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B CYS 103 SG ? ? ? 1_555 B CYS 119 SG ? ? C CYS 103 C CYS 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf11 disulf ? ? B CYS 128 SG ? ? ? 1_555 B CYS 165 SG ? ? C CYS 128 C CYS 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf12 disulf ? ? B CYS 337 SG ? ? ? 1_555 B CYS 353 SG ? ? C CYS 337 C CYS 353 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf13 disulf ? ? B CYS 433 SG ? ? ? 1_555 B CYS 560 SG ? ? C CYS 433 C CYS 560 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf14 disulf ? ? B CYS 455 SG ? ? ? 1_555 B CYS 505 SG ? ? C CYS 455 C CYS 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf15 disulf ? ? B CYS 457 SG ? ? ? 1_555 B CYS 473 SG ? ? C CYS 457 C CYS 473 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf16 disulf ? ? B CYS 460 SG ? ? ? 1_555 B CYS 475 SG ? ? C CYS 460 C CYS 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf17 disulf ? ? B CYS 477 SG ? ? ? 1_555 B CYS 486 SG ? ? C CYS 477 C CYS 486 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf18 disulf ? ? B CYS 512 SG ? ? ? 1_555 B CYS 545 SG ? ? C CYS 512 C CYS 545 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? disulf19 disulf ? ? B CYS 523 SG ? ? ? 1_555 B CYS 535 SG ? ? C CYS 523 C CYS 535 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf20 disulf ? ? B CYS 571 SG ? ? ? 1_555 B CYS 613 SG ? ? C CYS 571 C CYS 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf21 disulf ? ? B CYS 599 SG ? ? ? 1_555 B CYS 626 SG ? ? C CYS 599 C CYS 626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf22 disulf ? ? C CYS 65 SG ? ? ? 1_555 C CYS 100 SG ? ? D CYS 11 D CYS 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf23 disulf ? ? C CYS 76 SG ? ? ? 1_555 C CYS 110 SG ? ? D CYS 22 D CYS 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf24 disulf ? ? C CYS 79 SG ? ? ? 1_555 C CYS 116 SG ? ? D CYS 25 D CYS 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf25 disulf ? ? C CYS 122 SG ? ? ? 1_555 C CYS 133 SG ? ? D CYS 68 D CYS 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf26 disulf ? ? C CYS 127 SG ? ? ? 1_555 C CYS 146 SG ? ? D CYS 73 D CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf27 disulf ? ? C CYS 140 SG ? ? ? 1_555 C CYS 155 SG ? ? D CYS 86 D CYS 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf28 disulf ? ? C CYS 162 SG ? ? ? 1_555 C CYS 200 SG ? ? D CYS 108 D CYS 146 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf29 disulf ? ? C CYS 378 SG ? ? ? 1_555 C CYS 403 SG ? ? D CYS 324 D CYS 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf30 disulf ? ? C CYS 503 SG ? ? ? 1_555 C CYS 550 SG ? ? D CYS 449 D CYS 496 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf31 disulf ? ? C CYS 505 SG ? ? ? 1_555 C CYS 521 SG ? ? D CYS 451 D CYS 467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf32 disulf ? ? C CYS 508 SG ? ? ? 1_555 C CYS 523 SG ? ? D CYS 454 D CYS 469 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf33 disulf ? ? C CYS 525 SG ? ? ? 1_555 C CYS 534 SG ? ? D CYS 471 D CYS 480 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf34 disulf ? ? C CYS 557 SG ? ? ? 1_555 C CYS 590 SG ? ? D CYS 503 D CYS 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf35 disulf ? ? D CYS 39 SG ? ? ? 1_555 D CYS 74 SG ? ? E CYS 9 E CYS 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf36 disulf ? ? D CYS 50 SG ? ? ? 1_555 D CYS 84 SG ? ? 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E CYS 469 E CYS 485 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf46 disulf ? ? D CYS 502 SG ? ? ? 1_555 D CYS 517 SG ? ? E CYS 472 E CYS 487 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf47 disulf ? ? D CYS 519 SG ? ? ? 1_555 D CYS 528 SG ? ? E CYS 489 E CYS 498 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf48 disulf ? ? D CYS 551 SG ? ? ? 1_555 D CYS 584 SG ? ? E CYS 521 E CYS 554 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf49 disulf ? ? D CYS 562 SG ? ? ? 1_555 D CYS 574 SG ? ? E CYS 532 E CYS 544 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf50 disulf ? ? E CYS 96 SG ? ? ? 1_555 E CYS 188 SG ? ? F CYS 76 F CYS 168 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf51 disulf ? ? F CYS 43 SG ? ? ? 1_555 F CYS 78 SG ? ? H CYS 22 H CYS 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf52 disulf ? ? F CYS 54 SG ? ? ? 1_555 F CYS 88 SG ? ? H CYS 33 H CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf53 disulf ? ? F CYS 57 SG ? ? ? 1_555 F CYS 94 SG ? ? H CYS 36 H CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf54 disulf ? ? F CYS 101 SG ? ? ? 1_555 F CYS 112 SG ? ? H CYS 80 H CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf55 disulf ? ? F CYS 107 SG ? ? ? 1_555 F CYS 125 SG ? ? H CYS 86 H CYS 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf56 disulf ? ? F CYS 119 SG ? ? ? 1_555 F CYS 134 SG ? ? H CYS 98 H CYS 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf57 disulf ? ? F CYS 142 SG ? ? ? 1_555 F CYS 181 SG ? ? H CYS 121 H CYS 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf58 disulf ? ? F CYS 510 SG ? ? ? 1_555 F CYS 526 SG ? ? H CYS 489 H CYS 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf59 disulf ? ? F CYS 513 SG ? ? ? 1_555 F CYS 528 SG ? ? H CYS 492 H CYS 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf60 disulf ? ? F CYS 530 SG ? ? ? 1_555 F CYS 539 SG ? ? H CYS 509 H CYS 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf61 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 61 SG ? ? B CYS 22 B CYS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf62 disulf ? ? G CYS 24 SG ? ? ? 1_555 G CYS 65 SG ? ? B CYS 24 B CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf63 disulf ? ? G CYS 35 SG ? ? ? 1_555 G CYS 73 SG ? ? B CYS 35 B CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf64 disulf ? ? G CYS 39 SG ? ? ? 1_555 G CYS 78 SG ? ? B CYS 39 B CYS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf65 disulf ? ? G CYS 82 SG ? ? ? 1_555 G CYS 117 SG ? ? B CYS 82 B CYS 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf66 disulf ? ? G CYS 93 SG ? ? ? 1_555 G CYS 127 SG ? ? B CYS 93 B CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? ? disulf67 disulf ? ? G CYS 96 SG ? ? ? 1_555 G CYS 133 SG ? ? B CYS 96 B CYS 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf68 disulf ? ? G CYS 140 SG ? ? ? 1_555 G CYS 151 SG ? ? B CYS 140 B CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf69 disulf ? ? G CYS 146 SG ? ? ? 1_555 G CYS 164 SG ? ? B CYS 146 B CYS 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf70 disulf ? ? G CYS 158 SG ? ? ? 1_555 G CYS 173 SG ? ? B CYS 158 B CYS 173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf71 disulf ? ? G CYS 180 SG ? ? ? 1_555 G CYS 218 SG ? ? B CYS 180 B CYS 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf72 disulf ? ? G CYS 399 SG ? ? ? 1_555 G CYS 420 SG ? ? B CYS 399 B CYS 420 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf73 disulf ? ? G CYS 499 SG ? ? ? 1_555 G CYS 623 SG ? ? B CYS 499 B CYS 623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf74 disulf ? ? G CYS 521 SG ? ? ? 1_555 G CYS 570 SG ? ? B CYS 521 B CYS 570 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf75 disulf ? ? G CYS 523 SG ? ? ? 1_555 G CYS 539 SG ? ? B CYS 523 B CYS 539 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf76 disulf ? ? G CYS 526 SG ? ? ? 1_555 G CYS 541 SG ? ? B CYS 526 B CYS 541 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf77 disulf ? ? G CYS 543 SG ? ? ? 1_555 G CYS 552 SG ? ? B CYS 543 B CYS 552 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf78 disulf ? ? G CYS 577 SG ? ? ? 1_555 G CYS 611 SG ? ? B CYS 577 B CYS 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf79 disulf ? ? G CYS 589 SG ? ? ? 1_555 G CYS 601 SG ? ? B CYS 589 B CYS 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf80 disulf ? ? G CYS 644 SG ? ? ? 1_555 G CYS 686 SG ? ? B CYS 644 B CYS 686 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf81 disulf ? ? 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H CYS 142 SG ? ? ? 1_555 H CYS 181 SG ? ? J CYS 121 J CYS 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf91 disulf ? ? H CYS 510 SG ? ? ? 1_555 H CYS 526 SG ? ? J CYS 489 J CYS 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf92 disulf ? ? H CYS 513 SG ? ? ? 1_555 H CYS 528 SG ? ? J CYS 492 J CYS 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf93 disulf ? ? H CYS 530 SG ? ? ? 1_555 H CYS 539 SG ? ? J CYS 509 J CYS 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf94 disulf ? ? I CYS 43 SG ? ? ? 1_555 I CYS 78 SG ? ? I CYS 22 I CYS 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf95 disulf ? ? I CYS 54 SG ? ? ? 1_555 I CYS 88 SG ? ? I CYS 33 I CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf96 disulf ? ? I CYS 57 SG ? ? ? 1_555 I CYS 94 SG ? ? I CYS 36 I CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf97 disulf ? ? I CYS 101 SG ? ? ? 1_555 I CYS 112 SG ? ? I CYS 80 I CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf98 disulf ? ? I CYS 107 SG ? ? ? 1_555 I CYS 125 SG ? ? I CYS 86 I CYS 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf99 disulf ? ? I CYS 119 SG ? ? ? 1_555 I CYS 134 SG ? ? I CYS 98 I CYS 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf100 disulf ? ? I CYS 142 SG ? ? ? 1_555 I CYS 181 SG ? ? I CYS 121 I CYS 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf101 disulf ? ? I CYS 510 SG ? ? ? 1_555 I CYS 526 SG ? ? I CYS 489 I CYS 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf102 disulf ? ? I CYS 513 SG ? ? ? 1_555 I CYS 528 SG ? ? I CYS 492 I CYS 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf103 disulf ? ? I CYS 530 SG ? ? ? 1_555 I CYS 539 SG ? ? I CYS 509 I CYS 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf104 disulf ? ? J CYS 4 SG ? ? ? 1_555 J CYS 27 SG ? ? G CYS 3 G CYS 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf105 disulf ? ? J CYS 7 SG ? ? ? 1_555 J CYS 14 SG ? ? G CYS 6 G CYS 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf106 disulf ? ? J CYS 20 SG ? ? ? 1_555 J CYS 40 SG ? ? G CYS 19 G CYS 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf107 disulf ? ? J CYS 46 SG ? ? ? 1_555 J CYS 64 SG ? ? G CYS 45 G CYS 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf108 disulf ? ? J CYS 65 SG ? ? ? 1_555 J CYS 70 SG ? ? G CYS 64 G CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? ? covale1 covale one ? A ASN 911 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 911 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? C ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? D ASN 189 L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? D ASN 437 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? E ASN 407 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? F ASN 415 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? H ASN 394 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? G ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? B ASN 324 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale6 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale7 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? L NAG 1 L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale8 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale9 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale10 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TYR 59 A . ? TYR 59 A PRO 60 A ? PRO 60 A 1 -4.39 2 ASN 525 B . ? ASN 525 C PRO 526 B ? PRO 526 C 1 -5.18 3 GLY 582 C . ? GLY 528 D PRO 583 C ? 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anti-parallel AB4 5 7 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 1 6 ? anti-parallel AC5 3 5 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 4 36 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC5 6 7 ? anti-parallel AC5 6 8 ? anti-parallel AC5 6 9 ? anti-parallel AC5 7 11 ? anti-parallel AC5 8 11 ? anti-parallel AC5 10 12 ? anti-parallel AC5 11 12 ? anti-parallel AC5 12 13 ? anti-parallel AC5 13 14 ? anti-parallel AC5 13 15 ? anti-parallel AC5 14 16 ? anti-parallel AC5 16 17 ? anti-parallel AC5 17 18 ? anti-parallel AC5 18 19 ? anti-parallel AC5 18 20 ? anti-parallel AC5 18 21 ? anti-parallel AC5 19 54 ? anti-parallel AC5 20 25 ? anti-parallel AC5 22 23 ? anti-parallel AC5 22 27 ? anti-parallel AC5 24 26 ? anti-parallel AC5 25 26 ? anti-parallel AC5 26 27 ? anti-parallel AC5 27 28 ? anti-parallel AC5 27 29 ? anti-parallel AC5 28 47 ? anti-parallel AC5 30 31 ? anti-parallel AC5 30 35 ? anti-parallel AC5 32 34 ? anti-parallel AC5 33 34 ? anti-parallel AC5 34 35 ? anti-parallel AC5 35 36 ? anti-parallel AC5 35 37 ? anti-parallel AC5 38 41 ? anti-parallel AC5 39 40 ? anti-parallel AC5 39 50 ? anti-parallel AC5 40 41 ? anti-parallel AC5 41 42 ? anti-parallel AC5 41 43 ? anti-parallel AC5 44 45 ? anti-parallel AC5 44 49 ? anti-parallel AC5 46 48 ? anti-parallel AC5 47 48 ? anti-parallel AC5 48 49 ? anti-parallel AC5 49 50 ? anti-parallel AC5 49 51 ? anti-parallel AC5 52 53 ? anti-parallel AC5 52 54 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF3 4 5 ? anti-parallel AF3 5 6 ? anti-parallel AF3 6 7 ? anti-parallel AF3 7 8 ? anti-parallel AF3 8 9 ? anti-parallel AF3 9 10 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG3 1 2 ? parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG7 1 2 ? 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I LEU 381 1419 1 Y 1 I GLY 361 ? I GLY 382 1420 1 Y 1 I TYR 362 ? I TYR 383 1421 1 Y 1 I HIS 363 ? I HIS 384 1422 1 Y 1 I LEU 364 ? I LEU 385 1423 1 Y 1 I ASP 365 ? I ASP 386 1424 1 Y 1 I VAL 366 ? I VAL 387 1425 1 Y 1 I SER 367 ? I SER 388 1426 1 Y 1 I LEU 368 ? I LEU 389 1427 1 Y 1 I ALA 369 ? I ALA 390 1428 1 Y 1 I PHE 370 ? I PHE 391 1429 1 Y 1 I SER 371 ? I SER 392 1430 1 Y 1 I GLU 372 ? I GLU 393 1431 1 Y 1 I ILE 373 ? I ILE 394 1432 1 Y 1 I SER 374 ? I SER 395 1433 1 Y 1 I VAL 375 ? I VAL 396 1434 1 Y 1 I GLY 376 ? I GLY 397 1435 1 Y 1 I ALA 377 ? I ALA 398 1436 1 Y 1 I GLU 378 ? I GLU 399 1437 1 Y 1 I PHE 379 ? I PHE 400 1438 1 Y 1 I ASN 380 ? I ASN 401 1439 1 Y 1 I LYS 381 ? I LYS 402 1440 1 Y 1 I ASP 382 ? I ASP 403 1441 1 Y 1 I ASP 383 ? I ASP 404 1442 1 Y 1 I CYS 384 ? I CYS 405 1443 1 Y 1 I VAL 385 ? I VAL 406 1444 1 Y 1 I LYS 386 ? I LYS 407 1445 1 Y 1 I ARG 387 ? I ARG 408 1446 1 Y 1 I GLY 388 ? I GLY 409 1447 1 Y 1 I GLU 389 ? I GLU 410 1448 1 Y 1 I GLY 390 ? I GLY 411 1449 1 Y 1 I ARG 391 ? I ARG 412 1450 1 Y 1 I ALA 392 ? I ALA 413 1451 1 Y 1 I VAL 393 ? I VAL 414 1452 1 Y 1 I ASN 394 ? I ASN 415 1453 1 Y 1 I ILE 395 ? I ILE 416 1454 1 Y 1 I THR 396 ? I THR 417 1455 1 Y 1 I SER 397 ? I SER 418 1456 1 Y 1 I LYS 522 ? I LYS 543 1457 1 Y 1 I GLN 523 ? I GLN 544 1458 1 Y 1 I LYS 524 ? I LYS 545 1459 1 Y 1 I ILE 525 ? I ILE 546 1460 1 Y 1 I SER 526 ? I SER 547 1461 1 Y 1 I GLU 527 ? I GLU 548 1462 1 Y 1 I GLY 528 ? I GLY 549 1463 1 Y 1 I LEU 529 ? I LEU 550 1464 1 Y 1 I PRO 530 ? I PRO 551 1465 1 Y 1 I ALA 531 ? I ALA 552 1466 1 Y 1 I LEU 532 ? I LEU 553 1467 1 Y 1 I GLU 533 ? I GLU 554 1468 1 Y 1 I PHE 534 ? I PHE 555 1469 1 Y 1 I PRO 535 ? I PRO 556 1470 1 Y 1 I ASN 536 ? I ASN 557 1471 1 Y 1 I GLU 537 ? I GLU 558 1472 1 Y 1 I LYS 538 ? I LYS 559 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM HEPES '4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic acid' 1 2 120 mM NaCl 'sodium chloride' # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units ? _em_entity_assembly_molwt.value ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location Serum _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50 _em_image_recording.average_exposure_time 2 _em_image_recording.details 'Collected over 4 separate data collections' _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 (6k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 4 _em_image_recording.num_real_images 52838 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ;Dataset 1: 737,138 Dataset 2: 1,058,026 Dataset 3: 1,330,232 Dataset 4: 722,870 ; _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected ? _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'PARTICLE SELECTION' ? cryoSPARC ? 1 ? ? 3 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU ? ? ? 1 4 MASKING ? ? ? ? ? ? 5 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 4.1 1 ? ? 6 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL FITTING' ? ISOLDE ? ? 1 ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.2 ? 1 ? 11 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC 2 1 ? ? 12 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 13 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 14 RECONSTRUCTION ? RELION 3.1 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ;C5b, C6, C7, C8 and C9 purified components were sources from CompTech. Myrisolated CD59 was a gift from R. Smith. Individual components were reacted together empty DOPC nanodiscs then purified by sucrose gradient centrifugation. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'European Research Council (ERC)' 'European Union' 'No. 864751' 1 'Cancer Research UK' 'United Kingdom' C24523/A26234 2 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero K 9 NAG 1 K NAG 1 A NAG 1368 n K 9 NAG 2 K NAG 2 A NAG 1369 n L 9 NAG 1 L NAG 1 D NAG 537 n L 9 NAG 2 L NAG 2 D NAG 538 n M 9 NAG 1 M NAG 1 E NAG 555 n M 9 NAG 2 M NAG 2 E NAG 556 n N 9 NAG 1 N NAG 1 H NAG 522 n N 9 NAG 2 N NAG 2 H NAG 523 n O 9 NAG 1 O NAG 1 B NAG 764 n O 9 NAG 2 O NAG 2 B NAG 765 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # _pdbx_entity_branch.entity_id 9 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 9 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 9 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 9 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.entity_id 9 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.value_order sing _pdbx_entity_branch_link.details ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 9 NAG 1 n 9 NAG 2 n # loop_ _pdbx_initial_refinement_model.id _pdbx_initial_refinement_model.type _pdbx_initial_refinement_model.source_name _pdbx_initial_refinement_model.accession_code 1 'experimental model' PDB 7NYD 2 'experimental model' PDB 2J8B # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #