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_refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0016 ? 3924 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.3614 ? 5472 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0377 ? 720 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0025 ? 717 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.7528 ? 872 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 8AB0 _struct.title 'Complex of RecO-RecR-DNA from Thermus thermophilus.' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8AB0 _struct_keywords.text 'DNA binding protein, DNA Repair pathway, RecFOR pathway, Thermus thermophilus' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 5 ? I N N 5 ? J N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP RECR_THET8 Q5SHY0 ? 1 ;MRYPESLLKLTRALSRLPGIGPKTAQRLALHLAFHKEEAEALAEALEGIKRVRACRECGNLAEGELCPICQDEDRDRSLL AVVESVADLYALERSGEFRGLYHVLGGALNPLEGIGPKELNLEGLFRRLEGVEEVVLATSMTVEGEATALYLAEELKKRG VRVTRPAYGLPVGGSLEYADEVTLGRALEGRRPV ; 1 2 UNP Q5SKM0_THET8 Q5SKM0 ? 2 ;MAPAYTGKVERYRLEEGIVVGRKPLPQGDLLLRLVTPRGSLEAVVRKGQRPTGRTGRLSLFHHVRFQLYAKGEGLPTLTQ AELLGRLHGLEAPRRFLLAAFLAELAYRLASPEAAPRIYPLLVSGLRGIAKHEDPLLPLVWAGWRVAKAGGIGPNLEGEG LRLKRGRLGEEGVYLGREGVEALKATLRLPGAQALPHLEGAPLNRLFLALKAHAEEALGPLRSAEAIGV ; 1 3 PDB 8AB0 8AB0 ? 3 ? 1 4 PDB 8AB0 8AB0 ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8AB0 C 2 ? 195 ? Q5SHY0 1 ? 194 ? 1 194 2 1 8AB0 D 2 ? 195 ? Q5SHY0 1 ? 194 ? 1 194 3 1 8AB0 E 2 ? 195 ? Q5SHY0 1 ? 194 ? 1 194 4 1 8AB0 F 2 ? 195 ? Q5SHY0 1 ? 194 ? 1 194 5 2 8AB0 G 2 ? 230 ? Q5SKM0 1 ? 229 ? 1 229 6 3 8AB0 X 1 ? 25 ? 8AB0 1 ? 25 ? 1 25 7 4 8AB0 Y 1 ? 40 ? 8AB0 1 ? 40 ? 1 40 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8AB0 SER C 1 ? UNP Q5SHY0 ? ? 'expression tag' 0 1 2 8AB0 SER D 1 ? UNP Q5SHY0 ? ? 'expression tag' 0 2 3 8AB0 SER E 1 ? UNP Q5SHY0 ? ? 'expression tag' 0 3 4 8AB0 SER F 1 ? UNP Q5SHY0 ? ? 'expression tag' 0 4 5 8AB0 SER G 1 ? UNP Q5SKM0 ? ? 'expression tag' 0 5 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 7 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support cross-linking _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details GraFix # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PRO A 5 ? ARG A 17 ? PRO C 4 ARG C 16 1 ? 13 HELX_P HELX_P2 AA2 PRO A 23 ? HIS A 36 ? PRO C 22 HIS C 35 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 AA3 HIS A 36 ? GLY A 49 ? HIS C 35 GLY C 48 1 ? 14 HELX_P HELX_P4 AA4 GLU B 6 ? LEU B 18 ? GLU D 5 LEU D 17 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY B 22 ? PHE B 35 ? GLY D 21 PHE D 34 1 ? 14 HELX_P HELX_P6 AA6 HIS B 36 ? GLU B 48 ? HIS D 35 GLU D 47 1 ? 13 HELX_P HELX_P7 AA7 SER B 86 ? GLY B 97 ? SER D 85 GLY D 96 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU B 126 ? LEU B 130 ? LEU D 125 LEU D 129 5 ? 5 HELX_P HELX_P9 AA9 THR B 143 ? ALA B 154 ? THR D 142 ALA D 153 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 SER B 176 ? ALA B 180 ? SER D 175 ALA D 179 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 ASP B 181 ? GLY B 191 ? ASP D 180 GLY D 190 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 LEU C 11 ? LEU C 18 ? LEU E 10 LEU E 17 1 ? 8 HELX_P HELX_P13 AB4 LYS C 24 ? HIS C 36 ? LYS E 23 HIS E 35 1 ? 13 HELX_P HELX_P14 AB5 HIS C 36 ? LYS C 51 ? HIS E 35 LYS E 50 1 ? 16 HELX_P HELX_P15 AB6 SER C 86 ? GLY C 97 ? SER E 85 GLY E 96 1 ? 12 HELX_P HELX_P16 AB7 ASN C 111 ? GLY C 115 ? ASN E 110 GLY E 114 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 AB8 ASN C 122 ? ARG C 128 ? ASN E 121 ARG E 127 1 ? 7 HELX_P HELX_P18 AB9 THR C 143 ? ARG C 160 ? THR E 142 ARG E 159 1 ? 18 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP C 181 ? GLY C 191 ? ASP E 180 GLY E 190 1 ? 11 HELX_P HELX_P20 AC2 GLU D 6 ? LEU D 18 ? GLU F 5 LEU F 17 1 ? 13 HELX_P HELX_P21 AC3 GLY D 22 ? HIS D 36 ? GLY F 21 HIS F 35 1 ? 15 HELX_P HELX_P22 AC4 LYS D 37 ? GLU D 48 ? LYS F 36 GLU F 47 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 SER D 86 ? GLY D 97 ? SER F 85 GLY F 96 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 AC6 GLY D 117 ? LEU D 121 ? GLY F 116 LEU F 120 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 LEU D 123 ? LEU D 130 ? LEU F 122 LEU F 129 1 ? 8 HELX_P HELX_P26 AC8 THR D 143 ? LYS D 159 ? THR F 142 LYS F 158 1 ? 17 HELX_P HELX_P27 AC9 LEU E 88 ? GLU E 92 ? LEU G 87 GLU G 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA E 93 ? LEU E 110 ? ALA G 92 LEU G 109 1 ? 18 HELX_P HELX_P29 AD2 ALA E 115 ? HIS E 133 ? ALA G 114 HIS G 132 1 ? 19 HELX_P HELX_P30 AD3 PRO E 136 ? GLY E 151 ? PRO G 135 GLY G 150 1 ? 16 HELX_P HELX_P31 AD4 LEU E 176 ? LEU E 190 ? LEU G 175 LEU G 189 1 ? 15 HELX_P HELX_P32 AD5 PRO E 191 ? GLU E 200 ? PRO G 190 GLU G 199 1 ? 10 HELX_P HELX_P33 AD6 LEU E 207 ? GLY E 220 ? LEU G 206 GLY G 219 1 ? 14 HELX_P HELX_P34 AD7 LEU E 222 ? ALA E 227 ? LEU G 221 ALA G 226 5 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? B CYS 56 SG ? ? ? 1_555 H ZN . ZN ? ? D CYS 55 D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? ? metalc2 metalc ? ? B CYS 59 SG ? ? ? 1_555 H ZN . ZN ? ? D CYS 58 D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? ? metalc3 metalc ? ? B CYS 68 SG ? ? ? 1_555 H ZN . ZN ? ? D CYS 67 D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.340 ? ? metalc4 metalc ? ? B CYS 71 SG ? ? ? 1_555 H ZN . ZN ? ? D CYS 70 D ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.340 ? ? metalc5 metalc ? ? C CYS 56 SG ? ? ? 1_555 I ZN . ZN ? ? E CYS 55 E ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.340 ? ? metalc6 metalc ? ? C CYS 59 SG ? ? ? 1_555 I ZN . ZN ? ? E CYS 58 E ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? ? metalc7 metalc ? ? C CYS 68 SG ? ? ? 1_555 I ZN . ZN ? ? E CYS 67 E ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.340 ? ? metalc8 metalc ? ? C CYS 71 SG ? ? ? 1_555 I ZN . ZN ? ? E CYS 70 E ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.340 ? ? metalc9 metalc ? ? D CYS 56 SG ? ? ? 1_555 J ZN . ZN ? ? F CYS 55 F ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.340 ? ? metalc10 metalc ? ? D CYS 59 SG ? ? ? 1_555 J ZN . ZN ? ? F CYS 58 F ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.340 ? ? metalc11 metalc ? ? D CYS 68 SG ? ? ? 1_555 J ZN . ZN ? ? F CYS 67 F ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.340 ? ? metalc12 metalc ? ? D CYS 71 SG ? ? ? 1_555 J ZN . ZN ? ? F CYS 70 F ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.340 ? ? hydrog1 hydrog ? ? F DG 1 N1 ? ? ? 1_555 G DC 25 N3 ? ? X DG 1 Y DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? F DG 1 N2 ? ? ? 1_555 G DC 25 O2 ? ? X DG 1 Y DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? F DG 1 O6 ? ? ? 1_555 G DC 25 N4 ? ? X DG 1 Y DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? F DG 2 N1 ? ? ? 1_555 G DC 24 N3 ? ? X DG 2 Y DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? F DG 2 N2 ? ? ? 1_555 G DC 24 O2 ? ? X DG 2 Y DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? F DG 2 O6 ? ? ? 1_555 G DC 24 N4 ? ? X DG 2 Y DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? F DC 3 N3 ? ? ? 1_555 G DG 23 N1 ? ? X DC 3 Y DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? 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