MG . ? A MG 802 ? 1_555 O2B ? H ANP . ? A ANP 801 ? 1_555 83.1 ? 3 O1G ? H ANP . ? A ANP 801 ? 1_555 MG ? I MG . ? A MG 802 ? 1_555 O2B ? H ANP . ? A ANP 801 ? 1_555 78.0 ? 4 OG ? B SER 510 ? B SER 510 ? 1_555 MG ? K MG . ? B MG 802 ? 1_555 O1G ? J ANP . ? B ANP 801 ? 1_555 150.9 ? 5 OG ? B SER 510 ? B SER 510 ? 1_555 MG ? K MG . ? B MG 802 ? 1_555 O2B ? J ANP . ? B ANP 801 ? 1_555 79.8 ? 6 O1G ? J ANP . ? B ANP 801 ? 1_555 MG ? K MG . ? B MG 802 ? 1_555 O2B ? J ANP . ? B ANP 801 ? 1_555 72.4 ? 7 OG ? C SER 510 ? C SER 510 ? 1_555 MG ? M MG . ? C MG 802 ? 1_555 O1G ? L ANP . ? C ANP 801 ? 1_555 157.4 ? 8 OG ? C SER 510 ? C SER 510 ? 1_555 MG ? M MG . ? C MG 802 ? 1_555 O2B ? L ANP . ? C ANP 801 ? 1_555 76.0 ? 9 O1G ? L ANP . ? C ANP 801 ? 1_555 MG ? M MG . ? C MG 802 ? 1_555 O2B ? L ANP . ? C ANP 801 ? 1_555 81.5 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ILE 681 A . ? ILE 681 A PRO 682 A ? PRO 682 A 1 -2.32 2 ILE 681 B . ? ILE 681 B PRO 682 B ? PRO 682 B 1 0.56 3 ILE 681 C . ? ILE 681 C PRO 682 C ? PRO 682 C 1 -0.04 4 ILE 681 D . ? ILE 681 D PRO 682 D ? PRO 682 D 1 3.11 5 ASP 448 E . ? ASP 448 E THR 449 E ? THR 449 E 1 5.42 6 ILE 681 E . ? ILE 681 E PRO 682 E ? PRO 682 E 1 -1.08 7 ILE 681 F . ? ILE 681 F PRO 682 F ? PRO 682 F 1 -2.89 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 5 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 3 ? AD5 ? 5 ? 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GLY D 503 ? LEU D 498 GLY D 503 AC3 5 ILE D 621 ? PHE D 626 ? ILE D 621 PHE D 626 AC4 1 CYS D 581 ? ILE D 583 ? CYS D 581 ILE D 583 AC4 2 ASN D 593 ? ARG D 595 ? ASN D 593 ARG D 595 AC5 1 HIS D 629 ? SER D 631 ? HIS D 629 SER D 631 AC5 2 VAL D 648 ? LEU D 650 ? VAL D 648 LEU D 650 AC6 1 LEU D 706 ? VAL D 707 ? LEU D 706 VAL D 707 AC6 2 ILE D 777 ? PHE D 778 ? ILE D 777 PHE D 778 AC7 1 ILE D 726 ? TYR D 728 ? ILE D 726 TYR D 728 AC7 2 VAL D 731 ? THR D 733 ? VAL D 731 THR D 733 AC8 1 VAL E 339 ? LEU E 341 ? VAL E 339 LEU E 341 AC8 2 HIS E 347 ? TRP E 350 ? HIS E 347 TRP E 350 AC8 3 TRP E 355 ? PHE E 357 ? TRP E 355 PHE E 357 AC9 1 LYS E 412 ? PHE E 415 ? LYS E 412 PHE E 415 AC9 2 GLY E 418 ? ASP E 421 ? GLY E 418 ASP E 421 AC9 3 MET E 426 ? TYR E 428 ? MET E 426 TYR E 428 AD1 1 PHE E 524 ? THR E 527 ? PHE E 524 THR E 527 AD1 2 SER E 552 ? CYS E 555 ? SER E 552 CYS E 555 AD1 3 THR E 599 ? THR E 604 ? THR E 599 THR E 604 AD1 4 LEU E 498 ? PHE E 502 ? LEU E 498 PHE E 502 AD1 5 ILE E 621 ? 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