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M GLU 251 OE2 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8YIX _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8YIX _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8YIX _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8YIX _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.012 ? 29866 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.905 ? 40387 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 19.024 ? 4130 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.057 ? 4559 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 5191 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8YIX _struct.title 'Cryo-EM structure of human proteasome assembly intermediate half-proteasome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8YIX _struct_keywords.text 'Protein degradation, Proteasome, 20S proteasome, Assembly, Assembly chapreone, STRUCTURAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? 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8 ;MAAVSVYAPPVGGFSFDNCRRNAVLEADFAKRGYKLPKVRKTGTTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFI SPNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHG STDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKNLVSEAIAAGIFNDLGSGSNIDLCVISKNKLDFLRPYTVPNKKGT RLGRYRCEKGTTAVLTEKITPLEIEVLEETVQTMDTS ; 1 9 UNP PSB3_HUMAN P49720 ? 9 ;MSIMSYNGGAVMAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGR QIKPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCAEQMYGMCESLWEPNMDP DHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD ; 1 10 UNP PSB2_HUMAN P49721 ? 10 ;MEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASNIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAA ANFTRRNLADCLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISRERAVELL RKCLEELQKRFILNLPTFSVRIIDKNGIHDLDNISFPKQGS ; 1 11 UNP PSB5_HUMAN P28074 ? 11 ;MALASVLERPLPVNQRGFFGLGGRADLLDLGPGSLSDGLSLAAPGWGVPEEPGIEMLHGTTTLAFKFRHGVIVAADSRAT AGAYIASQTVKKVIEINPYLLGTMAGGAADCSFWERLLARQCRIYELRNKERISVAAASKLLANMVYQYKGMGLSMGTMI CGWDKRGPGLYYVDSEGNRISGATFSVGSGSVYAYGVMDRGYSYDLEVEQAYDLARRAIYQATYRDAYSGGAVNLYHVRE DGWIRVSSDNVADLHEKYSGSTP ; 1 12 UNP PSB1_HUMAN P20618 ? 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THR L 112 ARG L 127 1 ? 16 HELX_P HELX_P72 AH9 SER L 168 ? PHE L 183 ? SER L 168 PHE L 183 1 ? 16 HELX_P HELX_P73 AI1 SER L 195 ? ALA L 210 ? SER L 195 ALA L 210 1 ? 16 HELX_P HELX_P74 AI2 ALA L 211 ? ARG L 213 ? ALA L 211 ARG L 213 5 ? 3 HELX_P HELX_P75 AI3 ASP M 101 ? GLY M 123 ? ASP M 101 GLY M 123 1 ? 23 HELX_P HELX_P76 AI4 SER M 129 ? LYS M 147 ? SER M 129 LYS M 147 1 ? 19 HELX_P HELX_P77 AI5 GLY M 187 ? GLN M 202 ? GLY M 187 GLN M 202 1 ? 16 HELX_P HELX_P78 AI6 SER M 206 ? ASP M 225 ? SER M 206 ASP M 225 1 ? 20 HELX_P HELX_P79 AI7 SER N 82 ? ASN N 105 ? SER N 82 ASN N 105 1 ? 24 HELX_P HELX_P80 AI8 LEU N 109 ? TYR N 124 ? LEU N 109 TYR N 124 1 ? 16 HELX_P HELX_P81 AI9 TYR N 168 ? THR N 176 ? TYR N 168 THR N 176 1 ? 9 HELX_P HELX_P82 AJ1 THR N 182 ? ARG N 200 ? THR N 182 ARG N 200 1 ? 19 HELX_P HELX_P83 AJ2 GLY O 17 ? GLU O 21 ? GLY f 17 GLU f 21 5 ? 5 HELX_P HELX_P84 AJ3 THR O 31 ? ARG O 45 ? THR f 31 ARG f 45 1 ? 15 HELX_P HELX_P85 AJ4 SER O 61 ? TYR O 66 ? 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None 'Disulfide bridge' # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id SER _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 186 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id O _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id SER _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 186 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id f _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 187 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 O _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 187 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 f _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -6.96 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 5 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 5 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 5 ? 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