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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.000 0.016 21315 ? r_bond_other_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 2.087 1.670 31988 ? r_angle_refined_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.231 1.554 50087 ? r_angle_other_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.020 5.000 2611 ? r_dihedral_angle_1_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 11.119 9.595 111 ? r_dihedral_angle_2_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 16.845 10.000 3777 ? r_dihedral_angle_3_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_dihedral_angle_4_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.120 0.200 3900 ? r_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.020 0.020 24634 ? r_gen_planes_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.024 0.020 4255 ? r_gen_planes_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbd_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbd_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbtor_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbtor_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_xyhbond_nbd_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_xyhbond_nbd_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 63.906 44.307 10492 ? r_mcbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 63.906 44.307 10492 ? r_mcbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? 65.982 13087 ? r_mcangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? 65.977 13088 ? r_mcangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 43.508 46.029 12904 ? r_scbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 43.507 46.029 12905 ? r_scbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_scangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 83.545 68.682 18902 ? r_scangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? 23829 ? r_long_range_B_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? 23830 ? r_long_range_B_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_rigid_bond_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_free ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_bonded ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_ls_shell.d_res_high 12.001 _refine_ls_shell.d_res_low 12.312 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 0 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 1849 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.504 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_R_complete ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.000 # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 2 generate ? 0.309017 -0.951057 0.000000 0.951057 0.309017 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 362.56237 -57.42426 0.00000 3 generate ? -0.809017 -0.587785 0.000000 0.587785 -0.809017 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 529.21394 269.64800 0.00000 4 generate ? -0.809017 0.587785 0.000000 -0.587785 -0.809017 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 269.64800 529.21394 0.00000 5 generate ? 0.309017 0.951057 0.000000 -0.951057 0.309017 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 -57.42426 362.56237 0.00000 # _struct.entry_id 8OZP _struct.title 'In situ subtomogram average of Prototype Foamy Virus Env pentamer of trimers' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8OZP _struct_keywords.text 'membrane fusion, envelope glycoprotein, foamy virus, MPER, transmembrane, MEMBRANE PROTEIN, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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WA N N 9 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 8OZP _struct_ref.pdbx_db_accession 8OZP _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8OZP A 1 ? 988 ? 8OZP 1 ? 988 ? 1 988 2 1 8OZP B 1 ? 988 ? 8OZP 1 ? 988 ? 1 988 3 1 8OZP D 1 ? 988 ? 8OZP 1 ? 988 ? 1 988 4 1 8OZP F 1 ? 988 ? 8OZP 1 ? 988 ? 1 988 5 1 8OZP H 1 ? 988 ? 8OZP 1 ? 988 ? 1 988 6 1 8OZP L 1 ? 988 ? 8OZP 1 ? 988 ? 1 988 7 1 8OZP E 1 ? 988 ? 8OZP 1 ? 988 ? 1 988 8 1 8OZP I 1 ? 988 ? 8OZP 1 ? 988 ? 1 988 9 1 8OZP C 1 ? 988 ? 8OZP 1 ? 988 ? 1 988 10 1 8OZP G 1 ? 988 ? 8OZP 1 ? 988 ? 1 988 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 245-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 245 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2,3,4,5 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 2 'point symmetry operation' ? ? 0.309017 -0.951057 0.000000 362.56237 0.951057 0.309017 0.000000 -57.42426 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 3 'point symmetry operation' ? ? -0.809017 -0.587785 0.000000 529.21394 0.587785 -0.809017 0.000000 269.64800 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 4 'point symmetry operation' ? ? -0.809017 0.587785 0.000000 269.64800 -0.587785 -0.809017 0.000000 529.21394 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 5 'point symmetry operation' ? ? 0.309017 0.951057 0.000000 -57.42426 -0.951057 0.309017 0.000000 362.56237 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 TYR A 59 ? 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ALA H 897 ARG H 903 1 ? 7 HELX_P HELX_P44 AE8 ASP E 910 ? LYS E 923 ? ASP H 910 LYS H 923 1 ? 14 HELX_P HELX_P45 AE9 TRP E 926 ? THR E 943 ? TRP H 926 THR H 943 1 ? 18 HELX_P HELX_P46 AF1 GLY E 946 ? SER E 979 ? GLY H 946 SER H 979 1 ? 34 HELX_P HELX_P47 AF2 GLN F 596 ? ASP F 602 ? GLN L 596 ASP L 602 5 ? 7 HELX_P HELX_P48 AF3 LEU F 619 ? LEU F 624 ? LEU L 619 LEU L 624 1 ? 6 HELX_P HELX_P49 AF4 LEU F 624 ? MET F 630 ? LEU L 624 MET L 630 1 ? 7 HELX_P HELX_P50 AF5 GLU F 631 ? GLU F 652 ? GLU L 631 GLU L 652 1 ? 22 HELX_P HELX_P51 AF6 ASP F 656 ? MET F 660 ? ASP L 656 MET L 660 5 ? 5 HELX_P HELX_P52 AF7 SER F 661 ? GLN F 670 ? SER L 661 GLN L 670 1 ? 10 HELX_P HELX_P53 AF8 SER F 672 ? ALA F 683 ? SER L 672 ALA L 683 1 ? 12 HELX_P HELX_P54 AF9 LEU F 869 ? GLY F 878 ? LEU L 869 GLY L 878 1 ? 10 HELX_P HELX_P55 AG1 SER F 889 ? GLU F 895 ? SER L 889 GLU L 895 1 ? 7 HELX_P HELX_P56 AG2 ALA F 897 ? ARG F 903 ? ALA L 897 ARG L 903 1 ? 7 HELX_P HELX_P57 AG3 ASP F 910 ? LYS F 923 ? 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PRO G 537 ARG G 540 5 ? 4 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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E CYS 820 SG ? ? ? 1_555 E CYS 838 SG ? ? H CYS 820 H CYS 838 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? ? disulf11 disulf ? ? F CYS 763 SG ? ? ? 1_555 F CYS 771 SG ? ? L CYS 763 L CYS 771 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? ? disulf12 disulf ? ? F CYS 780 SG ? ? ? 1_555 F CYS 789 SG ? ? L CYS 780 L CYS 789 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf13 disulf ? ? F CYS 820 SG ? ? ? 1_555 F CYS 838 SG ? ? L CYS 820 L CYS 838 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? disulf14 disulf ? ? I CYS 228 SG ? ? ? 1_555 I CYS 506 SG ? ? C CYS 228 C CYS 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf15 disulf ? ? I CYS 235 SG ? ? ? 1_555 I CYS 318 SG ? ? C CYS 235 C CYS 318 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.060 ? ? disulf16 disulf ? ? I CYS 256 SG ? ? ? 1_555 I CYS 381 SG ? ? C CYS 256 C CYS 381 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf17 disulf ? ? I CYS 449 SG ? ? ? 1_555 I CYS 457 SG ? ? C CYS 449 C CYS 457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf18 disulf ? ? J CYS 228 SG ? ? ? 1_555 J CYS 506 SG ? ? G CYS 228 G CYS 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf19 disulf ? ? J CYS 235 SG ? ? ? 1_555 J CYS 318 SG ? ? G CYS 235 G CYS 318 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? ? disulf20 disulf ? ? J CYS 256 SG ? ? ? 1_555 J CYS 381 SG ? ? G CYS 256 G CYS 381 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? ? disulf21 disulf ? ? J CYS 449 SG ? ? ? 1_555 J CYS 457 SG ? ? G CYS 449 G CYS 457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? covale1 covale one ? A ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 109 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 141 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? B ASN 141 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 183 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? B ASN 183 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 311 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? B ASN 311 B NAG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? B ASN 391 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? B ASN 391 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? B ASN 405 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? B ASN 405 B NAG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 527 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? B ASN 527 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? B ASN 556 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? B ASN 556 B NAG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? C ASN 782 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? D ASN 782 h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? C ASN 808 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? D ASN 808 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? C ASN 833 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? D ASN 833 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? E ASN 782 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? H ASN 782 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? E ASN 808 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? H ASN 808 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? E ASN 833 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? H ASN 833 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? F ASN 782 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? L ASN 782 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? F ASN 808 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? L ASN 808 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? F ASN 833 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? L ASN 833 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? G ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? E ASN 109 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? H ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? I ASN 109 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? I ASN 141 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? C ASN 141 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? I ASN 183 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? C ASN 183 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? I ASN 311 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? C ASN 311 C NAG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? I ASN 391 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? C ASN 391 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? I ASN 405 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? C ASN 405 C NAG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? I ASN 527 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? C ASN 527 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? I ASN 556 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? C ASN 556 C NAG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? J ASN 141 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? G ASN 141 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? J ASN 183 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? G ASN 183 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? J ASN 311 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? G ASN 311 G NAG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? J ASN 391 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? G ASN 391 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? J ASN 405 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? G ASN 405 G NAG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? J ASN 527 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? G ASN 527 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? J ASN 556 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? G ASN 556 G NAG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale34 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale35 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? ? covale36 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale37 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? ? covale38 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M BMA . C1 ? ? X NAG 2 X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale39 covale both ? M BMA . O3 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? X BMA 3 X MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale40 covale both ? M BMA . O6 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? X BMA 3 X MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? ? covale41 covale both ? M MAN . O2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? X MAN 4 X NAG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? ? covale42 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale43 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N BMA . C1 ? ? R NAG 2 R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? ? covale44 covale both ? N BMA . O6 ? ? ? 1_555 N MAN . C1 ? ? R BMA 3 R MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? ? covale45 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.470 ? ? covale46 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? ? covale47 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P BMA . C1 ? ? e NAG 2 e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale48 covale both ? P BMA . O6 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? e BMA 3 e MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? ? covale49 covale both ? P BMA . O3 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? e BMA 3 e MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? covale50 covale both ? P MAN . O3 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? e MAN 4 e MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? covale51 covale both ? P MAN . O6 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? e MAN 4 e MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale52 covale both ? P MAN . O2 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? e MAN 5 e MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale53 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? ? covale54 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? h NAG 1 h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale55 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R BMA . C1 ? ? h NAG 2 h BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale56 covale both ? R BMA . O6 ? ? ? 1_555 R MAN . C1 ? ? h BMA 3 h MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale57 covale both ? R BMA . O3 ? ? ? 1_555 R MAN . C1 ? ? h BMA 3 h MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? ? covale58 covale both ? R MAN . O3 ? ? ? 1_555 R MAN . C1 ? ? h MAN 4 h MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale59 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? ? covale60 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S BMA . C1 ? ? f NAG 2 f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale61 covale both ? S BMA . O6 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? f BMA 3 f MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? ? covale62 covale both ? S BMA . O3 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? f BMA 3 f MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? ? covale63 covale both ? S MAN . O3 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? f MAN 4 f MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale64 covale both ? S MAN . O6 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? f MAN 4 f MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale65 covale both ? S MAN . O2 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? f MAN 5 f MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale66 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale67 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? i NAG 1 i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale68 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? i NAG 2 i BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? ? covale69 covale both ? U BMA . O6 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? i BMA 3 i MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale70 covale both ? U BMA . O3 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? i BMA 3 i MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? covale71 covale both ? U MAN . O3 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? i MAN 4 i MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? ? covale72 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale73 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V BMA . C1 ? ? g NAG 2 g BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale74 covale both ? V BMA . O6 ? ? ? 1_555 V MAN . C1 ? ? g BMA 3 g MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? ? covale75 covale both ? V BMA . O3 ? ? ? 1_555 V MAN . C1 ? ? g BMA 3 g MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale76 covale both ? V MAN . O3 ? ? ? 1_555 V MAN . C1 ? ? g MAN 4 g MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale77 covale both ? V MAN . O6 ? ? ? 1_555 V MAN . C1 ? ? g MAN 4 g MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale78 covale both ? V MAN . O2 ? ? ? 1_555 V MAN . C1 ? ? g MAN 5 g MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale79 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale80 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? j NAG 1 j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale81 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X BMA . C1 ? ? j NAG 2 j BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.470 ? ? covale82 covale both ? X BMA . O6 ? ? ? 1_555 X MAN . C1 ? ? j BMA 3 j MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale83 covale both ? X BMA . O3 ? ? ? 1_555 X MAN . C1 ? ? j BMA 3 j MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale84 covale both ? X MAN . O3 ? ? ? 1_555 X MAN . C1 ? ? j MAN 4 j MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale85 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale86 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale87 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? ? covale88 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA BMA . C1 ? ? S NAG 2 S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? ? covale89 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale90 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA BMA . C1 ? ? V NAG 2 V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale91 covale both ? BA BMA . O3 ? ? ? 1_555 BA MAN . C1 ? ? V BMA 3 V MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale92 covale both ? BA BMA . O6 ? ? ? 1_555 BA MAN . C1 ? ? V BMA 3 V MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale93 covale both ? BA MAN . O2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? V MAN 4 V NAG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale94 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? ? covale95 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? ? covale96 covale both ? CA BMA . O6 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? P BMA 3 P MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale97 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale98 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? ? covale99 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA BMA . C1 ? ? T NAG 2 T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? ? covale100 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? ? covale101 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA BMA . C1 ? ? W NAG 2 W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale102 covale both ? FA BMA . O3 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? W BMA 3 W MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale103 covale both ? FA BMA . O6 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? W BMA 3 W MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale104 covale both ? FA MAN . O2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? W MAN 4 W NAG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? ? covale105 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale106 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA BMA . C1 ? ? Q NAG 2 Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? ? covale107 covale both ? GA BMA . O6 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? Q BMA 3 Q MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? ? covale108 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 550 B . ? PHE 550 B PRO 551 B ? PRO 551 B 1 -11.93 2 GLU 798 C . ? GLU 798 D PRO 799 C ? PRO 799 D 1 -3.87 3 GLU 798 E . ? GLU 798 H PRO 799 E ? 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