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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.8025 ? 11370 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0550 ? 1374 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0087 ? 1365 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.1802 ? 1017 ? f_dihedral_angle_d ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details 1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_1 4.7089508625e-12 ? ? ? 'NCS constraints' C B ? ? ? ? 2 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_1 4.30824268827e-13 ? ? ? 'NCS constraints' C B ? ? ? ? 3 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_2 2.20061236269e-11 ? ? ? 'NCS constraints' B a ? ? ? ? 4 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_2 2.58571511206e-13 ? ? ? 'NCS constraints' B a ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details ens_1 d_1 ;chain "B" ; ens_1 d_2 ;chain "C" ; ens_1 d_3 ;chain "A" ; ens_2 d_1 ;chain "a" ; ens_2 d_2 ;chain "b" ; ens_2 d_3 ;chain "c" ; # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details ens_1 d_1 1 C ILE 27 . C LYS 216 . B ILE 67 B LYS 256 ? ? ens_1 d_1 2 M NAG . . M NAG . . J NAG 1 J NAG 1 ? ? ens_1 d_1 3 N NAG . . N NAG . . K NAG 1 K NAG 1 ? ? ens_1 d_1 4 O NAG . . O NAG . . L NAG 1 L NAG 1 ? ? ens_1 d_1 5 AA NAG . . AA NAG . . B NAG 301 B NAG 301 ? ? ens_1 d_1 6 P NAG . . P NAG . . M NAG 1 M NAG 1 ? ? ens_1 d_1 7 Q NAG . . Q NAG . . N NAG 1 N NAG 1 ? ? ens_1 d_1 8 M NAG . . M NAG . . J NAG 2 J NAG 2 ? ? ens_1 d_1 9 P NAG . . P NAG . . M NAG 2 M NAG 2 ? ? ens_1 d_1 10 Q NAG . . Q NAG . . N NAG 2 N NAG 2 ? ? ens_1 d_1 11 N NAG . . N NAG . . K NAG 2 K NAG 2 ? ? ens_1 d_1 12 O NAG . . O NAG . . L NAG 2 L NAG 2 ? ? ens_1 d_2 1 E ILE 27 . E LYS 216 . C ILE 67 C LYS 256 ? ? ens_1 d_2 2 S NAG . . S NAG . . P NAG 1 P NAG 1 ? ? ens_1 d_2 3 T NAG . . T NAG . . Q NAG 1 Q NAG 1 ? ? ens_1 d_2 4 U NAG . . U NAG . . R NAG 1 R NAG 1 ? ? ens_1 d_2 5 CA NAG . . CA NAG . . C NAG 301 C NAG 301 ? ? ens_1 d_2 6 V NAG . . V NAG . . S NAG 1 S NAG 1 ? ? ens_1 d_2 7 W NAG . . W NAG . . T NAG 1 T NAG 1 ? ? ens_1 d_2 8 S NAG . . S NAG . . P NAG 2 P NAG 2 ? ? ens_1 d_2 9 V NAG . . V NAG . . S NAG 2 S NAG 2 ? ? ens_1 d_2 10 W NAG . . W NAG . . T NAG 2 T NAG 2 ? ? ens_1 d_2 11 T NAG . . T NAG . . Q NAG 2 Q NAG 2 ? ? ens_1 d_2 12 U NAG . . U NAG . . R NAG 2 R NAG 2 ? ? ens_1 d_3 1 A ILE 27 . A LYS 216 . A ILE 67 A LYS 256 ? ? ens_1 d_3 2 G NAG . . G NAG . . D NAG 1 D NAG 1 ? ? ens_1 d_3 3 H NAG . . H NAG . . E NAG 1 E NAG 1 ? ? ens_1 d_3 4 I NAG . . I NAG . . F NAG 1 F NAG 1 ? ? ens_1 d_3 5 Y NAG . . Y NAG . . A NAG 301 A NAG 301 ? ? ens_1 d_3 6 J NAG . . J NAG . . G NAG 1 G NAG 1 ? ? ens_1 d_3 7 K NAG . . K NAG . . H NAG 1 H NAG 1 ? ? ens_1 d_3 8 G NAG . . G NAG . . D NAG 2 D NAG 2 ? ? ens_1 d_3 9 J NAG . . J NAG . . G NAG 2 G NAG 2 ? ? ens_1 d_3 10 K NAG . . K NAG . . H NAG 2 H NAG 2 ? ? ens_1 d_3 11 H NAG . . H NAG . . E NAG 2 E NAG 2 ? ? ens_1 d_3 12 I NAG . . I NAG . . F NAG 2 F NAG 2 ? ? ens_2 d_1 1 B TRP 5 . B ILE 161 . a TRP 270 a ILE 426 ? ? ens_2 d_1 2 L NAG . . L NAG . . I NAG 1 I NAG 1 ? ? ens_2 d_1 3 Z NAG . . Z NAG . . a NAG 701 a NAG 701 ? ? ens_2 d_1 4 L NAG . . L NAG . . I NAG 2 I NAG 2 ? ? ens_2 d_2 1 D TRP 5 . D ILE 161 . b TRP 270 b ILE 426 ? ? ens_2 d_2 2 R NAG . . R NAG . . O NAG 1 O NAG 1 ? ? ens_2 d_2 3 BA NAG . . BA NAG . . b NAG 701 b NAG 701 ? ? ens_2 d_2 4 R NAG . . R NAG . . O NAG 2 O NAG 2 ? ? ens_2 d_3 1 F TRP 5 . F ILE 161 . c TRP 270 c ILE 426 ? ? ens_2 d_3 2 X NAG . . X NAG . . U NAG 1 U NAG 1 ? ? ens_2 d_3 3 DA NAG . . DA NAG . . c NAG 701 c NAG 701 ? ? ens_2 d_3 4 X NAG . . X NAG . . U NAG 2 U NAG 2 ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details ens_1 ? ens_2 ? # _struct.entry_id 8DMI _struct.title 'Lymphocytic choriomeningitis virus glycoprotein' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8DMI _struct_keywords.text 'Viral glycoprotein, arenavirus, LCMV, GP, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 3 ? P N N 3 ? Q N N 3 ? R N N 3 ? S N N 3 ? T N N 3 ? U N N 3 ? V N N 3 ? W N N 3 ? X N N 3 ? Y N N 4 ? Z N N 4 ? AA N N 4 ? BA N N 4 ? CA N N 4 ? DA N N 4 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 HIS A 96 ? SER A 108 ? HIS A 136 SER A 148 1 ? 13 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 146 ? GLY A 160 ? THR A 186 GLY A 200 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 AA3 PRO A 204 ? SER A 213 ? PRO A 244 SER A 253 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 AA4 GLY B 35 ? CYS B 42 ? GLY a 300 CYS a 307 1 ? 8 HELX_P HELX_P5 AA5 GLU B 48 ? SER B 65 ? GLU a 313 SER a 330 1 ? 18 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP B 70 ? THR B 81 ? 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C CYS 144 SG ? ? ? 1_555 C CYS 180 SG ? ? B CYS 184 B CYS 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf11 disulf ? ? C CYS 167 SG ? ? ? 1_555 D CYS 101 SG ? ? B CYS 207 b CYS 366 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? ? disulf12 disulf ? ? D CYS 20 SG ? ? ? 1_555 D CYS 33 SG ? ? b CYS 285 b CYS 298 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf13 disulf ? ? D CYS 42 SG ? ? ? 1_555 D CYS 51 SG ? ? b CYS 307 b CYS 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf14 disulf ? ? D CYS 105 SG ? ? ? 1_555 D CYS 126 SG ? ? b CYS 370 b CYS 391 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf15 disulf ? ? E CYS 52 SG ? ? ? 1_555 E CYS 199 SG ? ? C CYS 92 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf16 disulf ? ? E CYS 83 SG ? ? ? 1_555 E CYS 120 SG ? ? C CYS 123 C CYS 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf17 disulf ? ? E CYS 144 SG ? ? ? 1_555 E CYS 180 SG ? ? C CYS 184 C CYS 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf18 disulf ? ? E CYS 167 SG ? ? ? 1_555 F CYS 101 SG ? ? C CYS 207 c CYS 366 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? ? disulf19 disulf ? ? F CYS 20 SG ? ? ? 1_555 F CYS 33 SG ? ? c CYS 285 c CYS 298 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf20 disulf ? ? F CYS 42 SG ? ? ? 1_555 F CYS 51 SG ? ? c CYS 307 c CYS 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf21 disulf ? ? F CYS 105 SG ? ? ? 1_555 F CYS 126 SG ? ? c CYS 370 c CYS 391 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? covale1 covale one ? A ASN 45 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 85 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 55 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? A ASN 95 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 74 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? A ASN 114 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 84 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? A ASN 124 A NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 131 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 171 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 192 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 232 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 106 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? a ASN 371 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? B ASN 136 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? a ASN 401 a NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? C ASN 45 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? B ASN 85 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? C ASN 55 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? B ASN 95 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? C ASN 74 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? B ASN 114 L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? C ASN 84 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? B ASN 124 B NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? C ASN 131 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? B ASN 171 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? C ASN 192 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? B ASN 232 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? D ASN 106 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? b ASN 371 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? D ASN 136 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b ASN 401 b NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? E ASN 45 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? C ASN 85 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? E ASN 55 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? C ASN 95 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? E ASN 74 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? C ASN 114 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? E ASN 84 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? C ASN 124 C NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? E ASN 131 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 171 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? E ASN 192 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? C ASN 232 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? F ASN 106 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? c ASN 371 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? F ASN 136 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? c ASN 401 c NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale25 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale26 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale27 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? ? covale28 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale29 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale30 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? 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