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'fadI, yfcY, b2342, JW2339' ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli K-12' 83333 ? ? ? ? ? ? ? ? ;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ; 866768 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 714 ? ? 'fadJ, yfcX, b2341, JW2338' ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli K-12' 83333 ? ? ? ? ? ? ? ? ;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ; 866768 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP FADI_ECOLI P76503 ? 1 ;MGQVLPLVTRQGDRIAIVSGLRTPFARQATAFHGIPAVDLGKMVVGELLARSEIPAEVIEQLVFGQVVQMPEAPNIAREI VLGTGMNVHTDAYSVSRACATSFQAVANVAESLMAGTIRAGIAGGADSSSVLPIGVSKKLARVLVDVNKARTMSQRLKLF SRLRLRDLMPVPPAVAEYSTGLRMGDTAEQMAKTYGITREQQDALAHRSHQRAAQAWSDGKLKEEVMTAFIPPYKQPLVE DNNIRGNSSLADYAKLRPAFDRKHGTVTAANSTPLTDGAAAVILMTESRAKELGLVPLGYLRSYAFTAIDVWQDMLLGPA WSTPLALERAGLTMSDLTLIDMHEAFAAQTLANIQLLGSERFAREALGRAHATGEVDDSKFNVLGGSIAYGHPFAATGAR MITQTLHELRRRGGGFGLVTACAAGGLGAAMVLEAE ; 1 2 UNP FADJ_ECOLI P77399 ? 2 ;MEMTSAFTLNVRLDNIAVITIDVPGEKMNTLKAEFASQVRAIIKQLRENKELRGVVFVSAKPDNFIAGADINMIGNCKTA QEAEALARQGQQLMAEIHALPIQVIAAIHGACLGGGLELALACHGRVCTDDPKTVLGLPEVQLGLLPGSGGTQRLPRLIG VSTALEMILTGKQLRAKQALKLGLVDDVVPHSILLEAAVELAKKERPSSRPLPVRERILAGPLGRALLFKMVGKKTEHKT QGNYPATERILEVVETGLAQGTSSGYDAEARAFGELAMTPQSQALRSIFFASTDVKKDPGSDAPPAPLNSVGILGGGLMG GGIAYVTACKAGIPVRIKDINPQGINHALKYSWDQLEGKVRRRHLKASERDKQLALISGTTDYRGFAHRDLIIEAVFENL ELKQQMVAEVEQNCAAHTIFASNTSSLPIGDIAAHATRPEQVIGLHFFSPVEKMPLVEIIPHAGTSAQTIATTVKLAKKQ GKTPIVVRDKAGFYVNRILAPYINEAIRMLTQGERVEHIDAALVKFGFPVGPIQLLDEVGIDTGTKIIPVLEAAYGERFS APANVVSSILNDDRKGRKNGRGFYLYGQKGRKSKKQVDPAIYPLIGTQGQGRISAPQVAERCVMLMLNEAVRCVDEQVIR SVRDGDIGAVFGIGFPPFLGGPFRYIDSLGAGEVVAIMQRLATQYGSRFTPCERLVEMGARGESFWKTTATDLQ ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8BNR A 15 ? 450 ? P76503 1 ? 436 ? 1 436 2 1 8BNR B 15 ? 450 ? P76503 1 ? 436 ? 1 436 3 2 8BNR C 1 ? 714 ? P77399 1 ? 714 ? 1 714 4 2 8BNR D 1 ? 714 ? P77399 1 ? 714 ? 1 714 5 1 8BNR E 15 ? 450 ? P76503 1 ? 436 ? 1 436 6 1 8BNR F 15 ? 450 ? P76503 1 ? 436 ? 1 436 7 2 8BNR G 1 ? 714 ? P77399 1 ? 714 ? 1 714 8 2 8BNR H 1 ? 714 ? P77399 1 ? 714 ? 1 714 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8BNR MET A 1 ? UNP P76503 ? ? 'initiating methionine' -13 1 1 8BNR GLY A 2 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -12 2 1 8BNR SER A 3 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -11 3 1 8BNR SER A 4 ? UNP P76503 ? ? 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'expression tag' -6 22 2 8BNR HIS B 9 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -5 23 2 8BNR HIS B 10 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -4 24 2 8BNR SER B 11 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -3 25 2 8BNR GLN B 12 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -2 26 2 8BNR ASP B 13 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -1 27 2 8BNR PRO B 14 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' 0 28 5 8BNR MET E 1 ? UNP P76503 ? ? 'initiating methionine' -13 29 5 8BNR GLY E 2 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -12 30 5 8BNR SER E 3 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -11 31 5 8BNR SER E 4 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -10 32 5 8BNR HIS E 5 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -9 33 5 8BNR HIS E 6 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -8 34 5 8BNR HIS E 7 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -7 35 5 8BNR HIS E 8 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -6 36 5 8BNR HIS E 9 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -5 37 5 8BNR HIS E 10 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -4 38 5 8BNR SER E 11 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -3 39 5 8BNR GLN E 12 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -2 40 5 8BNR ASP E 13 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -1 41 5 8BNR PRO E 14 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' 0 42 6 8BNR MET F 1 ? UNP P76503 ? ? 'initiating methionine' -13 43 6 8BNR GLY F 2 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -12 44 6 8BNR SER F 3 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -11 45 6 8BNR SER F 4 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -10 46 6 8BNR HIS F 5 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -9 47 6 8BNR HIS F 6 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -8 48 6 8BNR HIS F 7 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -7 49 6 8BNR HIS F 8 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -6 50 6 8BNR HIS F 9 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -5 51 6 8BNR HIS F 10 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -4 52 6 8BNR SER F 11 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -3 53 6 8BNR GLN F 12 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -2 54 6 8BNR ASP F 13 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' -1 55 6 8BNR PRO F 14 ? UNP P76503 ? ? 'expression tag' 0 56 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8BNR _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8BNR _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 34378 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.587 ? 46666 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.875 ? 4922 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.042 ? 5470 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 6120 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8BNR _struct.title 'Escherichia coli anaerobic fatty acid beta oxidation trifunctional enzyme (anEcTFE) octameric complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8BNR _struct_keywords.text 'complex, heterooctamer, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 2 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PRO A 50 ? ALA A 64 ? PRO A 36 ALA A 50 1 ? 15 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 89 ? THR A 98 ? ASN A 75 THR A 84 1 ? 10 HELX_P HELX_P3 AA3 ALA A 114 ? GLY A 130 ? ALA A 100 GLY A 116 1 ? 17 HELX_P HELX_P4 AA4 LYS A 152 ? ALA A 164 ? LYS A 138 ALA A 150 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 THR A 166 ? SER A 175 ? THR A 152 SER A 161 1 ? 10 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY A 199 ? GLY A 210 ? 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