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'Xu, H.E.' 12 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Cell _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1097-4172 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 186 _citation.language ? _citation.page_first 413 _citation.page_last 427.e17 _citation.title 'Structures of the entire human opioid receptor family.' _citation.year 2023 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.cell.2022.12.026 _citation.pdbx_database_id_PubMed 36638794 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Wang, Y.' 1 ? primary 'Zhuang, Y.' 2 ? primary 'DiBerto, J.F.' 3 ? primary 'Zhou, X.E.' 4 ? primary 'Schmitz, G.P.' 5 ? primary 'Yuan, Q.' 6 ? primary 'Jain, M.K.' 7 ? primary 'Liu, W.' 8 ? primary 'Melcher, K.' 9 ? primary 'Jiang, Y.' 10 ? primary 'Roth, B.L.' 11 ? primary 'Xu, H.E.' 12 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Delta-type opioid receptor' 42651.020 2 ? ? ? ? 2 polymer syn deltorphin 781.876 2 ? ? 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;MHHHHHHHHGSLLQSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDS RLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLS CCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHES DINAICFFPNGNAFATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGV LAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN ; B ? 5 'polypeptide(L)' no no MASNNTASIAQARKLVEQLKMEANIDRIKVSKAAADLMAYCEAHAKEDPLLTPVPASENPFREKKFFC MASNNTASIAQARKLVEQLKMEANIDRIKVSKAAADLMAYCEAHAKEDPLLTPVPASENPFREKKFFC C ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 6 CHOLESTEROL CLR 7 'PALMITIC ACID' PLM # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ASP n 1 2 TYR n 1 3 LYS n 1 4 ASP n 1 5 ASP n 1 6 ASP n 1 7 ASP n 1 8 VAL n 1 9 ASP n 1 10 ALA n 1 11 SER n 1 12 GLU n 1 13 PRO n 1 14 ALA n 1 15 PRO n 1 16 SER n 1 17 ALA n 1 18 GLY n 1 19 ALA n 1 20 GLU n 1 21 LEU n 1 22 GLN 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THR D 82 SER D 100 1 ? 19 HELX_P HELX_P30 AD3 THR F 111 ? GLU F 122 ? THR D 101 GLU D 112 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 AD4 GLY F 127 ? HIS F 162 ? GLY D 117 HIS D 152 1 ? 36 HELX_P HELX_P32 AD5 HIS F 162 ? ARG F 170 ? HIS D 152 ARG D 160 1 ? 9 HELX_P HELX_P33 AD6 THR F 171 ? MET F 196 ? THR D 161 MET D 186 1 ? 26 HELX_P HELX_P34 AD7 PRO F 215 ? ARG F 251 ? PRO D 205 ARG D 241 1 ? 37 HELX_P HELX_P35 AD8 SER F 259 ? VAL F 297 ? SER D 249 VAL D 287 1 ? 39 HELX_P HELX_P36 AD9 ASP F 303 ? ASP F 332 ? ASP D 293 ASP D 322 1 ? 30 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP F 332 ? CYS F 343 ? ASP D 322 CYS D 333 1 ? 12 HELX_P HELX_P38 AE2 DAL G 2 ? GLY G 7 ? DAL Q 2 GLY Q 7 1 ? 6 HELX_P HELX_P39 AE3 ASP H 337 ? GLY H 352 ? ASP F 337 GLY F 352 1 ? 16 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 131 SG ? ? ? 1_555 A CYS 208 SG ? ? R CYS 121 R CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf2 disulf ? ? F CYS 131 SG ? ? ? 1_555 F CYS 208 SG ? ? D CYS 121 D CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? covale1 covale both ? B TYR 1 C ? ? ? 1_555 B DAL 2 N ? ? P TYR 1 P DAL 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale2 covale both ? B DAL 2 C ? ? ? 1_555 B PHE 3 N ? ? P DAL 2 P PHE 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale3 covale both ? B GLY 7 C ? ? ? 1_555 B NH2 8 N ? ? P GLY 7 P NH2 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.470 ? ? covale4 covale both ? G TYR 1 C ? ? ? 1_555 G DAL 2 N ? ? Q TYR 1 Q DAL 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale5 covale both ? G DAL 2 C ? ? ? 1_555 G PHE 3 N ? ? Q DAL 2 Q PHE 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale6 covale both ? G GLY 7 C ? ? ? 1_555 G NH2 8 N ? ? Q GLY 7 Q NH2 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NH2 B 8 ? GLY B 7 ? NH2 P 8 ? 1_555 GLY P 7 ? 1_555 . . GLY 12 NH2 None 'Terminal amidation' 2 NH2 G 8 ? GLY G 7 ? NH2 Q 8 ? 1_555 GLY Q 7 ? 1_555 . . GLY 12 NH2 None 'Terminal amidation' 3 CYS A 131 ? CYS A 208 ? CYS R 121 ? 1_555 CYS R 198 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS F 131 ? CYS F 208 ? CYS D 121 ? 1_555 CYS D 198 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 214 A . ? SER 204 R PRO 215 A ? PRO 205 R 1 -13.55 2 SER 214 F . ? SER 204 D PRO 215 F ? PRO 205 D 1 -14.55 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA2 5 6 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ALA A 197 ? ARG A 202 ? ALA R 187 ARG R 192 AA1 2 ALA A 205 ? LEU A 210 ? ALA R 195 LEU R 200 AA2 1 VAL C 185 ? THR C 190 ? VAL A 185 THR A 190 AA2 2 HIS C 195 ? ASP C 200 ? HIS A 195 ASP A 200 AA2 3 VAL C 34 ? GLY C 40 ? VAL A 34 GLY A 40 AA2 4 ALA C 220 ? ALA C 226 ? ALA A 220 ALA A 226 AA2 5 SER C 263 ? ASN C 269 ? SER A 263 ASN A 269 AA2 6 ILE C 319 ? PHE C 323 ? ILE A 319 PHE A 323 AA3 1 ARG D 59 ? LEU D 64 ? ARG B 51 LEU B 56 AA3 2 LEU D 349 ? ASN D 353 ? LEU B 341 ASN B 345 AA3 3 VAL D 340 ? SER D 344 ? VAL B 332 SER B 336 AA3 4 VAL D 328 ? VAL D 333 ? VAL B 320 VAL B 325 AA4 1 ILE D 71 ? TRP D 76 ? ILE B 63 TRP B 68 AA4 2 LEU D 82 ? SER D 87 ? LEU B 74 SER B 79 AA4 3 LYS D 91 ? ASP D 96 ? LYS B 83 ASP B 88 AA4 4 ASN D 101 ? PRO D 107 ? ASN B 93 PRO B 99 AA5 1 THR D 115 ? TYR D 118 ? THR B 107 TYR B 110 AA5 2 TYR D 124 ? GLY D 128 ? TYR B 116 GLY B 120 AA5 3 CYS D 134 ? ASN D 138 ? CYS B 126 ASN B 130 AA5 4 ARG D 147 ? LEU D 152 ? ARG B 139 LEU B 144 AA6 1 LEU D 159 ? PHE D 164 ? LEU B 151 PHE B 156 AA6 2 GLN D 169 ? SER D 174 ? GLN B 161 SER B 166 AA6 3 CYS D 179 ? ASP D 183 ? CYS B 171 ASP B 175 AA6 4 GLN D 188 ? PHE D 193 ? GLN B 180 PHE B 185 AA7 1 VAL D 200 ? LEU D 205 ? VAL B 192 LEU B 197 AA7 2 LEU D 211 ? ALA D 216 ? LEU B 203 ALA B 208 AA7 3 ALA D 221 ? ASP D 225 ? ALA B 213 ASP B 217 AA7 4 CYS D 231 ? PHE D 235 ? CYS B 223 PHE B 227 AA8 1 ILE D 242 ? PHE D 247 ? ILE B 234 PHE B 239 AA8 2 ALA D 253 ? SER D 258 ? ALA B 245 SER B 250 AA8 3 CYS D 263 ? ASP D 267 ? CYS B 255 ASP B 259 AA8 4 GLN D 272 ? TYR D 277 ? GLN B 264 TYR B 269 AA9 1 ILE D 286 ? PHE D 291 ? ILE B 278 PHE B 283 AA9 2 LEU D 297 ? TYR D 302 ? LEU B 289 TYR B 294 AA9 3 CYS D 307 ? ASP D 311 ? CYS B 299 ASP B 303 AA9 4 ARG D 317 ? LEU D 321 ? ARG B 309 LEU B 313 AB1 1 ALA F 197 ? ARG F 202 ? ALA D 187 ARG D 192 AB1 2 ALA F 205 ? LEU F 210 ? ALA D 195 LEU D 200 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N ARG A 202 ? 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O TRP B 174 AA6 3 4 N CYS D 179 ? N CYS B 171 O PHE D 193 ? O PHE B 185 AA7 1 2 N MET D 201 ? N MET B 193 O GLY D 215 ? O GLY B 207 AA7 2 3 N PHE D 212 ? N PHE B 204 O TRP D 224 ? O TRP B 216 AA7 3 4 N ALA D 221 ? N ALA B 213 O PHE D 235 ? O PHE B 227 AA8 1 2 N CYS D 246 ? N CYS B 238 O ALA D 255 ? O ALA B 247 AA8 2 3 N PHE D 254 ? N PHE B 246 O PHE D 266 ? O PHE B 258 AA8 3 4 N CYS D 263 ? N CYS B 255 O TYR D 277 ? O TYR B 269 AA9 1 2 N SER D 288 ? N SER B 280 O GLY D 301 ? O GLY B 293 AA9 2 3 N LEU D 298 ? N LEU B 290 O TRP D 310 ? O TRP B 302 AA9 3 4 N CYS D 307 ? N CYS B 299 O LEU D 321 ? O LEU B 313 AB1 1 2 N ARG F 202 ? N ARG D 192 O ALA F 205 ? 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