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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.469 ? 13205 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.271 ? 1385 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.046 ? 1490 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 1620 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8BLB _struct.title 'Human serotonin 5-HT3A receptor in complex with vortioxetine (nanodiscs, ECD, active/distorted conformation)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8BLB _struct_keywords.text 'Human pentameric ligand-gated ion channel, Human serotonin receptor, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 2 ? M N N 2 ? 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LEU E 192 SER E 198 1 ? 7 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 129 SG ? ? ? 1_555 A CYS 143 SG ? ? A CYS 157 A CYS 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 129 SG ? ? ? 1_555 B CYS 143 SG ? ? B CYS 157 B CYS 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 129 SG ? ? ? 1_555 C CYS 143 SG ? ? C CYS 157 C CYS 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf4 disulf ? ? D CYS 129 SG ? ? ? 1_555 D CYS 143 SG ? ? D CYS 157 D CYS 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf5 disulf ? ? E CYS 129 SG ? ? ? 1_555 E CYS 143 SG ? ? E CYS 157 E CYS 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? covale1 covale one ? A ASN 76 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 104 A NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 142 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 170 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 158 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? A ASN 186 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 76 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? B ASN 104 B NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? B ASN 142 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? B ASN 170 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? B ASN 158 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? B ASN 186 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? C ASN 76 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? C ASN 104 C NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? C ASN 142 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? C ASN 170 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? C ASN 158 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? C ASN 186 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? D ASN 76 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? D ASN 104 D NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? D ASN 142 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? D ASN 170 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? D ASN 158 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? D ASN 186 L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? E ASN 76 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? E ASN 104 E NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? E ASN 142 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? E ASN 170 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? E ASN 158 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? E ASN 186 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale16 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale17 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale18 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale19 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale20 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale21 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale22 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? L NAG 1 L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale23 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale24 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale25 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG F . ? 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NAG O 1 ? 1_555 ASN E 170 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 11 NAG P . ? ASN A 76 ? NAG A 501 ? 1_555 ASN A 104 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 12 NAG R . ? ASN B 76 ? NAG B 501 ? 1_555 ASN B 104 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 13 NAG T . ? ASN C 76 ? NAG C 501 ? 1_555 ASN C 104 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 14 NAG V . ? ASN D 76 ? NAG D 501 ? 1_555 ASN D 104 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 15 NAG X . ? ASN E 76 ? NAG E 501 ? 1_555 ASN E 104 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 16 CYS A 129 ? CYS A 143 ? CYS A 157 ? 1_555 CYS A 171 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 17 CYS B 129 ? CYS B 143 ? CYS B 157 ? 1_555 CYS B 171 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 18 CYS C 129 ? CYS C 143 ? CYS C 157 ? 1_555 CYS C 171 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 19 CYS D 129 ? CYS D 143 ? CYS D 157 ? 1_555 CYS D 171 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 20 CYS E 129 ? CYS E 143 ? CYS E 157 ? 1_555 CYS E 171 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 6 ? AA8 ? 6 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 6 ? AB2 ? 6 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 6 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB1 5 6 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 5 6 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LYS A 79 ? 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