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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.896 ? 32066 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.074 ? 3095 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.048 ? 3422 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 4112 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8YGC _struct.title 'The Dimer Structure of DSR2-SPR' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8YGC _struct_keywords.text 'SIR2, NADase, dimer, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 1 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP D4G637_BACNB D4G637 ? 1 ;MVKVDLESKRYGEKLKEVFLMLDNNVVECIKEITESSRNGKLVFFVGAGVSTLSDYPQWWRLVDKYHEELYGSPKKGNYS SDEYLRIPQIFYNVKGEMAFDGILKDFFQVDKPTNPIHDKILAMNPAHVITTNYDNLIDTACWKRGKYFSVISAEEDVAN ATSSRYLLKVHGDFRKGFKGENVVLKEDDYLNYDQNYPLISNLMKTIIATHTIVFIGYGLGDYNINMLLNWVRKLQKDSF HKPFFIRTDPSPIENETLIYYENKGLRIIDAASLIDSNEYDYLERYSAVMDLLIESQENKFITKDDEVIDYIYGKISPLF ALQYIRKIDLKHVFEYDYHFEVNGTVVRHKNKGFGYMERFFELKESCDERSKLSKKQYERFNALFNFFEKNGVICMAKDA GTLNTSIEINSLAYHGKYDVMKKFIEEQSVSIEDDYKKAFFLACLGRWEESYDLYSNIILNSIDESNGCVYYLSQINRYR IYQSITQAVTQFNGLGLLTFGRHYKPFTDEFLARIEREMTNFNIDDLFNGMPFEFQKKYKILEFLSDNQFLYDDTVKLFE LTNKVRSEMSEGSYSFGMSSDIVVLLRLYDNLRFLYENCLWSVSFHEFHQYIRNSMSLLIEKAEYERTRDIDELGFSFFG KKSGFFMEYYDFVNISRHFKIDDIKNLERSCSIDKIRFGEQEKIEEYLVGIAEEITKQFSANGMNVVFYTQFISEAKAAL YFAKYVKLSEEGLGKIVKALLFYFPERDLDIGKRYVWLERLTKCNELPKSIISIIDDFLVLQAEKHIDQNYSEVSSNGLY SRDYGALIKHFEKNFISKRLSEITLCLTQDKQKQIDFLFKLLPLLSTNAKSHLLSFKSVENINDLMNGIRIGLIDEFTPE HEELIIEYLETRKVNYIVEKEKGIQTFSSNDYMSTFGIWYFLEEINNSKMEEFIGMDDQYDFFVDPENFDYKKFIPSWLK NYNDKLLGKIAGNKHMKHHVIEVLKERVKNSNDKRYLEILMNYFI ; 1 2 UNP A0A162TY69_BACIU A0A162TY69 ? 2 ;MKTVIQDTADVYFKRKSDGKLVFTAEAQTASFSQAISEEKLRGGIGNKPLYILKSEKEINLTVKNAFFDLEWLAMTQGET IQEETKVKVFDREHGLIVDDTNKVTLKGKPVSDVTFYNKKGLTYKIAVSTDGTYTIPTAFAAAKDKLTAVYQIEKVGRRL AIKASKFSERYEVEYRTIAYNPDTEEVYSDIYIQFPNVSPSGEFEMSLENGNALAPEIKFEALADTDTDEMAVVIEASRD ENTAAPVEDTTGSTQSSDLGGTTE ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8YGC A 1 ? 1005 ? 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UNP D4G637 HIS 171 'engineered mutation' 171 4 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 23 ? ASN A 39 ? ASP A 23 ASN A 39 1 ? 17 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY A 47 ? THR A 52 ? GLY A 47 THR A 52 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 LEU A 53 ? ASP A 55 ? LEU A 53 ASP A 55 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 AA4 GLN A 58 ? GLY A 72 ? GLN A 58 GLY A 72 1 ? 15 HELX_P HELX_P5 AA5 SER A 80 ? LYS A 95 ? SER A 80 LYS A 95 1 ? 16 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY A 96 ? GLN A 109 ? GLY A 96 GLN A 109 1 ? 14 HELX_P HELX_P7 AA7 ASN A 115 ? MET A 124 ? ASN A 115 MET A 124 1 ? 10 HELX_P HELX_P8 AA8 ASN A 136 ? GLY A 146 ? ASN A 136 GLY A 146 1 ? 11 HELX_P HELX_P9 AA9 GLU A 156 ? ALA A 161 ? GLU A 156 ALA A 161 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 LYS A 179 ? VAL A 183 ? LYS A 179 VAL A 183 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 LYS A 186 ? ASN A 192 ? LYS A 186 ASN A 192 1 ? 7 HELX_P HELX_P12 AB3 ASN A 192 ? TYR A 197 ? ASN A 192 TYR A 197 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 TYR A 197 ? THR A 210 ? TYR A 197 THR A 210 1 ? 14 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP A 222 ? LYS A 237 ? ASP A 222 LYS A 237 1 ? 16 HELX_P HELX_P15 AB6 ASP A 238 ? PHE A 240 ? ASP A 238 PHE A 240 5 ? 3 HELX_P HELX_P16 AB7 GLU A 254 ? GLY A 265 ? GLU A 254 GLY A 265 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 AB8 ALA A 271 ? ILE A 275 ? ALA A 271 ILE A 275 1 ? 5 HELX_P HELX_P18 AB9 ASP A 281 ? ILE A 294 ? ASP A 281 ILE A 294 1 ? 14 HELX_P HELX_P19 AC1 VAL A 308 ? SER A 317 ? VAL A 308 SER A 317 1 ? 10 HELX_P HELX_P20 AC2 PRO A 318 ? ALA A 321 ? PRO A 318 ALA A 321 5 ? 4 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP A 329 ? PHE A 334 ? ASP A 329 PHE A 334 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 MET A 357 ? SER A 366 ? MET A 357 SER A 366 1 ? 10 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP A 368 ? LEU A 373 ? ASP A 368 LEU A 373 5 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 SER A 374 ? ASN A 391 ? SER A 374 ASN A 391 1 ? 18 HELX_P HELX_P25 AC7 LYS A 417 ? GLU A 426 ? LYS A 417 GLU A 426 1 ? 10 HELX_P HELX_P26 AC8 SER A 431 ? LEU A 445 ? SER A 431 LEU A 445 1 ? 15 HELX_P HELX_P27 AC9 GLU A 449 ? SER A 462 ? GLU A 449 SER A 462 1 ? 14 HELX_P HELX_P28 AD1 ASN A 467 ? LEU A 495 ? ASN A 467 LEU A 495 1 ? 29 HELX_P HELX_P29 AD2 LEU A 495 ? PHE A 500 ? LEU A 495 PHE A 500 1 ? 6 HELX_P HELX_P30 AD3 THR A 508 ? MET A 519 ? THR A 508 MET A 519 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 AD4 THR A 520 ? PHE A 522 ? THR A 520 PHE A 522 5 ? 3 HELX_P HELX_P32 AD5 ASP A 526 ? MET A 531 ? ASP A 526 MET A 531 1 ? 6 HELX_P HELX_P33 AD6 PRO A 532 ? TYR A 539 ? PRO A 532 TYR A 539 1 ? 8 HELX_P HELX_P34 AD7 LYS A 540 ? SER A 546 ? LYS A 540 SER A 546 5 ? 7 HELX_P HELX_P35 AD8 ASN A 548 ? GLY A 572 ? ASN A 548 GLY A 572 1 ? 25 HELX_P HELX_P36 AD9 SER A 579 ? ASN A 598 ? SER A 579 ASN A 598 1 ? 20 HELX_P HELX_P37 AE1 LEU A 600 ? SER A 604 ? LEU A 600 SER A 604 5 ? 5 HELX_P HELX_P38 AE2 PHE A 605 ? THR A 628 ? PHE A 605 THR A 628 1 ? 24 HELX_P HELX_P39 AE3 LEU A 634 ? PHE A 639 ? LEU A 634 PHE A 639 1 ? 6 HELX_P HELX_P40 AE4 GLU A 648 ? PHE A 659 ? GLU A 648 PHE A 659 1 ? 12 HELX_P HELX_P41 AE5 LYS A 660 ? ARG A 669 ? LYS A 660 ARG A 669 1 ? 10 HELX_P HELX_P42 AE6 GLU A 680 ? ALA A 701 ? GLU A 680 ALA A 701 1 ? 22 HELX_P HELX_P43 AE7 ASN A 705 ? GLN A 711 ? ASN A 705 GLN A 711 1 ? 7 HELX_P HELX_P44 AE8 PHE A 712 ? ALA A 723 ? PHE A 712 ALA A 723 1 ? 12 HELX_P HELX_P45 AE9 LYS A 724 ? VAL A 726 ? LYS A 724 VAL A 726 5 ? 3 HELX_P HELX_P46 AF1 SER A 729 ? PHE A 742 ? SER A 729 PHE A 742 1 ? 14 HELX_P HELX_P47 AF2 ASP A 750 ? LEU A 761 ? ASP A 750 LEU A 761 1 ? 12 HELX_P HELX_P48 AF3 PRO A 768 ? HIS A 786 ? PRO A 768 HIS A 786 1 ? 19 HELX_P HELX_P49 AF4 LEU A 799 ? GLU A 812 ? LEU A 799 GLU A 812 1 ? 14 HELX_P HELX_P50 AF5 SER A 817 ? CYS A 826 ? SER A 817 CYS A 826 1 ? 10 HELX_P HELX_P51 AF6 LYS A 831 ? LEU A 838 ? LYS A 831 LEU A 838 1 ? 8 HELX_P HELX_P52 AF7 LEU A 841 ? LEU A 845 ? LEU A 841 LEU A 845 5 ? 5 HELX_P HELX_P53 AF8 SER A 846 ? SER A 855 ? SER A 846 SER A 855 1 ? 10 HELX_P HELX_P54 AF9 ASN A 861 ? ILE A 871 ? ASN A 861 ILE A 871 1 ? 11 HELX_P HELX_P55 AG1 THR A 878 ? GLY A 903 ? THR A 878 GLY A 903 1 ? 26 HELX_P HELX_P56 AG2 TYR A 912 ? LEU A 922 ? TYR A 912 LEU A 922 1 ? 11 HELX_P HELX_P57 AG3 SER A 928 ? ILE A 934 ? SER A 928 ILE A 934 5 ? 7 HELX_P HELX_P58 AG4 ASP A 937 ? ASP A 945 ? ASP A 937 ASP A 945 1 ? 9 HELX_P HELX_P59 AG5 ASP A 950 ? PHE A 954 ? ASP A 950 PHE A 954 5 ? 5 HELX_P HELX_P60 AG6 ILE A 955 ? TYR A 962 ? ILE A 955 TYR A 962 5 ? 8 HELX_P HELX_P61 AG7 ASN A 963 ? ILE A 970 ? ASN A 963 ILE A 970 1 ? 8 HELX_P HELX_P62 AG8 ASN A 973 ? LYS A 977 ? ASN A 973 LYS A 977 5 ? 5 HELX_P HELX_P63 AG9 HIS A 979 ? SER A 991 ? HIS A 979 SER A 991 1 ? 13 HELX_P HELX_P64 AH1 ASP A 993 ? TYR A 1003 ? ASP A 993 TYR A 1003 1 ? 11 HELX_P HELX_P65 AH2 ASN B 24 ? ASN B 39 ? ASN B 24 ASN B 39 1 ? 16 HELX_P HELX_P66 AH3 GLY B 47 ? THR B 52 ? GLY B 47 THR B 52 1 ? 6 HELX_P HELX_P67 AH4 LEU B 53 ? ASP B 55 ? LEU B 53 ASP B 55 5 ? 3 HELX_P HELX_P68 AH5 GLN B 58 ? GLY B 72 ? GLN B 58 GLY B 72 1 ? 15 HELX_P HELX_P69 AH6 SER B 80 ? GLN B 109 ? SER B 80 GLN B 109 1 ? 30 HELX_P HELX_P70 AH7 ASN B 115 ? ASN B 125 ? ASN B 115 ASN B 125 1 ? 11 HELX_P HELX_P71 AH8 ASN B 136 ? ARG B 145 ? ASN B 136 ARG B 145 1 ? 10 HELX_P HELX_P72 AH9 GLU B 156 ? ASN B 160 ? GLU B 156 ASN B 160 5 ? 5 HELX_P HELX_P73 AI1 LYS B 179 ? VAL B 183 ? LYS B 179 VAL B 183 5 ? 5 HELX_P HELX_P74 AI2 LYS B 186 ? ASN B 192 ? LYS B 186 ASN B 192 1 ? 7 HELX_P HELX_P75 AI3 ASN B 192 ? TYR B 197 ? ASN B 192 TYR B 197 1 ? 6 HELX_P HELX_P76 AI4 TYR B 197 ? HIS B 211 ? TYR B 197 HIS B 211 1 ? 15 HELX_P HELX_P77 AI5 ASP B 222 ? LYS B 237 ? ASP B 222 LYS B 237 1 ? 16 HELX_P HELX_P78 AI6 ASP B 238 ? PHE B 240 ? ASP B 238 PHE B 240 5 ? 3 HELX_P HELX_P79 AI7 GLU B 254 ? GLY B 265 ? GLU B 254 GLY B 265 1 ? 12 HELX_P HELX_P80 AI8 ASP B 281 ? GLU B 295 ? ASP B 281 GLU B 295 1 ? 15 HELX_P HELX_P81 AI9 GLN B 297 ? ILE B 302 ? GLN B 297 ILE B 302 5 ? 6 HELX_P HELX_P82 AJ1 LYS B 304 ? SER B 317 ? LYS B 304 SER B 317 1 ? 14 HELX_P HELX_P83 AJ2 PRO B 318 ? LEU B 322 ? PRO B 318 LEU B 322 5 ? 5 HELX_P HELX_P84 AJ3 ARG B 326 ? ILE B 328 ? ARG B 326 ILE B 328 5 ? 3 HELX_P HELX_P85 AJ4 ASP B 329 ? PHE B 334 ? 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