data_8J5K # _entry.id 8J5K # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.380 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8J5K pdb_00008j5k 10.2210/pdb8j5k/pdb WWPDB D_1300037260 ? ? 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_citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Zhao, S.' 1 ? primary 'Shen, L.' 2 ? primary 'Li, X.' 3 ? primary 'Tao, Q.' 4 ? primary 'Li, Z.' 5 ? primary 'Xu, C.' 6 ? primary 'Zhou, C.' 7 ? primary 'Yang, Y.' 8 ? primary 'Sang, M.' 9 ? primary 'Han, G.' 10 0000-0003-3373-2008 primary 'Yu, L.J.' 11 0000-0002-4962-1049 primary 'Kuang, T.' 12 0000-0002-1885-4210 primary 'Shen, J.R.' 13 0000-0003-4471-8797 primary 'Wang, W.' 14 0000-0002-1842-8633 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8J5K _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? 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949.299 8 ? ? ? ? 40 non-polymer syn 'BICARBONATE ION' 61.017 2 ? ? ? ? 41 non-polymer syn 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' 616.487 4 ? ? ? ? 42 non-polymer syn ;(3S,3'S,5R,5'R,6S,6'R,8'R)-3,5'-dihydroxy-8-oxo-6',7'-didehydro-5,5',6,6',7,8-hexahydro-5,6-epoxy-beta,beta-caroten-3'- yl acetate ; 658.906 24 ? ? ? ? 43 non-polymer syn ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15-octaen-17-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; 566.856 2 ? ? ? ? 44 non-polymer syn "(3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol" 582.855 12 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;VSLWERFCAWITSTENRLYIGWFGCLMFPTLLTATSCFIIAFIAAPPVDIDGIREPVSGSLLYGNNIISGAVVPSSNAIG MHFYPIWEAASVDEWLYNGGPYQLIVLHFLLGVSAYMGREWELSYRLGMRPWIFVAFSAPVAAASAVFLVYPIGQGSFSD GMPLGISGTFNFMLVFQAEHNILMHPFHMAGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLIRETTENESTNYGYKFGQEEETYNIVA AHGYFGRLIFQYASFNNSRALHFFLALWPVVGIWITAMGISTMAFNLNGFNFNQSVVDSQGRVINTWADILNRANLGIEV MHERNAHNFPLDL ; ;VSLWERFCAWITSTENRLYIGWFGCLMFPTLLTATSCFIIAFIAAPPVDIDGIREPVSGSLLYGNNIISGAVVPSSNAIG MHFYPIWEAASVDEWLYNGGPYQLIVLHFLLGVSAYMGREWELSYRLGMRPWIFVAFSAPVAAASAVFLVYPIGQGSFSD GMPLGISGTFNFMLVFQAEHNILMHPFHMAGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLIRETTENESTNYGYKFGQEEETYNIVA AHGYFGRLIFQYASFNNSRALHFFLALWPVVGIWITAMGISTMAFNLNGFNFNQSVVDSQGRVINTWADILNRANLGIEV MHERNAHNFPLDL ; A,a ? 2 'polypeptide(L)' no no ;ALPWYRVHTVVLNDPGRLIAVHLMHTALVAGWAGSMALYELAVFDPSDPVLNPMWRQGMFVMPFMTRLGITDSWGGWSIT GESVSNPGIWSFEGVALSHIILSGMCFLAAIWHWVYWDLELFRDPRTGEPALDLPKIFGIHLFLSGLLCFGFGAFHVTGL FGPGIWVSDAYGITGKVQPVAPAWGADGFNPFNPGGIAAHHIAAGIFGIFAGIFHLTVRPPQRLYRALRMGNIETVLSSS ISAVFFAAFVTSGTMWYGAAATPIELFGPTRYQWDSGYFQQEIERQVETSVSEGLSESQAWSRIPDKLAFYDYIGNNPAK GGLFRAGPMNKGDGIAEAWLGHPIFRDKEGRELTVRRMPAFFETFPVILVDKDGIIRADIPFRRAESKYSIEQVGVTVDF YGGKLNGQTFKDAPTVKKFARKAQLGEVFEFDRTSLESDGVFRSSPRGWYTYGHANFALLFFFGHLWHGGRTIFRDVFTG I ; ;ALPWYRVHTVVLNDPGRLIAVHLMHTALVAGWAGSMALYELAVFDPSDPVLNPMWRQGMFVMPFMTRLGITDSWGGWSIT GESVSNPGIWSFEGVALSHIILSGMCFLAAIWHWVYWDLELFRDPRTGEPALDLPKIFGIHLFLSGLLCFGFGAFHVTGL FGPGIWVSDAYGITGKVQPVAPAWGADGFNPFNPGGIAAHHIAAGIFGIFAGIFHLTVRPPQRLYRALRMGNIETVLSSS ISAVFFAAFVTSGTMWYGAAATPIELFGPTRYQWDSGYFQQEIERQVETSVSEGLSESQAWSRIPDKLAFYDYIGNNPAK GGLFRAGPMNKGDGIAEAWLGHPIFRDKEGRELTVRRMPAFFETFPVILVDKDGIIRADIPFRRAESKYSIEQVGVTVDF YGGKLNGQTFKDAPTVKKFARKAQLGEVFEFDRTSLESDGVFRSSPRGWYTYGHANFALLFFFGHLWHGGRTIFRDVFTG I ; B,b ? 3 'polypeptide(L)' no no ;IAGRDIESTGFAWWSGNARLINVSGKLLGAHVAHAGLMVFWAGAMVLFEVSHFVPEKPTYEQGFILIQHLATLGYGIGPG GEITSTVPYFAVGVIHLISSAILGFGGIYHSLLGPDTLEESFPFFGYDWRDKNKMTTILGIHLCLLGLGSFLLVIKAMYL 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FGVAAIFRFLLFLQGFHNWTLNPFHMMGVAGILGGALLCAIHGATVENTLFEDGDAANTFRAFTPTQSEETYSMVTANRF WSQIFGVAFSNKRWLHFFMLFVPVTGLWTSSIGIVGLALNLRAYDFVSQELRAAEDPEFETFYTKNHLLDEGIRAWMAAQ DQPHENFVFPEEVLPRGNAL ; ;GLFDLVDDWLKKDRFVFVGWSGLLLFPTAYLAAGGWMTGTTFVTSWYTHGLASSYLEGCNFLTAAVSTPANSVGHSLLLL WGPEAQGDFTRWCQIGGLWTFVALHGAFGLIGFCLRQFEIARLVGIRPYNAIAFSGPIAVFVSVFLLYPLGQASWFFAPS FGVAAIFRFLLFLQGFHNWTLNPFHMMGVAGILGGALLCAIHGATVENTLFEDGDAANTFRAFTPTQSEETYSMVTANRF WSQIFGVAFSNKRWLHFFMLFVPVTGLWTSSIGIVGLALNLRAYDFVSQELRAAEDPEFETFYTKNHLLDEGIRAWMAAQ DQPHENFVFPEEVLPRGNAL ; D,d ? 5 'polypeptide(L)' no no RPFSDIITSVRYWIIHSITIPSLFVSGWLFISTGLAYDVFGTPRPNEYFTQDRQQVPLVNDRFSAKQELEDLTKG RPFSDIITSVRYWIIHSITIPSLFVSGWLFISTGLAYDVFGTPRPNEYFTQDRQQVPLVNDRFSAKQELEDLTKG E,e ? 6 'polypeptide(L)' no no IFTFRWLAVHGLAIPTVFFLGGITAMQFIQR IFTFRWLAVHGLAIPTVFFLGGITAMQFIQR F,f ? 7 'polypeptide(L)' no no ALRTRLGEILRPLNAEYGKVAPGWGTTPIMGIVMLAFLIFLVIILQIYNSSLIIENVDVDWANGI ALRTRLGEILRPLNAEYGKVAPGWGTTPIMGIVMLAFLIFLVIILQIYNSSLIIENVDVDWANGI H,h ? 8 'polypeptide(L)' no no MLTLKILVYTTVIFFVSLFIFGFLSSDPSRNPNR MLTLKILVYTTVIFFVSLFIFGFLSSDPSRNPNR I,i ? 9 'polypeptide(L)' no no GRVPLWLVGLVGGFAVITIVSLFIYGSYSGLGSS GRVPLWLVGLVGGFAVITIVSLFIYGSYSGLGSS J,j ? 10 'polypeptide(L)' no no KLPEAYAFLNPIVDVMPVIPVLFFLLAFVWQAAVSFR KLPEAYAFLNPIVDVMPVIPVLFFLLAFVWQAAVSFR K,k ? 11 'polypeptide(L)' no no TGPNPNKQAVELNRTSLYWGLLLIFVLAVLFSSYFFN TGPNPNKQAVELNRTSLYWGLLLIFVLAVLFSSYFFN L,l ? 12 'polypeptide(L)' no no EVQFGAYLAVLLGTFLPALFLVNLFIQTEARKAGKAGGQDS EVQFGAYLAVLLGTFLPALFLVNLFIQTEARKAGKAGGQDS M,m ? 13 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX N,n ? 14 'polypeptide(L)' no no ;LTKSQINELSYLQVKGTGLANRCAEVVGEDSIKPKPGAKLVDMCIEPKAWAVEEEVGKAGKTEKKFVNSKVMTRQTYTLD AIEGPITVDGGKITFSEKEGIDYAATTVQLPGGERVPFLFTVKDLVAKGNGDTFKPGFQMGGDFNTPSYRTGLFLDPKGR GGTTGYDMAVALPALQLGEEGDAELFGENNKVFDITQGRIEMEVNKVNAEDSEIGGVFVATQLSDTDMGSKTPKKVLTKG IFYAKVEQ ; ;LTKSQINELSYLQVKGTGLANRCAEVVGEDSIKPKPGAKLVDMCIEPKAWAVEEEVGKAGKTEKKFVNSKVMTRQTYTLD AIEGPITVDGGKITFSEKEGIDYAATTVQLPGGERVPFLFTVKDLVAKGNGDTFKPGFQMGGDFNTPSYRTGLFLDPKGR GGTTGYDMAVALPALQLGEEGDAELFGENNKVFDITQGRIEMEVNKVNAEDSEIGGVFVATQLSDTDMGSKTPKKVLTKG IFYAKVEQ ; O,o ? 15 'polypeptide(L)' no no ;SVFGLIGDGTSYSEGAAYGTDQADKLYSPYSVYSPEGEKSLYKPDSAEYLARKKAVLAETKNRLQKIPGYVDKKEWFNVK DELTRYMYETRGAVRSLSSSVTQKEKAEVFFRALEDTYGAATLKKGDAVKASNDKAIAALDAFTA ; ;SVFGLIGDGTSYSEGAAYGTDQADKLYSPYSVYSPEGEKSLYKPDSAEYLARKKAVLAETKNRLQKIPGYVDKKEWFNVK DELTRYMYETRGAVRSLSSSVTQKEKAEVFFRALEDTYGAATLKKGDAVKASNDKAIAALDAFTA ; Q,q ? 16 'polypeptide(L)' no no MEALVYTFLLIGTLMVIFFAVFFRETPRI MEALVYTFLLIGTLMVIFFAVFFRETPRI T,t ? 17 'polypeptide(L)' no no ;VIDYENIGYLGGSSIVDINNANIRAYLKMPGMYPTVAGKIVSHGPYSGVSDLYKIPGLSSAEADVIKKYESRLTAKTPSP DYVIDRINNGLY ; ;VIDYENIGYLGGSSIVDINNANIRAYLKMPGMYPTVAGKIVSHGPYSGVSDLYKIPGLSSAEADVIKKYESRLTAKTPSP DYVIDRINNGLY ; U,u ? 18 'polypeptide(L)' no no ;IDLDEATRTVVVDNAGNTTVLTPEQVKRGKRLFNATCGACHVGGITKTNPNVGLDPEALSLATPRRDNINALVDYIKNPT TYDGLESIAEVHPSIKSADIYPRMRSLTDEDLYSIAGHIMLSPKIASEKWGGGKIY ; ;IDLDEATRTVVVDNAGNTTVLTPEQVKRGKRLFNATCGACHVGGITKTNPNVGLDPEALSLATPRRDNINALVDYIKNPT TYDGLESIAEVHPSIKSADIYPRMRSLTDEDLYSIAGHIMLSPKIASEKWGGGKIY ; V,v ? 19 'polypeptide(L)' no no 'ARFANGKPQSIEAKYIMRSPAEWDRFMRFMDRYAEANGLGFSS(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)' ARFANGKPQSIEAKYIMRSPAEWDRFMRFMDRYAEANGLGFSSXXXXXXX W,w ? 20 'polypeptide(L)' no no MTASLSNFIASLIAGGVVVGVIAIALIVISKSDR MTASLSNFIASLIAGGVVVGVIAIALIVISKSDR X,x ? 21 'polypeptide(L)' no no DTRLLVIAAPVLVAASWALFNIGRLAIQQIQRL DTRLLVIAAPVLVAASWALFNIGRLAIQQIQRL Y,y ? 22 'polypeptide(L)' no no MITALTALFVLVSLALVVTVPVALATPGEWETSKDQFNKIFQLWVGLVVAIATADGIST MITALTALFVLVSLALVVTVPVALATPGEWETSKDQFNKIFQLWVGLVVAIATADGIST Z,z ? 23 'polypeptide(L)' no no ;APPGLVGALPPVGFFDPAGFAAKASPEELSRYREVEIMHGRFAQLAVLGFIIPEKCAYDGSFGDDFLAPTGRALEVFNTD PLWLGLTLAVISALETVRLIETEPGTRTDAKIESLGWRPKTESEYINYQVRELQQGRLAMLAFAGEVAQELVNDKPLLVN LQDSGFVSW ; ;APPGLVGALPPVGFFDPAGFAAKASPEELSRYREVEIMHGRFAQLAVLGFIIPEKCAYDGSFGDDFLAPTGRALEVFNTD PLWLGLTLAVISALETVRLIETEPGTRTDAKIESLGWRPKTESEYINYQVRELQQGRLAMLAFAGEVAQELVNDKPLLVN LQDSGFVSW ; 5,0 ? 24 'polypeptide(L)' no no ;FENELGVIAPTGFFDPLGLSKNISKEKFDEYRTAELKHGRAAMLAVLGYIAPETYRFGFDIAPGVSTYDIPNGVAAIDYI PALGWAQIIFLIGAVDYWGVLGDFSFGKPDLGDKEEERKLQELQHGRLAMLAFLELLRHDSQNFVSPGFDGYDKMITGLP FMYG ; ;FENELGVIAPTGFFDPLGLSKNISKEKFDEYRTAELKHGRAAMLAVLGYIAPETYRFGFDIAPGVSTYDIPNGVAAIDYI PALGWAQIIFLIGAVDYWGVLGDFSFGKPDLGDKEEERKLQELQHGRLAMLAFLELLRHDSQNFVSPGFDGYDKMITGLP FMYG ; 7,2 ? 25 'polypeptide(L)' no no ;FENELGVIAPTGFFDPLGFTQDIDQEKFDQYRTAELKHGRVAQLAVVGYVVPEFFRWGFDIAPGIACADVPNGVAAINAI PALGWAQIIFAIGAVDVRGWFGNFDIGKPDLKGKEEERALQELQHGRLAMLAILELLRHDSQNLVKPGFDGLDNLITGLP FLYN ; ;FENELGVIAPTGFFDPLGFTQDIDQEKFDQYRTAELKHGRVAQLAVVGYVVPEFFRWGFDIAPGIACADVPNGVAAINAI PALGWAQIIFAIGAVDVRGWFGNFDIGKPDLKGKEEERALQELQHGRLAMLAILELLRHDSQNLVKPGFDGLDNLITGLP FLYN ; 6,1 ? 26 'polypeptide(L)' no no ;SPRALPFGSAPATLDGSLVGDVGFDPIGFSTAPFASFNNPLYKEGDFMSDLEWLREAELTHGRIAQLAVLGFIWPALFGT FPGNENFGGADAFSYVNPLEAITHVPDLAIYQIVGGMAWVEYQRVIRIKEQGKNRVSGDIGLGYPGGWNPFNLNYSPEEY AEKQLQEIKHCRLAMIGAFGLFFQALNSGTDIVSQLSPAFAAPDYAAKAGYFLP ; ;SPRALPFGSAPATLDGSLVGDVGFDPIGFSTAPFASFNNPLYKEGDFMSDLEWLREAELTHGRIAQLAVLGFIWPALFGT FPGNENFGGADAFSYVNPLEAITHVPDLAIYQIVGGMAWVEYQRVIRIKEQGKNRVSGDIGLGYPGGWNPFNLNYSPEEY AEKQLQEIKHCRLAMIGAFGLFFQALNSGTDIVSQLSPAFAAPDYAAKAGYFLP ; p,P ? 27 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; 4,9 ? 28 'polypeptide(L)' no no ;ENEIGALAPTGFFDPAKLSDGISQEKFDQYRLAELKHGRAAMLAVLGYVAPETYRFGYDLIPGELSTRDIPNGVAALNAI PFGGWVQMIAFVGTVEAYGWFTSPTGVLDLPADILAKRQTSELQHGRLAMLAFLELIRHDSQNLAQPGFDGYDNLITGLP FLY ; ;ENEIGALAPTGFFDPAKLSDGISQEKFDQYRLAELKHGRAAMLAVLGYVAPETYRFGYDLIPGELSTRDIPNGVAALNAI PFGGWVQMIAFVGTVEAYGWFTSPTGVLDLPADILAKRQTSELQHGRLAMLAFLELIRHDSQNLAQPGFDGYDNLITGLP FLY ; 3,8 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 VAL n 1 2 SER n 1 3 LEU n 1 4 TRP n 1 5 GLU n 1 6 ARG n 1 7 PHE n 1 8 CYS n 1 9 ALA n 1 10 TRP n 1 11 ILE n 1 12 THR n 1 13 SER n 1 14 THR n 1 15 GLU n 1 16 ASN n 1 17 ARG n 1 18 LEU n 1 19 TYR n 1 20 ILE n 1 21 GLY n 1 22 TRP n 1 23 PHE n 1 24 GLY n 1 25 CYS n 1 26 LEU n 1 27 MET n 1 28 PHE n 1 29 PRO n 1 30 THR n 1 31 LEU n 1 32 LEU n 1 33 THR n 1 34 ALA n 1 35 THR n 1 36 SER n 1 37 CYS n 1 38 PHE n 1 39 ILE n 1 40 ILE n 1 41 ALA n 1 42 PHE n 1 43 ILE n 1 44 ALA n 1 45 ALA n 1 46 PRO n 1 47 PRO n 1 48 VAL n 1 49 ASP n 1 50 ILE n 1 51 ASP n 1 52 GLY n 1 53 ILE n 1 54 ARG n 1 55 GLU n 1 56 PRO n 1 57 VAL n 1 58 SER n 1 59 GLY n 1 60 SER n 1 61 LEU n 1 62 LEU n 1 63 TYR n 1 64 GLY n 1 65 ASN n 1 66 ASN n 1 67 ILE n 1 68 ILE n 1 69 SER n 1 70 GLY n 1 71 ALA n 1 72 VAL n 1 73 VAL n 1 74 PRO n 1 75 SER n 1 76 SER n 1 77 ASN n 1 78 ALA n 1 79 ILE n 1 80 GLY n 1 81 MET n 1 82 HIS n 1 83 PHE n 1 84 TYR n 1 85 PRO n 1 86 ILE n 1 87 TRP n 1 88 GLU n 1 89 ALA n 1 90 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'Stephanocyclus meneghinianus' 29205 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 8J5K 8J5K ? 1 ? 1 2 PDB 8J5K 8J5K ? 2 ? 1 3 PDB 8J5K 8J5K ? 3 ? 1 4 PDB 8J5K 8J5K ? 4 ? 1 5 PDB 8J5K 8J5K ? 5 ? 1 6 PDB 8J5K 8J5K ? 6 ? 1 7 PDB 8J5K 8J5K ? 7 ? 1 8 PDB 8J5K 8J5K ? 8 ? 1 9 PDB 8J5K 8J5K ? 9 ? 1 10 PDB 8J5K 8J5K ? 10 ? 1 11 PDB 8J5K 8J5K ? 11 ? 1 12 PDB 8J5K 8J5K ? 12 ? 1 13 PDB 8J5K 8J5K ? 13 ? 1 14 PDB 8J5K 8J5K ? 14 ? 1 15 PDB 8J5K 8J5K ? 15 ? 1 16 PDB 8J5K 8J5K ? 16 ? 1 17 PDB 8J5K 8J5K ? 17 ? 1 18 PDB 8J5K 8J5K ? 18 ? 1 19 PDB 8J5K 8J5K ? 19 ? 1 20 PDB 8J5K 8J5K ? 20 ? 1 21 PDB 8J5K 8J5K ? 21 ? 1 22 PDB 8J5K 8J5K ? 22 ? 1 23 PDB 8J5K 8J5K ? 23 ? 1 24 PDB 8J5K 8J5K ? 24 ? 1 25 PDB 8J5K 8J5K ? 25 ? 1 26 PDB 8J5K 8J5K ? 26 ? 1 27 PDB 8J5K 8J5K ? 27 ? 1 28 PDB 8J5K 8J5K ? 28 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8J5K A 1 ? 333 ? 8J5K 11 ? 343 ? 11 343 2 2 8J5K B 1 ? 481 ? 8J5K 2 ? 482 ? 2 482 3 3 8J5K C 1 ? 450 ? 8J5K 23 ? 472 ? 23 472 4 4 8J5K D 1 ? 340 ? 8J5K 13 ? 352 ? 13 352 5 5 8J5K E 1 ? 75 ? 8J5K 8 ? 82 ? 8 82 6 6 8J5K F 1 ? 31 ? 8J5K 15 ? 45 ? 15 45 7 7 8J5K H 1 ? 65 ? 8J5K 14 ? 78 ? 14 78 8 8 8J5K I 1 ? 34 ? 8J5K 1 ? 34 ? 1 34 9 9 8J5K J 1 ? 34 ? 8J5K 6 ? 39 ? 6 39 10 10 8J5K K 1 ? 37 ? 8J5K 23 ? 59 ? 23 59 11 11 8J5K L 1 ? 37 ? 8J5K 2 ? 38 ? 2 38 12 12 8J5K M 1 ? 41 ? 8J5K 2 ? 42 ? 2 42 13 13 8J5K N 1 ? 30 ? 8J5K 1 ? 30 ? 1 30 14 14 8J5K O 1 ? 248 ? 8J5K 90 ? 337 ? 90 337 15 15 8J5K Q 1 ? 145 ? 8J5K 65 ? 209 ? 65 209 16 16 8J5K T 1 ? 29 ? 8J5K 1 ? 29 ? 1 29 17 17 8J5K U 1 ? 92 ? 8J5K 11 ? 102 ? 11 102 18 18 8J5K V 1 ? 136 ? 8J5K 1 ? 136 ? 1 136 19 19 8J5K W 1 ? 50 ? 8J5K 92 ? 141 ? 92 141 20 20 8J5K X 1 ? 34 ? 8J5K 80 ? 113 ? 80 113 21 21 8J5K Y 1 ? 33 ? 8J5K 14 ? 46 ? 14 46 22 22 8J5K Z 1 ? 59 ? 8J5K 4 ? 62 ? 4 62 23 1 8J5K a 1 ? 333 ? 8J5K 11 ? 343 ? 11 343 24 2 8J5K b 1 ? 481 ? 8J5K 2 ? 482 ? 2 482 25 3 8J5K c 1 ? 450 ? 8J5K 23 ? 472 ? 23 472 26 4 8J5K d 1 ? 340 ? 8J5K 13 ? 352 ? 13 352 27 5 8J5K e 1 ? 75 ? 8J5K 8 ? 82 ? 8 82 28 6 8J5K f 1 ? 31 ? 8J5K 15 ? 45 ? 15 45 29 7 8J5K h 1 ? 65 ? 8J5K 14 ? 78 ? 14 78 30 8 8J5K i 1 ? 34 ? 8J5K 1 ? 34 ? 1 34 31 9 8J5K j 1 ? 34 ? 8J5K 6 ? 39 ? 6 39 32 10 8J5K k 1 ? 37 ? 8J5K 23 ? 59 ? 23 59 33 11 8J5K l 1 ? 37 ? 8J5K 2 ? 38 ? 2 38 34 12 8J5K m 1 ? 41 ? 8J5K 2 ? 42 ? 2 42 35 13 8J5K n 1 ? 30 ? 8J5K 1 ? 30 ? 1 30 36 14 8J5K o 1 ? 248 ? 8J5K 90 ? 337 ? 90 337 37 15 8J5K q 1 ? 145 ? 8J5K 65 ? 209 ? 65 209 38 16 8J5K t 1 ? 29 ? 8J5K 1 ? 29 ? 1 29 39 17 8J5K u 1 ? 92 ? 8J5K 11 ? 102 ? 11 102 40 18 8J5K v 1 ? 136 ? 8J5K 1 ? 136 ? 1 136 41 19 8J5K w 1 ? 50 ? 8J5K 92 ? 141 ? 92 141 42 20 8J5K x 1 ? 34 ? 8J5K 80 ? 113 ? 80 113 43 21 8J5K y 1 ? 33 ? 8J5K 14 ? 46 ? 14 46 44 22 8J5K z 1 ? 59 ? 8J5K 4 ? 62 ? 4 62 45 23 8J5K 5 1 ? 169 ? 8J5K 37 ? 205 ? 37 205 46 24 8J5K 7 1 ? 164 ? 8J5K 23 ? 186 ? 23 186 47 25 8J5K 6 1 ? 164 ? 8J5K 36 ? 199 ? 36 199 48 26 8J5K p 1 ? 214 ? 8J5K 35 ? 248 ? 35 248 49 27 8J5K 4 1 ? 153 ? 8J5K 8 ? 160 ? 8 160 50 28 8J5K 3 1 ? 163 ? 8J5K 33 ? 195 ? 33 195 51 26 8J5K P 1 ? 214 ? 8J5K 35 ? 248 ? 35 248 52 27 8J5K 9 1 ? 153 ? 8J5K 8 ? 160 ? 8 160 53 28 8J5K 8 1 ? 163 ? 8J5K 33 ? 195 ? 33 195 54 23 8J5K 0 1 ? 169 ? 8J5K 37 ? 205 ? 37 205 55 24 8J5K 2 1 ? 164 ? 8J5K 23 ? 186 ? 23 186 56 25 8J5K 1 1 ? 164 ? 8J5K 36 ? 199 ? 36 199 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A86 non-polymer . ;(3S,3'S,5R,5'R,6S,6'R,8'R)-3,5'-dihydroxy-8-oxo-6',7'-didehydro-5,5',6,6',7,8-hexahydro-5,6-epoxy-beta,beta-caroten-3'- yl acetate ; Fucoxanthin 'C42 H58 O6' 658.906 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BCR non-polymer . BETA-CAROTENE ? 'C40 H56' 536.873 BCT non-polymer . 'BICARBONATE ION' ? 'C H O3 -1' 61.017 CL non-polymer . 'CHLORIDE ION' ? 'Cl -1' 35.453 CLA non-polymer . 'CHLOROPHYLL A' ? 'C55 H72 Mg N4 O5' 893.489 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DD6 non-polymer . "(3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol" Diadinoxanthin 'C40 H54 O3' 582.855 DGD saccharide . 'DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)' ? 'C51 H96 O15' 949.299 ET4 non-polymer . ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15-octaen-17-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; Diatoxanthin 'C40 H54 O2' 566.856 FE2 non-polymer . 'FE (II) ION' ? 'Fe 2' 55.845 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HEM non-polymer . 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' HEME 'C34 H32 Fe N4 O4' 616.487 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LHG non-polymer . 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE ? 'C38 H75 O10 P' 722.970 LMG non-polymer . 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE ? 'C45 H86 O10' 787.158 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 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'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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O2 ? ? a FE2 402 d BCT 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? ? metalc36 metalc ? ? JE FE2 . FE ? ? ? 1_555 MG BCT . O3 ? ? a FE2 402 d BCT 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.542 ? ? metalc37 metalc ? ? Y ASN 17 OD1 ? ? ? 1_555 BG CLA . MG ? ? c ASN 39 c CLA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.759 ? ? metalc38 metalc ? ? AA HIS 16 NE2 ? ? ? 1_555 XG HEM . FE ? ? e HIS 23 f HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? ? metalc39 metalc ? ? BA HIS 10 NE2 ? ? ? 1_555 XG HEM . FE ? ? f HIS 24 f HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.521 ? ? metalc40 metalc ? ? NA HIS 41 NE2 ? ? ? 1_555 FH HEM . FE ? ? v HIS 41 v HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? ? metalc41 metalc ? ? NA HIS 92 NE2 ? ? ? 1_555 FH HEM . FE ? ? v HIS 92 v HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? ? metalc42 metalc ? ? OA GLU 22 OE2 ? ? ? 1_555 HH CLA . MG ? ? w GLU 113 w CLA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.981 ? ? metalc43 metalc ? ? SA GLU 36 OE2 ? ? ? 1_555 OH CLA . MG ? ? 5 GLU 72 5 CLA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? ? metalc44 metalc ? ? SA GLU 95 OE2 ? ? ? 1_555 SH CLA . MG ? ? 5 GLU 131 5 CLA 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.849 ? ? metalc45 metalc ? ? SA LEU 115 O ? ? ? 1_555 XH CLA . MG ? ? 5 LEU 151 5 CLA 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.578 ? ? metalc46 metalc ? ? SA GLU 132 OE2 ? ? ? 1_555 TH CLA . MG ? ? 5 GLU 168 5 CLA 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.930 ? ? metalc47 metalc ? ? SA PHE 166 O ? ? ? 1_555 WH CLA . MG ? ? 5 PHE 202 5 CLA 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? ? metalc48 metalc ? ? TA GLU 35 OE2 ? ? ? 1_555 GI CLA . MG ? ? 7 GLU 57 7 CLA 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.980 ? ? metalc49 metalc ? ? TA ASP 96 OD2 ? ? ? 1_555 JI CLA . MG ? ? 7 ASP 118 7 CLA 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.903 ? ? metalc50 metalc ? ? TA LEU 101 O ? ? ? 1_555 NI CLA . MG ? ? 7 LEU 123 7 CLA 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? ? metalc51 metalc ? ? TA GLU 122 OE2 ? ? ? 1_555 KI CLA . MG ? ? 7 GLU 144 7 CLA 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.937 ? ? metalc52 metalc ? ? TA GLU 135 OE1 ? ? ? 1_555 MI CLA . MG ? ? 7 GLU 157 7 CLA 312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.846 ? ? metalc53 metalc ? ? 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N 1270 LYS NZ HZ1 sing N N 1271 LYS NZ HZ2 sing N N 1272 LYS NZ HZ3 sing N N 1273 LYS OXT HXT sing N N 1274 MET N CA sing N N 1275 MET N H sing N N 1276 MET N H2 sing N N 1277 MET CA C sing N N 1278 MET CA CB sing N N 1279 MET CA HA sing N N 1280 MET C O doub N N 1281 MET C OXT sing N N 1282 MET CB CG sing N N 1283 MET CB HB2 sing N N 1284 MET CB HB3 sing N N 1285 MET CG SD sing N N 1286 MET CG HG2 sing N N 1287 MET CG HG3 sing N N 1288 MET SD CE sing N N 1289 MET CE HE1 sing N N 1290 MET CE HE2 sing N N 1291 MET CE HE3 sing N N 1292 MET OXT HXT sing N N 1293 OEX O1 CA1 sing N N 1294 OEX O1 MN1 sing N N 1295 OEX O1 MN2 sing N N 1296 OEX CA1 O2 sing N N 1297 OEX CA1 O5 sing N N 1298 OEX MN1 O5 sing N N 1299 OEX MN1 O3 sing N N 1300 OEX O2 MN2 sing N N 1301 OEX O2 MN3 sing N N 1302 OEX MN2 O3 sing N N 1303 OEX MN4 O5 sing N N 1304 OEX O3 MN3 sing N N 1305 OEX MN3 O4 sing N N 1306 OEX O4 MN4 sing N N 1307 OEX MN3 O5 sing N N 1308 PHE N CA sing N N 1309 PHE N H sing N N 1310 PHE N H2 sing N N 1311 PHE CA C sing N N 1312 PHE CA CB sing N N 1313 PHE CA HA sing N N 1314 PHE C O doub N N 1315 PHE C OXT sing N N 1316 PHE CB CG sing N N 1317 PHE CB HB2 sing N N 1318 PHE CB HB3 sing N N 1319 PHE CG CD1 doub Y N 1320 PHE CG CD2 sing Y N 1321 PHE CD1 CE1 sing Y N 1322 PHE CD1 HD1 sing N N 1323 PHE CD2 CE2 doub Y N 1324 PHE CD2 HD2 sing N N 1325 PHE CE1 CZ doub Y N 1326 PHE CE1 HE1 sing N N 1327 PHE CE2 CZ sing Y N 1328 PHE CE2 HE2 sing N N 1329 PHE CZ HZ sing N N 1330 PHE OXT HXT sing N N 1331 PHO HNB NB sing N N 1332 PHO HND ND sing N N 1333 PHO CHA C1A sing Y N 1334 PHO CHA C4D doub Y N 1335 PHO CHA CBD sing N N 1336 PHO CHB C4A doub Y N 1337 PHO CHB C1B sing Y N 1338 PHO CHB HHB sing N N 1339 PHO CHC C4B sing Y N 1340 PHO CHC C1C doub Y N 1341 PHO CHC HHC sing N N 1342 PHO CHD C4C sing Y N 1343 PHO CHD C1D doub Y N 1344 PHO CHD HHD sing N N 1345 PHO NA C1A doub Y N 1346 PHO NA C4A sing Y N 1347 PHO C1A C2A sing N N 1348 PHO C2A C3A sing N N 1349 PHO C2A CAA sing N N 1350 PHO C2A H2A sing N N 1351 PHO C3A C4A sing N N 1352 PHO C3A CMA sing N N 1353 PHO C3A H3A sing N N 1354 PHO CMA HMA1 sing N N 1355 PHO CMA HMA2 sing N N 1356 PHO CMA HMA3 sing N N 1357 PHO CAA CBA sing N N 1358 PHO CAA HAA1 sing N N 1359 PHO CAA HAA2 sing N N 1360 PHO CBA CGA sing N N 1361 PHO CBA HBA1 sing N N 1362 PHO CBA HBA2 sing N N 1363 PHO CGA O1A doub N N 1364 PHO CGA O2A sing N N 1365 PHO O2A C1 sing N N 1366 PHO NB C1B sing Y N 1367 PHO NB C4B sing Y N 1368 PHO C1B C2B doub Y N 1369 PHO C2B C3B sing Y N 1370 PHO C2B CMB sing N N 1371 PHO C3B C4B doub Y N 1372 PHO C3B CAB sing N N 1373 PHO CMB HMB1 sing N N 1374 PHO CMB HMB2 sing N N 1375 PHO CMB HMB3 sing N N 1376 PHO CAB CBB doub N N 1377 PHO CAB HAB sing N N 1378 PHO CBB HBB1 sing N N 1379 PHO CBB HBB2 sing N N 1380 PHO NC C1C sing Y N 1381 PHO NC C4C doub Y N 1382 PHO C1C C2C sing Y N 1383 PHO C2C C3C doub Y N 1384 PHO C2C CMC sing N N 1385 PHO C3C C4C sing Y N 1386 PHO C3C CAC sing N N 1387 PHO CMC HMC1 sing N N 1388 PHO CMC 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