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_refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # _database_PDB_matrix.entry_id 8ZP4 _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 8ZP4 _struct.title 'Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc1 to 5) with ARS1 DNA bound' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8ZP4 _struct_keywords.text 'origin recognition complex, REPLICATION' _struct_keywords.pdbx_keywords REPLICATION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 8 ? K N N 9 ? L N N 8 ? 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P54784 1 ? 914 ? 1 914 2 2 8ZP4 B 1 ? 620 ? P32833 1 ? 620 ? 1 620 3 3 8ZP4 C 1 ? 616 ? P54790 1 ? 616 ? 1 616 4 4 8ZP4 D 1 ? 529 ? P54791 1 ? 529 ? 1 529 5 5 8ZP4 G 1 ? 77 ? 8ZP4 1 ? 77 ? 1 77 6 6 8ZP4 H 1 ? 77 ? 8ZP4 -4 ? 72 ? -4 72 7 7 8ZP4 E 1 ? 479 ? P50874 1 ? 479 ? 1 479 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 7 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 381 ? 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C N N 566 VAL OXT O N N 567 VAL H H N N 568 VAL H2 H N N 569 VAL HA H N N 570 VAL HB H N N 571 VAL HG11 H N N 572 VAL HG12 H N N 573 VAL HG13 H N N 574 VAL HG21 H N N 575 VAL HG22 H N N 576 VAL HG23 H N N 577 VAL HXT H N N 578 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal AGS PG S1G doub N N 1 AGS PG O2G sing N N 2 AGS PG O3G sing N N 3 AGS PG O3B sing N N 4 AGS PB O1B doub N N 5 AGS PB O2B sing N N 6 AGS PB O3B sing N N 7 AGS PB O3A sing N N 8 AGS PA O1A doub N N 9 AGS PA O2A sing N N 10 AGS PA O3A sing N N 11 AGS PA "O5'" sing N N 12 AGS "O5'" "C5'" sing N N 13 AGS "C5'" "C4'" sing N N 14 AGS "C4'" "O4'" sing N N 15 AGS "C4'" "C3'" sing N N 16 AGS "O4'" "C1'" sing N N 17 AGS "C3'" "O3'" sing N N 18 AGS "C3'" "C2'" sing N N 19 AGS "C2'" "O2'" sing N N 20 AGS "C2'" "C1'" sing N N 21 AGS "C1'" N9 sing N N 22 AGS N9 C8 sing Y N 23 AGS N9 C4 sing Y N 24 AGS C8 N7 doub Y N 25 AGS N7 C5 sing Y N 26 AGS C5 C6 sing Y N 27 AGS C5 C4 doub Y N 28 AGS C6 N6 sing N N 29 AGS C6 N1 doub Y N 30 AGS N1 C2 sing Y N 31 AGS C2 N3 doub Y N 32 AGS N3 C4 sing Y N 33 AGS O2G HOG2 sing N N 34 AGS O3G H21 sing N N 35 AGS O2B HOB2 sing N N 36 AGS O2A HOA2 sing N N 37 AGS "C5'" "H5'1" sing N N 38 AGS "C5'" "H5'2" sing N N 39 AGS "C4'" "H4'" sing N N 40 AGS "C3'" "H3'" sing N N 41 AGS "O3'" "HO3'" sing N N 42 AGS "C2'" "H2'" sing N N 43 AGS "O2'" "HO2'" sing N N 44 AGS "C1'" "H1'" sing N N 45 AGS C8 H8 sing N N 46 AGS N6 HN61 sing N N 47 AGS N6 HN62 sing N N 48 AGS C2 H2 sing N N 49 ALA N CA sing N N 50 ALA N H sing N N 51 ALA N H2 sing N N 52 ALA CA C sing N N 53 ALA CA CB sing N N 54 ALA CA HA sing N N 55 ALA C O doub N N 56 ALA C OXT sing N N 57 ALA CB HB1 sing N N 58 ALA CB HB2 sing N N 59 ALA CB HB3 sing N N 60 ALA OXT HXT sing N N 61 ARG N CA sing N N 62 ARG N H sing N N 63 ARG N H2 sing N N 64 ARG CA C sing N N 65 ARG CA CB 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N N 110 ASP C OXT sing N N 111 ASP CB CG sing N N 112 ASP CB HB2 sing N N 113 ASP CB HB3 sing N N 114 ASP CG OD1 doub N N 115 ASP CG OD2 sing N N 116 ASP OD2 HD2 sing N N 117 ASP OXT HXT sing N N 118 CYS N CA sing N N 119 CYS N H sing N N 120 CYS N H2 sing N N 121 CYS CA C sing N N 122 CYS CA CB sing N N 123 CYS CA HA sing N N 124 CYS C O doub N N 125 CYS C OXT sing N N 126 CYS CB SG sing N N 127 CYS CB HB2 sing N N 128 CYS CB HB3 sing N N 129 CYS SG HG sing N N 130 CYS OXT HXT sing N N 131 DA OP3 P sing N N 132 DA OP3 HOP3 sing N N 133 DA P OP1 doub N N 134 DA P OP2 sing N N 135 DA P "O5'" sing N N 136 DA OP2 HOP2 sing N N 137 DA "O5'" "C5'" sing N N 138 DA "C5'" "C4'" sing N N 139 DA "C5'" "H5'" sing N N 140 DA "C5'" "H5''" sing N N 141 DA "C4'" "O4'" sing N N 142 DA "C4'" "C3'" sing N N 143 DA "C4'" "H4'" sing N N 144 DA "O4'" "C1'" sing N N 145 DA "C3'" "O3'" sing N N 146 DA "C3'" "C2'" sing N N 147 DA "C3'" "H3'" sing N N 148 DA "O3'" "HO3'" sing N N 149 DA "C2'" "C1'" sing N N 150 DA "C2'" "H2'" sing N N 151 DA "C2'" "H2''" sing N N 152 DA "C1'" N9 sing N N 153 DA "C1'" "H1'" sing N N 154 DA N9 C8 sing Y N 155 DA N9 C4 sing Y N 156 DA C8 N7 doub Y N 157 DA C8 H8 sing N N 158 DA N7 C5 sing Y N 159 DA C5 C6 sing Y N 160 DA C5 C4 doub Y N 161 DA C6 N6 sing N N 162 DA C6 N1 doub Y N 163 DA N6 H61 sing N N 164 DA N6 H62 sing N N 165 DA N1 C2 sing Y N 166 DA C2 N3 doub Y N 167 DA C2 H2 sing N N 168 DA N3 C4 sing Y N 169 DC OP3 P sing N N 170 DC OP3 HOP3 sing N N 171 DC P OP1 doub N N 172 DC P OP2 sing N N 173 DC P "O5'" sing N N 174 DC OP2 HOP2 sing N N 175 DC "O5'" "C5'" sing N N 176 DC "C5'" "C4'" sing N N 177 DC "C5'" "H5'" sing N N 178 DC "C5'" "H5''" sing N N 179 DC "C4'" "O4'" sing N N 180 DC "C4'" "C3'" sing N N 181 DC "C4'" "H4'" sing N N 182 DC "O4'" "C1'" sing N N 183 DC "C3'" "O3'" sing N N 184 DC "C3'" "C2'" sing N N 185 DC "C3'" "H3'" sing N N 186 DC "O3'" "HO3'" sing N N 187 DC "C2'" "C1'" sing N N 188 DC "C2'" "H2'" sing N N 189 DC "C2'" "H2''" sing N N 190 DC "C1'" N1 sing N N 191 DC "C1'" "H1'" sing N N 192 DC N1 C2 sing N N 193 DC N1 C6 sing N N 194 DC C2 O2 doub N N 195 DC C2 N3 sing N N 196 DC N3 C4 doub N N 197 DC C4 N4 sing N N 198 DC C4 C5 sing N N 199 DC N4 H41 sing N N 200 DC N4 H42 sing N N 201 DC C5 C6 doub N N 202 DC C5 H5 sing N N 203 DC C6 H6 sing N N 204 DG OP3 P sing N N 205 DG OP3 HOP3 sing N N 206 DG P OP1 doub N N 207 DG P OP2 sing N N 208 DG P "O5'" sing N N 209 DG OP2 HOP2 sing N N 210 DG "O5'" "C5'" sing N N 211 DG "C5'" "C4'" sing N N 212 DG "C5'" "H5'" sing N N 213 DG "C5'" "H5''" sing N N 214 DG "C4'" "O4'" sing N N 215 DG "C4'" "C3'" sing N N 216 DG "C4'" "H4'" sing N N 217 DG "O4'" "C1'" sing N N 218 DG "C3'" "O3'" sing N N 219 DG "C3'" "C2'" sing N N 220 DG "C3'" "H3'" sing N N 221 DG "O3'" "HO3'" sing N N 222 DG "C2'" "C1'" sing N N 223 DG "C2'" "H2'" sing N N 224 DG "C2'" "H2''" sing N N 225 DG "C1'" N9 sing N N 226 DG "C1'" "H1'" sing N N 227 DG N9 C8 sing Y N 228 DG N9 C4 sing Y N 229 DG C8 N7 doub Y N 230 DG C8 H8 sing N N 231 DG N7 C5 sing Y N 232 DG C5 C6 sing N N 233 DG C5 C4 doub Y N 234 DG C6 O6 doub N N 235 DG C6 N1 sing N N 236 DG N1 C2 sing N N 237 DG N1 H1 sing N N 238 DG C2 N2 sing N N 239 DG C2 N3 doub N N 240 DG N2 H21 sing N N 241 DG N2 H22 sing N N 242 DG N3 C4 sing N N 243 DT OP3 P sing N N 244 DT OP3 HOP3 sing N N 245 DT P OP1 doub N N 246 DT P OP2 sing N N 247 DT P "O5'" sing N N 248 DT OP2 HOP2 sing N N 249 DT "O5'" "C5'" sing N N 250 DT "C5'" "C4'" sing N N 251 DT "C5'" "H5'" sing N N 252 DT "C5'" "H5''" sing N N 253 DT "C4'" "O4'" sing N N 254 DT "C4'" "C3'" sing N N 255 DT "C4'" "H4'" sing N N 256 DT "O4'" "C1'" sing N N 257 DT "C3'" "O3'" sing N N 258 DT "C3'" "C2'" sing N N 259 DT "C3'" "H3'" sing N N 260 DT "O3'" "HO3'" sing N N 261 DT "C2'" "C1'" sing N N 262 DT "C2'" "H2'" sing N N 263 DT "C2'" "H2''" sing N N 264 DT "C1'" N1 sing N N 265 DT "C1'" "H1'" sing N N 266 DT N1 C2 sing N N 267 DT N1 C6 sing N N 268 DT C2 O2 doub N N 269 DT C2 N3 sing N N 270 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