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'Human betaherpesvirus 5' 10359 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A8T7C4_HCMV A8T7C4 ? 1 MSNTAPGPTVANKRDEKHRHVVNVVLELPTEISEATHPVLATMLSKYTRMSSLFNDKCAFKLDLLRMVAVSRTRR 1 2 UNP A0A1U8QPG3_HCMV A0A1U8QPG3 ? 2 ;MENWSALELLPKVGIPTDFLTHVKTSAGEEMFEALRIYYGDDPERYNIHFEAIFGTFCNRLEWVYFLTSGLAAAAHAIKF HDLNKLTTGKMLFHVQVPRVASGAGLPTSRQTTIMVTKYSEKSPITIPFELSAACLTYLRETFEGTILDKILNVEAMHTV LRALKNTADAMERGLIHSFLQTLLRKAPPYFVVQTLVENATLARQALNRIQRSNILQSFKAKMLATLFLLNRTRDRDYVL KFLTRLAEAATDSILDNPTTYTTSSGAKISGVMVSTANVMQIIMSLLSSHITKETVSAPATYGNFVLSPENAVTAISYHS ILADFNSYKAHLTSGQPHLPNDSLSQAGAHSLTPLSMDVIRLGEKTVIMENLRRVYKNTDTKDPLERNVDLTFFFPVGLY LPEDRGYTTVESKVKLNDTVRNALPTTAYLLNRDRAVQKIDFVDALKTLCHPVLHEPAPCLQTFTERGPPSEPAMQRLLE CRFQQEPMGGAARRIPHFYRVRREVPRTVNEMKQDFVVTDFYKVGNITLYTELHPFFDFTHCQENSETVALCTPRIVIGN LPDGLAPGPFHELRTWEIMEHMRLRPPPDYEETLRLFKTTVTSPNYPELCYLVDVLVHGNVDAFLLIRTFVARCIVNMFH TRQLLVFAHSYALVTLIAEHLADGALPPQLLFHYRNLVAVLRLVTRISALPGLNNGQLAEEPLSAYVNALHDHRLWPPFV THLPRNMEGVQVVADRQPLNPANIEARHHGVSDVPRLGAMDADEPLFVDDYRATDDEWTLQKVFYLCLMPAMTNNRACGL GLNLKTLLVDLFYRPAFLLMPAATAVSTSGTTSKESTSGVTPEDSIAAQRQAVGEMLTELVEDVATDAHTPLLQACRELF LAVQFVGEHVKVLEVRAPLDHAQRQGLPDFISRQHVLYNGCCVVTAPKTLIEYSLPVPFHRFYSNPTICAALSDDIKRYV TEFPHYHRHDGGFPLPTAFAHEYHNWLRSPFSRYSATCPNVLHSVMTLAAMLYKISPVSLVLQTKAHIHPGFALTAVRTD TFEVDMLLYSGKSCTSVIINNPIVTKEERDISTTYHVTQNINTVDMGLGYTSNTCVAYVNRVRTDMGVRVQDLFRVFPMN VYRHDEVDRWIRHAAGVERPQLLDTETISMLTFGSMSERNAAATVHGQKAACELILTPVTMDVNYFKIPNNPRGRASCML AVDPYDTEAATKAIYDHREADAQTFAATHNPWASQAGCLSDVLYNTRHRERLGYNSKFYSPCAQYFNTEEIIAANKTLFK TIDEYLLRAKDCIRGDTDTQYVCVEGTEQLIENPCRLTQEALPILSTTTLALMETKLKGGAGAFATSETHFGNYVVGEII PLQQSMLFNS ; 1 3 UNP Q6RXF2_HCMV Q6RXF2 ? 3 ;MAAMEANIFCTFDHKLSIADVGKLTKLVAAVVPIPQRLHLIKHYQLGLHQFVDHTRGYVRLRGLLRNMTLTLMRRVEGNQ ILLHVPTHGLLYTVLNTGPVTWEKGDALCVLPPLFHGPLARENLLTLGQWELVLPWIVPMPLALEINQRLLIMGLFSLDR SYEEVKAAVQQLQTITFRDATFTIPDPVIDQHLLIDMKTACLSMSMVANLASELTMTYVRKLALEDSSMLLVKCQELLMR LDRERSVGEPRTPARPQHVSPDDEIARLSALFVMLRQLDDLIREQVVFTVCDVSPDNKSATCIFKG ; 1 4 UNP Q6RXH2_HCMV Q6RXH2 ? 4 ;MDARAVAKRPRDPADEDNELVTALKAKREVNTISVRYLYHADHQALTARFFVPEGLVEFEAQPGALLIRMETGCDSPRHL YISLYLLGIRASNVSASTRCLLESVYTASAARAALQWLDLGPHLLHRRLETLGCVKTVSLGITSLLTCVMRGYLYNTLKT EVFALMIPKDMYLTWEETRGRLQYVYLIIVYDYDGPETRPGIYVLTSSIAHWQTLVDVARGKFARERCSFVNRRITRPRQ IPLCTGVIQKLGWCLADDIHTSFLVHKELKLSVVRLDNFSVELGDFREFV ; 1 5 UNP A0A6C0PJD3_HCMV A0A6C0PJD3 ? 5 ;METHLYSDLAFEARFADDEQLPLHLVLDQEVLSNEEAETLRYVYYRNVDSAGRSTGRAPGGDEDDAPASDDAEDAVGGDR AFDRERRTWQRACFRVLPRPLELLDYLRQSGLTVTLEKEQRVRMFYAVFTTLGLRCPDNRLSGAQTLHLRLVWPDGSYRD WEFLARDLLREEMEANKRDRQHQLATTTNHRRRGGLRNNLDNGSDRRLPEAAVASLETAVSTPFFEIPNGAGTSSANGDG RFSNLEQRVARLLRGDEEFIYHAGPLEPPSKIRGHELVQLRLDVNPDLMYATDPHDRDEVARTDEWKGAGVSRLREVWDV QHRVRLRVLWYVNSFWRSRELSYDDHEVELYRALDAYRARIAVEYVLIRAVRDEIYAVLRRDGGALPQRFACHVSRNMSW RVVWELCRHALALWMDWADVRSCIIKALTPRLSRGAAAAAQRARRQRERSAPKPQELLFGPRNESGPPAEQTWYADVVRC VRAQVDLGVEVRAARCPRTGLWIVRDRRGRLRRWLSQPEVCVLYVTPDLDFYWVLPGGFAVSSRVTLHGLAQRALRDRFQ NFEAVLARGMHVEAGRQEPETPRVSGRRLPFDDL ; 1 6 UNP A0A3G6XKK5_HCMV A0A3G6XKK5 ? 6 ;MSLLHTFWRLPVAVFFEPHEENVLRCPERVLRRLLEDAAVTMRGGGWREDVLMDRVRKRYLRQELRDLGHRVQTYCEDLE GRVSEAEALLNQQCELDEGPSPRTLLQPPCRPRSSSPGTGVAGASAVPHGLYSRHDAITGPAAAPSDVVAPSDAVAASAA AGASSTWLAQCAERPLPGNVPSYFGITQNDPFIRFHTDFRGEVVNTMFENASTWTFSFGIWYYRLKRGLYTQPRWKRVYH LAQMDNFSISQELLLGVVNALENVTVYPTYDCVLSDLEAAACLLAAYGHALWEGRDPPDSVATVLGELPQLLPRLADDVS REIAAWEGPVAAGNNYYAYRDSPDLRYYMPLSGGRHYHPGTFDRHVLVRLFHKRGVIQHLPGYGTITEELVQERLSGQVR DDVLSLWSRRLLVGKLGRDVPVFVHEQQYLRSGLTCLAGLLLLWKVTNADSVFAPRTGKFTLADLLGSDAVAGGGLPGGR AGGEEEGYGGRHGRVRNFEFLVRYYIGPWYARDPAVTLSQLFPGLALLAVTESVRSGWDPSRREDSAGGGDGGGAVLMQL SKSNPVADYMFAQSSKQYGDLRRLEVHDALLFHYEHGLGRLLSVTLPRHRVSTLGSSLFNVNDIYELLYFLVLGFLPSVA VL ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8HEY T 1 ? 75 ? 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A0A3G6XKK5 1 ? 642 ? 1 642 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8HEY _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8HEY _struct.title 'One CVSC-binding penton vertex in HCMV B-capsid' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8HEY _struct_keywords.text 'B-capsid, one CVSC-binding penton vertex, asymmetric reconstruction, VIRUS, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 4 ? N N N 1 ? O N N 1 ? P N N 1 ? Q N N 2 ? R N N 2 ? S N N 2 ? T N N 5 ? U N N 6 ? V N N 6 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 56 ? ARG A 72 ? ASP T 56 ARG T 72 1 ? 17 HELX_P HELX_P2 AA2 HIS B 37 ? ARG B 49 ? HIS i 37 ARG i 49 1 ? 13 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP B 56 ? THR B 73 ? ASP i 56 THR i 73 1 ? 18 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG C 19 ? VAL C 24 ? ARG j 19 VAL j 24 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 HIS C 37 ? ARG C 49 ? HIS j 37 ARG j 49 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 LYS C 57 ? ARG C 72 ? LYS j 57 ARG j 72 1 ? 16 HELX_P HELX_P7 AA7 SER D 69 ? ALA D 74 ? SER a 69 ALA a 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 ASP D 82 ? LEU D 86 ? ASP a 82 LEU a 86 5 ? 5 HELX_P HELX_P9 AA9 SER D 132 ? GLU D 141 ? SER a 132 GLU a 141 1 ? 10 HELX_P HELX_P10 AB1 THR D 146 ? ALA D 187 ? THR a 146 ALA a 187 1 ? 42 HELX_P HELX_P11 AB2 PRO D 189 ? ASN D 199 ? PRO a 189 ASN a 199 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 ASN D 208 ? THR D 226 ? ASN a 208 THR a 226 1 ? 19 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP D 235 ? GLU D 248 ? ASP a 235 GLU a 248 1 ? 14 HELX_P HELX_P14 AB5 THR D 263 ? ALA D 267 ? THR a 263 ALA a 267 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 THR D 276 ? LEU D 287 ? THR a 276 LEU a 287 1 ? 12 HELX_P HELX_P16 AB7 SER D 308 ? HIS D 319 ? SER a 308 HIS a 319 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 AB8 ASP D 324 ? GLY D 335 ? ASP a 324 GLY a 335 1 ? 12 HELX_P HELX_P18 AB9 THR D 419 ? ALA D 423 ? 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anti-parallel AF7 3 4 ? anti-parallel AF7 4 5 ? parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 3 4 ? anti-parallel AF8 4 5 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel AG1 4 5 ? parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG2 2 3 ? anti-parallel AG2 3 4 ? anti-parallel AG2 4 5 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG3 3 4 ? anti-parallel AG3 4 5 ? parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG4 3 4 ? anti-parallel AG4 4 5 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG6 1 3 ? parallel AG6 2 3 ? anti-parallel AG6 2 4 ? anti-parallel AG6 4 5 ? anti-parallel AG6 4 6 ? anti-parallel AG7 1 6 ? anti-parallel AG7 2 6 ? anti-parallel AG7 3 4 ? anti-parallel AG7 3 5 ? anti-parallel AG7 5 6 ? anti-parallel AG7 6 11 ? anti-parallel AG7 7 9 ? parallel AG7 8 9 ? anti-parallel AG7 8 10 ? anti-parallel AG7 10 11 ? anti-parallel AG7 10 12 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG9 1 2 ? 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