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EMDB EMD-17252 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2023-08-30 2 'Structure model' 1 1 2023-09-06 3 'Structure model' 1 2 2024-10-23 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Data collection' 3 3 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 3 'Structure model' em_admin 4 3 'Structure model' pdbx_entry_details 5 3 'Structure model' pdbx_modification_feature # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.journal_volume' 2 2 'Structure model' '_citation.page_first' 3 2 'Structure model' '_citation.page_last' 4 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 5 2 'Structure model' '_citation.title' 6 2 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 7 2 'Structure model' '_citation_author.name' 8 3 'Structure model' '_em_admin.last_update' 9 3 'Structure model' '_pdbx_entry_details.has_protein_modification' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8OX1 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-04-28 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Structure of TRF1core in complex with telomeric nucleosome' _pdbx_database_related.db_id EMD-17252 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 3 _pdbx_contact_author.email knguyen@mrc-lmb.cam.ac.uk _pdbx_contact_author.name_first 'Thi Hoang Duong' _pdbx_contact_author.name_last Nguyen _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-2180-3430 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Hu, H.' 1 0000-0002-3086-3072 'van Roon, A.M.M.' 2 0000-0002-4435-9926 'Ghanim, G.E.' 3 0000-0002-3341-3122 'Ahsan, B.' 4 0000-0003-1839-5023 'Oluwole, A.' 5 0000-0001-8647-4781 'Peak-Chew, S.' 6 ? 'Robinson, C.V.' 7 0000-0001-7829-5505 'Nguyen, T.H.D.' 8 0000-0002-2180-3430 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Sci Adv' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2375-2548 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 9 _citation.language ? _citation.page_first eadi4148 _citation.page_last eadi4148 _citation.title 'Structural basis of telomeric nucleosome recognition by shelterin factor TRF1.' _citation.year 2023 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/sciadv.adi4148 _citation.pdbx_database_id_PubMed 37624885 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id 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no ;(DA)(DT)(DC)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG) (DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT) (DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA) (DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG) (DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT) (DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA) (DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG) (DG)(DT)(DG)(DA)(DT) ; ;ATCTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGG GTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTGAT ; J ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MAEDVSSAAPSPRGCADGRDADPTEEQMAETERNDEEQFECQELLECQVQVGAPEEEEEEEEDAGLVAEAEAVAAGWMLD FLCLSLCRAFRDGRSEDFRRTRNSAEAIIHGLSSLTACQLRTIYICQFLTRIAAGKTLDAQFENDERITPLESALMIWGS 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.722 9.443 3610 ? r_mcbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.723 9.438 3609 ? r_mcbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.628 14.156 4495 ? r_mcangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.627 14.161 4496 ? r_mcangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.429 11.659 10397 ? r_scbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.430 11.657 10395 ? r_scbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_scangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 12.019 17.377 15637 ? r_scangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 18.784 ? 55818 ? r_long_range_B_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 18.784 ? 55819 ? r_long_range_B_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_rigid_bond_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_free ? ? 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'expression tag' -4 32 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 61210 ? 1 MORE -448 ? 1 'SSA (A^2)' 81440 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'native gel electrophoresis' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 49 ? 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ARG A 83 PHE A 84 AA1 2 THR B 85 ? VAL B 86 ? THR B 80 VAL B 81 AA2 1 THR A 123 ? ILE A 124 ? THR A 118 ILE A 119 AA2 2 ARG B 50 ? ILE B 51 ? ARG B 45 ILE B 46 AA3 1 THR B 101 ? TYR B 103 ? THR B 96 TYR B 98 AA3 2 VAL G 105 ? ILE G 107 ? VAL G 100 ILE G 102 AA4 1 ARG C 47 ? VAL C 48 ? ARG C 42 VAL C 43 AA4 2 THR D 93 ? ILE D 94 ? THR D 85 ILE D 86 AA5 1 ARG C 82 ? ILE C 83 ? ARG C 77 ILE C 78 AA5 2 GLY D 58 ? ILE D 59 ? GLY D 50 ILE D 51 AA6 1 VAL C 105 ? ILE C 107 ? VAL C 100 ILE C 102 AA6 2 THR F 101 ? TYR F 103 ? THR F 96 TYR F 98 AA7 1 ARG E 88 ? PHE E 89 ? ARG E 83 PHE E 84 AA7 2 THR F 85 ? VAL F 86 ? THR F 80 VAL F 81 AA8 1 THR E 123 ? ILE E 124 ? THR E 118 ILE E 119 AA8 2 ARG F 50 ? ILE F 51 ? ARG F 45 ILE F 46 AA9 1 ARG G 47 ? VAL G 48 ? ARG G 42 VAL G 43 AA9 2 THR H 93 ? ILE H 94 ? THR H 85 ILE H 86 AB1 1 ARG G 82 ? ILE G 83 ? ARG G 77 ILE G 78 AB1 2 GLY H 58 ? ILE H 59 ? GLY H 50 ILE H 51 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N ARG A 88 ? N ARG A 83 O VAL B 86 ? O VAL B 81 AA2 1 2 N ILE A 124 ? N ILE A 119 O ARG B 50 ? O ARG B 45 AA3 1 2 N THR B 101 ? N THR B 96 O THR G 106 ? O THR G 101 AA4 1 2 N ARG C 47 ? N ARG C 42 O ILE D 94 ? O ILE D 86 AA5 1 2 N ILE C 83 ? N ILE C 78 O GLY D 58 ? O GLY D 50 AA6 1 2 N THR C 106 ? N THR C 101 O TYR F 103 ? O TYR F 98 AA7 1 2 N ARG E 88 ? N ARG E 83 O VAL F 86 ? O VAL F 81 AA8 1 2 N ILE E 124 ? N ILE E 119 O ARG F 50 ? O ARG F 45 AA9 1 2 N ARG G 47 ? N ARG G 42 O ILE H 94 ? O ILE H 86 AB1 1 2 N ILE G 83 ? N ILE G 78 O GLY H 58 ? O GLY H 50 # _pdbx_entry_details.entry_id 8OX1 _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ARG C 99 ? ? -99.71 30.39 2 1 ASN C 110 ? ? -161.46 117.01 3 1 PHE F 100 ? ? -140.04 28.97 4 1 PHE L 412 ? ? -110.45 75.42 5 1 ASN M 402 ? ? -91.80 59.39 # loop_ _pdbx_struct_mod_residue.id _pdbx_struct_mod_residue.label_asym_id _pdbx_struct_mod_residue.label_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.label_seq_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_asym_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_seq_id _pdbx_struct_mod_residue.PDB_ins_code _pdbx_struct_mod_residue.parent_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.details 1 L SEP 434 M SEP 434 ? SER 'modified residue' 2 L SEP 435 M SEP 435 ? SER 'modified residue' 3 L SEP 437 M SEP 437 ? SER 'modified residue' # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 8OX1 _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 8OX1 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 2.7 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 93463 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages 1 _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ;25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630, 1 mM DTT ; _em_buffer.pH 8.0 # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details _em_entity_assembly.entity_id_list 1 0 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX 'TRF1core in complex with telomeric nucleosome' ? ? ? 1,2,3,4,5,6,7,8 2 1 RECOMBINANT COMPLEX 'Human telomeric nucleosome' ;Human telomeric nucleosome with 145 bp DNA and human histone octamer. 145 bp DNA consists of 23 copies of TTAGGG repeats. Histone octamer consists of 2 copies of H2A, H2B, H3 and H4 ; ? ? 1,2,3,4,5,6 3 1 RECOMBINANT COMPLEX 'Human TRF1core complex' ? ? ? 7,8 # _em_imaging.entry_id 8OX1 _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 105000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum 78 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 50.0 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type C-flat-1.2/1.3 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 8OX1 _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 277.15 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ;Blot Force: -15 Blot Time: 2.5 s ; # _em_experiment.entry_id 8OX1 _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 8OX1 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A GLY -4 ? A GLY 1 2 1 Y 1 A PRO -3 ? A PRO 2 3 1 Y 1 A ARG -2 ? A ARG 3 4 1 Y 1 A GLY -1 ? A GLY 4 5 1 Y 1 A MET 0 ? A MET 5 6 1 Y 1 A ALA 1 ? A ALA 6 7 1 Y 1 A ARG 2 ? A ARG 7 8 1 Y 1 A THR 3 ? A THR 8 9 1 Y 1 A LYS 4 ? A LYS 9 10 1 Y 1 A GLN 5 ? A GLN 10 11 1 Y 1 A THR 6 ? A THR 11 12 1 Y 1 A ALA 7 ? A ALA 12 13 1 Y 1 A ARG 8 ? A ARG 13 14 1 Y 1 A LYS 9 ? A LYS 14 15 1 Y 1 A SER 10 ? A SER 15 16 1 Y 1 A THR 11 ? A THR 16 17 1 Y 1 A GLY 12 ? A GLY 17 18 1 Y 1 A GLY 13 ? A GLY 18 19 1 Y 1 A LYS 14 ? A LYS 19 20 1 Y 1 A ALA 15 ? A ALA 20 21 1 Y 1 A PRO 16 ? A PRO 21 22 1 Y 1 A ARG 17 ? A ARG 22 23 1 Y 1 A LYS 18 ? A LYS 23 24 1 Y 1 A GLN 19 ? A GLN 24 25 1 Y 1 A LEU 20 ? A LEU 25 26 1 Y 1 A ALA 21 ? A ALA 26 27 1 Y 1 A THR 22 ? A THR 27 28 1 Y 1 A LYS 23 ? A LYS 28 29 1 Y 1 A ALA 24 ? A ALA 29 30 1 Y 1 A ALA 25 ? A ALA 30 31 1 Y 1 A ARG 26 ? A ARG 31 32 1 Y 1 A LYS 27 ? A LYS 32 33 1 Y 1 A SER 28 ? A SER 33 34 1 Y 1 A ALA 29 ? A ALA 34 35 1 Y 1 A PRO 30 ? A PRO 35 36 1 Y 1 A ALA 31 ? A ALA 36 37 1 Y 1 A THR 32 ? A THR 37 38 1 Y 1 A GLY 33 ? A GLY 38 39 1 Y 1 A GLY 34 ? A GLY 39 40 1 Y 1 A VAL 35 ? A VAL 40 41 1 Y 1 A LYS 36 ? A LYS 41 42 1 Y 1 A ALA 135 ? A ALA 140 43 1 Y 1 B GLY -4 ? B GLY 1 44 1 Y 1 B PRO -3 ? B PRO 2 45 1 Y 1 B ARG -2 ? B ARG 3 46 1 Y 1 B GLY -1 ? B GLY 4 47 1 Y 1 B MET 0 ? B MET 5 48 1 Y 1 B SER 1 ? B SER 6 49 1 Y 1 B GLY 2 ? B GLY 7 50 1 Y 1 B ARG 3 ? B ARG 8 51 1 Y 1 B GLY 4 ? B GLY 9 52 1 Y 1 B LYS 5 ? B LYS 10 53 1 Y 1 B GLY 6 ? B GLY 11 54 1 Y 1 B GLY 7 ? B GLY 12 55 1 Y 1 B LYS 8 ? B LYS 13 56 1 Y 1 B GLY 9 ? B GLY 14 57 1 Y 1 B LEU 10 ? B LEU 15 58 1 Y 1 B GLY 11 ? B GLY 16 59 1 Y 1 B LYS 12 ? B LYS 17 60 1 Y 1 B GLY 13 ? B GLY 18 61 1 Y 1 B GLY 14 ? B GLY 19 62 1 Y 1 B ALA 15 ? B ALA 20 63 1 Y 1 B LYS 16 ? B LYS 21 64 1 Y 1 B ARG 17 ? B ARG 22 65 1 Y 1 B HIS 18 ? B HIS 23 66 1 Y 1 B ARG 19 ? B ARG 24 67 1 Y 1 C GLY -4 ? C GLY 1 68 1 Y 1 C PRO -3 ? C PRO 2 69 1 Y 1 C ARG -2 ? C ARG 3 70 1 Y 1 C GLY -1 ? C GLY 4 71 1 Y 1 C MET 0 ? C MET 5 72 1 Y 1 C SER 1 ? C SER 6 73 1 Y 1 C GLY 2 ? C GLY 7 74 1 Y 1 C ARG 3 ? C ARG 8 75 1 Y 1 C GLY 4 ? C GLY 9 76 1 Y 1 C LYS 5 ? C LYS 10 77 1 Y 1 C GLN 6 ? C GLN 11 78 1 Y 1 C GLY 7 ? C GLY 12 79 1 Y 1 C GLY 8 ? C GLY 13 80 1 Y 1 C LYS 9 ? C LYS 14 81 1 Y 1 C THR 120 ? C THR 125 82 1 Y 1 C GLU 121 ? C GLU 126 83 1 Y 1 C SER 122 ? C SER 127 84 1 Y 1 C HIS 123 ? C HIS 128 85 1 Y 1 C HIS 124 ? C HIS 129 86 1 Y 1 C LYS 125 ? C LYS 130 87 1 Y 1 C ALA 126 ? C ALA 131 88 1 Y 1 C LYS 127 ? C LYS 132 89 1 Y 1 C GLY 128 ? C GLY 133 90 1 Y 1 C LYS 129 ? C LYS 134 91 1 Y 1 D GLY -7 ? D GLY 1 92 1 Y 1 D PRO -6 ? D PRO 2 93 1 Y 1 D ARG -5 ? D ARG 3 94 1 Y 1 D GLY -4 ? D GLY 4 95 1 Y 1 D MET -3 ? D MET 5 96 1 Y 1 D PRO -2 ? D PRO 6 97 1 Y 1 D GLU -1 ? D GLU 7 98 1 Y 1 D PRO 0 ? D PRO 8 99 1 Y 1 D ALA 1 ? D ALA 9 100 1 Y 1 D LYS 2 ? D LYS 10 101 1 Y 1 D SER 3 ? D SER 11 102 1 Y 1 D ALA 4 ? D ALA 12 103 1 Y 1 D PRO 5 ? D PRO 13 104 1 Y 1 D ALA 6 ? D ALA 14 105 1 Y 1 D PRO 7 ? 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J 38 ? 1 I DC 37 1_555 J DG 109 1_555 I DT 38 1_555 J DA 108 1_555 0.120 0.379 3.358 2.309 2.383 31.688 0.243 0.216 3.376 4.349 -4.215 31.857 37 II_DC-38DT-37:DA37DG38_JJ I -38 ? J 38 ? I -37 ? J 37 ? 1 I DT 38 1_555 J DA 108 1_555 I DA 39 1_555 J DT 107 1_555 0.017 1.581 3.446 0.596 -1.308 42.959 2.294 0.038 3.399 -1.785 -0.814 42.982 38 II_DT-37DA-36:DT36DA37_JJ I -37 ? J 37 ? I -36 ? J 36 ? 1 I DA 39 1_555 J DT 107 1_555 I DA 40 1_555 J DT 106 1_555 -0.774 2.091 3.530 -3.409 -16.681 45.341 3.839 0.684 2.695 -20.794 4.249 48.274 39 II_DA-36DA-35:DT35DT36_JJ I -36 ? J 36 ? I -35 ? J 35 ? 1 I DA 40 1_555 J DT 106 1_555 I DC 41 1_555 J DG 105 1_555 0.171 -0.110 3.432 -3.209 0.468 31.861 -0.288 -0.917 3.397 0.850 5.828 32.021 40 II_DA-35DC-34:DG34DT35_JJ I -35 ? J 35 ? I -34 ? J 34 ? 1 I DC 41 1_555 J DG 105 1_555 I DC 42 1_555 J DG 104 1_555 -0.141 -0.361 3.371 -2.566 1.539 35.430 -0.823 -0.155 3.355 2.524 4.207 35.552 41 II_DC-34DC-33:DG33DG34_JJ I -34 ? J 34 ? I -33 ? J 33 ? 1 I DC 42 1_555 J DG 104 1_555 I DC 43 1_555 J DG 103 1_555 0.062 -0.391 3.357 -1.216 3.456 34.014 -1.220 -0.301 3.298 5.887 2.072 34.205 42 II_DC-33DC-32:DG32DG33_JJ I -33 ? J 33 ? I -32 ? J 32 ? 1 I DC 43 1_555 J DG 103 1_555 I DT 44 1_555 J DA 102 1_555 0.272 -0.252 3.402 0.339 4.615 29.642 -1.470 -0.453 3.329 8.951 -0.657 29.993 43 II_DC-32DT-31:DA31DG32_JJ I -32 ? J 32 ? I -31 ? J 31 ? 1 I DT 44 1_555 J DA 102 1_555 I DA 45 1_555 J DT 101 1_555 0.202 -0.481 3.100 1.111 13.461 35.293 -2.357 -0.179 2.747 21.265 -1.755 37.713 44 II_DT-31DA-30:DT30DA31_JJ I -31 ? J 31 ? I -30 ? J 30 ? 1 I DA 45 1_555 J DT 101 1_555 I DA 46 1_555 J DT 100 1_555 -0.323 -0.058 3.340 -2.404 0.288 34.733 -0.142 0.165 3.354 0.482 4.021 34.814 45 II_DA-30DA-29:DT29DT30_JJ I -30 ? J 30 ? I -29 ? J 29 ? 1 I DA 46 1_555 J DT 100 1_555 I DC 47 1_555 J DG 99 1_555 -0.246 -0.661 3.309 -0.558 0.708 34.091 -1.241 0.330 3.299 1.207 0.952 34.103 46 II_DA-29DC-28:DG28DT29_JJ I -29 ? J 29 ? I -28 ? J 28 ? 1 I DC 47 1_555 J DG 99 1_555 I DC 48 1_555 J DG 98 1_555 0.279 0.671 3.480 0.711 -2.850 38.047 1.407 -0.332 3.427 -4.364 -1.089 38.156 47 II_DC-28DC-27:DG27DG28_JJ I -28 ? J 28 ? I -27 ? J 27 ? 1 I DC 48 1_555 J DG 98 1_555 I DC 49 1_555 J DG 97 1_555 -0.871 0.445 3.403 -1.659 -2.840 38.425 1.040 1.105 3.396 -4.305 2.516 38.560 48 II_DC-27DC-26:DG26DG27_JJ I -27 ? J 27 ? I -26 ? J 26 ? 1 I DC 49 1_555 J DG 97 1_555 I DT 50 1_555 J DA 96 1_555 0.400 1.059 3.494 2.578 -4.456 36.299 2.328 -0.264 3.364 -7.108 -4.112 36.650 49 II_DC-26DT-25:DA25DG26_JJ I -26 ? J 26 ? I -25 ? J 25 ? 1 I DT 50 1_555 J DA 96 1_555 I DA 51 1_555 J DT 95 1_555 -0.529 1.626 3.519 -3.239 -3.688 40.935 2.732 0.380 3.397 -5.251 4.611 41.216 50 II_DT-25DA-24:DT24DA25_JJ I -25 ? J 25 ? I -24 ? J 24 ? 1 I DA 51 1_555 J DT 95 1_555 I DA 52 1_555 J DT 94 1_555 -0.390 0.011 3.269 -4.195 2.403 32.383 -0.397 -0.038 3.285 4.278 7.470 32.732 51 II_DA-24DA-23:DT23DT24_JJ I -24 ? J 24 ? I -23 ? 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J -2 ? 1 I DC 77 1_555 J DG 69 1_555 I DC 78 1_555 J DG 68 1_555 0.025 -0.190 3.244 2.691 3.254 35.537 -0.772 0.343 3.208 5.308 -4.389 35.779 77 II_DC2DC3:DG-3DG-2_JJ I 2 ? J -2 ? I 3 ? J -3 ? 1 I DC 78 1_555 J DG 68 1_555 I DC 79 1_555 J DG 67 1_555 0.540 0.726 3.396 4.948 -0.489 37.023 1.201 -0.159 3.428 -0.766 -7.749 37.344 78 II_DC3DC4:DG-4DG-3_JJ I 3 ? J -3 ? I 4 ? J -4 ? 1 I DC 79 1_555 J DG 67 1_555 I DT 80 1_555 J DA 66 1_555 -0.203 1.302 3.615 1.343 -3.625 36.422 2.613 0.523 3.465 -5.779 -2.141 36.620 79 II_DC4DT5:DA-5DG-4_JJ I 4 ? J -4 ? I 5 ? J -5 ? 1 I DT 80 1_555 J DA 66 1_555 I DA 81 1_555 J DT 65 1_555 0.257 1.977 3.412 -2.026 -8.597 44.229 3.342 -0.515 2.983 -11.284 2.659 45.059 80 II_DT5DA6:DT-6DA-5_JJ I 5 ? J -5 ? I 6 ? J -6 ? 1 I DA 81 1_555 J DT 65 1_555 I DA 82 1_555 J DT 64 1_555 -0.362 0.762 3.445 -4.136 -0.652 34.905 1.365 -0.054 3.450 -1.082 6.864 35.147 81 II_DA6DA7:DT-7DT-6_JJ I 6 ? J -6 ? I 7 ? J -7 ? 1 I DA 82 1_555 J DT 64 1_555 I DC 83 1_555 J DG 63 1_555 -0.658 -0.210 3.392 -4.952 0.682 34.024 -0.467 0.301 3.446 1.157 8.406 34.378 82 II_DA7DC8:DG-8DT-7_JJ I 7 ? J -7 ? I 8 ? J -8 ? 1 I DC 83 1_555 J DG 63 1_555 I DC 84 1_555 J DG 62 1_555 -0.030 -0.170 3.337 -0.871 3.792 34.406 -0.880 -0.086 3.299 6.386 1.466 34.619 83 II_DC8DC9:DG-9DG-8_JJ I 8 ? J -8 ? I 9 ? J -9 ? 1 I DC 84 1_555 J DG 62 1_555 I DC 85 1_555 J DG 61 1_555 0.523 -0.247 3.337 0.922 4.430 34.737 -1.088 -0.728 3.294 7.380 -1.536 35.022 84 II_DC9DC10:DG-10DG-9_JJ I 9 ? J -9 ? I 10 ? J -10 ? 1 I DC 85 1_555 J DG 61 1_555 I DT 86 1_555 J DA 60 1_555 -0.199 -0.606 3.337 1.597 4.630 29.067 -2.183 0.734 3.189 9.143 -3.154 29.468 85 II_DC10DT11:DA-11DG-10_JJ I 10 ? J -10 ? I 11 ? J -11 ? 1 I DT 86 1_555 J DA 60 1_555 I DA 87 1_555 J DT 59 1_555 0.438 0.372 3.299 1.437 7.747 37.810 -0.416 -0.482 3.322 11.799 -2.188 38.593 86 II_DT11DA12:DT-12DA-11_JJ I 11 ? J -11 ? I 12 ? J -12 ? 1 I DA 87 1_555 J DT 59 1_555 I DA 88 1_555 J DT 58 1_555 -0.587 -0.079 3.362 -0.770 2.361 37.046 -0.448 0.816 3.362 3.711 1.210 37.127 87 II_DA12DA13:DT-13DT-12_JJ I 12 ? J -12 ? I 13 ? J -13 ? 1 I DA 88 1_555 J DT 58 1_555 I DC 89 1_555 J DG 57 1_555 0.479 -0.435 3.408 2.414 -2.739 33.468 -0.281 -0.413 3.457 -4.739 -4.176 33.661 88 II_DA13DC14:DG-14DT-13_JJ I 13 ? J -13 ? I 14 ? J -14 ? 1 I DC 89 1_555 J DG 57 1_555 I DC 90 1_555 J DG 56 1_555 -0.193 0.604 3.491 -0.196 -6.231 39.673 1.628 0.257 3.363 -9.112 0.287 40.141 89 II_DC14DC15:DG-15DG-14_JJ I 14 ? J -14 ? I 15 ? J -15 ? 1 I DC 90 1_555 J DG 56 1_555 I DC 91 1_555 J DG 55 1_555 0.083 1.472 3.694 -0.492 -7.653 40.115 3.028 -0.178 3.368 -11.035 0.710 40.812 90 II_DC15DC16:DG-16DG-15_JJ I 15 ? J -15 ? I 16 ? J -16 ? 1 I DC 91 1_555 J DG 55 1_555 I DT 92 1_555 J DA 54 1_555 -0.764 1.181 3.731 -3.056 -5.100 35.625 2.718 0.746 3.584 -8.265 4.953 36.102 91 II_DC16DT17:DA-17DG-16_JJ I 16 ? J -16 ? I 17 ? 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J -22 ? 1 I DC 97 1_555 J DG 49 1_555 I DT 98 1_555 J DA 48 1_555 0.258 -0.450 3.331 3.652 1.990 30.334 -1.253 0.247 3.303 3.780 -6.937 30.611 97 II_DC22DT23:DA-23DG-22_JJ I 22 ? J -22 ? I 23 ? J -23 ? 1 I DT 98 1_555 J DA 48 1_555 I DA 99 1_555 J DT 47 1_555 0.248 0.434 3.290 2.764 1.876 39.130 0.420 -0.036 3.315 2.795 -4.118 39.267 98 II_DT23DA24:DT-24DA-23_JJ I 23 ? J -23 ? I 24 ? J -24 ? 1 I DA 99 1_555 J DT 47 1_555 I DA 100 1_555 J DT 46 1_555 -0.429 0.667 3.554 -0.031 -2.669 34.813 1.548 0.710 3.495 -4.453 0.051 34.912 99 II_DA24DA25:DT-25DT-24_JJ I 24 ? J -24 ? I 25 ? J -25 ? 1 I DA 100 1_555 J DT 46 1_555 I DC 101 1_555 J DG 45 1_555 0.266 -0.379 3.431 -1.535 -3.871 35.630 -0.032 -0.663 3.438 -6.300 2.498 35.864 100 II_DA25DC26:DG-26DT-25_JJ I 25 ? J -25 ? I 26 ? J -26 ? 1 I DC 101 1_555 J DG 45 1_555 I DC 102 1_555 J DG 44 1_555 -0.157 0.025 3.390 -2.924 -3.528 38.460 0.486 -0.135 3.378 -5.333 4.420 38.722 101 II_DC26DC27:DG-27DG-26_JJ I 26 ? J -26 ? I 27 ? 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