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;METIAKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGP SMKRIMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR ; ;METIAKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGP SMKRIMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR ; P ? 9 'polypeptide(L)' no no AVQQNKPTRSKRGMRRSHDALTAVTSLSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIAK AVQQNKPTRSKRGMRRSHDALTAVTSLSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIAK Q ? 10 'polypeptide(L)' no no MKRTFQPSVLKRNRSHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRARLTVSK MKRTFQPSVLKRNRSHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRARLTVSK R ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 11 ;(3aS,4R,7S,9R,10R,11R,13R,15R,15aR)-1-{4-[4-(3-aminophenyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl]butyl}-4-ethyl-7-fluoro-11-methoxy-3a ,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,8,14-tetraoxotetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-10-yl 3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranoside ; EM1 12 'VIRGINIAMYCIN M1' VIR # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id 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_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code K 11 EM1 1 3001 3001 EM1 EM1 I . 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ALA P 89 GLY P 91 5 ? 3 HELX_P HELX_P30 AD3 THR I 8 ? ARG I 16 ? THR Q 9 ARG Q 17 1 ? 9 HELX_P HELX_P31 AD4 SER I 17 ? ASP I 19 ? SER Q 18 ASP Q 20 5 ? 3 HELX_P HELX_P32 AD5 SER J 8 ? GLY J 17 ? SER R 8 GLY R 17 1 ? 10 HELX_P HELX_P33 AD6 GLY J 17 ? MET J 22 ? GLY R 17 MET R 22 1 ? 6 HELX_P HELX_P34 AD7 THR J 24 ? GLY J 38 ? THR R 24 GLY R 38 1 ? 15 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? A U 744 "O3'" ? ? ? 1_555 A 1MG 745 P ? ? I U 744 I 1MG 745 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale2 covale both ? A 1MG 745 "O3'" ? ? ? 1_555 A PSU 746 P ? ? I 1MG 745 I PSU 746 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale3 covale both ? A PSU 746 "O3'" ? ? ? 1_555 A 5MU 747 P ? ? I PSU 746 I 5MU 747 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.607 ? ? covale4 covale both ? A 5MU 747 "O3'" ? ? ? 1_555 A G 748 P ? ? I 5MU 747 I G 748 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.607 ? ? covale5 covale both ? A G 954 "O3'" ? ? ? 1_555 A PSU 955 P ? ? I G 954 I PSU 955 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale6 covale both ? A PSU 955 "O3'" ? ? ? 1_555 A G 956 P ? ? I PSU 955 I G 956 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.605 ? ? covale7 covale both ? A C 1617 "O3'" ? ? ? 1_555 A 6MZ 1618 P ? ? I C 1617 I 6MZ 1618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.604 ? ? covale8 covale both ? A 6MZ 1618 "O3'" ? ? ? 1_555 A G 1619 P ? ? I 6MZ 1618 I G 1619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale9 covale both ? A U 1834 "O3'" ? ? ? 1_555 A 2MG 1835 P ? ? I U 1834 I 2MG 1835 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale10 covale both ? A 2MG 1835 "O3'" ? ? ? 1_555 A C 1836 P ? ? I 2MG 1835 I C 1836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.607 ? ? covale11 covale both ? A G 1910 "O3'" ? ? ? 1_555 A PSU 1911 P ? ? I G 1910 I PSU 1911 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale12 covale both ? A PSU 1911 "O3'" ? ? ? 1_555 A A 1912 P ? ? I PSU 1911 I A 1912 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.609 ? ? covale13 covale both ? A C 1914 "O3'" ? ? ? 1_555 A 3TD 1915 P ? ? I C 1914 I 3TD 1915 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.608 ? ? covale14 covale both ? A 3TD 1915 "O3'" ? ? ? 1_555 A A 1916 P ? ? I 3TD 1915 I A 1916 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.607 ? ? covale15 covale both ? A A 1916 "O3'" ? ? ? 1_555 A PSU 1917 P ? ? I A 1916 I PSU 1917 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.608 ? ? covale16 covale both ? A PSU 1917 "O3'" ? ? ? 1_555 A A 1918 P ? ? I PSU 1917 I A 1918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.607 ? ? covale17 covale both ? A A 1938 "O3'" ? ? ? 1_555 A 5MU 1939 P ? ? I A 1938 I 5MU 1939 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.607 ? ? covale18 covale both ? A 5MU 1939 "O3'" ? ? ? 1_555 A U 1940 P ? ? I 5MU 1939 I U 1940 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.605 ? ? covale19 covale both ? A C 1961 "O3'" ? ? ? 1_555 A 5MC 1962 P ? ? I C 1961 I 5MC 1962 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale20 covale both ? A 5MC 1962 "O3'" ? ? ? 1_555 A U 1963 P ? ? I 5MC 1962 I U 1963 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale21 covale both ? A U 2068 "O3'" ? ? ? 1_555 A G7M 2069 P ? ? I U 2068 I G7M 2069 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.605 ? ? covale22 covale both ? A G7M 2069 "O3'" ? ? ? 1_555 A A 2070 P ? ? I G7M 2069 I A 2070 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.607 ? ? covale23 covale both ? A G 2250 "O3'" ? ? ? 1_555 A OMG 2251 P ? ? I G 2250 I OMG 2251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.608 ? ? covale24 covale both ? A OMG 2251 "O3'" ? ? ? 1_555 A G 2252 P ? ? I OMG 2251 I G 2252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale25 covale both ? A G 2444 "O3'" ? ? ? 1_555 A 2MG 2445 P ? ? I G 2444 I 2MG 2445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.604 ? ? covale26 covale both ? A 2MG 2445 "O3'" ? ? ? 1_555 A G 2446 P ? ? I 2MG 2445 I G 2446 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.605 ? ? covale27 covale both ? A C 2456 "O3'" ? ? ? 1_555 A PSU 2457 P ? ? I C 2456 I PSU 2457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.605 ? ? covale28 covale both ? A PSU 2457 "O3'" ? ? ? 1_555 A G 2458 P ? ? I PSU 2457 I G 2458 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.605 ? ? covale29 covale both ? A A 2497 "O3'" ? ? ? 1_555 A OMC 2498 P ? ? I A 2497 I OMC 2498 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale30 covale both ? A OMC 2498 "O3'" ? ? ? 1_555 A C 2499 P ? ? I OMC 2498 I C 2499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.610 ? ? covale31 covale both ? A G 2502 "O3'" ? ? ? 1_555 A 2MA 2503 P ? ? I G 2502 I 2MA 2503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.605 ? ? covale32 covale both ? A 2MA 2503 "O3'" ? ? ? 1_555 A PSU 2504 P ? ? I 2MA 2503 I PSU 2504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale33 covale both ? A PSU 2504 "O3'" ? ? ? 1_555 A G 2505 P ? ? I PSU 2504 I G 2505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale34 covale both ? A C 2551 "O3'" ? ? ? 1_555 A OMU 2552 P ? ? I C 2551 I OMU 2552 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.607 ? ? covale35 covale both ? A OMU 2552 "O3'" ? ? ? 1_555 A G 2553 P ? ? I OMU 2552 I G 2553 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.605 ? ? covale36 covale both ? A C 2579 "O3'" ? ? ? 1_555 A PSU 2580 P ? ? I C 2579 I PSU 2580 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale37 covale both ? A PSU 2580 "O3'" ? ? ? 1_555 A G 2581 P ? ? I PSU 2580 I G 2581 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? covale38 covale both ? A U 2604 "O3'" ? ? ? 1_555 A PSU 2605 P ? ? I U 2604 I PSU 2605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.607 ? ? covale39 covale both ? A PSU 2605 "O3'" ? ? ? 1_555 A C 2606 P ? ? I PSU 2605 I C 2606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.606 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A G 1 N1 ? ? ? 1_555 A C 2902 N3 ? ? I G 1 I C 2902 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 1 N2 ? ? ? 1_555 A C 2902 O2 ? ? I G 1 I C 2902 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 1 O6 ? ? ? 1_555 A C 2902 N4 ? ? I G 1 I C 2902 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 2 N1 ? ? ? 1_555 A C 2901 N3 ? ? I G 2 I C 2901 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A G 2 N2 ? ? ? 1_555 A C 2901 O2 ? ? I G 2 I C 2901 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A G 2 O6 ? ? ? 1_555 A C 2901 N4 ? ? I G 2 I C 2901 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A U 3 N3 ? ? ? 1_555 A A 2900 N1 ? ? I U 3 I A 2900 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A U 3 O4 ? ? ? 1_555 A A 2900 N6 ? ? I U 3 I A 2900 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A U 4 N3 ? ? ? 1_555 A A 2899 N1 ? ? I U 4 I A 2899 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A U 4 O4 ? ? ? 1_555 A A 2899 N6 ? ? I U 4 I A 2899 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A A 5 N1 ? ? ? 1_555 A U 2898 N3 ? ? I A 5 I U 2898 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A A 5 N6 ? ? ? 1_555 A U 2898 O4 ? ? I A 5 I U 2898 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A A 6 N1 ? ? ? 1_555 A U 2897 N3 ? ? I A 6 I U 2897 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A A 6 N6 ? ? ? 1_555 A U 2897 O4 ? ? I A 6 I U 2897 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A G 7 N1 ? ? ? 1_555 A C 2896 N3 ? ? I G 7 I C 2896 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A G 7 N2 ? ? ? 1_555 A C 2896 O2 ? ? I G 7 I C 2896 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A G 7 O6 ? ? ? 1_555 A C 2896 N4 ? ? I G 7 I C 2896 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A C 8 N3 ? ? ? 1_555 A G 2895 N1 ? ? I C 8 I G 2895 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A C 8 N4 ? ? ? 1_555 A G 2895 O6 ? ? I C 8 I G 2895 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A C 8 O2 ? ? ? 1_555 A G 2895 N2 ? ? I C 8 I G 2895 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A G 9 N2 ? ? ? 1_555 A A 2800 N1 ? ? I G 9 I A 2800 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_10_PAIR ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A G 9 N3 ? ? ? 1_555 A A 2800 N6 ? ? I G 9 I A 2800 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_10_PAIR ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A A 10 N6 ? ? ? 1_555 A U 2629 O2 ? ? I A 10 I U 2629 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A A 10 N7 ? ? ? 1_555 A U 2629 N3 ? ? I A 10 I U 2629 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A U 12 N3 ? ? ? 1_555 A A 526 N7 ? ? I U 12 I A 526 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A U 12 O2 ? ? ? 1_555 A A 526 N6 ? ? I U 12 I A 526 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A G 15 N1 ? ? ? 1_555 A U 525 O2 ? ? I G 15 I U 525 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A G 15 O6 ? ? ? 1_555 A U 525 N3 ? ? I G 15 I U 525 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A C 16 N3 ? ? ? 1_555 A G 524 N1 ? ? I C 16 I G 524 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A C 16 N4 ? ? ? 1_555 A G 524 O6 ? ? I C 16 I G 524 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A C 16 O2 ? ? ? 1_555 A G 524 N2 ? ? I C 16 I G 524 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A G 17 N1 ? ? ? 1_555 A C 523 N3 ? ? I G 17 I C 523 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? A G 17 N2 ? ? ? 1_555 A C 523 O2 ? ? I G 17 I C 523 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? A G 17 O6 ? ? ? 1_555 A C 523 N4 ? ? I G 17 I C 523 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? A U 18 N3 ? ? ? 1_555 A A 522 N1 ? ? I U 18 I A 522 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? A U 18 O4 ? ? ? 1_555 A A 522 N6 ? ? I U 18 I A 522 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? A A 19 N1 ? ? ? 1_555 A U 521 N3 ? ? I A 19 I U 521 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A A 19 N6 ? ? ? 1_555 A U 521 O4 ? ? I A 19 I U 521 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A C 20 N3 ? ? ? 1_555 A G 520 N1 ? ? I C 20 I G 520 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A C 20 N4 ? ? ? 1_555 A G 520 O6 ? ? I C 20 I G 520 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? A C 20 O2 ? ? ? 1_555 A G 520 N2 ? ? I C 20 I G 520 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A A 21 N1 ? ? ? 1_555 A U 519 N3 ? ? I A 21 I U 519 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? A A 21 N6 ? ? ? 1_555 A U 519 O4 ? ? I A 21 I U 519 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? A C 22 N3 ? ? ? 1_555 A G 518 N1 ? ? I C 22 I G 518 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? A C 22 N4 ? ? ? 1_555 A G 518 O6 ? ? I C 22 I G 518 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? A C 22 O2 ? ? ? 1_555 A G 518 N2 ? ? I C 22 I G 518 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? A G 23 N1 ? ? ? 1_555 A C 517 N3 ? ? I G 23 I C 517 1_555 ? ? ? ? ? ? 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_ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 1 1_555 A C 2902 1_555 -0.496 -0.410 0.134 8.295 -4.838 -2.738 1 I_G1:C2902_I I 1 ? 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