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'Escherichia coli' 562 ? ? Can20-12E ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 25 1 sample 1 65 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? Can20-12E ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 26 1 sample 1 136 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? Can20-12E ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 27 1 sample 1 2904 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? Can20-12E ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 28 1 sample 1 119 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? Can20-12E ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP RL2_ECOLI P60422 ? 1 ;MAVVKCKPTSPGRRHVVKVVNPELHKGKPFAPLLEKNSKSGGRNNNGRITTRHIGGGHKQAYRIVDFKRNKDGIPAVVER LEYDPNRSANIALVLYKDGERRYILAPKGLKAGDQIQSGVDAAIKPGNTLPMRNIPVGSTVHNVEMKPGKGGQLARSAGT YVQIVARDGAYVTLRLRSGEMRKVEADCRATLGEVGNAEHMLRVLGKAGAARWRGVRPTVRGTAMNPVDHPHGGGEGRNF GKHPVTPWGVQTKGKKTRSNKRTDKFIVRRRSK ; 1 2 UNP RL3_ECOLI P60438 ? 2 ;MIGLVGKKVGMTRIFTEDGVSIPVTVIEVEANRVTQVKDLANDGYRAIQVTTGAKKANRVTKPEAGHFAKAGVEAGRGLW EFRLAEGEEFTVGQSISVELFADVKKVDVTGTSKGKGFAGTVKRWNFRTQDATHGNSLSHRVPGSIGQNQTPGKVFKGKK MAGQMGNERVTVQSLDVVRVDAERNLLLVKGAVPGATGSDLIVKPAVKA ; 1 3 UNP RL4_ECOLI P60723 ? 3 ;MELVLKDAQSALTVSETTFGRDFNEALVHQVVVAYAAGARQGTRAQKTRAEVTGSGKKPWRQKGTGRARSGSIKSPIWRS GGVTFAARPQDHSQKVNKKMYRGALKSILSELVRQDRLIVVEKFSVEAPKTKLLAQKLKDMALEDVLIITGELDENLFLA ARNLHKVDVRDATGIDPVSLIAFDKVVMTADAVKQVEEMLA ; 1 4 UNP RL5_ECOLI P62399 ? 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'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8C8X _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8C8X _struct.title 'Cryo-EM captures early ribosome assembly in action' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8C8X _struct_keywords.text 'ribosome, ribosome assembly, ribosome biogenesis, total reconstitution, RNA, ribosomal protein.' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? 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'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog265 hydrog ? ? AA C 192 O2 ? ? ? 1_555 AA A 800 N6 ? ? A C 192 A A 800 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-A MISPAIR' ? ? ? hydrog266 hydrog ? ? AA G 194 N1 ? ? ? 1_555 AA C 201 N3 ? ? A G 194 A C 201 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog267 hydrog ? ? AA G 194 N2 ? ? ? 1_555 AA C 201 O2 ? ? A G 194 A C 201 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog268 hydrog ? ? AA G 194 O6 ? ? ? 1_555 AA C 201 N4 ? ? A G 194 A C 201 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog269 hydrog ? ? AA G 194 N2 ? ? ? 1_555 AA A 251 N3 ? ? A G 194 A A 251 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog270 hydrog ? ? AA A 195 N3 ? ? ? 1_555 AA G 250 N2 ? ? A A 195 A G 250 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog271 hydrog ? ? AA A 196 N1 ? ? ? 1_555 AA G 831 N2 ? ? A A 196 A G 831 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_10_PAIR ? ? ? hydrog272 hydrog ? ? AA A 196 N6 ? ? ? 1_555 AA G 831 N3 ? ? A A 196 A G 831 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_10_PAIR ? ? ? hydrog273 hydrog ? ? AA C 198 N3 ? ? ? 1_555 AA G 248 N1 ? ? A C 198 A G 248 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog274 hydrog ? ? AA C 198 N4 ? ? ? 1_555 AA G 248 O6 ? ? A C 198 A G 248 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog275 hydrog ? ? AA C 198 O2 ? ? ? 1_555 AA G 248 N2 ? ? A C 198 A G 248 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog276 hydrog ? ? AA U 200 N3 ? ? ? 1_555 AA G 250 O6 ? ? A U 200 A G 250 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_27_PAIR ? ? ? hydrog277 hydrog ? ? AA U 200 O4 ? ? ? 1_555 AA G 250 N1 ? ? A U 200 A G 250 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_27_PAIR ? ? ? hydrog278 hydrog ? ? AA G 215 N2 ? ? ? 1_555 AA A 432 N1 ? ? A G 215 A A 432 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog279 hydrog ? ? AA G 215 N2 ? ? ? 1_555 AA C 433 O2 ? ? A G 215 A C 433 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? ? hydrog280 hydrog ? ? AA A 216 N6 ? ? ? 1_555 AA U 431 O2 ? ? A A 216 A U 431 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog281 hydrog ? ? AA A 216 N7 ? ? ? 1_555 AA U 431 N3 ? ? A A 216 A U 431 1_555 ? ? ? ? ? ? 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AA C 239 N4 ? ? ? 1_555 AA G 259 O6 ? ? A C 239 A G 259 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog317 hydrog ? ? AA C 239 O2 ? ? ? 1_555 AA G 259 N2 ? ? A C 239 A G 259 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog318 hydrog ? ? AA C 240 O2 ? ? ? 1_555 AA C 257 N4 ? ? A C 240 A C 257 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-C MISPAIR' ? ? ? hydrog319 hydrog ? ? AA C 240 O2 ? ? ? 1_555 AA G 258 N1 ? ? A C 240 A G 258 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-G PAIR' ? ? ? hydrog320 hydrog ? ? AA A 241 N6 ? ? ? 1_555 AA A 256 N7 ? ? A A 241 A A 256 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_2_PAIR ? ? ? hydrog321 hydrog ? ? AA A 241 N7 ? ? ? 1_555 AA A 256 N6 ? ? A A 241 A A 256 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_2_PAIR ? ? ? hydrog322 hydrog ? ? AA U 243 N3 ? ? ? 1_555 AA A 255 N7 ? ? A U 243 A A 255 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog323 hydrog ? ? AA A 244 N6 ? ? ? 1_555 AA G 254 N3 ? ? A A 244 A G 254 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog324 hydrog ? ? AA A 244 N7 ? ? ? 1_555 AA G 254 N2 ? ? A A 244 A G 254 1_555 ? ? ? ? ? ? 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E GLU 55 74 1 Y 1 H ALA 56 ? E ALA 56 75 1 Y 1 H LYS 57 ? E LYS 57 76 1 Y 1 H LEU 58 ? E LEU 58 77 1 Y 1 H ALA 59 ? E ALA 59 78 1 Y 1 H GLU 60 ? E GLU 60 79 1 Y 1 H VAL 61 ? E VAL 61 80 1 Y 1 H LEU 62 ? E LEU 62 81 1 Y 1 H ALA 63 ? E ALA 63 82 1 Y 1 H ALA 64 ? E ALA 64 83 1 Y 1 H ALA 65 ? E ALA 65 84 1 Y 1 H ASN 66 ? E ASN 66 85 1 Y 1 H ALA 67 ? E ALA 67 86 1 Y 1 H ARG 68 ? E ARG 68 87 1 Y 1 H ALA 69 ? E ALA 69 88 1 Y 1 H GLU 70 ? E GLU 70 89 1 Y 1 H LYS 71 ? E LYS 71 90 1 Y 1 H ILE 72 ? E ILE 72 91 1 Y 1 H ASN 73 ? E ASN 73 92 1 Y 1 H ALA 74 ? E ALA 74 93 1 Y 1 H LEU 75 ? E LEU 75 94 1 Y 1 H GLU 76 ? E GLU 76 95 1 Y 1 H THR 77 ? E THR 77 96 1 Y 1 H VAL 78 ? E VAL 78 97 1 Y 1 H THR 79 ? E THR 79 98 1 Y 1 H ILE 80 ? E ILE 80 99 1 Y 1 H ALA 81 ? E ALA 81 100 1 Y 1 H SER 82 ? E SER 82 101 1 Y 1 H LYS 83 ? E LYS 83 102 1 Y 1 H ALA 84 ? E ALA 84 103 1 Y 1 H GLY 85 ? E GLY 85 104 1 Y 1 H ASP 86 ? E ASP 86 105 1 Y 1 H GLU 87 ? E GLU 87 106 1 Y 1 H GLY 88 ? E GLY 88 107 1 Y 1 H LYS 89 ? 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