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US ? ? primary Science SCIEAS 0038 1095-9203 ? ? 381 ? 313 319 'Hexasome-INO80 complex reveals structural basis of noncanonical nucleosome remodeling.' 2023 ? 10.1126/science.adf6287 37384673 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 'Acta Crystallogr D Struct Biol' ? ? 2059-7983 ? ? 74 ? 531 544 'Real-space refinement in PHENIX for cryo-EM and crystallography.' 2018 ? 10.1107/S2059798318006551 29872004 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 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;CTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGCAAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCC CCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGCATGTATTGAAC AGCGACCTTGCCGGTGCCAGTCGGATAGTGTTCCGAGCTCCCACTCTAGAGGATCCCCGGGTACCG ; K ? 2 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DG)(DG)(DT)(DA)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA) (DG)(DA)(DG)(DT)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DC)(DT) (DA)(DT)(DC)(DC)(DG)(DA)(DC)(DT)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DA)(DG) (DG)(DT)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA) (DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA) (DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG) (DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA) (DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC) (DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DG) (DA)(DG)(DC)(DT)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA) (DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT) (DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG) ; ;CGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGTGGGAGCTCGGAACACTATCCGACTGGCACCGGCAAGGTCGCTGTTCAATACATGCA CAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTAC GTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTTGCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAG ; L ? 3 'polypeptide(L)' no no ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; M,Q ? 4 'polypeptide(L)' no no ;SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKT VTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKT VTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; N,R ? 5 'polypeptide(L)' no no ;SGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; ;SGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; O ? 6 'polypeptide(L)' no no ;PEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRL AHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; ;PEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRL AHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; P ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DC n 1 2 DT n 1 3 DG n 1 4 DG n 1 5 DA n 1 6 DG n 1 7 DA n 1 8 DA n 1 9 DT n 1 10 DC n 1 11 DC n 1 12 DC n 1 13 DG n 1 14 DG n 1 15 DT n 1 16 DG n 1 17 DC n 1 18 DC n 1 19 DG n 1 20 DA n 1 21 DG n 1 22 DG n 1 23 DC n 1 24 DC n 1 25 DG n 1 26 DC n 1 27 DT n 1 28 DC n 1 29 DA n 1 30 DA n 1 31 DT n 1 32 DT n 1 33 DG n 1 34 DG 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RELION 4 # _em_specimen.concentration 0.88 _em_specimen.details '11-subunit ctINO80 reconstituted with hexasome' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 8OOA 'double helix' 8OOA 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DT 2 1_555 B DA 225 1_555 -0.956 -0.300 0.954 -11.656 -8.910 3.769 1 K_DT-72:DA72_L K -72 ? 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L 72 ? K -71 ? L 71 ? 1 A DG 3 1_555 B DC 224 1_555 A DG 4 1_555 B DC 223 1_555 -0.099 1.452 3.545 3.944 0.189 35.469 2.340 0.781 3.522 0.309 -6.449 35.681 2 KK_DG-71DG-70:DC70DC71_LL K -71 ? L 71 ? K -70 ? L 70 ? 1 A DG 4 1_555 B DC 223 1_555 A DA 5 1_555 B DT 222 1_555 -0.139 1.573 2.811 -4.496 11.059 32.565 1.039 -0.418 3.155 18.946 7.702 34.629 3 KK_DG-70DA-69:DT69DC70_LL K -70 ? L 70 ? K -69 ? L 69 ? 1 A DA 5 1_555 B DT 222 1_555 A DG 6 1_555 B DC 221 1_555 -0.051 1.378 3.251 0.017 5.226 38.289 1.425 0.079 3.402 7.922 -0.026 38.631 4 KK_DA-69DG-68:DC68DT69_LL K -69 ? L 69 ? K -68 ? L 68 ? 1 A DG 6 1_555 B DC 221 1_555 A DA 7 1_555 B DT 220 1_555 0.122 0.674 3.029 -4.023 0.872 33.787 1.023 -0.803 3.011 1.493 6.891 34.030 5 KK_DG-68DA-67:DT67DC68_LL K -68 ? L 68 ? K -67 ? L 67 ? 1 A DA 7 1_555 B DT 220 1_555 A DA 8 1_555 B DT 219 1_555 -0.349 -0.328 3.139 -4.639 0.127 39.620 -0.494 -0.005 3.158 0.187 6.815 39.880 6 KK_DA-67DA-66:DT66DT67_LL K -67 ? L 67 ? K -66 ? 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