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B . n B 1 979 MET 979 1009 ? ? ? B . n B 1 980 VAL 980 1010 ? ? ? B . n B 1 981 GLU 981 1011 ? ? ? B . n B 1 982 ASN 982 1012 ? ? ? B . n # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero C 2 NAG 1 C NAG 1 A NAG 703 n C 2 NAG 2 C NAG 2 A NAG 704 n C 2 BMA 3 C BMA 3 A BMA 705 n C 2 MAN 4 C MAN 4 A MAN 706 n D 3 NAG 1 D NAG 1 A NAG 707 n D 3 NAG 2 D NAG 2 A NAG 708 n E 2 NAG 1 E NAG 1 B NAG 703 n E 2 NAG 2 E NAG 2 B NAG 704 n E 2 BMA 3 E BMA 3 B BMA 705 n E 2 MAN 4 E MAN 4 B MAN 706 n F 3 NAG 1 F NAG 1 B NAG 707 n F 3 NAG 2 F NAG 2 B NAG 708 n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 4 NAG 1 1101 701 NAG NAG A . 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.608 ? 12672 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 11.570 ? 1354 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.046 ? 1462 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1640 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8K3J _struct.title 'Structure of human CNTN2 immunoglobulin domains 1-6 homo-dimer' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8K3J _struct_keywords.text 'neural cell adhesion, CELL ADHESION' _struct_keywords.pdbx_keywords 'CELL ADHESION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 4 ? 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Q02246 31 ? 1012 ? 31 1012 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 71 ? ALA A 76 ? THR A 101 ALA A 106 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 168 ? LEU A 172 ? ASN A 198 LEU A 202 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 267 ? GLU A 271 ? SER A 297 GLU A 301 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 GLN A 548 ? GLY A 552 ? GLN A 578 GLY A 582 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 THR B 71 ? ALA B 76 ? THR B 101 ALA B 106 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 ASN B 168 ? LEU B 172 ? ASN B 198 LEU B 202 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 SER B 267 ? GLU B 271 ? SER B 297 GLU B 301 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 AA8 GLN B 548 ? GLY B 552 ? GLN B 578 GLY B 582 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 31 SG ? ? ? 1_555 A CYS 81 SG ? ? A CYS 61 A CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 125 SG ? ? ? 1_555 A CYS 177 SG ? ? A CYS 155 A CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 231 SG ? ? ? 1_555 A CYS 276 SG ? ? A CYS 261 A CYS 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 318 SG ? ? ? 1_555 A CYS 365 SG ? ? A CYS 348 A CYS 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf5 disulf ? ? A CYS 410 SG ? ? ? 1_555 A CYS 458 SG ? ? A CYS 440 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf6 disulf ? ? A CYS 500 SG ? ? ? 1_555 A CYS 557 SG ? ? A CYS 530 A CYS 587 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf7 disulf ? ? B CYS 31 SG ? ? ? 1_555 B CYS 81 SG ? ? B CYS 61 B CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf8 disulf ? ? B CYS 125 SG ? ? ? 1_555 B CYS 177 SG ? ? B CYS 155 B CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf9 disulf ? ? B CYS 231 SG ? ? ? 1_555 B CYS 276 SG ? ? B CYS 261 B CYS 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf10 disulf ? ? B CYS 318 SG ? ? ? 1_555 B CYS 365 SG ? ? B CYS 348 B CYS 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf11 disulf ? ? B CYS 410 SG ? ? ? 1_555 B CYS 458 SG ? ? B CYS 440 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf12 disulf ? ? B CYS 500 SG ? ? ? 1_555 B CYS 557 SG ? ? B CYS 530 B CYS 587 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? covale1 covale one ? A ASN 46 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 76 A NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 431 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? A ASN 461 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 447 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? A ASN 477 A NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 468 ND2 ? ? ? 1_555 C NAG . C1 ? ? A ASN 498 C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? B ASN 46 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? B ASN 76 B NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? B ASN 431 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? B ASN 461 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 447 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? B ASN 477 B NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? B ASN 468 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? B ASN 498 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale9 covale both ? C NAG . O4 ? ? ? 1_555 C NAG . C1 ? ? C NAG 1 C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale10 covale both ? C NAG . O4 ? ? ? 1_555 C BMA . C1 ? ? C NAG 2 C BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale11 covale both ? C BMA . O3 ? ? ? 1_555 C MAN . C1 ? ? C BMA 3 C MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale12 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale13 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale14 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E BMA . C1 ? ? E NAG 2 E BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale15 covale both ? E BMA . O3 ? ? ? 1_555 E MAN . C1 ? ? E BMA 3 E MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale16 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 36 A . ? SER 66 A PRO 37 A ? PRO 67 A 1 2.79 2 TYR 131 A . ? TYR 161 A PRO 132 A ? PRO 162 A 1 -3.82 3 PHE 143 A . ? PHE 173 A PRO 144 A ? PRO 174 A 1 -5.53 4 ASN 236 A . ? ASN 266 A PRO 237 A ? PRO 267 A 1 1.65 5 ALA 415 A . ? ALA 445 A PRO 416 A ? PRO 446 A 1 2.75 6 SER 36 B . ? SER 66 B PRO 37 B ? PRO 67 B 1 2.59 7 TYR 131 B . ? TYR 161 B PRO 132 B ? PRO 162 B 1 -3.59 8 PHE 143 B . ? PHE 173 B PRO 144 B ? PRO 174 B 1 -5.83 9 ASN 236 B . ? ASN 266 B PRO 237 B ? PRO 267 B 1 0.79 10 ALA 415 B . ? ALA 445 B PRO 416 B ? PRO 446 B 1 2.79 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 5 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 5 ? AD4 ? 3 ? AD5 ? 5 ? AD6 ? 3 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 5 ? AD9 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD5 1 2 ? parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD5 4 5 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD8 4 5 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 PHE A 5 ? 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GLY A 203 HIS A 212 AA6 4 THR A 187 ? PHE A 191 ? THR A 217 PHE A 221 AA7 1 VAL A 121 ? LEU A 123 ? VAL A 151 LEU A 153 AA7 2 LEU A 162 ? ILE A 164 ? LEU A 192 ILE A 194 AA8 1 SER A 210 ? ALA A 213 ? SER A 240 ALA A 243 AA8 2 PHE A 232 ? PHE A 234 ? PHE A 262 PHE A 264 AA9 1 GLU A 218 ? LEU A 222 ? GLU A 248 LEU A 252 AA9 2 GLY A 283 ? GLN A 294 ? GLY A 313 GLN A 324 AA9 3 GLY A 272 ? ASN A 280 ? GLY A 302 ASN A 310 AA9 4 ARG A 240 ? LYS A 245 ? ARG A 270 LYS A 275 AB1 1 VAL A 227 ? GLU A 230 ? VAL A 257 GLU A 260 AB1 2 THR A 260 ? ILE A 263 ? THR A 290 ILE A 293 AB2 1 GLU A 298 ? LYS A 301 ? GLU A 328 LYS A 331 AB2 2 ALA A 319 ? ALA A 321 ? ALA A 349 ALA A 351 AB3 1 THR A 306 ? ASP A 309 ? THR A 336 ASP A 339 AB3 2 GLY A 372 ? GLN A 383 ? GLY A 402 GLN A 413 AB3 3 GLY A 361 ? ASN A 369 ? GLY A 391 ASN A 399 AB3 4 THR A 327 ? ARG A 332 ? THR A 357 ARG A 362 AB3 5 GLU A 335 ? PRO A 336 ? GLU A 365 PRO A 366 AB4 1 LEU A 314 ? GLY A 317 ? LEU A 344 GLY A 347 AB4 2 ASP A 349 ? PHE A 352 ? 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