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F N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 8D8Q 8D8Q ? 1 ? 1 2 PDB 8D8Q 8D8Q ? 2 ? 1 3 UNP SPIKE_SARS2 P0DTC2 ? 3 ;VNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFAST EKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPF LMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSS SGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNL CPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQT GKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSY GFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDA VRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEH VNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTS VDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKR SFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQ IPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISS VLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQS APHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNN TVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINAS ; 16 4 PDB 8D8Q 8D8Q ? 4 ? 1 5 PDB 8D8Q 8D8Q ? 5 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8D8Q H 1 ? 234 ? 8D8Q 1 ? 228 ? 1 228 2 2 8D8Q L 1 ? 219 ? 8D8Q 1 ? 214 ? 1 214 3 3 8D8Q A 1 ? 1160 ? P0DTC2 16 ? 1175 ? 16 1175 4 4 8D8Q B 1 ? 216 ? 8D8Q 1 ? 214 ? 1 214 5 5 8D8Q C 1 ? 226 ? 8D8Q 1 ? 222 ? 1 222 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 3 8D8Q GLY A 1161 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1176 1 3 8D8Q TYR A 1162 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1177 2 3 8D8Q ILE A 1163 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1178 3 3 8D8Q PRO A 1164 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1179 4 3 8D8Q GLU A 1165 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1180 5 3 8D8Q ALA A 1166 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1181 6 3 8D8Q PRO A 1167 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1182 7 3 8D8Q ARG A 1168 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1183 8 3 8D8Q ASP A 1169 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1184 9 3 8D8Q GLY A 1170 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1185 10 3 8D8Q GLN A 1171 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1186 11 3 8D8Q ALA A 1172 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1187 12 3 8D8Q TYR A 1173 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1188 13 3 8D8Q VAL A 1174 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1189 14 3 8D8Q ARG A 1175 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1190 15 3 8D8Q LYS A 1176 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1191 16 3 8D8Q ASP A 1177 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1192 17 3 8D8Q GLY A 1178 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1193 18 3 8D8Q GLU A 1179 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1194 19 3 8D8Q TRP A 1180 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1195 20 3 8D8Q VAL A 1181 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1196 21 3 8D8Q LEU A 1182 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1197 22 3 8D8Q LEU A 1183 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1198 23 3 8D8Q SER A 1184 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1199 24 3 8D8Q THR A 1185 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1200 25 3 8D8Q PHE A 1186 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1201 26 3 8D8Q LEU A 1187 ? UNP P0DTC2 ? ? 'expression tag' 1202 27 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 64 ? LYS A 67 ? ALA H 61 LYS H 64 5 ? 4 HELX_P HELX_P2 AA2 LYS A 89 ? THR A 93 ? LYS H 83 THR H 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 SER B 32 B LYS B 36 F SER L 30 LYS L 30 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 GLN B 85 ? VAL B 89 ? GLN L 79 VAL L 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 PHE C 323 ? ASN C 328 ? PHE A 338 ASN A 343 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 SER C 334 ? TRP C 338 ? SER A 349 TRP A 353 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 TYR C 350 ? ASN C 355 ? TYR A 365 ASN A 370 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 THR C 370 ? LEU C 375 ? THR A 385 LEU A 390 5 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP C 390 ? ILE C 395 ? ASP A 405 ILE A 410 5 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY C 401 ? ASN C 407 ? GLY A 416 ASN A 422 1 ? 7 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY C 487 ? TYR C 490 ? GLY A 502 TYR A 505 5 ? 4 HELX_P HELX_P12 AB3 SER D 30 ? SER D 32 ? SER B 30 SER B 31 5 ? 3 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU D 80 ? PHE D 84 ? GLU B 79 PHE B 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 GLN E 62 ? GLN E 65 ? GLN C 61 GLN C 64 5 ? 4 HELX_P HELX_P15 AB6 ARG E 87 ? THR E 91 ? ARG C 83 THR C 87 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 22 SG ? ? ? 1_555 A CYS 98 SG ? ? H CYS 22 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? ? disulf2 disulf ? ? C CYS 321 SG ? ? ? 1_555 C CYS 346 SG ? ? A CYS 336 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 364 SG ? ? ? 1_555 C CYS 417 SG ? ? A CYS 379 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 376 SG ? ? ? 1_555 C CYS 510 SG ? ? A CYS 391 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.116 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 465 SG ? ? ? 1_555 C CYS 473 SG ? ? A CYS 480 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? ? disulf6 disulf ? ? E CYS 22 SG ? ? ? 1_555 E CYS 96 SG ? ? C CYS 22 C CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf7 disulf ? ? E CYS 101 SG ? ? ? 1_555 E CYS 106 SG ? ? C CYS 97 C CYS 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? ? covale1 covale one ? C ASN 328 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? A ASN 343 A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG F . ? ASN C 328 ? NAG A 1301 ? 1_555 ASN A 343 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 2 CYS A 22 ? CYS A 98 ? CYS H 22 ? 1_555 CYS H 92 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 3 CYS C 321 ? CYS C 346 ? CYS A 336 ? 1_555 CYS A 361 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS C 364 ? CYS C 417 ? CYS A 379 ? 1_555 CYS A 432 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 5 CYS C 376 ? CYS C 510 ? CYS A 391 ? 1_555 CYS A 525 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 6 CYS C 465 ? CYS C 473 ? CYS A 480 ? 1_555 CYS A 488 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 7 CYS E 22 ? CYS E 96 ? CYS C 22 ? 1_555 CYS C 92 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 8 CYS E 101 ? CYS E 106 ? CYS C 97 ? 1_555 CYS C 102 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 7 B . ? SER 7 L PRO 8 B ? PRO 8 L 1 -5.67 2 SER 7 D . ? SER 7 B PRO 8 D ? PRO 8 B 1 -18.69 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 6 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 5 6 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 5 ? 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