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A . n # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero D 3 NAG 1 B NAG 1 D NAG 616 n D 3 NAG 2 B NAG 2 D NAG 617 n E 3 NAG 1 E NAG 1 D NAG 621 n E 3 NAG 2 E NAG 2 D NAG 622 n F 3 NAG 1 F NAG 1 C NAG 294 n F 3 NAG 2 F NAG 2 C NAG 295 n G 3 NAG 1 G NAG 1 C NAG 298 n G 3 NAG 2 G NAG 2 C NAG 299 n H 3 NAG 1 H NAG 1 C NAG 300 n H 3 NAG 2 H NAG 2 C NAG 301 n I 3 NAG 1 I NAG 1 C NAG 304 n I 3 NAG 2 I NAG 2 C NAG 305 n J 3 NAG 1 J NAG 1 A NAG 595 n J 3 NAG 2 J NAG 2 A NAG 596 n K 4 NAG 1 K NAG 1 A NAG 597 n K 4 NAG 2 K NAG 2 A NAG 598 n K 4 BMA 3 K BMA 3 A BMA 599 n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code L 5 NAG 1 701 614 NAG NAG D . 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.376 ? 13375 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 21.275 ? 3570 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.039 ? 1497 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 1698 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8Z7B _struct.title ;Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S trimer in the early fusion intermediate conformation (E-FIC) (focused refinement of NTD-SD1-RBD-ACE2) ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8Z7B _struct_keywords.text 'Spike-ACE2 complex, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 4 ? L N N 5 ? M N N 5 ? N N N 5 ? O N N 5 ? P N N 5 ? 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_em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id _em_software.name _em_software.version 'PARTICLE SELECTION' ? 1 1 ? ? ? ? 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RECONSTRUCTION ? 13 1 ? ? ? ? # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Ministry of Science and Technology (MoST, China)' China 2021YFC2302500 1 'National Natural Science Foundation of China (NSFC)' China '82394463; 92169112; 82341036' 2 'National Key R&D Program of China' China '2022YFC2604100; 2021YFC2300703; 2023YFC2307800' 3 'Non-profit Central Research Institute Fund of Chinese Academy of Medical Sciences' China 2023-PT310-02 4 'Major Project of Guangzhou National Laboratory' China 'GZNL2023A01008; GZNL2024A01008' 5 'R&D Program of Guangzhou Laboratory' China SRPG22-003 6 'Shanghai Municipal Science and Technology Major Project' China ZD2021CY001 7 # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 3 NAG 1 n 3 NAG 2 n 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n 4 BMA 3 n # _atom_sites.entry_id 8Z7B _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.Cartn_transform_axes ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C N O S # loop_