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_refine_hist.number_reflns_obs ? _refine_hist.number_reflns_R_free ? _refine_hist.number_reflns_R_work ? _refine_hist.R_factor_all ? _refine_hist.R_factor_obs ? _refine_hist.R_factor_R_free ? _refine_hist.R_factor_R_work ? _refine_hist.pdbx_number_residues_total ? _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_ligand ? _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_solvent ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_lipid ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_carb ? _refine_hist.pdbx_pseudo_atom_details ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 0.012 11639 ? r_bond_refined_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_bond_other_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.169 1.599 15857 ? r_angle_refined_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_angle_other_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.963 5.000 1329 ? r_dihedral_angle_1_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 36.828 23.473 550 ? r_dihedral_angle_2_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 19.008 15.000 2044 ? r_dihedral_angle_3_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 15.139 15.000 56 ? r_dihedral_angle_4_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.094 0.200 1556 ? r_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 0.020 8324 ? r_gen_planes_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_gen_planes_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbd_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbd_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbtor_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbtor_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_xyhbond_nbd_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_xyhbond_nbd_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 18.883 17.461 5340 ? r_mcbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_mcbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 31.939 26.128 6661 ? r_mcangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_mcangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 15.585 23.022 6299 ? r_scbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_scbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_scangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_scangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 60.093 60.093 50687 ? r_long_range_B_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_long_range_B_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_rigid_bond_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_free ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_bonded ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.17 ? 0.05 1 'interatomic distance' ? C 1872 ? ? 1 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.17 ? 0.05 2 'interatomic distance' ? D 1872 ? ? 1 # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_ls_shell.d_res_high 3.290 _refine_ls_shell.d_res_low 3.376 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 0 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 108906 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.546 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_R_complete ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.000 # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 C 1 2 D 1 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 0 A DA 4 . A DG 16 . C DA 4 C DG 16 0 ? 1 2 0 B DA 4 . B DG 17 . D DA 4 D DG 17 0 ? # _struct_ncs_ens.id 1 _struct_ncs_ens.details ? # _struct.entry_id 8OMA _struct.title 'MutSbeta bound to 61bp homoduplex DNA' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8OMA _struct_keywords.text 'Protein-DNA complex, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 5 ? G N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 8OMA 8OMA ? 1 ? 1 2 PDB 8OMA 8OMA ? 2 ? 1 3 UNP MSH2_HUMAN P43246 ? 3 ;MAVQPKETLQLESAAEVGFVRFFQGMPEKPTTTVRLFDRGDFYTAHGEDALLAAREVFKTQGVIKYMGPAGAKNLQSVVL SKMNFESFVKDLLLVRQYRVEVYKNRAGNKASKENDWYLAYKASPGNLSQFEDILFGNNDMSASIGVVGVKMSAVDGQRQ VGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEALLIQIGPKECVLPGGETAGDMGKLRQIIQRGGILITERKKADFSTKDIYQD LNRLLKGKKGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFLELLSDDSNFGQFELTTFDFSQYMKLDIAAVRALNLFQGSVEDT TGSQSLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRIEERLNLVEAFVEDAELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKFQRQAAN LQDCYRLYQGINQLPNVIQALEKHEGKHQKLLLAVFVTPLTDLRSDFSKFQEMIETTLDMDQVENHEFLVKPSFDPNLSE LREIMNDLEKKMQSTLISAARDLGLDPGKQIKLDSSAQFGYYFRVTCKEEKVLRNNKNFSTVDIQKNGVKFTNSKLTSLN EEYTKNKTEYEEAQDAIVKEIVNISSGYVEPMQTLNDVLAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAILEKGQGRIILKASRHA CVEVQDEIAFIPNDVYFEKDKQMFHIITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEVSIVDCILARVGAGDSQLK GVSTFMAEMLETASILRSATKDSLIIIDELGRGTSTYDGFGLAWAISEYIATKIGAFCMFATHFHELTALANQIPTVNNL HVTALTTEETLTMLYQVKKGVCDQSFGIHVAELANFPKHVIECAKQKALELEEFQYIGESQGYDIMEPAAKKCYLEREQG EKIIQEFLSKVKQMPFTEMSEENITIKLKQLKAEVIAKNNSFVNEIISRIKVTT ; 1 4 UNP MSH3_HUMAN P20585 ? 4 ;MSRRKPASGGLAASSSAPARQAVLSRFFQSTGSLKSTSSSTGAADQVDPGAAAAAAAAAAAAPPAPPAPAFPPQLPPHIA TEIDRRKKRPLENDGPVKKKVKKVQQKEGGSDLGMSGNSEPKKCLRTRNVSKSLEKLKEFCCDSALPQSRVQTESLQERF AVLPKCTDFDDISLLHAKNAVSSEDSKRQINQKDTTLFDLSQFGSSNTSHENLQKTASKSANKRSKSIYTPLELQYIEMK QQHKDAVLCVECGYKYRFFGEDAEIAARELNIYCHLDHNFMTASIPTHRLFVHVRRLVAKGYKVGVVKQTETAALKAIGD NRSSLFSRKLTALYTKSTLIGEDVNPLIKLDDAVNVDEIMTDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEV VFDSFQDSASRSELETRMSSLQPVELLLPSALSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTEFYAKDT VDIKGSQIISGIVNLEKPVICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQLSSKMEFMTINGTTLRNLEILQNQTDMKTKGSL LWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREINARLDAVSEVLHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFL IVKTLYHLKSEFQAIIPAVNSHIQSDLLRTVILEIPELLSPVEHYLKILNEQAAKVGDKTELFKDLSDFPLIKKRKDEIQ GVIDEIRMHLQEIRKILKNPSAQYVTVSGQEFMIEIKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENYRHLNQLREQLV LDCSAEWLDFLEKFSEHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGDYCRPTVQEERKIVIKNGRHPVIDVLLGEQDQYVPN NTDLSEDSERVMIITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGQSTFMEELTDTA EIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKNYSHQVGNYHMGFLVSEDESK LDPGAAEQVPDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPGEILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAKLWTMHNAQDLQ KWTEEFNMEETQTSLLH ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8OMA C 1 ? 17 ? 8OMA 1 ? 17 ? 1 17 2 2 8OMA D 1 ? 17 ? 8OMA 1 ? 17 ? 1 17 3 3 8OMA A 1 ? 934 ? P43246 1 ? 934 ? 1 934 4 4 8OMA B 1 ? 1137 ? P20585 1 ? 1137 ? 1 1137 # _struct_ref_seq_dif.align_id 4 _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code 8OMA _struct_ref_seq_dif.mon_id ARG _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id B _struct_ref_seq_dif.seq_num 949 _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code ? _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name UNP _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code P20585 _struct_ref_seq_dif.db_mon_id GLN _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num 949 _struct_ref_seq_dif.details variant _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num 949 _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PHE C 184 ? 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ASN A 920 ILE A 930 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 AD3 ASN D 538 ? LEU D 545 ? ASN B 538 LEU B 545 1 ? 8 HELX_P HELX_P31 AD4 SER D 559 ? ASP D 565 ? SER B 559 ASP B 565 1 ? 7 HELX_P HELX_P32 AD5 THR D 569 ? THR D 581 ? THR B 569 THR B 581 1 ? 13 HELX_P HELX_P33 AD6 LYS D 586 ? HIS D 602 ? LYS B 586 HIS B 602 1 ? 17 HELX_P HELX_P34 AD7 SER D 606 ? LEU D 615 ? SER B 606 LEU B 615 1 ? 10 HELX_P HELX_P35 AD8 GLU D 622 ? HIS D 630 ? GLU B 622 HIS B 630 1 ? 9 HELX_P HELX_P36 AD9 SER D 634 ? ILE D 663 ? SER B 634 ILE B 663 1 ? 30 HELX_P HELX_P37 AE1 SER D 665 ? LEU D 679 ? SER B 665 LEU B 679 1 ? 15 HELX_P HELX_P38 AE2 VAL D 682 ? ILE D 688 ? VAL B 682 ILE B 688 1 ? 7 HELX_P HELX_P39 AE3 ASN D 690 ? GLY D 697 ? ASN B 690 GLY B 697 1 ? 8 HELX_P HELX_P40 AE4 ASP D 705 ? ASP D 708 ? ASP B 705 ASP B 708 5 ? 4 HELX_P HELX_P41 AE5 PHE D 709 ? LYS D 738 ? PHE B 709 LYS B 738 1 ? 30 HELX_P HELX_P42 AE6 ASN D 758 ? SER D 762 ? ASN B 758 SER B 762 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 AE7 SER D 782 ? HIS D 817 ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG ? 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