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'Thermoplasma acidophilum' 2303 ? ? ? ? ? ? ? ? ;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ; 866768 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP PSB_THEAC P28061 ? 1 ;MNQTLETGTTTVGITLKDAVIMATERRVTMENFIMHKNGKKLFQIDTYTGMTIAGLVGDAQVLVRYMKAELELYRLQRRV NMPIEAVATLLSNMLNQVKYMPYMVQLLVGGIDTAPHVFSIDAAGGSVEDIYASTGSGSPFVYGVLESQYSEKMTVDEGV DLVIRAISAAKQRDSASGGMIDVAVITRKDGYVQLPTDQIESRIRKLGLIL ; 1 2 UNP PSA_THEAC P25156 ? 2 ;MQQGQMAYDRAITVFSPDGRLFQVEYAREAVKKGSTALGMKFANGVLLISDKKVRSRLIEQNSIEKIQLIDDYVAAVTSG LVADARVLVDFARISAQQEKVTYGSLVNIENLVKRVADQMQQYTQYGGVRPYGVSLIFAGIDQIGPRLFDCDPAGTINEY KATAIGSGKDAVVSFLEREYKENLPEKEAVTLGIKALKSSLEEGEELKAPEIASITVGNKYRIYDQEEVKKFL ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8F6A H 1 ? 211 ? 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P25156 1 ? 233 ? 1 233 24 2 8F6A Q 1 ? 233 ? P25156 1 ? 233 ? 1 233 25 2 8F6A R 1 ? 233 ? P25156 1 ? 233 ? 1 233 26 2 8F6A S 1 ? 233 ? P25156 1 ? 233 ? 1 233 27 2 8F6A T 1 ? 233 ? P25156 1 ? 233 ? 1 233 28 2 8F6A U 1 ? 233 ? P25156 1 ? 233 ? 1 233 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8F6A _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8F6A _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 46536 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.602 ? 62804 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.948 ? 6510 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.044 ? 7364 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 8050 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8F6A _struct.title 'Thermoplasma acidophilum 20S proteasome - wild type' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8F6A _struct_keywords.text 'Protease, threonine protease, endopeptidase activity, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 1 ? N N N 1 ? O N N 1 ? P N N 2 ? Q N N 2 ? R N N 2 ? S N N 2 ? T N N 2 ? U N N 2 ? V N N 2 ? W N N 2 ? X N N 2 ? Y N N 2 ? Z N N 2 ? AA N N 2 ? BA N N 2 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 56 ? ARG A 79 ? LEU H 48 ARG H 71 1 ? 24 HELX_P HELX_P2 AA2 PRO A 83 ? VAL A 98 ? PRO H 75 VAL H 90 1 ? 16 HELX_P HELX_P3 AA3 GLY A 138 ? TYR A 150 ? GLY H 130 TYR H 142 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 THR A 155 ? ASP A 174 ? THR H 147 ASP H 166 1 ? 20 HELX_P HELX_P5 AA5 PRO A 196 ? LEU A 207 ? 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GLY J 130 TYR J 142 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 AC2 THR D 155 ? ASP D 174 ? THR J 147 ASP J 166 1 ? 20 HELX_P HELX_P21 AC3 PRO D 196 ? LEU D 207 ? PRO J 188 LEU J 199 1 ? 12 HELX_P HELX_P22 AC4 LEU E 56 ? ARG E 79 ? LEU K 48 ARG K 71 1 ? 24 HELX_P HELX_P23 AC5 PRO E 83 ? VAL E 98 ? PRO K 75 VAL K 90 1 ? 16 HELX_P HELX_P24 AC6 GLY E 138 ? TYR E 150 ? GLY K 130 TYR K 142 1 ? 13 HELX_P HELX_P25 AC7 THR E 155 ? ASP E 174 ? THR K 147 ASP K 166 1 ? 20 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO E 196 ? LEU E 207 ? PRO K 188 LEU K 199 1 ? 12 HELX_P HELX_P27 AC9 LEU F 56 ? ARG F 79 ? LEU L 48 ARG L 71 1 ? 24 HELX_P HELX_P28 AD1 PRO F 83 ? VAL F 98 ? PRO L 75 VAL L 90 1 ? 16 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY F 138 ? TYR F 150 ? GLY L 130 TYR L 142 1 ? 13 HELX_P HELX_P30 AD3 THR F 155 ? ASP F 174 ? THR L 147 ASP L 166 1 ? 20 HELX_P HELX_P31 AD4 PRO F 196 ? LEU F 207 ? PRO L 188 LEU L 199 1 ? 12 HELX_P HELX_P32 AD5 LEU G 56 ? ARG G 79 ? LEU M 48 ARG M 71 1 ? 24 HELX_P HELX_P33 AD6 PRO G 83 ? VAL G 98 ? 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