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'S, 2' ? ? ? ? ? ? 'Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2' 2697049 'Gamma (P.1)' ? ? ? ? ? ? human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 255 human ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 'Biological sequence' 1 232 human ? ? ? ? ? ? ? ? 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'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8DLR _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean 78.90 _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 8DLR _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0059 ? 4125 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.7824 ? 5609 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0558 ? 641 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0070 ? 705 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.4471 ? 580 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 8DLR _struct.title 'Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Gamma (P.1) spike protein in complex with Fab 4-8 (focused refinement of NTD and 4-8)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8DLR _struct_keywords.text 'SARS-CoV-2, glycoprotein, fusion protein, viral protein, Viral Protein-Immune System complex, Gamma, P.1, 4-8' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 4 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 4 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LYS A 147 ? ASN A 149 ? LYS A 147 ASN A 149 5 ? 3 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 294 ? LYS A 304 ? ASP A 294 LYS A 304 1 ? 11 HELX_P HELX_P3 AA3 GLY B 46 ? SER B 50 ? GLY H 46 SER H 50 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG B 106 ? THR B 110 ? ARG H 106 THR H 110 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 ALA B 124 ? TYR B 129 ? ALA H 124 TYR H 129 5 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 LYS C 46 ? LYS C 50 ? LYS L 46 LYS L 50 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 GLN C 98 ? GLU C 102 ? GLN L 98 GLU L 102 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 15 SG ? ? ? 1_555 A CYS 136 SG ? ? A CYS 15 A CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 131 SG ? ? ? 1_555 A CYS 166 SG ? ? A CYS 131 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 291 SG ? ? ? 1_555 A CYS 301 SG ? ? A CYS 291 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 41 SG ? ? ? 1_555 B CYS 115 SG ? ? H CYS 41 H CYS 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 42 SG ? ? ? 1_555 C CYS 107 SG ? ? L CYS 42 L CYS 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? covale1 covale one ? A ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? A ASN 61 A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? A ASN 122 A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? A ASN 149 A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 165 A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 234 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? A ASN 234 A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 282 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? A ASN 282 A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 6 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER A 26 ? ASN A 30 ? SER A 26 ASN A 30 AA1 2 ASN A 61 ? PHE A 65 ? ASN A 61 PHE A 65 AA1 3 TYR A 265 ? TYR A 269 ? TYR A 265 TYR A 269 AA1 4 VAL A 90 ? THR A 95 ? VAL A 90 THR A 95 AA1 5 ASN A 188 ? ILE A 197 ? ASN A 188 ILE A 197 AA1 6 TYR A 200 ? PRO A 209 ? TYR A 200 PRO A 209 AA1 7 GLU A 224 ? PRO A 230 ? GLU A 224 PRO A 230 AA2 1 VAL A 47 ? PHE A 55 ? VAL A 47 PHE A 55 AA2 2 GLN A 271 ? TYR A 279 ? GLN A 271 TYR A 279 AA2 3 ILE A 285 ? ASP A 290 ? ILE A 285 ASP A 290 AA3 1 VAL A 83 ? PRO A 85 ? VAL A 83 PRO A 85 AA3 2 ARG A 237 ? LEU A 244 ? ARG A 237 LEU A 244 AA3 3 ILE A 101 ? GLY A 107 ? ILE A 101 GLY A 107 AA3 4 SER A 116 ? ASN A 121 ? SER A 116 ASN A 121 AA3 5 VAL A 126 ? TYR A 145 ? VAL A 126 TYR A 145 AA3 6 MET A 153 ? SER A 172 ? MET A 153 SER A 172 AA4 1 VAL A 83 ? PRO A 85 ? VAL A 83 PRO A 85 AA4 2 ARG A 237 ? LEU A 244 ? ARG A 237 LEU A 244 AA4 3 VAL A 126 ? TYR A 145 ? VAL A 126 TYR A 145 AA4 4 MET A 153 ? SER A 172 ? MET A 153 SER A 172 AA5 1 VAL B 24 ? GLN B 25 ? VAL H 24 GLN H 25 AA5 2 VAL B 37 ? LYS B 42 ? VAL H 37 LYS H 42 AA5 3 THR B 97 ? LEU B 102 ? THR H 97 LEU H 102 AA5 4 VAL B 87 ? ASP B 92 ? VAL H 87 ASP H 92 AA6 1 GLU B 29 ? LYS B 31 ? GLU H 29 LYS H 31 AA6 2 THR B 138 ? VAL B 142 ? THR H 138 VAL H 142 AA6 3 ALA B 111 ? LEU B 118 ? ALA H 111 LEU H 118 AA6 4 THR B 52 ? GLN B 58 ? THR H 52 GLN H 58 AA6 5 LEU B 64 ? ILE B 71 ? LEU H 64 ILE H 71 AA6 6 ILE B 76 ? TYR B 79 ? ILE H 76 TYR H 79 AA7 1 GLU B 29 ? LYS B 31 ? GLU H 29 LYS H 31 AA7 2 THR B 138 ? VAL B 142 ? THR H 138 VAL H 142 AA7 3 ALA B 111 ? LEU B 118 ? ALA H 111 LEU H 118 AA7 4 VAL B 133 ? TRP B 134 ? VAL H 133 TRP H 134 AA8 1 LEU C 24 ? THR C 25 ? LEU L 24 THR L 25 AA8 2 ALA C 38 ? GLY C 44 ? ALA L 38 GLY L 44 AA8 3 THR C 89 ? ILE C 94 ? THR L 89 ILE L 94 AA8 4 PHE C 81 ? SER C 86 ? PHE L 81 SER L 86 AA9 1 SER C 29 ? VAL C 32 ? SER L 29 VAL L 32 AA9 2 THR C 121 ? VAL C 125 ? THR L 121 VAL L 125 AA9 3 ALA C 103 ? ASP C 111 ? ALA L 103 ASP L 111 AA9 4 ALA C 52 ? GLN C 57 ? ALA L 52 GLN L 57 AA9 5 PRO C 63 ? ILE C 67 ? PRO L 63 ILE L 67 AB1 1 SER C 29 ? VAL C 32 ? SER L 29 VAL L 32 AB1 2 THR C 121 ? VAL C 125 ? THR L 121 VAL L 125 AB1 3 ALA C 103 ? ASP C 111 ? ALA L 103 ASP L 111 AB1 4 THR C 114 ? PHE C 117 ? THR L 114 PHE L 117 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N ALA A 27 ? N ALA A 27 O TRP A 64 ? O TRP A 64 AA1 2 3 N PHE A 65 ? N PHE A 65 O TYR A 265 ? O TYR A 265 AA1 3 4 O TYR A 266 ? O TYR A 266 N ALA A 93 ? N ALA A 93 AA1 4 5 N PHE A 92 ? N PHE A 92 O PHE A 192 ? O PHE A 192 AA1 5 6 N LEU A 189 ? N LEU A 189 O THR A 208 ? O THR A 208 AA1 6 7 N ILE A 203 ? N ILE A 203 O VAL A 227 ? O VAL A 227 AA2 1 2 N HIS A 49 ? N HIS A 49 O LEU A 277 ? O LEU A 277 AA2 2 3 N LYS A 278 ? N LYS A 278 O ASP A 287 ? O ASP A 287 AA3 1 2 N LEU A 84 ? N LEU A 84 O PHE A 238 ? O PHE A 238 AA3 2 3 O ARG A 237 ? O ARG A 237 N GLY A 107 ? N GLY A 107 AA3 3 4 N TRP A 104 ? N TRP A 104 O ILE A 119 ? O ILE A 119 AA3 4 5 N VAL A 120 ? N VAL A 120 O VAL A 127 ? O VAL A 127 AA3 5 6 N CYS A 136 ? N CYS A 136 O VAL A 159 ? O VAL A 159 AA4 1 2 N LEU A 84 ? N LEU A 84 O PHE A 238 ? O PHE A 238 AA4 2 3 O LEU A 244 ? O LEU A 244 N VAL A 143 ? N VAL A 143 AA4 3 4 N CYS A 136 ? N CYS A 136 O VAL A 159 ? O VAL A 159 AA5 1 2 N VAL B 24 ? N VAL H 24 O LYS B 42 ? O LYS H 42 AA5 2 3 N VAL B 37 ? 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C SER 232 # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 2 1 ? ? 2697049 ? ? 'Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2' ? ? 4 3 ? ? 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? 5 2 ? ? 2697049 ? ? 'Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2' ? ? 6 3 ? ? 9606 ? ? 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'COVID-19 research' 2 # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 4 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _space_group.crystal_system triclinic _space_group.name_H-M_alt 'P 1' _space_group.IT_number 1 _space_group.name_Hall 'P 1' _space_group.id 1 #