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UA CHL 1 C4 234 1 N 1 C CHL 605 ? C5 ? UA CHL 1 C5 235 1 N 1 C CHL 605 ? C6 ? UA CHL 1 C6 236 1 N 1 C CHL 605 ? C7 ? UA CHL 1 C7 237 1 N 1 C CHL 605 ? C8 ? UA CHL 1 C8 238 1 N 1 C CHL 605 ? C9 ? UA CHL 1 C9 239 1 N 1 C CHL 605 ? C10 ? UA CHL 1 C10 240 1 N 1 C CHL 605 ? C11 ? UA CHL 1 C11 241 1 N 1 C CHL 605 ? C12 ? UA CHL 1 C12 242 1 N 1 C CHL 605 ? C13 ? UA CHL 1 C13 243 1 N 1 C CHL 605 ? C14 ? UA CHL 1 C14 244 1 N 1 C CHL 605 ? C15 ? UA CHL 1 C15 245 1 N 1 C CHL 605 ? C16 ? UA CHL 1 C16 246 1 N 1 C CHL 605 ? C17 ? UA CHL 1 C17 247 1 N 1 C CHL 605 ? C18 ? UA CHL 1 C18 248 1 N 1 C CHL 605 ? C19 ? UA CHL 1 C19 249 1 N 1 C CHL 605 ? C20 ? UA CHL 1 C20 250 1 N 1 C CHL 606 ? C6 ? VA CHL 1 C6 251 1 N 1 C CHL 606 ? C7 ? VA CHL 1 C7 252 1 N 1 C CHL 606 ? C8 ? VA CHL 1 C8 253 1 N 1 C CHL 606 ? C9 ? VA CHL 1 C9 254 1 N 1 C CHL 606 ? C10 ? VA CHL 1 C10 255 1 N 1 C CHL 606 ? C11 ? VA CHL 1 C11 256 1 N 1 C CHL 606 ? C12 ? VA CHL 1 C12 257 1 N 1 C CHL 606 ? C13 ? VA CHL 1 C13 258 1 N 1 C CHL 606 ? C14 ? VA CHL 1 C14 259 1 N 1 C CHL 606 ? C15 ? VA CHL 1 C15 260 1 N 1 C CHL 606 ? C16 ? VA CHL 1 C16 261 1 N 1 C CHL 606 ? C17 ? VA CHL 1 C17 262 1 N 1 C CHL 606 ? C18 ? VA CHL 1 C18 263 1 N 1 C CHL 606 ? C19 ? VA CHL 1 C19 264 1 N 1 C CHL 606 ? C20 ? VA CHL 1 C20 265 1 N 1 C CHL 607 ? C1 ? WA CHL 1 C1 266 1 N 1 C CHL 607 ? C2 ? WA CHL 1 C2 267 1 N 1 C CHL 607 ? C3 ? WA CHL 1 C3 268 1 N 1 C CHL 607 ? C4 ? WA CHL 1 C4 269 1 N 1 C CHL 607 ? C5 ? WA CHL 1 C5 270 1 N 1 C CHL 607 ? C6 ? WA CHL 1 C6 271 1 N 1 C CHL 607 ? C7 ? WA CHL 1 C7 272 1 N 1 C CHL 607 ? C8 ? WA CHL 1 C8 273 1 N 1 C CHL 607 ? C9 ? WA CHL 1 C9 274 1 N 1 C CHL 607 ? C10 ? WA CHL 1 C10 275 1 N 1 C CHL 607 ? C11 ? WA CHL 1 C11 276 1 N 1 C CHL 607 ? C12 ? WA CHL 1 C12 277 1 N 1 C CHL 607 ? C13 ? WA CHL 1 C13 278 1 N 1 C CHL 607 ? C14 ? WA CHL 1 C14 279 1 N 1 C CHL 607 ? C15 ? WA CHL 1 C15 280 1 N 1 C CHL 607 ? C16 ? WA CHL 1 C16 281 1 N 1 C CHL 607 ? C17 ? WA CHL 1 C17 282 1 N 1 C CHL 607 ? C18 ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.070 ? 12288 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.893 ? 3450 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.086 ? 1002 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 2868 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8Y15 _struct.title 'Cryo-EM structure of Light-harvesting complex from Spinacia oleracea' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8Y15 _struct_keywords.text 'Complex, light-harvesting, membrane protein, PHOTOSYNTHESIS' _struct_keywords.pdbx_keywords PHOTOSYNTHESIS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 2 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 3 ? P N N 3 ? Q N N 3 ? R N N 4 ? S N N 4 ? T N N 5 ? 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P12333 49 ? 264 ? 14 229 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB ; # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 12 ? 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GLY C 204 ASP C 215 1 ? 12 HELX_P HELX_P30 AD3 ASN C 207 ? ALA C 212 ? 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A CHL 607 ? 1_555 MG ? J CHL . ? A CHL 607 ? 1_555 ND ? J CHL . ? A CHL 607 ? 1_555 91.1 ? 119 NB ? J CHL . ? A CHL 607 ? 1_555 MG ? J CHL . ? A CHL 607 ? 1_555 ND ? J CHL . ? A CHL 607 ? 1_555 160.0 ? 120 NC ? J CHL . ? A CHL 607 ? 1_555 MG ? J CHL . ? A CHL 607 ? 1_555 ND ? J CHL . ? A CHL 607 ? 1_555 84.1 ? 121 O ? IB HOH . ? A HOH 728 ? 1_555 MG ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 NA ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 89.1 ? 122 O ? IB HOH . ? A HOH 728 ? 1_555 MG ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 NB ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 106.4 ? 123 NA ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 MG ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 NB ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 93.3 ? 124 O ? IB HOH . ? A HOH 728 ? 1_555 MG ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 NC ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 105.6 ? 125 NA ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 MG ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 NC ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 164.8 ? 126 NB ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 MG ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 NC ? K CHL . ? A CHL 608 ? 1_555 86.5 ? 127 O ? IB HOH . ? 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