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E SER 338 OG 2375 1 Y 1 C GLN 515 ? CG ? E GLN 339 CG 2376 1 Y 1 C GLN 515 ? CD ? E GLN 339 CD 2377 1 Y 1 C GLN 515 ? OE1 ? E GLN 339 OE1 2378 1 Y 1 C GLN 515 ? NE2 ? 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J N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP SYVN1_HUMAN Q86TM6 ? 1 ;MFRTAVMMAASLALTGAVVAHAYYLKHQFYPTVVYLTKSSPSMAVLYIQAFVLVFLLGKVMGKVFFGQLRAAEMEHLLER SWYAVTETCLAFTVFRDDFSPRFVALFTLLLFLKCFHWLAEDRVDFMERSPNISWLFHCRIVSLMFLLGILDFLFVSHAY HSILTRGASVQLVFGFEYAILMTMVLTIFIKYVLHSVDLQSENPWDNKAVYMLYTELFTGFIKVLLYMAFMTIMIKVHTF PLFAIRPMYLAMRQFKKAVTDAIMSRRAIRNMNTLYPDATPEELQAMDNVCIICREEMVTGAKRLPCNHIFHTSCLRSWF QRQQTCPTCRMDVLRASLPAQSPPPPEPADQGPPPAPHPPPLLPQPPNFPQGLLPPFPPGMFPLWPPMGPFPPVPPPPSS GEAVAPPSTSAAALSRPSGAATTTAAGTSATAASATASGPGSGSAPEAGPAPGFPFPPPWMGMPLPPPFAFPPMPVPPAG FAGLTPEELRALEGHERQHLEARLQSLRNIHTLLDAAMLQINQYLTVLASLGPPRPATSVNSTEETATTVVAAASSTSIP SSEATTPTPGASPPAPEMERPPAPESVGTEEMPEDGEPDAAELRRRRLQKLESPVAH ; 1 2 UNP ERLEC_HUMAN Q96DZ1 ? 2 ;MEEGGGGVRSLVPGGPVLLVLCGLLEASGGGRALPQLSDDIPFRVNWPGTEFSLPTTGVLYKEDNYVIMTTAHKEKYKCI LPLVTSGDEEEEKDYKGPNPRELLEPLFKQSSCSYRIESYWTYEVCHGKHIRQYHEEKETGQKINIHEYYLGNMLAKNLL FEKEREAEEKEKSNEIPTKNIEGQMTPYYPVGMGNGTPCSLKQNRPRSSTVMYICHPESKHEILSVAEVTTCEYEVVILT PLLCSHPKYRFRASPVNDIFCQSLPGSPFKPLTLRQLEQQEEILRVPFRRNKEEDLQSTKEERFPAIHKSIAIGSQPVLT VGTTHISKLTDDQLIKEFLSGSYCFRGGVGWWKYEFCYGKHVHQYHEDKDSGKTSVVVGTWNQEEHIEWAKKNTARAYHL QDDGTQTVRMVSHFYGNGDICDITDKPRQVTVKLKCKESDSPHAVTVYMLEPHSCQYILGVESPVICKILDTADENGLLS LPN ; 1 3 PDB 8KET 8KET ? 3 ? 1 4 UNP SE1L1_HUMAN Q9UBV2 ? 4 ;RRQMQEAEMMYQTGMKILNGSNKKSQKREAYRYLQKAASMNHTKALERVSYALLFGDYLPQNIQAAREMFEKLTEEGSPK GQTALGFLYASGLGVNSSQAKALVYYTFGALGGNLIAHMVLGYRYWAGIGVLQSCESALTHYRLVANHVASDISLTGGSV VQRIRLPDEVENPGMNSGMLEEDLIQYYQFLAEKGDVQAQVGLGQLHLHGGRGVEQNHQRAFDYFNLAANAGNSHAMAFL GKMYSEGSDIVPQSNETALHYFKKAADMGNPVGQSGLGMAYLYGRGVQVNYDLALKYFQKAAEQGWVDGQLQLGSMYYNG IGVKRDYKQALKYFNLASQGGHILAFYNLAQMHASGTGVMRSCHTAVELFKNVCERGRWSERLMTAYNSYKDGDYNAAVI QYLLLAEQGYEVAQSNAAFILDQREASIVGENETYPRALLHWNRAASQGYTVARIKLGDYHFYGFGTDVDYETAFIHYRL ASEQQHSAQAMFNLGYMHEKGLGIKQDIHLAKRFYDMAAEASPDAQVPVFLALCKLGVVYFLQYIRE ; 177 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8KET A 1 ? 617 ? Q86TM6 1 ? 617 ? 1 617 2 1 8KET B 1 ? 617 ? Q86TM6 1 ? 617 ? 1 617 3 2 8KET F 1 ? 483 ? Q96DZ1 1 ? 483 ? 1 483 4 3 8KET H 1 ? 3 ? 8KET 349 ? 351 ? 349 351 5 4 8KET C 1 ? 547 ? Q9UBV2 177 ? 723 ? 177 723 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 MET A 1 ? LYS A 26 ? MET A 1 LYS A 26 1 ? 26 HELX_P HELX_P2 AA2 GLN A 28 ? SER A 39 ? GLN A 28 SER A 39 1 ? 12 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 39 ? PHE A 66 ? SER A 39 PHE A 66 1 ? 28 HELX_P HELX_P4 AA4 ALA A 72 ? ARG A 96 ? ALA A 72 ARG A 96 1 ? 25 HELX_P HELX_P5 AA5 SER A 100 ? SER A 130 ? SER A 100 SER A 130 1 ? 31 HELX_P HELX_P6 AA6 SER A 134 ? ARG A 166 ? SER A 134 ARG A 166 1 ? 33 HELX_P HELX_P7 AA7 SER A 169 ? GLN A 200 ? SER A 169 GLN A 200 1 ? 32 HELX_P HELX_P8 AA8 TRP A 205 ? VAL A 237 ? TRP A 205 VAL A 237 1 ? 33 HELX_P HELX_P9 AA9 ILE A 245 ? ARG A 266 ? ILE A 245 ARG A 266 1 ? 22 HELX_P HELX_P10 AB1 PHE B 2 ? LYS B 26 ? PHE B 2 LYS B 26 1 ? 25 HELX_P HELX_P11 AB2 PHE B 29 ? THR B 37 ? PHE B 29 THR B 37 1 ? 9 HELX_P HELX_P12 AB3 SER B 39 ? PHE B 66 ? SER B 39 PHE B 66 1 ? 28 HELX_P HELX_P13 AB4 ALA B 72 ? PHE B 95 ? ALA B 72 PHE B 95 1 ? 24 HELX_P HELX_P14 AB5 SER B 100 ? SER B 130 ? SER B 100 SER B 130 1 ? 31 HELX_P HELX_P15 AB6 SER B 134 ? ARG B 166 ? SER B 134 ARG B 166 1 ? 33 HELX_P HELX_P16 AB7 SER B 169 ? SER B 201 ? SER B 169 SER B 201 1 ? 33 HELX_P HELX_P17 AB8 ASP B 206 ? LYS B 236 ? ASP B 206 LYS B 236 1 ? 31 HELX_P HELX_P18 AB9 ILE B 245 ? ARG B 267 ? ILE B 245 ARG B 267 1 ? 23 HELX_P HELX_P19 AC1 ASN C 99 ? SER C 111 ? ASN F 99 SER F 111 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 AC2 PRO C 241 ? HIS C 246 ? PRO F 241 HIS F 246 5 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 PRO C 271 ? VAL C 286 ? PRO F 271 VAL F 286 1 ? 16 HELX_P HELX_P22 AC4 ARG E 2 ? SER E 21 ? ARG C 178 SER C 197 1 ? 20 HELX_P HELX_P23 AC5 LYS E 23 ? MET E 40 ? LYS C 199 MET C 216 1 ? 18 HELX_P HELX_P24 AC6 HIS E 42 ? GLY E 56 ? HIS C 218 GLY C 232 1 ? 15 HELX_P HELX_P25 AC7 ASN E 62 ? GLY E 77 ? ASN C 238 GLY C 253 1 ? 16 HELX_P HELX_P26 AC8 SER E 78 ? GLY E 92 ? SER C 254 GLY C 268 1 ? 15 HELX_P HELX_P27 AC9 SER E 98 ? GLY E 112 ? SER C 274 GLY C 288 1 ? 15 HELX_P HELX_P28 AD1 ILE E 116 ? GLY E 128 ? ILE C 292 GLY C 304 1 ? 13 HELX_P HELX_P29 AD2 SER E 134 ? ILE E 153 ? 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ALA C 701 GLU C 723 1 ? 23 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? C CYS 79 SG ? ? ? 1_555 C CYS 261 SG ? ? F CYS 79 F CYS 261 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf2 disulf ? ? C CYS 113 SG ? ? ? 1_555 C CYS 126 SG ? ? F CYS 113 F CYS 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 199 SG ? ? ? 1_555 C CYS 232 SG ? ? F CYS 199 F CYS 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf4 disulf ? ? E CYS 135 SG ? ? ? 1_555 E CYS 363 SG ? ? C CYS 311 C CYS 539 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? covale1 covale one ? D ASN 2 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? H ASN 350 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? E ASN 41 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? C ASN 217 C NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? E ASN 96 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? C ASN 272 C NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? E ASN 255 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? C ASN 431 C NAG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? E ASN 432 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? C ASN 608 C NAG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale6 covale both ? F NAG . O3 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale7 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F MAN . C1 ? ? D NAG 2 D MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale8 covale both ? F MAN . O6 ? ? ? 1_555 F MAN . C1 ? ? D MAN 3 D MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? ? covale9 covale both ? F MAN . O4 ? ? ? 1_555 F BMA . C1 ? ? D MAN 3 D BMA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale10 covale both ? F MAN . O3 ? ? ? 1_555 F BMA . C1 ? ? D MAN 4 D BMA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale11 covale both ? F MAN . O6 ? ? ? 1_555 F MAN . C1 ? ? D MAN 4 D MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.470 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG F . ? ASN D 2 ? NAG D 1 ? 1_555 ASN H 350 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 2 NAG G . ? ASN E 41 ? NAG C 801 ? 1_555 ASN C 217 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 3 NAG H . ? ASN E 96 ? NAG C 802 ? 1_555 ASN C 272 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 4 NAG I . ? ASN E 255 ? NAG C 803 ? 1_555 ASN C 431 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 5 NAG J . ? ASN E 432 ? NAG C 804 ? 1_555 ASN C 608 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 6 CYS C 79 ? CYS C 261 ? CYS F 79 ? 1_555 CYS F 261 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 7 CYS C 113 ? CYS C 126 ? CYS F 113 ? 1_555 CYS F 126 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 8 CYS C 199 ? CYS C 232 ? CYS F 199 ? 1_555 CYS F 232 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 9 CYS E 135 ? CYS E 363 ? CYS C 311 ? 1_555 CYS C 539 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 PHE C 43 ? ASN C 46 ? PHE F 43 ASN F 46 AA1 2 ASN C 257 ? SER C 263 ? ASN F 257 SER F 263 AA1 3 LYS C 76 ? LEU C 83 ? LYS F 76 LEU F 83 AA1 4 LEU C 60 ? THR C 70 ? LEU F 60 THR F 70 AA2 1 THR C 122 ? VAL C 125 ? THR F 122 VAL F 125 AA2 2 HIS C 130 ? TYR C 134 ? HIS F 130 TYR F 134 AA2 3 TYR C 149 ? ASN C 153 ? TYR F 149 ASN F 153 AA3 1 THR C 178 ? ILE C 181 ? THR F 178 ILE F 181 AA3 2 GLN C 184 ? PRO C 187 ? GLN F 184 PRO F 187 AA4 1 TYR C 189 ? MET C 193 ? TYR F 189 MET F 193 AA4 2 SER C 208 ? CYS C 215 ? SER F 208 CYS F 215 AA4 3 GLU C 233 ? THR C 240 ? GLU F 233 THR F 240 AA4 4 GLU C 222 ? GLU C 228 ? GLU F 222 GLU F 228 AA5 1 PRO C 198 ? CYS C 199 ? PRO F 198 CYS F 199 AA5 2 ARG C 205 ? PRO C 206 ? 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